DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AFDN and Afdn

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047274744.1 Gene:AFDN / 4301 HGNCID:7137 Length:1909 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063138525.1 Gene:Afdn / 26955 RGDID:708561 Length:1923 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1925 Identity:1763/1925 - (91%)
Similarity:1825/1925 - (94%) Gaps:18/1925 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSST 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSST 65

Human    66 ATTQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGEERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLK 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 ATTQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGEERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLK 130

Human   131 NENDAIPPKKAQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKREKEALRQASDKDDRPFQGEDVE 195
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::||.||:|.|
  Rat   131 NENDAIPAKKAQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKREKEALRQASDKEERPSQGDDSE 195

Human   196 NSRLAAEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKP 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 NSRLAAEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKP 260

Human   261 NIPYKTILLSTTDPADFAVAEALEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDEKGAKEIILDDDEC 325
            |||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
  Rat   261 NIPYKTILLSTTDPADFAVAESLEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDERGAKEIILDDDEC 325

Human   326 PLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDHIPKKTKKHLEGKTPKGKERADGSGYGSTLPPEKLPYLVE 390
            |||||||||||||||||||||||||:||||.|||:|||..|||:|||||||||.|||||||||||
  Rat   326 PLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDYIPKKMKKHVEGKPLKGKDRADGSGYGSALPPEKLPYLVE 390

Human   391 LSPGRRNHFAYYNYHTYEDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKLDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTN 455
            ||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
  Rat   391 LSPGRRNHFAYYSYHTYEDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKFDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTN 455

Human   456 MDGVVTVTPRSMDAETYVEGQRISETTMLQSGMKVQFGASHVFKFVDPSQDHALAKRSVDGGLMV 520
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||::|||.|||||||||.|||.|:||||||||||
  Rat   456 MDGVVTVTPRSMDAETYVDGQRISETTMLQSGMRLQFGTSHVFKFVDPIQDHVLSKRSVDGGLMV 520

Human   521 KGPRHKPGIVQETTFDLGGDIHSGTALPTSKSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPMIRVEQQPDY 585
            ||||||||.||||||:||||||||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||::|:.||
  Rat   521 KGPRHKPGAVQETTFELGGDIHSGTALPASRSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPMIRLDQEQDY 585

Human   586 RRQESRTQDASGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYVLSNQ 650
            ||:|||||||:||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   586 RRRESRTQDAAGPELMLPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYVLSSQ 650

Human   651 YRPDISPTERTHKVIAVVNKMVSMMEGVIQEVDQVDQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRD 715
            :||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 HRPDISPTERTHKAIAVVNKMVSMMEGVIQEVDQVDQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRD 715

Human   716 LSRITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAMSL 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 LSRITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAMSL 780

Human   781 LRRCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLEL 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 LRRCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLEL 845

Human   846 AADCHLSRIVQATTLLTMDKYAPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENV 910
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 AADCHLSRIVQATTLLTMDKYVPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENV 910

Human   911 VTVAENTADELARSDGREVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRL 975
            |.|||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 VAVAENTADELARSDGRDVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRL 975

Human   976 IPHTRSPGTWTIYFEGADYESHLLRENTELAQPLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDK 1040
            :||||||||||||||||||||||:||||||.||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 VPHTRSPGTWTIYFEGADYESHLMRENTELTQPLRKEPEVITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDK 1040

Human  1041 LGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYH 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 LGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYH 1105

Human  1106 GLATLLNQPSPMMQRISDRRGSGKPRPKSEGFELYNNSTQNGSPESPQLPWAEYSEPKKLPGDDR 1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:||.|||||||||||||
  Rat  1106 GLATLLNQPSPMMQRISDRRGSGKPRPKSEGFELYNNSAQNGSPESPQMPWTEYSEPKKLPGDDR 1170

Human  1171 LMKNRADHRSSPNVANQPPSPGGKSAYASGTTAKITSVSTGNLCTEEQTPPPRPEAYPIPTQTYT 1235
            |||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 LMKNRADHRSSPNVANQPPSPGGKSPYTSGTAAKITSVSTGNLCTEEQTPPPRPEAYPIPTQTYT 1235

Human  1236 REYFTFPASKSQDRMAPPQNQWPNYEEKPHMHTDSNHSSIAIQ----RVTRSQEELREDKAYQLE 1296
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||:|:|:|||||    |||||||||||:|.||||
  Rat  1236 REYFTFPASKSQDRMAPVQNQWPNYEEKPHMHTESDHASIAIQVRNKRVTRSQEELREEKVYQLE 1300

Human  1297 RHRIEAAMDRKSDSDMWINQSSSLDSSTSSQEHLNHSSKSVTPASTLTKSGPGRWKTPAAIPATP 1361
            |||:|:.||||.|||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||:..||
  Rat  1301 RHRVESGMDRKCDSDMWINQSSSVESSTSSQEHLNHSSKSVTPASTLTKSGPGRWKTPAAVLPTP 1365

Human  1362 VAVSQPIRTDLPPPPPPPPVHYAGDFDGMSMDLPLPPPPSANQIGLPSAQVAAAERRKREEHQRW 1426
            |||||||||||||||||||.||..||||:|||||||||| |||....|||||||||:||||||||
  Rat  1366 VAVSQPIRTDLPPPPPPPPAHYTSDFDGISMDLPLPPPP-ANQAAPQSAQVAAAERKKREEHQRW 1429

Human  1427 YEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRTQSLNPAPFSPLTAQQMKPEKPSTLQRPQETVIRELQP 1491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||| |.|.|||||||||||||||||||||
  Rat  1430 YEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRTQSLNPASFSPL-ATQAKPEKPSTLQRPQETVIRELQP 1493

Human  1492 QQQPRTIERRDLQYITVSKEELSSGDSLSPDPWKRDAKEKLEKQQQMHIVDMLSKEIQELQSKPD 1556
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.|||:|.|
  Rat  1494 QQQPRTIERRDLQYITISKEELSSGDSLSPDPWKRDAREKLEKQQQMHIVDMLSKEIHELQNKGD 1558

Human  1557 RSAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDEEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRAR--------- 1612
            |:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||         
  Rat  1559 RTAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDDEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRARQTAMPAISV 1623

Human  1613 ---LQDEERRRQQQLEEMRKREAEDRARQEEERRRQEEERTKRDAEEKRRQEEGYYSRLEAERRR 1674
               |||||||||||||||||||.|||.||||:.|.|||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat  1624 LDLLQDEERRRQQQLEEMRKREVEDRVRQEEDGRHQEEERVKRDAEEKRRQEEGYYSRLEAERRR 1688

Human  1675 QHDEAARRLLEPEAPGLCRPPLPRDYEPPSPSPAPGAPPPPPQRNASYLKTQVLSPDSLFTAKFV 1739
            ||:||||||||||.|||.|||||:||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1689 QHEEAARRLLEPEEPGLSRPPLPQDYEPPSQSSAPSAPPPPPQRNASYLKTQVLSPDSLFTAKFV 1753

Human  1740 AYNEEEEEEDCSLAGQDKYSSTRKSHGDLLPAPLKPRPPPCQPRPASDGVFLSNSFQPPSAKANS 1804
            ||::::|||:...||||||.|||||:|.|..|..||:.|||||||||||:.|.||||||.|||:|
  Rat  1754 AYDDDDEEENYVPAGQDKYPSTRKSYGHLPLATHKPQQPPCQPRPASDGISLCNSFQPPLAKAHS 1818

Human  1805 TAHKKGQPLPPPKKSSSYHPSHCKGRGPNSYPGSTGAAVGAHDACRDAKEKRSKSQDADSPGSSG 1869
            ||:|.|||.|||.|.|.|.|.|.||||||||.||.|...|.:||.||.:||.|:|||||.|||||
  Rat  1819 TAYKAGQPPPPPGKPSLYGPGHWKGRGPNSYSGSAGTTAGTYDAPRDTREKLSRSQDADLPGSSG 1883

Human  1870 APENLTFKERQRLFSQGQDVSNKVKASRKLTELENELNTK 1909
            |||||||:|||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat  1884 APENLTFRERQRLFSQGQDVSDKVKASRKLTELENELNTK 1923

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AFDNXP_047274744.1 RA1_Afadin 20..132 CDD:340480 111/111 (100%)
RA2_Afadin 248..348 CDD:340479 97/99 (98%)
FHA_AFDN 385..503 CDD:438763 111/117 (95%)
Myo5p-like_CBD_afadin 612..940 CDD:271255 321/327 (98%)
PDZ_AFDN-like 1013..1100 CDD:467251 85/86 (99%)
DUF4670 <1470..1688 CDD:464815 202/229 (88%)
AfdnXP_063138525.1 None

Return to query results.
Submit another query.