DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AFDN and Afdn

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047274744.1 Gene:AFDN / 4301 HGNCID:7137 Length:1909 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006523815.1 Gene:Afdn / 17356 MGIID:1314653 Length:1917 Species:Mus musculus


Alignment Length:1921 Identity:1764/1921 - (91%)
Similarity:1828/1921 - (95%) Gaps:16/1921 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSST 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSST 65

Human    66 ATTQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGEERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLK 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 ATTQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGEERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLK 130

Human   131 NENDAIPPKKAQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKREKEALRQASDKDDRPFQGEDVE 195
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||::||.||:|.|
Mouse   131 NENDAIPAKKAQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKKEKEALRQASDKEERPSQGDDSE 195

Human   196 NSRLAAEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKP 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 NSRLAAEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKP 260

Human   261 NIPYKTILLSTTDPADFAVAEALEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDEKGAKEIILDDDEC 325
            |||||||||||||.|||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
Mouse   261 NIPYKTILLSTTDTADFAVAESLEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDERGAKEIILDDDEC 325

Human   326 PLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDHIPKKTKKHLEGKTPKGKERADGSGYGSTLPPEKLPYLVE 390
            |||||||||||||||||||||||||:||||.|||:|||:.|||:|||||||||.|||||||||||
Mouse   326 PLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDYIPKKMKKHVEGKSLKGKDRADGSGYGSALPPEKLPYLVE 390

Human   391 LSPGRRNHFAYYNYHTYEDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKLDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTN 455
            ||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Mouse   391 LSPGRRNHFAYYSYHTYEDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKFDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTN 455

Human   456 MDGVVTVTPRSMDAETYVEGQRISETTMLQSGMKVQFGASHVFKFVDPSQDHALAKRSVDGGLMV 520
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||::|||.|||||||||.|||.|:||||||||||
Mouse   456 MDGVVTVTPRSMDAETYVDGQRISETTMLQSGMRLQFGTSHVFKFVDPIQDHVLSKRSVDGGLMV 520

Human   521 KGPRHKPGIVQETTFDLGGDIHSGTALPTSKSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPMIRVEQQPDY 585
            ||||||||.||||||:||||:|||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||::|:.:|
Mouse   521 KGPRHKPGAVQETTFELGGDVHSGTALPASRSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPMIRLDQEQEY 585

Human   586 RRQESRTQDASGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYVLSNQ 650
            ||:|:|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse   586 RRRENRTQDATGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYVLSSQ 650

Human   651 YRPDISPTERTHKVIAVVNKMVSMMEGVIQEVDQVDQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRD 715
            :||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   651 HRPDISPTERTHKAIAVVNKMVSMMEGVIQEVDQVDQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRD 715

Human   716 LSRITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAMSL 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   716 LSRITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAMSL 780

Human   781 LRRCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLEL 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   781 LRRCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLEL 845

Human   846 AADCHLSRIVQATTLLTMDKYAPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENV 910
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   846 AADCHLSRIVQATTLLTMDKYVPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENV 910

Human   911 VTVAENTADELARSDGREVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRL 975
            |.|||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   911 VAVAENTADELARSDGRDVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRL 975

Human   976 IPHTRSPGTWTIYFEGADYESHLLRENTELAQPLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDK 1040
            :||||||||||||||||||||||:|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   976 VPHTRSPGTWTIYFEGADYESHLMRENAELAQPLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDK 1040

Human  1041 LGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYH 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1041 LGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYH 1105

Human  1106 GLATLLNQPSPMMQRISDRRGSGKPRPKSEGFELYNNSTQNGSPESPQLPWAEYSEPKKLPGDDR 1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:||.|||||||||||||
Mouse  1106 GLATLLNQPSPMMQRISDRRGSGKPRPKSEGFELYNNSAQNGSPESPQMPWTEYSEPKKLPGDDR 1170

Human  1171 LMKNRADHRSSPNVANQPPSPGGKSAYASGTTAKITSVSTGNLCTEEQTPPPRPEAYPIPTQTYT 1235
            ||||||||||||||||||||||||..|.|||.||||||||||||||||:||||||||||||||||
Mouse  1171 LMKNRADHRSSPNVANQPPSPGGKGPYTSGTAAKITSVSTGNLCTEEQSPPPRPEAYPIPTQTYT 1235

Human  1236 REYFTFPASKSQDRMAPPQNQWPNYEEKPHMHTDSNHSSIAIQRVTRSQEELREDKAYQLERHRI 1300
            |||||||||||||||||||:||||||||||:||:||||||||||||||||||||:|.|||||||:
Mouse  1236 REYFTFPASKSQDRMAPPQSQWPNYEEKPHVHTESNHSSIAIQRVTRSQEELREEKVYQLERHRV 1300

Human  1301 EAAMDRKSDSDMWINQSSSLDSSTSSQEHLNHSSKSVTPASTLTKSGPGRWKTPAAIPATPVAVS 1365
            ||.||||.|||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||:..||||||
Mouse  1301 EAGMDRKCDSDMWINQSSSVESSTSSQEHLNHSSKSVTPASTLTKSGPGRWKTPAAVLPTPVAVS 1365

Human  1366 QPIRTDLPPPPPPPPVHYAGDFDGMSMDLPLPPPPSANQIGLPSAQVAAAERRKREEHQRWYEKE 1430
            ||||||||||||||||||..:|||:.||||||||| |||.|..||||||||.:||||||||||||
Mouse  1366 QPIRTDLPPPPPPPPVHYTSEFDGIPMDLPLPPPP-ANQAGPQSAQVAAAEWKKREEHQRWYEKE 1429

Human  1431 KARLEEERERKRREQERKLGQMRTQSLNPAPFSPLTAQQMKPEKPSTLQRPQETVIRELQPQQQP 1495
            |||||||||||||||||||||||:|:||||.|||| |.|.|||||||||||||||||||||||||
Mouse  1430 KARLEEERERKRREQERKLGQMRSQTLNPASFSPL-ATQAKPEKPSTLQRPQETVIRELQPQQQP 1493

Human  1496 RTIERRDLQYITVSKEELSSGDSLSPDPWKRDAKEKLEKQQQMHIVDMLSKEIQELQSKPDRSAE 1560
            |||||:||||||:||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.|||:|.||:||
Mouse  1494 RTIERKDLQYITISKEELSSGDSLSPDPWKRDAREKLEKQQQMHIVDMLSKEIHELQNKVDRTAE 1558

Human  1561 ESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDEEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRAR------------L 1613
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||            :
Mouse  1559 ESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDDEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRARQTAMPAISVLDLM 1623

Human  1614 QDEERRRQQQLEEMRKREAEDRARQEEERRRQEEERTKRDAEEKRRQEEGYYSRLEAERRRQHDE 1678
            ||||||||||||||||||||||.||||:.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse  1624 QDEERRRQQQLEEMRKREAEDRVRQEEDGRHQEEERVKRDAEEKRRQEEGYYSRLEAERRRQHEE 1688

Human  1679 AARRLLEPEAPGLCRPPLPRDYEPPSPSPAPGAPPPPPQRNASYLKTQVLSPDSLFTAKFVAYNE 1743
            |||||||||.|||.||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||  
Mouse  1689 AARRLLEPEEPGLSRPPLPRDYEPPSLSSAPCAPPPPPQRNASYLKTQVLSPDSLFTAKFVAY-- 1751

Human  1744 EEEEEDCSLAGQDKYSSTRKSHGDLLPAPLKPRPPPCQPRPASDGVFLSNSFQPPSAKANSTAHK 1808
            :|||||...||||||.|||||||.|..|.|||:.|||||||||||:.|.||||||.|||||||:|
Mouse  1752 DEEEEDYGPAGQDKYPSTRKSHGHLPLATLKPQQPPCQPRPASDGISLCNSFQPPLAKANSTAYK 1816

Human  1809 KGQPLPPPKKSSSYHPSHCKGRGPNSYPGSTGAAVGAHDACRDAKEKRSKSQDADSPGSSGAPEN 1873
            .|||.|.|.|.|.|.|.|.||||||||.||.|.||||:||.|:|:||.::|||||.|||||||||
Mouse  1817 AGQPPPLPGKPSLYRPGHWKGRGPNSYSGSAGTAVGAYDAPREAREKLTRSQDADLPGSSGAPEN 1881

Human  1874 LTFKERQRLFSQGQDVSNKVKASRKLTELENELNTK 1909
            |||||||||||||||||:||||||||||||||||||
Mouse  1882 LTFKERQRLFSQGQDVSDKVKASRKLTELENELNTK 1917

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AFDNXP_047274744.1 RA1_Afadin 20..132 CDD:340480 111/111 (100%)
RA2_Afadin 248..348 CDD:340479 96/99 (97%)
FHA_AFDN 385..503 CDD:438763 111/117 (95%)
Myo5p-like_CBD_afadin 612..940 CDD:271255 321/327 (98%)
PDZ_AFDN-like 1013..1100 CDD:467251 86/86 (100%)
DUF4670 <1470..1688 CDD:464815 201/229 (88%)
AfdnXP_006523815.1 RA1_Afadin 20..132 CDD:340480 111/111 (100%)
RA2_Afadin 248..348 CDD:340479 96/99 (97%)
FHA_AFDN 385..503 CDD:438763 111/117 (95%)
Myo5p-like_CBD_afadin 612..940 CDD:271255 321/327 (98%)
PDZ_AFDN-like 1013..1100 CDD:467251 86/86 (100%)
DUF4670 <1456..1697 CDD:464815 210/241 (87%)
MAP7 <1623..>1698 CDD:461709 67/74 (91%)

Return to query results.
Submit another query.