Protein Alignment Root and CROCC

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651216.2
• Gene: Root / 42860
• FlyBaseID: FBgn0039152
• Length: 2048
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_055490.4
• Gene: CROCC / 9696
• HGNCID: 21299
• Length: 2017
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 2003
• Identity: 554/2003 - (27%)
• Similarity: 986/2003 - (49%)
• Gaps: 238/2003 - (11%)

  Fly    87 DPSALLRQNQELRQRLADESHSYRRRLDTYKQAQHNQANLVSRLQSKIQQYRQRCSDLEERMHET 151
            :|..|:||:.|||::|.:|..||||:|..|::.|..||.||.|||.||.||::|||:||:::.|
Human   133 EPRGLVRQSVELRRQLQEEQASYRRKLQAYQEGQQRQAQLVQRLQGKILQYKKRCSELEQQLLE- 196

  Fly   152 IKPTAGVGPKLTTGPTNQVLCSTSLTLGQSSLPCSSSLDSPPPSCSRDYVDDVLVTGGGAGAAEL 216
                                  .|..|.|..|..:..        |:| ::..|:
Human   197 ----------------------RSGELEQQRLRDTEH--------SQD-LESALI---------- 220

  Fly   217 CRKLEEEHQRCEQIVAQNSALRQQLEESNRTNEALTNDLQKLTNDWASLRDELLIKEDEFKEEEQ 281
              :||||.||...:...|:.||:||:::...|:||:.|::|:||||...|.||..:|..::.||:
Human   221 --RLEEEQQRSASLAQVNAMLREQLDQAGSANQALSEDIRKVTNDWTRCRKELEHREAAWRREEE 283

  Fly   282 AFKDYYNSEHNRLLKMWREVVAVKRSFKEMQTAMKAEVAKMGQEINCVGKDIN----GSNATVAF 342
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Human   284 SFNAYFSNEHSRLLLLWRQVVGFRRLVSEVKMFTERDLLQLGGELARTSRAVQEAGLGLSTGLRL 348

  Fly   343 AVQQAKRA--------------------ADDELKQSQRSND----ELQNQLATLKVQYESARHEI 383
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Human   349 AESRAEAALEKQALLQAQLEEQLRDKVLREKDLAQQQMQSDLDKADLSARVTELGLAVKRLEKQN 413

  Fly   384 MERDQRLLELMNQLKKLEDRCAQAESQAALASRYSDEIERLNNSMREIAQAVVQDAEN------A 442
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Human   414 LEKDQVNKDLTEKLEALES--LRLQEQAALE---TEDGEGLQQTLRDLAQAVLSDSESGVQLSGS 473

  Fly   443 DREADAEVTGGVMQHMHLTRDAASVVGGAGGAGS------TAGGGGKSPRRNSTRASQAFAEGTI 501
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Human   474 ERTADA--SNGSLR-------------GLSGQRTPSPPRRSSPGRGRSPRRGPSPACS--DSSTL 521

  Fly   502 SAVQAALHKYQLALHDMQVKFQNTSETLRTTKAQLETSEGTKQLLTTKMQQLTEKLDSSNSKLSE 566
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Human   522 ALIHSALHKRQLQVQDMRGRYEASQDLLGTLRKQLSDSESERRALEEQLQRLRDKTDGA------ 580

  Fly   567 LLQERESLQRGLDDIR-----VQKQQSEMGRA--DINSAFENLSSDYEKMQLNCGKLQKRIDSME 624
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Human   581 -MQAHEDAQREVQRLRSANELLSREKSNLAHSLQVAQQQAEELRQEREKLQAAQEELRRQRDRLE 644

  Fly   625 EDKKAVELEIQRILKDKNITELNLRSEEDRSSRLREETISLREELNRVSLNRDLLEQQRIESDNL 689
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Human   645 EEQEDAVQDGARVRRELERSHRQLEQLEGKRSVLAKELVEVREALSRATLQRDMLQAEKAEVAEA 709

  Fly   690 INLLEKQKSDLEYDLDKLLLEKCDLQEKHEKLSNNSCSTSDELKSVQNCLQEAQEERKKLRIQSV 754
            :...|..:.:||..:.||..|:..||:...|||..:.|.:.:...:...:.:.:||:..|:.:..
Human   710 LTKAEAGRVELELSMTKLRAEEASLQDSLSKLSALNESLAQDKLDLNRLVAQLEEEKSALQGRQR 774

  Fly   755 DQCNEIGELKKELAILDKARLELETDNLSAGEKLKCLQLEKEKILQDLACVTRDRGDIHNQLTAM 819
            ....|....::|...|::.|||.|.........|:..:..:|.:.|.|..:..:|..:..||..:
Human   775 QAEQEATVAREEQERLEELRLEQEVARQGLEGSLRVAEQAQEALEQQLPTLRHERSQLQEQLAQL 839

  Fly   820 CRKKEALNEELMRTRQRLEQTTETNSRLNRNLEEMVKDVEEKQVVIDLHEKDTHRLNELLAALRS 884
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Human   840 SRQLSGREQELEQARREAQRQVEALERAAREKEALAKEHAGLAVQLVAAEREGRTLSEEATRLRL 904

  Fly   885 EKESLESVLFDTNTSLEATEERRSQLERDLQEALVREESLKNHVARLQKELEQCQRKAQETK--- 946
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Human   905 EKEALEGSLFEVQRQLAQLEARREQLEAEGQALLLAKETLTGELAGLRQQIIATQEKASLDKELM 969

  Fly   947 -TQLLNAARAAESDFNQKIA----NLQAC--AEEAAKRHGE-EILQLRNALEKRMQQALQALQTA 1003
             .:|:.|.|.|::...::.|    :||..  .:|||.|..| |..||::.|::..::.|..|:..
Human   970 AQKLVQAEREAQASLREQRAAHEEDLQRLQREKEAAWRELEAERAQLQSQLQREQEELLARLEAE 1034

  Fly  1004 KDDEIEKLQERLATLQAHLESLVQQHEEALIRAESEKQQALLIAHRDKQAVAERLEAVSRDLKTE 1068
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Human  1035 K----EELSEEIAALQ-------QERDEGLLLAESEKQQALSLKESEKTALSEKLMGTRHSLATI 1088

  Fly  1069 QESLDRSRREANARDEKQRAAIAQLKDEMVQMRTKEEEHKIKLEECIRKQELQLSSLREERESLC 1133
            ...::|.:|:|.:|.|:.|:.:..|..|:..:|.:.||......:.:|:.:.|...|.::|:|..
Human  1089 SLEMERQKRDAQSRQEQDRSTVNALTSELRDLRAQREEAAAAHAQEVRRLQEQARDLGKQRDSCL 1153

  Fly  1134 RVSEELKMEIRLKEDRMESTNNELQDALRKSKEGEGFIDSLRKELTDCRRQLADSNIERDKYSGS 1198
            |.:|||:.::||.||..:....||.:|.||.:|.:...:..|:|..:.||.|.:...||:....|
Human  1154 REAEELRTQLRLLEDARDGLRRELLEAQRKLRESQEGREVQRQEAGELRRSLGEGAKEREALRRS 1218

  Fly  1199 NKELRDHVKRVESAKREQARAIEEALQKISNLEDTKNSLENERTRLSTILKETENHFTKTTQDLN 1263
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Human  1219 NEELRSAVKKAESERISLKLANEDKEQKLALLEEARTAVGKEAGELRTGLQEVERSRLEARRELQ 1283

  Fly  1264 ATKAQLQKAQVEFAQKDEGGKELQCKLVAEVELKERAQQELCQIKKQLSDLEANLCATRQELGRA 1328
            ..:.|::....|..:......|||.:|......::.:::|...::::|...||:|...||||..|
Human  1284 ELRRQMKMLDSENTRLGRELAELQGRLALGERAEKESRRETLGLRQRLLKGEASLEVMRQELQVA 1348

  Fly  1329 RCQNNQEEHRFHAREQELAQRLEEGRGREKRLEDQKHNLEVCLADATQQIQELKARLGGAEGRIR 1393
            :.:..::|..|..||:.|...|||.||.||:..|....||:.|..|..:..||..||..||||.:
Human  1349 QRKLQEQEGEFRTRERRLLGSLEEARGTEKQQLDHARGLELKLEAARAEAAELGLRLSAAEGRAQ 1413

  Fly  1394 ALDEQLSCVELHKRDTEQKLSSVVHTLRRIAGI---------QVDGSVNLSHRLLSPSRRFSPSR 1449
            .|:.:|:.||:.:|..|.:|..:...|||..|:         .|.|         ||:|. :|:.
Human  1414 GLEAELARVEVQRRAAEAQLGGLRSALRRGLGLGRAPSPAPRPVPG---------SPARD-APAE 1468

  Fly  1450 SCGD-YDNRSTSQC--------------PDGPIDVDPDLVRKGVRNLMHQVAQLEREKDDYKSQL 1499
            ..|: .::.||.:|              |..| |:||:.||..:|..:.::...:||:|:.::|.
Human  1469 GSGEGLNSPSTLECSPGSQPPSPGPATSPASP-DLDPEAVRGALREFLQELRSAQRERDELRTQT 1532

  Fly  1500 GAAKKQLQDAADQQLRCDAKLGKLQAMLRNLQEEKSNLETDRKMKISAIQA----LEEKLKHRND 1560
            .|..:||.:...::....::..:||..:...:|.:.:::.    ::|.:||    .||.::....
Human  1533 SALNRQLAEMEAERDSATSRARQLQKAVAESEEARRSVDG----RLSGVQAELALQEESVRRSER 1593

  Fly  1561 ECQMLRERLAQTEMQLAATSEENGQNEERLEKSRQQCSKLDNEKRQLQEELAKVEGRASKLELQR 1625
            |.:...:::|..|..|.||..|...::|::.|.:...:||:.:||:|:|.|...|.|..||||||
Human  1594 ERRATLDQVATLERSLQATESELRASQEKISKMKANETKLEGDKRRLKEVLDASESRTVKLELQR 1658

  Fly  1626 VAMEGDLTRLQMALQEKDCSIRQMAERLENQNRALTQLEDRCTALKSTVDQLKERLQKSAVSETQ 1690
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Human  1659 RSLEGELQRSRLGLSDREAQAQALQDRVDSLQRQVADSEVKAGTLQLTVERLNGALAKVEESEGA 1723

  Fly  1691 LRGEIKTLQKELSEQGHCSQANEDKLKLVQKSLQTAENEKRILTERLDSAQTNLNELRRSQQAQL 1755
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Human  1724 LRDKVRGLTEALAQSSASLNSTRDKNLHLQKALTACEHDRQVLQERLDAARQALSEARKQSSSLG 1788

  Fly  1756 DGNQRLQEQVTDLEVQRSALESQLR----IAKWNQESGGDKDLTNGNGGGNGEEELSRQLKSSQR 1816
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Human  1789 EQVQTLRGEVADLELQRVEAEGQLQQLREVLRQRQE---------------GEAAALNTVQKLQD 1838

  Fly  1817 EKSELRSKLQTLQDKVKQLECDR-----------KSKFSGGNAYDRAEKSNSFYGGAAESGEFDS 1870
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Human  1839 ERRLLQERLGSLQRALAQLEAEKREVERSALRLEKDRVALRRTLDKVEREK------LRSHE-DT 1896

  Fly  1871 NRYDVGGGNAGGGSFNCGLDHSV--IEQETRDLRLKVRRLETLLAEKESELARCKARMNDSAKCH 1933
            .|.....|.         ||.::  .|.|..:.:.::::||..:...|.  :...|::...|:..
Human  1897 VRLSAEKGR---------LDRTLTGAELELAEAQRQIQQLEAQVVVLEQ--SHSPAQLEVDAQQQ 1950

  Fly  1934 D---GLDGDRYRSAQMHAEKLLDAREQSHRQQVLRLENQISMLREQLAQEAKR 1983
            .   ..:.:|.||||...|:.|:|||::|||:|..||.|:|.|:.||.||.:|
Human  1951 QLELQQEVERLRSAQAQTERTLEARERAHRQRVRGLEEQVSTLKGQLQQELRR 2003

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Root	NP_651216.2	Rootletin	110..330	CDD:464459	70/219 (32%)
		Gp58	<336..>604	CDD:369586	71/310 (23%)
		SMC_prok_B	503..1314	CDD:274008	227/828 (27%)
		SMC_prok_B	991..>1779	CDD:274008	239/815 (29%)
CROCC	NP_055490.4	Smc	<76..>672	CDD:440809	162/611 (27%)
		Rootletin	156..332	CDD:464459	70/219 (32%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	464..518		15/70 (21%)
		Smc	<555..>1057	CDD:440809	135/519 (26%)
		Smc	<816..>1368	CDD:440809	168/562 (30%)
		SMC_prok_B	1135..1927	CDD:274008	228/837 (27%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1184..1226		13/41 (32%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1443..1575		29/146 (20%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1962..2017		23/42 (55%)