Protein Alignment Root and Cep135

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651216.2
• Gene: Root / 42860
• FlyBaseID: FBgn0039152
• Length: 2048
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001189108.1
• Gene: Cep135 / 39647
• FlyBaseID: FBgn0036480
• Length: 1065
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1217
• Identity: 257/1217 - (21%)
• Similarity: 462/1217 - (37%)
• Gaps: 295/1217 - (24%)

  Fly   196 CSRDYVDDVLVTGGGAGAAEL-----CRKLEEEHQRCEQIVAQNSALRQQLEESNRTNEALTNDL 255
            |.||....|         |||     |.:|..|..:|:     ||.|   |.|.|..:.....|.
  Fly    45 CLRDTKKKV---------AELLEEKTCWELGVEPYKCD-----NSRL---LAECNELHLQFLRDR 92

  Fly   256 QKLTNDWASLRDELLIKEDEFKEEEQAFKDYYNSEHNRLLKMWREVVAVKRSFKEMQTAMKAEVA 320
            :    |:     ||.:.|.|.|.........:...||..|:...:.:..|:....:..  |...|
  Fly    93 E----DY-----ELRLCESERKIRNLELDKQHLQSHNDGLQRQLDALLTKQMVSSVTN--KKATA 146

  Fly   321 KMGQE-----INCVGKDIN-----GSNATV-------AFAVQQAKRAADDELKQSQRSN----DE 364
            .:|::     |..|...|.     |::::.       |...|:......|.:..:|.|.    |:
  Fly   147 GIGRQTKKPFITTVRSGIAMPTTLGTSSSALKCTKCNAGVFQKTTTTTKDGVTVTQTSGQEELDK 211

  Fly   365 LQNQLATLKVQYESARHEIMERDQRLLELMNQLKKLEDRCAQAESQAALASR--YSDEIERLNNS 427
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  Fly   212 MQNDLTAAGEQLEFFKRKVEARNR-------EIRRLNDMLAGGRPLAALAKDCCYKD-------- 261

  Fly   428 MREIAQAVVQDAENADREADAEVTGGVMQHMHLTRDAASVVGGAGGAGSTAGGGGKSPRRNSTRA 492
                ..|:.||.:...||                                     ||......|
  Fly   262 ----VGALSQDIDLLQRE-------------------------------------KSDLMMQVR- 284

  Fly   493 SQAFAEGTISAVQAALHKYQLALHDMQVKFQNTSETLRTTKAQLETSEGTKQLLTTKMQQLTEKL 557
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  Fly   285 --EFQDKMHDAMQRA-----LSSEEDKIKLQTQLEELKEAALQVE-------------QQANAEI 329

  Fly   558 DSSNSKLSELLQERESLQRGLDDIRV----QKQQSEMGRADINSAFENLSSDYEKMQLNCGKLQK 618
            |:..|:|.:|..|   |::...|.|:    ...||:  :.::|.....|:...|::|....|.:|
  Fly   330 DAKESELRQLQLE---LKKKGKDHRLTGGFASNQSD--KHNLNERLNLLTRREEELQATNEKHKK 389

  Fly   619 RIDSMEEDKKAVELEIQRILKDKNITELNLRSEEDRSSRLREETISLREELNRVSLNRDLLEQQR 683
            :|..|:    |..||:|:.|||:|                :...::|.||..|:|..||..:::.
  Fly   390 KIQKMQ----AKILELQKELKDQN----------------KHSNVTLDEEKIRLSSERDFFQKEY 434

  Fly   684 IE------SDNLINLLEKQKSDLEYDLDKLLLE---------KCDLQEKHEKLSNNSCS--TSDE 731
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  Fly   435 LRLMSKTGSESEIAFLHAQIKSKDEELKALRSELFHGGKQQFSPQKSVQYETLPPPTASSITSTV 499

  Fly   732 LKSVQNCLQEAQEERKKLRIQSVDQCNEIGELKKELAILDKAR-LELETDNLSAGEKLKCLQLEK 795
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  Fly   500 TSNTSDCVQAA-----IARVERERDCART-ELERVRCERDTLREKQLSTVQLHADE-LQALRLRN 557

  Fly   796 EKILQDLACVTRDRGDIHNQLTAMCRKKEALNEELMRTRQR-------LEQTTETNSR---LNRN 850
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  Fly   558 EELNDRLRQMERDNRELNSARLPTETNLVLLKEDLLQMRQRVASMQTEIDQLKTENDQITMLNDQ 622

  Fly   851 LEEMVKDVEEKQVVIDLHEKDTHRLNELLAALRSEKESLESVLFDTNTSLEATEERRSQLERDLQ 915
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  Fly   623 NERIIADYQSKLLVA---ERQRQSADVRASTLDSSRESNRSEVTQLRMDLGALRQTYISLEHEKD 684

  Fly   916 EALVREESLKNHVARLQKELEQCQRKAQETKTQLLNAARAAESDFNQKIANLQACAEEAAKRHGE 980
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  Fly   685 TLLHQLDTKTERVYKLEYELKDCKEKR--------NALEQNVKDLEDQLRKL---ANRNRQRDSE 738

  Fly   981 EILQLRNALEKRMQQALQALQTAKDDEI---EKLQERLATLQAHLESLVQQHEEALIRAESEKQQ 1042
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  Fly   739 --LTETSTESKTLRQQIVALKASRDEAIAENRRLMDKLSDAQVEARTLQKKLTDSELQVANMKQQ 801

  Fly  1043 A------------LLIAHRDKQAVAERLEAVSRD--------LKTEQESLDRSRREANARDEKQR 1087
            .            |||     |.|:.:.:...||        |...|.:|:.:.:.......:.|
  Fly   802 LHKYVQEVKKAEDLLI-----QKVSSKFKEKERDDMLDQYHCLTQGQATLEGNNQSLECEAVEFR 861

  Fly  1088 AAIAQLKDEMVQMRTKEEEHKIKLEEC-IRKQELQLSSLREERESLCRVSEELKMEIRLKEDRME 1151
            ..|.:|:.|:..::     .:::|.:| :...|:||::.|.....|.|..|..:.:||:::..:|
  Fly   862 RQICELECEVHSLK-----EQLQLRQCALHDMEVQLTAARASVRCLERELENARDDIRVQKVDLE 921

  Fly  1152 STNNELQDALRKSKEGEGFIDSLRKELTDCRRQLADSNIERDKYSGSNKELRDHVKRVESAKREQ 1216
            :                      ||||.|      ..::||.|.   |.||.| |..:.....:|
  Fly   922 A----------------------RKELCD------KLDVERSKL---NAELND-VNEIRKKLEKQ 954

  Fly  1217 ARAIEEALQKISNLEDTKNSLENERT-----RLSTILKETENHFTKTTQDLNATKAQLQKAQVEF 1276
            ...:.:.||:...:    |.:.||.|     ||....:..|:...::..:::..:.|||:...:.
  Fly   955 CEKLRDELQQSLAI----NQVTNETTDLMLGRLHNDQQHQEDDDIRSKHEMDRLQRQLQQTLDQL 1015

  Fly  1277 AQKDEGGKELQCKLVAEVELKERAQQELCQIKKQLSDLEANLCATRQ 1323
            .:     :.::|:  ...||.|:.:|::..:::.|:|...|...||:
  Fly  1016 QE-----ERVRCR--HHEELAEKWEQQVRDLRRNLADDRYNQARTRE 1055

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Root	NP_651216.2	Rootletin	110..330	CDD:464459	32/143 (22%)
		Gp58	<336..>604	CDD:369586	54/284 (19%)
		SMC_prok_B	503..1314	CDD:274008	188/871 (22%)
		SMC_prok_B	991..>1779	CDD:274008	75/362 (21%)
Cep135	NP_001189108.1	DR0291	206..>346	CDD:441187	43/219 (20%)
		SMC_prok_B	286..1044	CDD:274008	188/876 (21%)