DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Cftr and Cftr

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651269.1 Gene:Cftr / 42928 FlyBaseID:FBgn0039207 Length:1402 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_312930.5 Gene:Cftr / 1273896 VectorBaseID:AGAMI1_011650 Length:1450 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1454 Identity:846/1454 - (58%)
Similarity:1065/1454 - (73%) Gaps:86/1454 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MDSSAKPTRKNPRQHANIISQLIFAWAIPLLYRGSRRGLNTDDLTQCLKEDRSEQLGDRLEDQWF 65
            ||||.||.:||||:.|..:|||.|.|.:||.||||||||..||||:|||.||||.|||.||:||.
Mosquito     1 MDSSTKPVKKNPRKGAFCLSQLFFGWLLPLFYRGSRRGLGKDDLTKCLKADRSEDLGDELEEQWE 65

  Fly    66 KELERSHRKKQKPHLRNALFRCFLGPTIINGLICFIYIVIKTLIPAVLAQLLIQFQK-------- 122
            ||:.::....::|.|||||||.|...::.:|.:.|::::|||::|.||||||:|||:        
Mosquito    66 KEVSQARIASREPKLRNALFRTFYKQSLFDGFLIFLFVLIKTILPVVLAQLLVQFQEPTNSTHVA 130

  Fly   123 ------------------------TPVAQLRNIDVNDISISDSLNRTARAIPNYVLSQAVANSSG 163
                                    |..:.|.|:..::.::.:...|..|.        .:.:...
Mosquito   131 VVNMNNDVFSTVPPMAMPLMMLPDTTQSHLENLVFDETAMINKRRRKRRI--------RIEDDKP 187

  Fly   164 SPGDAL---FPKSLDKAGPLE-PIQPPVEEV----DHNATAVRSILDQT---VEHMWNDMNSLGA 217
            :||:::   .|....:|..:| .|.|.:.|.    |.:|||..:::|..   :.|.|||...|..
Mosquito   188 APGNSIGGSKPNVAQEAEAMETTILPDLSEQFGADDPSATANSTVVDDLSDFLHHAWNDAFWLSG 252

  Fly   218 VLVLSTLFCCFLLHHVDLRQRLMGARMRIACCSLIYRKTLRLSMKTAGQTPAGYLINLLSNDVNR 282
            :|||.||..||..||.|||:||:||||||||||||||||||:|.|.||||||||:||||||||:|
Mosquito   253 LLVLLTLLGCFCCHHSDLRERLVGARMRIACCSLIYRKTLRMSRKAAGQTPAGYMINLLSNDVSR 317

  Fly   283 LDYGFIFMHWIWIMPLQAMLTCYLIWLNIGIPAIVGVVGLLLKTVPVQTALSKVTSVLRMRIAER 347
            ||||||::|::|::|.||..||||||..:...|||||||||:||:||||.||:::|::|||:|::
Mosquito   318 LDYGFIYVHYVWVLPFQACFTCYLIWRRVQWAAIVGVVGLLVKTIPVQTGLSRLSSIIRMRVAKK 382

  Fly   348 TDARVGIMNELVQGIQVIKMYAWEKPFQAVVAEARRSEIKQIRYASYLRGFYLSTMVFTERSTLY 412
            ||.||||||||:|||||||||||||||..||:.||:.|::|||:|||:||.|||||||||||||:
Mosquito   383 TDQRVGIMNELIQGIQVIKMYAWEKPFHKVVSLARKKEVRQIRWASYIRGIYLSTMVFTERSTLF 447

  Fly   413 ITLAAAALMGQTITADFVFSAASYYNILQLVAAIWYPLAVSFGAEALVSLRRIQDFLMLEGRE-- 475
            :.:|...:.|:.||||.||..|.::|||||.|||:||||||.|||||||:.|||:||.|:..:  
Mosquito   448 LAIACCVIEGRAITADIVFPMAQFFNILQLTAAIFYPLAVSLGAEALVSIDRIQEFLALQEHDAT 512

  Fly   476 ----ERTQGLTHKRD-------QEGGDSRAVTIKDINASWDIEKPQKTLQSINLQIEKGQLCAVI 529
                ..|.||  ||:       .|..:..|:.::::.|||: |...|||:.|:::||.|:|.|||
Mosquito   513 PPSASATGGL--KRNLNDLHLLAEHDNKPAIELQNVTASWE-ETTDKTLKDISVKIEPGRLLAVI 574

  Fly   530 GPVGAGKSSILQLLLGELPVIDGGVFIQGDLSYAAQEPWLFTGSVRNNILFGEEFDRKRYQEVTR 594
            |||||||||:||:||||||:.:|...|.||:||.:||||||||:||||||||..:||.|||.|.|
Mosquito   575 GPVGAGKSSLLQMLLGELPIQNGTATINGDVSYGSQEPWLFTGTVRNNILFGLPYDRHRYQAVVR 639

  Fly   595 CCALSTDFQQLPNGDKTLVGERGASLSGGQRARISLARAVYKPAQIYLMDDPLSAVDAHVGRHLF 659
            .|||:|||||||:||||:|||||.|||||||||:|||||||..|.|||:||||||||||||:|||
Mosquito   640 HCALTTDFQQLPDGDKTVVGERGTSLSGGQRARVSLARAVYNNASIYLLDDPLSAVDAHVGKHLF 704

  Fly   660 DEVIGPRGRLAQ-LKATRILVTHQVHFLSEADVIVIVDQGRILRQGTYQELINSDLDFARLLERP 723
            ||||||||.||| .||||:|||||||||.|||.|||::.|:|:.||||.||.|..:||.:||:..
Mosquito   705 DEVIGPRGYLAQKQKATRVLVTHQVHFLKEADWIVIIEGGKIVTQGTYTELANGKVDFGKLLKSG 769

  Fly   724 KEEEEGENSRNQTSPLSVNSLESDDEDIPFIDGVK-DGYQQLRKQSSSVHG-SKSLDSTQLDDNV 786
            :.|:.|.:.       ||.:.:..:::|||||||. |||:.|:..:.|:.| :.|..::.:.||:
Mosquito   770 EPEKGGADD-------SVLAADIPEDEIPFIDGVTLDGYKLLKGSTVSLRGVTPSSCASSVADNL 827

  Fly   787 DEDDLAEAQASGGISPRVWYEYFHAGSTLLSFSFMVFVMVMSQVVCSSSDFFANIWTQQEHQRSQ 851
            .. .:||.||.|.||.|:|..||.:|..:|...|...:::.||.:.|.||:|...||:||..|..
Mosquito   828 GR-QVAEDQAEGTISWRIWATYFLSGGNVLMLLFTFLMLLFSQAIVSGSDYFVTYWTRQEELRLV 891

  Fly   852 GEATFST--FECMYIYGALIIAVVIMTTFRGFLFFKICMHASKVLHDRMFACILHATMRFFDTTP 914
            .|...:|  .:.:|.||.:||.||:.|.|||:|||.|||.||:.|||||||.:|.|.||||||.|
Mosquito   892 NERAVTTTKVDFLYTYGVIIIGVVVFTIFRGYLFFNICMKASRNLHDRMFARMLTAPMRFFDTNP 956

  Fly   915 SGRILNRFSKDMGAIDELLPRAMMDFIQIALVMFGILIVIGILNPVLVAAMLVVAVVDVLILKLY 979
            ||||||||||||||||||||:||::.|||.|||.|||.:|.|:||:|:..:|...::..:.||||
Mosquito   957 SGRILNRFSKDMGAIDELLPKAMIEAIQILLVMTGILTMITIVNPLLLLPLLGAVLLYAIALKLY 1021

  Fly   980 LRPSQDLKRLEGICRSPVFSHLSASLTGLAIIRSRQLQDVVAKEFDLLQDVHSSVWQLTMAVNTT 1044
            |||.||:||||||.||||||||||:|:||:.||:..:|:.:.:|||.||:|||:||||||:.|..
Mosquito  1022 LRPIQDMKRLEGITRSPVFSHLSATLSGLSTIRASGVQEKIREEFDDLQNVHSAVWQLTMSSNAA 1086

  Fly  1045 LGLWLDCVSCIFLTSVTFSFIISSETTYSGNVGLAIAQAMILTGMVQYGVRQVAESLQQMTSVER 1109
            |||||||:|..|:..||||||:..:.|||.||||||:||:|||||||||:||..||:||||:|||
Mosquito  1087 LGLWLDCISTAFVACVTFSFIVLHQDTYSANVGLAISQALILTGMVQYGIRQTTESIQQMTAVER 1151

  Fly  1110 VLQYTEL--EQEPALGEKTPPQQWPTRGQVEFRNMSCRYDPNGSPVLRNLNLTIEAGWKVGIVGR 1172
            |:||||:  |.:|   .|.||..||.:||::|.|||..|:.:..|||:||.|.||..||||||||
Mosquito  1152 VVQYTEIASETDP---PKVPPGDWPWKGQIQFHNMSLCYEQDAPPVLKNLELVIEPTWKVGIVGR 1213

  Fly  1173 TGAGKSSLIGALFRLAHIEGEIFIDGIETGTISLEILRTRISIIPQDPVLFSATIRYNLDPFERY 1237
            ||||||||||||||||.|||.|.||||:||.||||.||::||||||||||||||||||||||..|
Mosquito  1214 TGAGKSSLIGALFRLARIEGRIMIDGIDTGVISLEALRSKISIIPQDPVLFSATIRYNLDPFSLY 1278

  Fly  1238 TDAELWSALEDVELRKAIPGLDYMVTERGGNFSVGQRQLLCLARAILRNNKVLVLDEATANVDPQ 1302
            .|..||.|:.:||||.||.|||:||||.|.|||||||||:|||||||||||:|||||||||||||
Mosquito  1279 DDDMLWRAIGEVELRSAISGLDFMVTEGGTNFSVGQRQLICLARAILRNNKILVLDEATANVDPQ 1343

  Fly  1303 TDALIQRTIRIKFKQCTVLTVAHRLHTVMDSDRIIVMDAGVAVEFDVPYLLLKKSQGHLRQMVEA 1367
            ||||||:|||.|||.|||||||||||||||||||:|||||.|.|||.|::||::..|.|:.||||
Mosquito  1344 TDALIQKTIREKFKHCTVLTVAHRLHTVMDSDRILVMDAGEAREFDTPHILLQQEGGILKDMVEA 1408

  Fly  1368 TG-GESEALKKTASDSHKRMQRER 1390
            || .|||:||:.|::::.:|...|
Mosquito  1409 TGPSESESLKRIAAETYAQMDPNR 1432

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CftrNP_651269.1 MRP_assoc_pro 12..1356 CDD:188098 822/1406 (58%)
CftrXP_312930.5 MRP_assoc_pro <276..1404 CDD:188098 708/1136 (62%)

Return to query results.
Submit another query.