DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AFDN and afdna

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047274744.1 Gene:AFDN / 4301 HGNCID:7137 Length:1909 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_073789719.1 Gene:afdna / 558359 ZFINID:ZDB-GENE-050419-52 Length:1931 Species:Danio rerio


Alignment Length:1978 Identity:1446/1978 - (73%)
Similarity:1630/1978 - (82%) Gaps:120/1978 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     3 AGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTAT 67
            :|.|:||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||:.||||||||||||||||
Zfish     2 SGSREEERRKLADIINHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDRVAGNFATKCIRVSSTAT 66

Human    68 TQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGEERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNE 132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||||
Zfish    67 TQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGEERKLDLDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNE 131

Human   133 NDAIPPKKAQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKREKEALRQASDKDDRPFQGEDVENS 197
            || |.||:..:||||| |||||||||||||||||||::|||||||..:..|.||.....||.|||
Zfish   132 ND-IMPKRTLTNGPEK-EKEGVIQNFKRTLSKKEKKKEKKREKEAFSRIPDGDDHVLNREDGENS 194

Human   198 RLAAEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNI 262
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Zfish   195 RLAAEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSEDGRPDSGGTLRIYADSLKPNI 259

Human   263 PYKTILLSTTDPADFAVAEALEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDEKGAKEIILDDDECPL 327
            |||||||||||.|||||||||||||||||||:|||||:|:      |:::|..||.||||.:|||
Zfish   260 PYKTILLSTTDMADFAVAEALEKYGLEKENPRDYCIAQVI------HANDKAVKETILDDTDCPL 318

Human   328 QIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDHIPKKTKKHLEGKTPKGKERADGSGYGSTLPPEKLPYLVELS 392
            ||.|:|.|||..||||||:||||:.|:|      |:.|..:.   |..:|| :||||||||||||
Zfish   319 QILRDWTSDKEALVFQLKKRPPDYAPRK------GRKPDNRM---GPQHGS-IPPEKLPYLVELS 373

Human   393 PGRRNHFAYYNYHTYEDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKLDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMD 457
            |||.:|:||| |..:||||||||||||||||.||||||:::.:|.:||||||||.||||||.:.|
Zfish   374 PGRGSHYAYY-YRHHEDGSDSRDKPKLYRLQHSVTEVGSDRSEDGNIQLFGPGILPHHCDLMHAD 437

Human   458 GVVTVTPRSMDAETYVEGQRISETTMLQSGMKVQFGASHVFKFVDPSQDHALAKRSVDGGLMVKG 522
            |:||:||.:|||||:|:||||::||:|:||:.|||||:|||||||||.|.:::||  |.|.|:||
Zfish   438 GLVTITPANMDAETFVDGQRIADTTVLRSGVTVQFGATHVFKFVDPSYDQSMSKR--DPGPMMKG 500

Human   523 PRHKPGIVQETTFDLGGDIHSGTALPTSKSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPMIRVEQQPDYRR 587
             |||.|.|.||||||.||||||:|||||||:.:|:.:|   :.:::|||:||||||.||| |:.:
Zfish   501 -RHKSGSVPETTFDLHGDIHSGSALPTSKSSGKLEMER---SGNSSERGLVKPMIRGEQQ-DFSK 560

Human   588 QESRTQDASGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYVLSNQYR 652
            .:.|:||  ||||.|||||||||:|||:||||||||||||||||||||||||||.||||:|:|||
Zfish   561 HDGRSQD--GPELTLPASIEFRENSEDAFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMTCRYVMSSQYR 623

Human   653 PDISPTERTHKVIAVVNKMVSMMEGVIQEVDQVDQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRDLS 717
            |||||:||||||||:||||||||||||||:.:.||||||||||||||||||||||||||||:|||
Zfish   624 PDISPSERTHKVIAIVNKMVSMMEGVIQEIAEGDQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDKDLS 688

Human   718 RITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAMSLLR 782
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||:||:|.:.|||||:||||||||||||||
Zfish   689 RITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSDLNNYMPAFLEDPDEQNPQRPKIEDVLHTLTGAMSLLR 753

Human   783 RCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLELAA 847
            |||||||||||||||||||:||||||:|||:.||||||||||||:||||.|||||||||||||||
Zfish   754 RCRVNAALTIQLFSQLFHFVNMWLFNKLVTEADSGLCSHYWGAILRQQLSHIEAWAEKQGLELAA 818

Human   848 DCHLSRIVQATTLLTMDKYAPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENVVT 912
            |||||||||||||||||||:..|:.|||:||||||||||.|||.|||||||||:||.:||::||.
Zfish   819 DCHLSRIVQATTLLTMDKYSMQDVQNINNTCFKLNSLQLNALLSNYHCAPDEPYIPPELIDHVVA 883

Human   913 VAENTADELARSDGREVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRLIP 977
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||:||||||||||.|
Zfish   884 VAENTADELARSDGREVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGFQEFLEPLCQRGFCRLTP 948

Human   978 HTRSPGTWTIYFEGADYESHLLRENTELAQPLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLG 1042
            |.|||||||||||||:.:||...:.:||  |:||||||:||||||.|||||||||||||||||||
Zfish   949 HPRSPGTWTIYFEGANCDSHFSADTSEL--PMRKEPEIVTVTLKKHNGMGLSIVAAKGAGQDKLG 1011

Human  1043 IYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYHGL 1107
            ||:||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Zfish  1012 IYIKSVVKGGAADMDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTGSVVTLEVAKQGAIYHGL 1076

Human  1108 ATLLNQPSPMMQRISDR-RG-SGKPRPKSEGFELYNNSTQNGSPESPQLPWAEYSEPKKLPGDDR 1170
            |||||||||||.|.||| || .||.|||||||||||||.|||||||||..|..|.||||   :||
Zfish  1077 ATLLNQPSPMMPRASDRGRGDKGKLRPKSEGFELYNNSVQNGSPESPQGTWDTYPEPKK---EDR 1138

Human  1171 LMKNRADHRSSPNVANQPPSPGGKSAYASGTTAKITSVSTGNLCTEEQTPPPRPEAYPIPTQTYT 1235
            |:|||||||||||||||..|||||..| .|...|||||||||||.:|:..||||||||||||||.
Zfish  1139 LLKNRADHRSSPNVANQAQSPGGKPVY-PGAPGKITSVSTGNLCPDEEPSPPRPEAYPIPTQTYP 1202

Human  1236 REYFTFPASKSQDRMAPPQNQWPNYEEKPHMHTDSNHS--SIAIQRVTRSQEE------------ 1286
            |||||||||||||||.|.| .|.|.|::|....| |||  |:.:|||.|||||            
Zfish  1203 REYFTFPASKSQDRMGPGQ-PWQNNEQEPLPPMD-NHSNNSMVMQRVARSQEELCDMPGGYPGER 1265

Human  1287 LREDKAYQLERHRIEAAMDRKSDSDMWINQ-SSSLDSSTSSQEHLNHSSKSVTPASTLTKSGPGR 1350
            ||::....|::.:...|..::...:.|.:| |||::||||||||||.||.|.:......||||||
Zfish  1266 LRQEDLMLLQQQQQREAEYQRGVGEHWNHQVSSSVESSTSSQEHLNFSSSSGSRTQGNHKSGPGR 1330

Human  1351 WKTPAAIPATPVAVSQPIRTDLPPPPPPPPVHYAGDFDGMSMDLPLPPPPSANQIGLPSAQVAAA 1415
            ||||.|..:.|  ||||.|:||||||||||.||  ||:..: ||||||||||.|    ..|.|||
Zfish  1331 WKTPLAPHSGP--VSQPSRSDLPPPPPPPPAHY--DFEPQT-DLPLPPPPSATQ----QQQQAAA 1386

Human  1416 ERRKREEHQRWYEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRTQSLN-------------PAP-FSPLT 1466
            :|:|||:.||||||||||||||||||||:|||||.|:|..|::             |:| ..|:|
Zfish  1387 DRKKREDQQRWYEKEKARLEEERERKRRDQERKLVQIRNPSVSGPVMHNNQHGPVPPSPQMPPMT 1451

Human  1467 --------------AQQMKPEKPSTLQR--PQETVIRELQPQQQPRTIERRDLQYITVSKEELSS 1515
                          .|..:|:|.|:|.|  ||:||||:|.|||||||||||||||||:||||||:
Zfish  1452 LPQSYLPPVQQPPPPQPARPDKLSSLPRQPPQDTVIRDLLPQQQPRTIERRDLQYITISKEELSA 1516

Human  1516 GDSLSPDPWKRDAKEKLEKQQQMHIVDMLSKEIQELQSKPDRSAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQE 1580
            .||||||||||||:||||||||:||||:|.|||||||:||:|:||::||||||||||||||||||
Zfish  1517 SDSLSPDPWKRDAREKLEKQQQLHIVDLLDKEIQELQAKPERTAEDNDRLRKLMLEWQFQKRLQE 1581

Human  1581 SKQKDEDDEEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRAR------------LQDEERRRQQQLEEMRKREAE 1633
            |||.:||:|||:|:||||.|||||||||:|||            ||||||||:|||||:||||||
Zfish  1582 SKQNEEDEEEEDDEDVDTTLIMQRLEAEKRARQTAVPAISVLDLLQDEERRRKQQLEEIRKREAE 1646

Human  1634 DRARQEEERRRQEEERTKRDAEEKRRQEEGYYSRLEAERRRQHDEAARRLLEPEAPGLCRPPLPR 1698
            :||:||||||.:||||.:|:|:|||||||.||:||||||||||:||.|:|..|:..||.||||||
Zfish  1647 ERAKQEEERRWREEERARREADEKRRQEEEYYTRLEAERRRQHEEAERKLPTPDETGLYRPPLPR 1711

Human  1699 DYEPPSPSPAP------GAPPPPPQRNASYLKTQVLSPDSLFTAKFVAYN---EEEEEEDCSLAG 1754
            ||:|||||.||      .|||||||||.|||||||.|||:::|||||:||   |||:|||..|.|
Zfish  1712 DYQPPSPSSAPATNHTTSAPPPPPQRNTSYLKTQVASPDTIYTAKFVSYNDEEEEEDEEDAGLTG 1776

Human  1755 QDKYSSTRKSHGDLLPAPLKPRPPPC--QPRPASDGVFLSNSFQ-PPSAKANSTAHKKGQPLPPP 1816
            |.|.|:||||:|||.||| ||:|||.  :|||.|||:||||||| |....|||||.|.||| |.|
Zfish  1777 QVKLSATRKSYGDLPPAP-KPQPPPTARKPRPVSDGIFLSNSFQLPAGLNANSTALKTGQP-PLP 1839

Human  1817 KKSSSYHPSHCKGRGPNSYPGSTGAAVGAHDACRDAKEKRSKSQDADSPGSSGAPENLTFKERQR 1881
            ....|:.|| ...:|.|||.|:|...|.. :..:|.::|.:|..........|||||||||||||
Zfish  1840 FTKPSFIPS-ANSKGFNSYTGNTTGLVSG-EVYKDPRDKWTKGSPDQENTIGGAPENLTFKERQR 1902

Human  1882 LFSQGQDVSNKVKASRKLTELENELNTK 1909
            |||||::|||||||||||.|||||||.|
Zfish  1903 LFSQGKEVSNKVKASRKLMELENELNIK 1930

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AFDNXP_047274744.1 RA1_Afadin 20..132 CDD:340480 107/111 (96%)
RA2_Afadin 248..348 CDD:340479 75/99 (76%)
FHA_AFDN 385..503 CDD:438763 85/117 (73%)
Myo5p-like_CBD_afadin 612..940 CDD:271255 289/327 (88%)
PDZ_AFDN-like 1013..1100 CDD:467251 81/86 (94%)
DUF4670 <1470..1688 CDD:464815 172/231 (74%)
afdnaXP_073789719.1 None

Return to query results.
Submit another query.