DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment tnc and AT5G40450

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651318.3 Gene:tnc / 42990 FlyBaseID:FBgn0039257 Length:2819 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_198861.4 Gene:AT5G40450 / 834043 AraportID:AT5G40450 Length:2889 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:2946 Identity:668/2946 - (22%)
Similarity:1070/2946 - (36%) Gaps:870/2946 - (29%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   307 TEIVEITTPESATSVPAKGIHAEIPKE-------DVDLQEHIDDD-------DKNKETATIPSAE 357
            |.:|.|..|.| |.....|:.||:..|       .|:|...:||:       ..|..|.....||
plant     3 TGVVTIQEPVS-TKTDVGGVPAEVILEKSSMEVQKVNLSTVLDDEITSGADRGNNIITGEADVAE 66

  Fly   358 L--GSGEIEEEEEEKDKATTVAPVQVTDE----KDFSFEPESSTAGIP-------SDSRIDLPSS 409
            :  |||:.|.||.:::.......:.|.|:    ||   :.||.....|       .|.:|.|...
plant    67 VVNGSGDKETEELKRENGEATKTISVLDDSKIVKD---DQESIVVREPQSLNEKKEDEKIILSDV 128

  Fly   410 TEESKESSTEAAEEDIVKIVTTPEPEGSGEEDVPKP----SQIPEKEITEDE-----LIKVSTSA 465
            |.|:|:      |||     ||.:||   |..|.||    .|...|...|.|     :.||....
plant   129 TLENKK------EED-----TTGKPE---EVSVEKPVIEEDQTEAKHSLEQEEDIGNISKVCEEI 179

  Fly   466 PAKASPEEEVVTATTSAPTEEDVKPTTAGTISEEEEEGKPTPAEEGSGEEEKDVKVTAAPEETED 530
            |.|.   :||...|.|...|..|..|       |.|.......||.|...:..|..|.:.::|..
plant   180 PIKT---DEVREETDSRTVETSVNGT-------EAEHNATVSVEEISRNGDNTVNETVSEDQTAT 234

  Fly   531 EAKPTSAPVASDEKEQEPKPSEGSGDEELDLKPTTAPTAGATSASEESEEQDEGKSTEAPTSVDD 595
            :.:|.. .|.:.::|.|  |...:..|:..:..|...||..:...:|...|:|        ..:.
plant   235 DGEPLH-DVETIKREAE--PFYKTVVEDAKIVNTEETTAHESKILKEDNHQEE--------YAES 288

  Fly   596 IEPAKPTESSEEASGEGEDVAKETTPAGEASIAGEEEIVKGTTPAGEPSSEGDEEIVKGTTPAEE 660
            :|..|.::::|::|.| ..|.||.          ||:|::......|..|..:...::|.....:
plant   289 VEATKNSDAAEQSSRE-VTVDKEK----------EEDIIQNIEEVQESPSVMESPTIQGEDIESK 342

  Fly   661 SSSESEDELTKVTTPAGEPS--------VAGEEEIAKETTPAGEPSIAGEEEIVKVTTPAGE--S 715
            :|.:.|:|:.|:|....|..        |...|.:..|...|...|:. |.||:|......|  |
plant   343 ASLDHEEEMDKITKDTEEQEHVLVRDVPVPQSETLVTEAKTAETFSVQ-EAEILKTNINESEAHS 406

  Fly   716 SIAGEE---EIVKVTTPAGESSSEGEE---EIIKVTTPAGE-SSSEGDEEIVKESTPAGEPISEG 773
            :|.|||   |..:.|.|:.:...:.|:   |.:|....:.| .||:...|:..|.|   ||.|  
plant   407 AIGGEEDGQETKENTEPSKDLKDDKEQEDSETVKTIISSDEVRSSDVQAEVFGEHT---EPCS-- 466

  Fly   774 EEDVIKATTSAPKSDIEGVKE----------PETATEVPAEEVEDFAKPTTPIAEAEEEPIAGTP 828
                     |..|.|..|..|          ||..|.|..|.|.:.......:.|||:|.     
plant   467 ---------SEIKDDRHGRDESIEVKAKETGPEIETAVDGESVHEIETTERVLLEAEKEE----- 517

  Fly   829 IPTDGISGEEE-----IVKGTTP--QTLEEQPEI-SEESTEVPVAEDDLSSSTSASAIASSTEGV 885
             ..:.|..:||     |.|..|.  :.:.|:||| :.|.|.|..:|....::....|:.:| :|.
plant   518 -DKEEIKIDEEPSLNAIEKAETENVKIVIEEPEIVNNEETSVHESESLKENAEPVEAVKNS-DGT 580

  Fly   886 QDAASETTSSAPARAGDKDEAATTVPTAQDKDDEEVEQDATDLPVEDVVQSTTAKTTTTEQPKEE 950
            :..:.|.|..   ||.::|.|                      |..:.:|...:::..:.:||||
plant   581 EQISREVTVD---RAKEEDIA----------------------PKTEEIQERPSESKASLEPKEE 620

  Fly   951 ---SSTEAEDAEIEVTTSSPADKQEVPEAEPADKDHKDEEDVQTATDLPIKSDIGPPVVDTEATT 1012
               .|.|.|:.|                       |..|.|||..           ..:::||. 
plant   621 VDHISNETEEHE-----------------------HVLERDVQQC-----------ETIESEAV- 650

  Fly  1013 GQPETSDETATDKPPSVYLPPGGEKDTEKEDETTATEPSVQEEPSKPVD-------ISPVSQEVP 1070
                   ||..|..||:.|..  :|:|| |.||..|..|..|..|..|.       ..|.|.|:.
plant   651 -------ETKEDTQPSLDLKE--DKETE-EAETFKTVFSSDEVRSSAVQEEQFGEHTEPCSSEIK 705

  Fly  1071 SSTAKVDNRNDFETEKPTLPPSGEDQSSEPLPAMDLPAGIPGEGDCLVEGKTYANNTIVPATAPC 1135
            ..:...:...:.::::.....:.||:..    .:.:|:         .|.:.|..|.        
plant   706 DESHGKEESVEVKSQETVQDENTEDKHD----VLKVPS---------TESEKYQGNE-------- 749

  Fly  1136 DVSCKCISSLVACQQMECKLPENLEKCTVAADLLDGCCPTYICDESTESAEKDEESTAKPDNKID 1200
                                                  |..:...:|.|.||.|:|.:  |..::
plant   750 --------------------------------------PETVLVSNTGSYEKSEKSPS--DLVLN 774

  Fly  1201 EDVSEISTEEIPKDVIMPTGITEQPL---SHVKPDEEI-QPVTSVPAQFDESTTAK----VDKKP 1257
            .|..|::.|:|..|.:..|.|.|:|:   |:....|:| |.:|:   :.:|...||    :|.|.
plant   775 VDKEELNDEKINVDQVDGTQIMEEPIGLDSNGAEAEQIDQNITN---ETEEILVAKPVSLLDVKS 836

  Fly  1258 IDESAEDK--KPIGESEEDSKPIDESEEDKKPVEESAEDKKPVEDSEEKEKPLPTVIPASEIEKE 1320
            :::..:.|  .|...|||.||.:||..|:|...|.:...:..|:.|...|....||.....||.|
plant   837 VEQMQKPKLESPSEVSEETSKTVDEKIEEKPEEEVTLYQEGQVDGSYGLETKEETVSVPESIELE 901

  Fly  1321 SKPEDEKKTEADFAAPTEQPEATTPAQIADTAEKEVDDKLATTSAPVSGEDELKPADEKKRTETA 1385
            .:|::|:.. .| ..|.::|...:|:::.:.:.|.||:|:...:..:    ||....:::|:.|.
plant   902 EQPQEERSV-ID-PTPLQKPTLESPSEVLEESSKTVDEKIEEKTDSI----ELGEIAQEERSVTD 960

  Fly  1386 QIPDAEIPASTDEPESSTELPTVDLDKKPEEDSTKGTEAPESDKVPEVPTSASTENEIE-----E 1445
            ..|..|..:..:|.|..|:|          |......|..:||:|.|| .|||...|:|     |
plant   961 LTPLQEESSQPNEQEKETKL----------EKHEPTNEEVKSDEVIEV-LSASPSKELEGETVVE 1014

  Fly  1446 SDKFTTV-------APPKISASDETEPTA-----------EEDLVPATFEPIESE-------FEV 1485
            ::....:       |..||..|.||..|.           |:|.|....|.::.:       .::
plant  1015 AENIENIKENEEEQAAEKIQKSLETVQTVESPSSLLFSSEEQDHVTVAEEIVDEKAKEEVPMLQI 1079

  Fly  1486 STKKPAVQ------------GPPLPTLAPA---QPEKKPVDA--ETSTEADISTEP--------- 1524
            ..:..|.:            ||.|..:...   |||::..:|  :...|.:|||..         
plant  1080 KNEDDATKIHETRVEQARDIGPSLTEICSINQNQPEEQVKEACSKEEQEKEISTNSENIVNETYA 1144

  Fly  1525 --SAEVEKEASGETSESDNEIDAGASSTPVPVSADED----KTPS-------------TEKTVEA 1570
              |.|..:|.:....||.::::. ..|..:.|..:|:    ||.:             |.|||..
plant  1145 LHSVEAAEEETATNGESLDDVET-TKSVLLEVRKEEEEAEMKTDAEPRLDAIEKEELETVKTVVQ 1208

  Fly  1571 DDKFTTVAPLAGDEEESNLPKLPQDIFEEE--APVAVTTAAPSKDDGEQ----------KPVEVE 1623
            |.|..........|.||    |..|..:|:  .||..|   .:.||.||          :..::.
plant  1209 DAKIVNNEETTAHESES----LKGDNHQEKNAEPVEAT---QNLDDAEQISREVTVDTEREADIT 1266

  Fly  1624 EK--PIEDGQKPIEDETSTPTSSENEIEPESDRATTIAPSKEEPSEPSTGAPTKDEPAEPSTDAP 1686
            ||  .:::|...||    |||....:||.|                  |....|:|..:.|.|  
plant  1267 EKIEKVQEGPTVIE----TPTIQGEDIESE------------------TSLELKEEVDQSSKD-- 1307

  Fly  1687 ESDESKETPESEVPTTVAPAGEKIPTSSI----------TPDEEPTA----TSAPVAKPDEDVEK 1737
             ::|.:...|.::|.......|.:.||::          |...||.|    ||..:....|..|.
plant  1308 -TEEHEHVLERDIPQCETLKAEAVDTSTVEEAAILKTLETNISEPEAMHSETSLDLKVDKEQKEA 1371

  Fly  1738 ET------STEIPT-DA----------PASSE-EDENSSTDQIPSEVPEKKPET-PAQTPEEGDI 1783
            ||      |.|:.| ||          |.||| :||:..:::   .|..|..|| ..::.||.|:
plant  1372 ETVKTVIFSNEVGTSDAQAEEFGEHTEPCSSEIKDESQGSEE---SVEVKSKETVQGESSEEKDV 1433

  Fly  1784 ----------------------VGATAAPTTSDEVPPV-------QRLPEEVLAEIPQPSTETGI 1819
                                  |..|......:|:|.|       :....:.|.::     |:.:
plant  1434 NMLDVQSGESEKYQENEPDISLVSKTENGDKFEEIPSVVEGAGLDETTHNQTLLDV-----ESVV 1493

  Fly  1820 KQQ----DETTAAPSIDRK---EP---------------YVTEIDEEATTVAPISEKDEKPTEEE 1862
            ||.    .|...:.:||.|   :|               |..:..:||.:|....|..|:|.:||
plant  1494 KQSLDTPSEEETSKTIDEKIEDKPKEEVTLHQEGREEGSYGLDTKDEAVSVLESRELGEQPQQEE 1558

  Fly  1863 -----------KPVEQKPTGEEPSEEE---EKEKPIEQ------DVS----TEGP---VSTEASE 1900
                       |..|::....||::||   :::.|:|:      .||    :|||   ...||.:
plant  1559 LCLANEQENETKLQEEQVDKHEPTKEEVSNDQQSPVEEISNEVIQVSSASLSEGPEYETVVEAEK 1623

  Fly  1901 AGSTESSEEVKPSTE-GEVAEKPEDKQPSSTAQAPVETIPEISTELPAQD----GDK-------- 1952
            .|..:.:::::.|.| ||:.| .....|||:.:...||:.|.:.:...:|    ||.        
plant  1624 IGEEQVADKIQKSFETGEIVE-AHSSLPSSSEEKEHETVSEKTDDEKVKDAEPIGDMRERGLDIA 1687

  Fly  1953 -------PTSEAPVDSDE----DTSAPSD--EKIPSVSGEEVEGPEV----------TTASPQAA 1994
                   |:.:...|.||    ..:.|.|  ||:.|....|.:..|.          ::.||..:
plant  1688 ETTHLSLPSVDQKEDVDEIHIPSVALPLDEQEKVTSTEKGETKSSEAEDDKPDEHVDSSTSPMLS 1752

  Fly  1995 EEDELKTPA---------ESEPSSTDKVPETEYQKPEDETKADETPESVTQVSD----VATSTSA 2046
            |:::.:|..         :.|.|.|.:||:.|..|.:...:..||.|.:...||    :.||.:.
plant  1753 EKNDNETQTSKTSEDVCMQQEESGTLEVPKPEESKEDKSQEISETIEEIEATSDQTLPIETSHTD 1817

  Fly  2047 PVAGGDI--EKDEQATTASPEEEEEI---KPTIAPAAEIPQPSEKE-PVDEQEVE--------SG 2097
            .....::  |:|:|    ||::.|||   :|  ..|.::...||:. ||:..:.:        |.
plant  1818 NTLSSELVSEQDDQ----SPKKVEEIHEEEP--KEAHDVEATSERNLPVETSDADNTLSSQLVSE 1876

  Fly  2098 TKATPAESDGQPI-DEIAPATSGPIDEASTAAPTKEESTTVASAASPAVHDDEIKDVTTTQPVAD 2161
            ||.......|:.: .||.|..|.  |||..:.....|...||     ...|:...||..|..:.:
plant  1877 TKEEHKLQAGEILPTEIIPRESS--DEALVSMLASREDDKVA-----LQEDNCADDVRETNDIQE 1934

  Fly  2162 EKEVAAPQDETKTSIDVSTDSPTAQDDEKQD-KTEAPVAPTTVSSPTADS--------------- 2210
            |:.::...:|:     |....|...:||.:| ..|.|.||..:....:::               
plant  1935 ERSISVETEES-----VGETKPKEHEDEIRDAHVETPTAPIILEENDSETLIAEAKKGNEEINET 1994

  Fly  2211 ----AADSSTPTVEVPSPVEIDTKPMDDIMSQTIAPHTADGAAST-------STEDEDQAPVTVS 2264
                |.|.....|...:|...:||   |..||.| |.||....:|       .|...||.|..||
plant  1995 ERTVALDHEEEFVNHEAPKLEETK---DEKSQEI-PETAKATETTIDQTLPIGTSQADQTPSLVS 2055

  Fly  2265 PQDAEKTPVSPAPQDSDKTPSSEAPQDADEIPATATPLDDNKIPATVAPQTDDGVPATAAPLDED 2329
            .:| ::||........::|..:...| |::|.:|.|...::.|.|.|: ....|......|.:.|
plant  2056 DKD-DQTPKQVEEILEEETKETHKVQ-AEDIFSTETVPKESFIEAPVS-MLASGEDEPVTPQEGD 2117

  Fly  2330 KIQTTAAPLDEEKIPSTAAPLDDEKIPAPVSPVVFDVEPSSEKPAVSEYDGEESTEPPVHDVET- 2393
                .||...||:..|...   :||:             ...||..|:.:|.|.::..|.|..| 
plant  2118 ----YAANTQEERHVSAET---EEKV-------------GETKPKESQAEGAEKSDDQVEDESTK 2162

  Fly  2394 ---------STDEPTSDA-----------------KLKPPTSAPATPSESPATEAEIVPETAAPE 2432
                     ..|.||.:|                 :|:.........::|.::|..::.|.|..|
plant  2163 KTDVEVAGLENDYPTEEAEHGDETYSTLPVVGILTQLQTTLETERAINDSASSEVSMIKEPADQE 2227

  Fly  2433 LEK--EVPE-------------------KATEQPELEKETPEKATEQPELEKETPEKATEQPELE 2476
            .:|  :|.|                   |:.|..::::|:.......|..|....|:..|:.:::
plant  2228 EKKGDDVVESNEKDFVSDILEAKRLHGDKSGEAEKIKEESGLAGKSLPIEEINLQEEHKEEVKVQ 2292

  Fly  2477 KETPEKATEQPELEKEVTDK--ATEQPESV--DEKTTPEPVVKPSLD---STEED-----EESVE 2529
            :||.|.|...|..|..::..  :.|:.|.|  |||....   :|..|   ||.|.     |...:
plant  2293 EETREIAQVLPREEILISSSPLSAEEQEHVISDEKQEER---EPQQDFNGSTSEKISLQVEHLKD 2354

  Fly  2530 SEEESADKKDKNKET--EED-----TDKKHEEPEVPAVVSEIPQPSEEA---------VPTTGH- 2577
            .|....::||:..||  |||     .|||.::.|...|.||:.:.:::|         |...|. 
plant  2355 FETSKKEQKDETHETVKEEDQIVDIKDKKKDDEEQEIVSSEVKKDNKDARELEVGNDFVSRDGEK 2419

  Fly  2578 PLFPHLASSTTTPPAVDDRVGEEDEENTTVKLSSSTTTSTTESPVTSAPSTTTVASQQQ--QPIT 2640
            ...||.|.             |.:||...|                       |||::|  .|:.
plant  2420 EEVPHNAL-------------ENEEEMNEV-----------------------VASEKQISDPVG 2448

  Fly  2641 PPPYGHAPEYEDEYD-----EEEVFGPGTCRYAGKLYVSAQQIPRDDPCDFCFCFRSDIICLQQS 2700
            ........|:||..|     ::..|             ..:|.|:|         :||.:...::
plant  2449 VIKKASEAEHEDPVDDIKSNDDRDF-------------PTEQAPKD---------QSDEVSADET 2491

  Fly  2701 CPPPIAGCHEEPISGFCCPRYECPVSMAAVL-NITTSTTTTSTT------LPPHFLHYSHGEAVK 2758
            .|....|             .|..|..:.|| :|..::.|.:.|      ||           |:
plant  2492 VPKEAIG-------------EELKVPSSKVLDDIQENSNTEAVTNFADRDLP-----------VQ 2532

  Fly  2759 HTGCLINGRSYRVGEQIESTS 2779
            :...||  :|::...|:|.||
plant  2533 NLSELI--QSHQSPNQVEETS 2551

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
tncNP_651318.3 VWC 47..105 CDD:450195
VWC 235..296 CDD:214564
LGT <469..641 CDD:469786 38/171 (22%)
MDN1 484..1426 CDD:444083 223/996 (22%)
PRK12323 <1240..1648 CDD:481241 118/502 (24%)
MDN1 1523..2549 CDD:444083 300/1336 (22%)
VWC 2762..>2805 CDD:450195 7/18 (39%)
AT5G40450NP_198861.4 PTZ00121 <50..751 CDD:173412 200/900 (22%)
PTZ00121 <937..1789 CDD:173412 201/908 (22%)
PTZ00121 <2106..2882 CDD:173412 115/553 (21%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.