Protein Alignment Cftr and cftr

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651269.1
• Gene: Cftr / 42928
• FlyBaseID: FBgn0039207
• Length: 1402
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031754831.1
• Gene: cftr / 100486085
• XenbaseID: XB-GENE-853972
• Length: 1485
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1593
• Identity: 450/1593 - (28%)
• Similarity: 747/1593 - (46%)
• Gaps: 315/1593 - (19%)

  Fly     9 RKNPRQHANIISQLIFAWAIPLLYRGSRRGLNTDDLTQCLKEDRSEQLGDRLEDQWFKELERSHR 73
            :::|.:.|:|.||:.|:|..|:|::|.|:.|...|:.|....|.::.|.:|||.:|.:|:..|
 Frog     2 QRSPLEKASIFSQIFFSWTKPILWKGYRQRLELSDIYQIHPGDSADNLSERLEREWDREVATS-- 64

  Fly    74 KKQKPHLRNALFRCFLGPTIINGLICFIYIVIKTLIPAVLAQLLIQFQKTPVAQLRNIDVNDISI 138
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 Frog    65 -KKNPKLINALKRCFFWKFLFYGILLYLGEVTKAVQPLLLGRIIASY------------------ 110

  Fly   139 SDSLNRTARAIPNYVLSQAVANSSGSPGDALFPKSLDKAGPLEPIQPPVEEVDHNATAVRSILDQ 203
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 Frog   111 -DRDNEHERSIAYYL------------------------------------------AIGLCL-- 130

  Fly   204 TVEHMWNDMNSLGAVLVLSTLFCCFLLHHVDLRQRLMGARMRIACCSLIYRKTLRLSMKTAGQTP 268
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 Frog   131 -----------LFVVRMLLLHPAIFGLHHI-------GMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKIS 177

  Fly   269 AGYLINLLSNDVNRLDYGFIFMHWIWIMPLQAMLTCYLIWLNIGIPAIVGVVGLLLKTVPVQTAL 333
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 Frog   178 TGQLVSLLSNNLNKFDEGLALAHFVWIAPLQVLLLMGLLWDLLQASAFCG-LGFLIILALFQAWL 241

  Fly   334 SKVTSVLRMRIAERTDARVGIMNELVQGIQVIKMYAWEKPFQAVVAEARRSEIKQIRYASYLRGF 398
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 Frog   242 GRMMMKYRDKRAGKINERLVITSEIIENIQSVKAYCWESAMEKIIETIRETELKLTRKAAYVRYF 306

  Fly   399 YLSTMVFTERSTLYITLAAAALMGQTITADFVFSAASYYNILQLVAAIWYPLAVSFGAEALVSLR 463
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 Frog   307 NSSAFFFSGFFVVFLCIVPHLLL-DGISLRKIFTTISFSIVLRMAVTRQFPWAVQTWYDSLGVIN 370

  Fly   464 RIQDFLMLEGREERTQGLTHKRDQEGGDSRAVTIKDINASWD------IEKPQK----------- 511
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 Frog   371 KIQEFLQKEEYKSLEYNLT---------TTEVAMENVSASWDEGIGEFFEKAKQEVNGGNISNED 426

  Fly   512 --------------TLQSINLQIEKGQLCAVIGPVGAGKSSILQLLLGELPVIDGGVFIQGDLSY 562
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 Frog   427 PSPFFSNFSLHVAPVLRNINFKIEKGQLLAIAGSTGAGKTSLLMMIMGELEPSAGKIKHSGRISF 491

  Fly   563 AAQEPWLFTGSVRNNILFGEEFDRKRYQEVTRCCALSTDFQQLPNGDKTLVGERGASLSGGQRAR 627
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 Frog   492 SPQVSWIMPGTIKENIIFGVSYDQYRYLSVIKACQLEEDISKFPEKDNTVLGEGGITLSGGQRAR 556

  Fly   628 ISLARAVYKPAQIYLMDDPLSAVDAHVGRHLFDEVIGPRGRLAQLKA--TRILVTHQVHFLSEAD 690
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 Frog   557 ISLARAVYKDADLYLMDSPFSYLDLFTEKEIFESCV------CKLMANKTRILVTSKVEQLKKAD 615

  Fly   691 VIVIVDQGRILRQGTYQELINSDLDFA-------------------RLLERPKEEEEGENSRNQT 736
            .::|:.:|.....||:.||.:...:|:                   ..|.|...:.:....||:.
 Frog   616 KVLILHEGSCYFYGTFSELQDQRPEFSSHLTGFDHFNAERRNSIITETLRRCSIDSDPTAVRNEV 680

  Fly   737 SPLS---------------VNSLES-----------------DDEDIPFIDGVK----------- 758
            ...|               :|..:|                 ::||||...|.:
 Frog   681 KNKSFKQVADFSEKRKNSVINPRKSSRKFSIMQKSQPQMSGIEEEDIPPNQGERKLSLVPESEQG 745

  Fly   759 -------------DGYQQLRKQS---------------------SSVH----GSKSLDSTQLD-- 783
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 Frog   746 EASLPRSNVLNTGPTFQGRRRQSVLNLMTRTSVSQGSNAFATRNTSVRKMSVGSFSNSSFEVDIY 810

  Fly   784 -------------DNVDEDDLAEAQASGGISP---RVWYEYFHAGSTLLSFSF-MVF--VMVMSQ 829
                         :.::|:||.|.......||   ..|..|....:...:|.| :||  |:.:::
 Frog   811 NRRLSQDSILEVSEEINEEDLKECFLDDTDSPSPTTTWNTYIRFLTAHKNFIFILVFCIVIFLAE 875

  Fly   830 VVCSSSDFFANIW-----------TQQEHQRSQGE-----ATFSTF-ECMYIYGALIIAVVIMTT 877
            |:.||    |.:|           |..|:.....:     .|.::| ...|||..:..:::.:..
 Frog   876 VIASS----AGLWIIKRNAPVSNMTSNENISEASDILSVIVTHTSFYYVFYIYVGVADSLLALGI 936

  Fly   878 FRGFLFFKICMHASKVLHDRMFACILHATMRFFDTTPSGRILNRFSKDMGAIDELLPRAMMDFIQ 942
            |||.......:..|:|||.:|...||||.|..|:|..:||||||||||...:|::||.::.||.|
 Frog   937 FRGLPLVHSLISVSRVLHKKMLHSILHAPMSTFNTMRAGRILNRFSKDTAILDDILPLSIFDFTQ 1001

  Fly   943 IALVMFGILIVIGILNPVLVAAMLVVAVVDVLILKLYLRPSQDLKRLEGICRSPVFSHLSASLTG 1007
            :.|::.|.:.|:.:|.|.:..|.:.|....:|:...:|..||.||:||...|||:|:||..||.|
 Frog  1002 LVLIVIGAITVVSLLEPYIFLATVPVIAAFILLRSYFLHTSQQLKQLESEARSPIFAHLITSLKG 1066

  Fly  1008 LAIIRSRQLQDVVAKEFDLLQDVHSSVWQLTMAVNTTLGLWLDCVSCIFLTSVTFSFIISSETTY 1072
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 Frog  1067 LWTLRAFGRQPYFETLFHKALNLHTANWFLYLSTLRWFQMTIEMIFVIFFIAVSF---ISIATSG 1128

  Fly  1073 SG--NVGLAIAQAMILTGMVQYGVRQVAESLQQMTSVERVLQYTELEQEPALGEKT--------- 1126
            :|  .||:.:..||.:...:|:.|....:....|.||.|:.::.::.:|..:.:..
 Frog  1129 AGEEKVGIVLTLAMNIMNTLQWAVNASIDVDSLMRSVSRIFRFIDMPREELIHDNNHKDDQLSEV 1193

  Fly  1127 ---------PPQQWPTRGQVEFRNMSCRYDPNGSPVLRNLNLTIEAGWKVGIVGRTGAGKSSLIG 1182
                     ..|.||:.||:..:|:|.:|...|..||.|::.::..|.:||::||||:|||:|:.
 Frog  1194 LIYENDYIKKNQVWPSGGQMTVKNLSAKYKDGGHTVLENISFSLNPGQRVGLLGRTGSGKSTLLS 1258

  Fly  1183 ALFRLAHIEGEIFIDGIETGTISLEILRTRISIIPQDPVLFSATIRYNLDPFERYTDAELWSALE 1247
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 Frog  1259 AFLRLLSTQGDIQIDGVSWQTIPLQKWRKAFGVVPQKVFIFSGTIRKNLDPYGKWSDEELLKVTE 1323

  Fly  1248 DVELRKAI---PG-LDYMVTERGGNFSVGQRQLLCLARAILRNNKVLVLDEATANVDPQTDALIQ 1308
            :|.|:..|   || ||:::.:.|...|.|.:||:||||::|...|:|:|||.:|::||.|..:|:
 Frog  1324 EVGLKSIIDQFPGQLDFVLLDGGCVLSHGHKQLVCLARSVLSKAKILLLDEPSAHLDPITFQIIR 1388

  Fly  1309 RTIRIKFKQCTVLTVAHRLHTVMDSDRIIVMDAGVAVEFD-VPYLLLKKSQGHLRQMVEATGGES 1372
            :|::..|..|||:...|||..:::....:|::.....::| :..|:.:||  ..:|.:    .:|
 Frog  1389 KTLKHAFANCTVILSEHRLEAMLECQHFLVIEDNTVRQYDSIQKLMNEKS--FFKQAI----SQS 1447

  Fly  1373 EALKKTASDSHKRMQRERDERDRD---QDESQE 1402
            :.||  ....|:|...:|..|.:.   |:|::|
 Frog  1448 DRLK--LFPLHRRNSSKRKSRPKISALQEETEE 1478

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cftr	NP_651269.1	MRP_assoc_pro	12..1356	CDD:188098	437/1539 (28%)
cftr	XP_031754831.1	CFTR_protein	1..1472	CDD:273530	447/1585 (28%)