DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AFDN and afdn

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047274744.1 Gene:AFDN / 4301 HGNCID:7137 Length:1909 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_031758152.1 Gene:afdn / 100493083 XenbaseID:XB-GENE-948333 Length:1902 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1938 Identity:1474/1938 - (76%)
Similarity:1650/1938 - (85%) Gaps:68/1938 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     3 AGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTAT 67
            :|.|:||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog     2 SGSREEERRKLADIINHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTAT 66

Human    68 TQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGEERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNE 132
            ||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:||.:||||||||||||||||||||||||
 Frog    67 TQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPRYSLYEVHVSGEERKLDFEEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNE 131

Human   133 NDAIPPKKAQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKREKEALRQASDKDDRPFQGEDVENS 197
            ||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||:||::.|:|::|.:|||...:|.||.
 Frog   132 NDIFPAKKAQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKRRERDILKQSTDNEDRPQVRDDSENL 196

Human   198 RLAAEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNI 262
            :||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   197 QLAMEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNI 261

Human   263 PYKTILLSTTDPADFAVAEALEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDEKGAKEIILDDDECPL 327
            |||||||||.|.|||||.|||||||:||||||:||||:|:||||||||| ||.||.||||:||||
 Frog   262 PYKTILLSTNDTADFAVIEALEKYGMEKENPKEYCIAKVVLPPGAQHSD-KGMKEFILDDEECPL 325

Human   328 QIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDHIPKKTKKHLEGKTPKGKERADGSGYGSTLPPEKLPYLVELS 392
            .|||:|||:||.|||||||||.|.:.|:.:|| |.|:.|.|||  |..|..:|.|:|||||||||
 Frog   326 HIFRDWPSEKGELVFQLKRRPTDSLLKQNRKH-ESKSGKSKER--GDHYSLSLSPDKLPYLVELS 387

Human   393 PGRRNHFAYYNYHTYEDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKLDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMD 457
                           .|||||||||||||||.|||||||||..||||||||||||.|||||.|||
 Frog   388 ---------------ADGSDSRDKPKLYRLQPSVTEVGTEKFQDNSIQLFGPGIQHHHCDLNNMD 437

Human   458 GVVTVTPRSMDAETYVEGQRISETTMLQSGMKVQFGASHVFKFVDPSQDHALAKRSVDGGLMVKG 522
            |||||||||:||:|||:|.||||||||.||:.||||:|||||||||:.||.|.||..|.|.:.|.
 Frog   438 GVVTVTPRSIDADTYVDGHRISETTMLHSGVTVQFGSSHVFKFVDPNLDHLLGKRLSDAGQIGKN 502

Human   523 PRHKPGIVQETTFDLGGDIHSGTALPTSKSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPMIRVEQQPDYRR 587
            .|.|.|: |||||.|.|::.....||.:|..::||:||....:   |||||||:||:::|.|.|.
 Frog   503 QRSKQGL-QETTFGLEGEVLGDVTLPVNKMVSKLDNDRTPGMT---ERGMVKPIIRMDKQQDQRV 563

Human   588 QESRTQDASGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYVLSNQYR 652
            |..|:||:.|||.:|||:|||||:|||:||||||||||||||||||||||||||.|||||||:||
 Frog   564 QNGRSQDSQGPENVLPANIEFRENSEDAFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMTCRYVLSNKYR 628

Human   653 PDISPTERTHKVIAVVNKMVSMMEGVIQEVDQVDQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRDLS 717
            ||.||.||||||||||||||.|||.||||:|:.:||||||||||||||||||||||||||||||:
 Frog   629 PDTSPAERTHKVIAVVNKMVGMMESVIQEIDKGNQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRDLN 693

Human   718 RITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAMSLLR 782
            |||||||||||||||||||||||||||||.:.||||:||||||..|||||:||||||||||||||
 Frog   694 RITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELTSSMPAFIDDPEENDSQRPKIEDVLHTLTGAMSLLR 758

Human   783 RCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLELAA 847
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
 Frog   759 RCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLAHIEAWAEKQGLELAA 823

Human   848 DCHLSRIVQATTLLTMDKYAPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENVVT 912
            |||||||||||||||||||:..||||||:||||||||||||||||||||||||:|||:||::||:
 Frog   824 DCHLSRIVQATTLLTMDKYSHQDIPNINNTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPYIPTELIDSVVS 888

Human   913 VAENTADELARSDGREVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRLIP 977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:|
 Frog   889 VAENTADELARSDGREVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLEPLCQRGFCRLVP 953

Human   978 HTRSPGTWTIYFEGADYESHLLRENTELAQPLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLG 1042
            |:||||.||||||||::|::||.:||:|  |||||||||||||||||||||||||||||||:|||
 Frog   954 HSRSPGMWTIYFEGAEFENNLLTDNTDL--PLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQEKLG 1016

Human  1043 IYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYHGL 1107
            ||:|||||||||:|||||||||||:||||:|||||||||||||||||.:||||||||||||||||
 Frog  1017 IYIKSVVKGGAAEVDGRLAAGDQLISVDGQSLVGLSQERAAELMTRTGAVVTLEVAKQGAIYHGL 1081

Human  1108 ATLLNQPSPMMQRISDRRGSGKPRPKSEGFELYNNSTQNGSPESPQLPWAEYSEPKKLPGDDRLM 1172
            |||||||||:|||  ||||||||||||||||||||::|||||:|||..|.||:|||||||||:||
 Frog  1082 ATLLNQPSPLMQR--DRRGSGKPRPKSEGFELYNNASQNGSPDSPQTQWPEYTEPKKLPGDDKLM 1144

Human  1173 KNRADHRSSPNVANQPPSPGGKSAYASGTTAKITSVSTGNLCTEEQTPPPRPEAYPIPTQTYTRE 1237
            ||||||||||||||||.|||||:.|:|.:|.||||||||||||||||.|.||||||||||||.||
 Frog  1145 KNRADHRSSPNVANQPQSPGGKTTYSSSSTVKITSVSTGNLCTEEQTAPARPEAYPIPTQTYARE 1209

Human  1238 YFTFPASKSQDRMAPPQNQWPNYEEKPHMHTDSNHS-SIAIQRVTRSQEELREDKAYQLERHRIE 1301
            |||||..|||||:.|.||||..||:...:...:||: :.:.|:|..|:||||::..:|.||.|:|
 Frog  1210 YFTFPTPKSQDRIGPAQNQWQGYEDNFQVQMGNNHARNTSAQQVAYSEEELRDNLTFQSERGRVE 1274

Human  1302 AA----MDRKSDSDMWINQSSSLDSSTSSQEHLNHSSKSVTPASTLTKSGPGRWKTPAAIPATPV 1362
            ..    ::....:|.|.|:.||::||.|.|:..|..:.||   .:|:|:||||||||.:..:..|
 Frog  1275 PQVRKDVEHLDGNDTWFNRGSSMESSASCQDLNNSKTHSV---GSLSKTGPGRWKTPISSQSATV 1336

Human  1363 AVSQPIRTDLPPPPPPPPVHYAGDFDGMSMDLPLPPPPSANQIGL-PSAQVAAAERRKREEHQRW 1426
            .:.||:|||| ||||||||||..:|:|:.:|||||||||.:|:|| .::|.||.||:||||||||
 Frog  1337 LLPQPVRTDL-PPPPPPPVHYGAEFEGVPIDLPLPPPPSESQLGLSTNSQAAALERKKREEHQRW 1400

Human  1427 YEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRTQ--SLNPAPFSPLT--------AQQMKPEKPSTLQRP 1481
            |||||||||||||||||||||||||:|.|  ::.|.|.:|.:        ..|.:.|||:||.|.
 Frog  1401 YEKEKARLEEERERKRREQERKLGQVRPQPPTIPPQPVNPQSPPLIPPPNVAQARTEKPATLPRQ 1465

Human  1482 QETVIRELQPQQQPRTIERRDLQYITVSKEELSSGDSLSPDPWKRDAKEKLEKQQQMHIVDMLSK 1546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1466 QETVIRELQPQQQPRTIERRDLQYITVSKEELSSSDSLSPDPWKRDAKEKLEKQQQMHIVDMLSK 1530

Human  1547 EIQELQSKPDRSAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQK--DEDDEEEEDDDVDTMLIMQRLEAER 1609
            ||.|||:||||::||:|||||||||||||||||||:||  |:||::::|||||||||||||||||
 Frog  1531 EINELQNKPDRTSEENDRLRKLMLEWQFQKRLQESQQKDDDDDDDDDDDDDVDTMLIMQRLEAER 1595

Human  1610 RAR------------LQDEERRRQQQLEEMRKREAEDRARQEEERRRQEEERTKRDAEEKRRQEE 1662
            :||            ||||||||||.|||.||||||||.|||||.|.|||||.:|:|||||||||
 Frog  1596 KARQTAMPAISILDLLQDEERRRQQHLEEARKREAEDRLRQEEEHRHQEEERARREAEEKRRQEE 1660

Human  1663 GYYSRLEAERRRQHDEAARRLLEPEAPGLCRPPLPRDYEPPSPSPAPGAPPPPPQRNASYLKTQV 1727
            .||:||||||||.|:||.||||:||.|||.||||||:||..||:..|..||||||||.||||||.
 Frog  1661 EYYNRLEAERRRIHEEAERRLLDPEEPGLYRPPLPREYELSSPTLPPNPPPPPPQRNTSYLKTQA 1725

Human  1728 LSPDSLFTAKFVAYNEEEEEEDCSLAGQDKYSSTRKSHGDLLPAPLKPRPPPCQ-PRPASDGVFL 1791
            ||||:::|||||.|.  ::|||.:|:|||||||.|||:|||.||..||:.|..: |||.|||:||
 Frog  1726 LSPDTVYTAKFVTYT--DDEEDTNLSGQDKYSSMRKSYGDLPPAAHKPQLPAARLPRPVSDGIFL 1788

Human  1792 SNSFQPPSAKANSTAHKKGQPLPPPKKSSSYHPSHCKGRGPNSYPGSTGAAVGAHDACRDAKEKR 1856
            |.|||||||.|||||.|.|.|:  ..|.|..|.|..|  |||||.||:||||..::..:|.::.|
 Frog  1789 SGSFQPPSANANSTASKTGPPI--ANKPSFLHYSSSK--GPNSYSGSSGAAVPGNEVYKDPRDVR 1849

Human  1857 SKSQDADSPGSSGAPENLTFKERQRLFSQGQDVSNKVKASRKLTELENELNTK 1909
            .||||.::..:.||||:||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
 Frog  1850 LKSQDGEAYSTGGAPESLTFKERQRLFSQGQDVSNKVKASRKLMELENELNTK 1902

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AFDNXP_047274744.1 RA1_Afadin 20..132 CDD:340480 107/111 (96%)
RA2_Afadin 248..348 CDD:340479 84/99 (85%)
FHA_AFDN 385..503 CDD:438763 88/117 (75%)
Myo5p-like_CBD_afadin 612..940 CDD:271255 298/327 (91%)
PDZ_AFDN-like 1013..1100 CDD:467251 79/86 (92%)
DUF4670 <1470..1688 CDD:464815 184/231 (80%)
afdnXP_031758152.1 RA1_Afadin 19..131 CDD:340480 107/111 (96%)
RA2_Afadin 247..346 CDD:340479 84/99 (85%)
FHA_AFDN 380..483 CDD:438763 88/117 (75%)
Myo5p-like_CBD_afadin 587..916 CDD:271255 298/328 (91%)
PDZ_AFDN-like 987..1074 CDD:467251 79/86 (92%)

Return to query results.
Submit another query.