Protein Alignment Cftr and abc1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651269.1
• Gene: Cftr / 42928
• FlyBaseID: FBgn0039207
• Length: 1402
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_594585.1
• Gene: abc1 / 2542640
• PomBaseID: SPAC9E9.12C
• Length: 1427
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1427
• Identity: 396/1427 - (27%)
• Similarity: 659/1427 - (46%)
• Gaps: 253/1427 - (17%)

  Fly     5 AKPTRKNPRQHANIISQLIF--AWAIPLLYRGSRRGLNTDDL-----TQCLKEDRSEQLGDRLED 62
            :|..|.:|.|..:|.| |||  .|...::::..::.:...|:     |:|.:
pombe   186 SKVARPSPEQTCSIFS-LIFTYGWLNGIIWKSWKKPITLTDVPALPDTECTQ------------- 236

  Fly    63 QWFKELERSHRKKQKPHLRNALFRCFLGPTIINGLICFIYIVIKTLIPAVLAQLLIQFQKTPVAQ 127
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pombe   237 IWYSRFAKNDRK---------------------SLMHTILLSLKSTI------LLMVFL------ 268

  Fly   128 LRNIDVNDISISDSLNRTARAIPNYVLSQAVANSSGSPGDALFPKSLDKAGPLEPIQPPVEEVDH 192
                   .:.:|.:|..|..||..  |.|.:.|.....|::.|
pombe   269 -------SVLVSSTLFVTPLAIKK--LLQYLQNPKSDEGNSPF---------------------- 302

  Fly   193 NATAVRSILDQTVEHMWNDMNSLGAVL--VLSTLFCCFLLHHVDLRQRLMGARMRIACCSLIYRK 255
                           :|..:..:|..|  |:..|:.     ||..|..|   |::.|...:||:|
pombe   303 ---------------LWVFVLLIGPYLASVVKELYV-----HVSRRFML---RIKAAITQMIYKK 344

  Fly   256 TLRLSMKT------AGQTPAGYLINLLSNDVNRLDYGFIFMHWIWIMPLQAMLTCYLIWLNIGIP 314
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pombe   345 V--LTSKTLFVAVDGSKINLDYVYNLLAKDVDNIGEMREFIGIIARAPLEMGVSMYFLYQLLGWS 407

  Fly   315 AIVG-VVGLLLKTVP--VQTALSKVTSVLRMRIAERTDARVGIMNELVQGIQVIKMYAWEKPFQA 376
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pombe   408 AYVGLLLAILSSSFPLLVASKISRLTSIAN----TSSDERIRLTTELLKSIKITKLFGWERPMLS 468

  Fly   377 VVAEARRSEIKQIRYASYLRGFYLSTMVFTERSTLYITLAA-AALMGQTITADFVFSAASYYNIL 440
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pombe   469 RIQEKRSFEVNNMYSLTLFDIIFKSGMKIAPFISMFITFAIYTKIMGHQLTPATAFTSISMFGLL 533

  Fly   441 QLVAAIWYPLAVSFGAEALVSLRRIQDFLMLEGREERTQGLTHKRDQEGGDSRAVTIKDINASWD 505
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pombe   534 R-YQFIWLASVSRQFIQFKVSLKRVDNFVY--------GNMVNDSSIESSDS--FVFENTSLSWS 587

  Fly   506 IEKPQKT---LQSINLQIEKGQLCAVIGPVGAGKSSILQLLLGELPVIDGGV---FIQGDLSYAA 564
             ..|...   |:::|..|.:.|...|:|..|:|||::...|||||.||.|.:   .|...::|..
pombe   588 -PTPSTALFQLKNLNFTIPRNQFTLVVGSTGSGKSTLAMALLGELHVISGKMTTPSISQRIAYVP 651

  Fly   565 QEPWLFTGSVRNNILFGEEFDRKRYQEVTRCCALSTDFQQLPNGDKTLVGERGASLSGGQRARIS 629
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pombe   652 QAAWLRNGTIRSNILFGEPYDEERYFQIIKACCLDSDLNSMNDGDLTYIHSNGSSLSGGQKQRVS 716

  Fly   630 LARAVYKPAQIYLMDDPLSAVDAHVGRHLFDEVIGPRGRLAQLKATRILVTHQVHF---LSEADV 691
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pombe   717 LARALYSNAEVYIFDDIFSALDVSTSRKIYESCF--LSTLLQHK-TIILFTHNVSLCLPIAENVI 778

  Fly   692 IVIVDQGRILRQGTYQELINSDLDFARLLERPKEEEEGENSRNQTSPLSVNSLESDDEDIPFIDG 756
            ::.....:::...:.|||:.|.. |:...::...|||              :||..
pombe   779 VLKNSTAQLVSPDSIQELVPSTF-FSSNTKKDNIEEE--------------NLEPH--------- 819

  Fly   757 VKDGYQQLRKQSSSVHGSKSLDST--QLDDNVDEDDLAEAQASGGISPRVWYEYFHAGSTLLSFS 819
                             |.|.|||  ...||.::.|.| :.:|..:....:.:||.:...:|.
pombe   820 -----------------SFSFDSTLASSSDNDEQRDFA-SNSSIVLLGLHYLKYFGSNKYILG-- 864

  Fly   820 FMVFVMVMSQVVCSSSDFFANIWTQQEHQRSQGEATF-----STFECMYIYGALIIAVVIMTTFR 879
             .:.:::||||..:|..|:..:|:        |.:.|     |:|..::.|..|:....:|...|
pombe   865 -SILLVMMSQVSLASIHFWIALWS--------GNSLFSLKLPSSFSFLWGYAILLFIYFLMDLSR 920

  Fly   880 GFLFFKICMHASKVLHDRMFACILHATMRFFDTTPSGRILNRFSKDMGAIDELLPRAMMDFIQIA 944
            ...|.|....||:.:||.:...:|::.:.:|:.|.:|||||||||||.|.|.||..::...:
pombe   921 AITFAKGGRTASENIHDILSERVLYSPLHWFEKTAAGRILNRFSKDMYATDNLLWASLEGML--- 982

  Fly   945 LVMFGILIVIGILNPVLVAAMLVV--AVVDVLIL---KLYLRPSQDLKRLEGICRSPVFSHLSAS 1004
            |.:..|||.  :||..||..:.:|  |.|.:|:.   ..|.:..:.|..|:....||||:.|..:
pombe   983 LCVMAILIT--MLNVTLVMPIFMVPAAFVSLLVYLHGYAYSKAQKQLTSLQSSRTSPVFTMLGET 1045

  Fly  1005 LTGLAIIRSRQLQDVVAKE-----FDLLQDVHSSVWQLTMAVNTTLGLWLDCVSCIFLTSVTFS- 1063
            |.|:.:||:.:.:.:...|     .|::|.::     ::.|:|..|.:..|.:|.:    |.||
pombe  1046 LGGITVIRAFKKEKIFEHENMAFIDDMIQPLY-----ISFAINRWLAIRTDGISGL----VGFST 1101

  Fly  1064 --FIISSETTYSGNVGLAIAQAMILTGMVQYGVRQVAESLQQMTSVERVLQYTEL---EQEPALG 1123
              ..:..:....|.||.::..|:.....|...||...|.|..:.:..|:.:|..|   :.|.:..
pombe  1102 GLIALLRQNIPPGLVGFSLNSAIGFNISVLVFVRANNEILTYINNFRRLYEYMLLPSEKNESSCL 1166

  Fly  1124 EKTPPQQWPTRGQVEFRNMSCRYDPNGSPVLRNLNLTIEAGWKVGIVGRTGAGKSSLIGALFRLA 1188
            .|...::|||.|.|..:|::..|....:.||.::||.|....|:.||||||:|||::...|.|..
pombe  1167 TKPMNKEWPTLGHVSIKNLTVSYSIGQAAVLEDINLEILPKEKIAIVGRTGSGKSTMGLTLLRFT 1231

  Fly  1189 HI-EGEIFIDGIETGTISLEILRTRISIIPQDPVLFSATIRYNLDPFERYTDAELWSALEDVELR 1252
            .| .|.:.:|||:..::.||:||.|||:|||||||.|.|:|.||||||.|.|.||...|:.....
pombe  1232 MIMSGAVEVDGIDINSLDLEVLRQRISLIPQDPVLISGTVRSNLDPFEEYGDGELNEILKTASCE 1296

  Fly  1253 KAIPG------------LDYMVTERGGNFSVGQRQLLCLARAILRNNKVLVLDEATANVDPQTDA 1305
            ..:..            ||..|...|.|||.||||:|.||||::|.:::::|||:||:||..||.
pombe  1297 SLVQASNKNSLDAFAIHLDTPVDSGGVNFSSGQRQILALARALVRKSRIVILDESTASVDDTTDR 1361

  Fly  1306 LIQRTIRIKFKQCTVLTVAHRLHTVMDSDRIIVMDAGVAVEFDVPYLLLKKSQGHLRQMVEA 1367
            .||:.:|..||..|||.:|||:.|::|.|:::|:|:|..|||..|..|..:.:...:...|:
pombe  1362 RIQQMLRAAFKHATVLCIAHRIKTIVDYDKVLVLDSGKTVEFGSPKSLYTQRRAFWKMCKES 1423

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cftr	NP_651269.1	MRP_assoc_pro	12..1356	CDD:188098	393/1407 (28%)
abc1	NP_594585.1	MRP_assoc_pro	166..1423	CDD:188098	395/1425 (28%)