Protein Alignment Vps33B and vps33a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651395.1
• Gene: Vps33B / 43077
• FlyBaseID: FBgn0039335
• Length: 640
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001093443.1
• Gene: vps33a / 448942
• ZFINID: ZDB-GENE-040914-82
• Length: 599
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 647
• Identity: 139/647 - (21%)
• Similarity: 274/647 - (42%)
• Gaps: 106/647 - (16%)

  Fly    16 AQEKLCSILCSIPGKKELILEPDLIKPLEHVVTASWLKLKGIQRIYKHDAAQSLPRSADQVHIYM 80
            |::.|...|....|.|.::.:..|..|...:...|.||...:::::.....: :|.:|.:..::.
Zfish    19 ARKDLREFLDKCSGSKAIVWDEYLTGPFGLIAQYSLLKEHEVEKMFTLKGGR-IPSAAVKNIVFF 82

  Fly    81 IRSVLGTFQTLLKQLQPVASEEMPDISMKMYHIVCVPS----CYSYFQTLLEQAGLYGLVQLHHF 141
            :|..|.....:.:.   |:||:  .:..:.:||:.||.    |.   |.|.|:..|.....:..:
Zfish    83 VRPRLELMDIIAEN---VSSED--KLQPREFHILFVPRRSLLCE---QRLKEKGVLNSFTNIDEY 139

  Fly   142 NWDFIYFDQGVLSLELPNLYECLYLQKNTSPLPAVAQSLRLLQMICGQPSLILSFG----HHSSQ 202
            ..|.|.:|..:||:|..:.:...||:.:.:.|...|:.|..||.:.|....|...|    |.::.
Zfish   140 ILDLIPYDGDLLSMESESSFRECYLENDQTSLYHAAKGLMTLQALYGTIPQIFGKGECARHVANM 204

  Fly   203 LMQMAKTLGKLPAPTNP---PDYGGWLVIDRDKDYPASLLTPAIYAGLLLEVFEHSSGEILVDNS 264
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Zfish   205 MLRMKREF----AGSHTQILPVFDTLLLLDRNVDLLTPLATQLTYEGLIDEIFGITNGYVKLPPE 265

  Fly   265 KNKIRSQRVELLQGKKSKIGVNSASKPCSIRLNSTSDEIYGDNRYKRFAQVSSLIHAQVKALGLE 329
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Zfish   266 K---------FAQKKQGEGGKDLPTEPKKLQLNS-AEELYAEIRDKNFNAVGAALSKKAKIISAA 320

  Fly   330 L-QKLNDMQLDEMHDYVARKLPKLTELKSKVLRHLNASEIV--IQMMGNFRKLQTLEEDILNNDS 391
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Zfish   321 FEERHNAKTVGEIKQFVS-QLPHMQAARSSLANHTSIAELIKDITTSEVFFDSLTVEQEFMTGVD 384

  Fly   392 RKRLLSEIDELLTTDGQRFNTLRLLCLLHHC-VGVAPEELQIFARNYCNLFGHQELGVFQQLSQA 455
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Zfish   385 TDKVSTYIEDCIAQKDPLIKILRLVCMQSVCNNGLKQKVLDYYKREILQTYGYKHILTLKNLEKV 449

  Fly   456 GLLPPLVVEKKAPTKLLSNLPLPKFQQTEFQANANRLKLLTSSGDGQDGGSSSKSQSSGLQTCPS 520
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Zfish   450 GLLKP-------QSTMRNNYPTIR----------KTLKLWMEDANEQNPNDI------------S 485

  Fly   521 FVFNGTYIPLVAQLCSILLK--INSAEELSSKLGMIEGLHLHLDSGKITPKAYASQVKLNGVADQ 583
            :|::| |.||..:|..:|.:  ..|.||:   |.|:.|.|..                     ::
Zfish   486 YVYSG-YAPLSVRLTQVLARPGWRSIEEV---LKMLPGPHFE---------------------ER 525

  Fly   584 DMFPLRL---------RNLFVFIVGGASYAEIAACDFVAKL--TGAQITVASDSLMAGSDLI 634
            ...|..|         |...||.:||.:||||||..|::.:  :|.:..:|:..|:.|:..:
Zfish   526 QQVPTGLHKKRQPGENRTTLVFFLGGVTYAEIAALRFLSHMEDSGTEYIIATTKLINGTSWV 587

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Vps33B	NP_651395.1	Sec1	31..634	CDD:460020	135/630 (21%)
vps33a	NP_001093443.1	Sec1	34..589	CDD:460020	135/632 (21%)