DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Clbn and Y82E9BR.18

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651341.2 Gene:Clbn / 43018 FlyBaseID:FBgn0259152 Length:992 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_497411.2 Gene:Y82E9BR.18 / 175303 WormBaseID:WBGene00022350 Length:921 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1020 Identity:397/1020 - (38%)
Similarity:579/1020 - (56%) Gaps:135/1020 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MKTRFNTFDIICGVAELQKLVGWRVNQIYDVDNKTYLFRMQGTGAVEKVTLLIESGTRFHTTRFE 65
            ||.||...|:|....||:||.|.|||.:||:||||||.::..|.  ||..:|.|||.|.|.|..:
 Worm     1 MKNRFTLVDVIAATTELKKLEGMRVNNVYDIDNKTYLIKLSRTD--EKAVILFESGVRLHQTFHD 63

  Fly    66 WPKNMAPSGFSMKLRKHLKNKRLEKVQQMGSDRIVDFQFGTGDAAYHVILELYDRGNVILTDYEL 130
            |||:..||.||||||||:..|||..::.:|.||:|:..|||.|....:.:||||||||:|||.||
 Worm    64 WPKSQTPSSFSMKLRKHINQKRLTSIRVVGFDRLVELTFGTEDRENRLYVELYDRGNVVLTDQEL 128

  Fly   131 TTLYILRPHTEGE-NLRFAMREKYPV----ERAKQPTKELELEALVKLLENARNG--DYLRQILT 188
            |.|.|||..|:.: ::|:|:|||:..    ..|.:..::||:..:...:....:|  :...:||.
 Worm   129 TILNILRVRTDKDTSVRWAVREKFTFSDDENSAAKTGEKLEISDVKLAISGIPDGKEEQFGRILA 193

  Fly   189 PNLDCGPAVIEHVLLSHGLDNHVIKKETTEETPEAEDKPEKGGKKQRKKQQNTKLEQKPFD-MVN 252
            ....||..|.:.:|.     ...:|.:|                    |.:|:....:.|| .::
 Worm   194 QITKCGNPVTKEILA-----RCQVKWDT--------------------KIKNSSEISEIFDGNLH 233

  Fly   253 DLPILQQAVKDAQELIAEGNSGKSKGYIIQVKEEKPTENGTVEFFFRNIEFHPYLFIQFKNFEKA 317
            ....:|:|.:|..:.:..    |..|:|...:...|... .::.:   .:|:| :.::|......
 Worm   234 KFEEIQKATEDVWDTVLH----KPLGFISYSEVLSPIST-PIQIY---QDFNP-ISMEFTAKLSK 289

  Fly   318 TFESFMEAVDEFYSTQESQKIDMKTLQQEREALKKLSNVKNDHAKRLEELTKVQDVDRKKAELIT 382
            ...||.||||||||..|:||.:.|.:..|::|||||.||:.|...|:|.|...|....:.|..|.
 Worm   290 ELSSFCEAVDEFYSRIETQKQEQKAVNMEKQALKKLENVEKDQKDRIEALQLTQSQREQMANRII 354

  Fly   383 SNQSLVDNAIRAVQSAIASQLSWPDIHELVKEAQANGDAVASSIKQLKLETNHISLMLSDPYDND 447
            .|..||:.|:..::||:|:|.||..|.|:.|.|..|||.||.||...|.|.|...:.|:|||| |
 Worm   355 LNTELVEKALLLIRSALANQFSWQTIEEMRKTAAGNGDPVAKSIDSFKFENNEFMMSLADPYD-D 418

  Fly   448 EDDDLKDPEVTVVDVDLALSAWANARRYYDMKRSAAQKEKKTVDASQKALKSAERKTQQTLKEVR 512
            |.:.||.|      :|::|:|..||:|::..|:|||:|.||||.:|:||:|:|:.|.:.||::|:
 Worm   419 EAEVLKVP------IDISLNASKNAQRHFVDKKSAAEKVKKTVASSEKAIKNAQEKAKSTLEQVK 477

  Fly   513 TISNIVKARKVFWFEKFYWFISSENYLVIGGRDAQQNELIVKRYMRPKDIYVHAEIQGASSVIIQ 577
            .:..:.|:||..|||||.||||||.::|:.|||||||||:||:|:||.|||:||:::|||||:|:
 Worm   478 IVVEVKKSRKSMWFEKFRWFISSEGFIVVAGRDAQQNELLVKKYLRPNDIYMHADVRGASSVVIR 542

  Fly   578 NPTGE-EIPPKTLLEAGSMAISYSVAWDAKVVTNSYWVTSDQVSKTAPTGEYLATGSFMIRGKKN 641
            |.:.: |||||||.||..||:.||.||:|.|..:::||..||||:||||||||.:||||||||||
 Worm   543 NKSFDAEIPPKTLTEAAQMAVCYSNAWEATVTASAWWVHPDQVSRTAPTGEYLPSGSFMIRGKKN 607

  Fly   642 FLPSCHLTMGLSLLFKLEDSFIERHLGERKVRSLEDDQIDPNVKENEVEHDLLSDNEDADSNINL 706
            |:|...|.|||.:||::::..||||:...|.::.|         ::|.:.:.:.|:....:.|. 
 Worm   608 FMPPSQLVMGLGILFRMDEESIERHVALEKSKAEE---------KSEEDGEKMEDSPKKTAKIP- 662

  Fly   707 SEPSSNTEITAFPNTEVKIEHDTGRIIVRSDSVNPEIEETKESEVVLDKILKKTDDEETTIILAG 771
            ..|:.|.|   ||:.||||...:|             ||.                ||.|:|..|
 Worm   663 ENPAENDE---FPDIEVKIARPSG-------------EEA----------------EEMTLIEVG 695

  Fly   772 PSR--KKQVSAKKTKEDKARAKQEAAKQEVPPVSSEPKNPSQVKRGQKGKLKKMKQKYKDQDDEE 834
            |..  |...:|:|..::..:..|...::::......|...:|.:|.:|.||.||  |||||.|::
 Worm   696 PKNPVKNSQNAQKLPKNAEKTTQLYLEEKLKEQLGGPSAKTQKRRQRKEKLAKM--KYKDQTDDD 758

  Fly   835 REIRMMILKSSGKEKPQASADKVVEKSESTKEYVKPEKSAAP--------------KNPVELDDA 885
            .|:...:||..|         |:|||.|. :...:||||..|              :||   |:.
 Worm   759 LELHKELLKPQG---------KIVEKVEE-RPVERPEKSEKPVKIEEFKPKIQEKRENP---DEE 810

  Fly   886 DEVPVGGD-------VDVLNSLTGQPHEGDELLFAIPVVAPYQALQNYKFKVKLTPGTGKRGKAA 943
            .|.|...|       :.:|.:||.||.:.|.||||:||||||.||..||::||:|||.||||||.
 Worm   811 AEEPEEDDKEANLEELSILTTLTAQPLDEDTLLFAVPVVAPYSALSTYKYRVKITPGIGKRGKAT 875

  Fly   944 KLALNIFAKEKSCSAREKDLLKS-IKEESLARNIPGKVKLSAPQL 987
            |.|:.:|.:::  :.|:..|:|| :.::|.:||:|.||::|||||
 Worm   876 KSAIELFTRQR--TDRQAALIKSLLSDDSASRNLPTKVRISAPQL 918

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ClbnNP_651341.2 RqcH_arch 8..643 CDD:469043 271/643 (42%)
PTZ00341 <654..>814 CDD:173534 35/161 (22%)
NFACT-C 893..983 CDD:432191 45/97 (46%)
Y82E9BR.18NP_497411.2 RqcH_arch 8..620 CDD:469043 277/654 (42%)
PTZ00121 <626..>804 CDD:173412 59/231 (26%)
NFACT-C 824..914 CDD:432191 44/91 (48%)

Return to query results.
Submit another query.