Protein Alignment Root and lfi-1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651216.2
• Gene: Root / 42860
• FlyBaseID: FBgn0039152
• Length: 2048
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001371014.1
• Gene: lfi-1 / 180771
• WormBaseID: WBGene00022500
• Length: 2401
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 2414
• Identity: 471/2414 - (19%)
• Similarity: 922/2414 - (38%)
• Gaps: 568/2414 - (23%)

  Fly    27 QSATASRLPFSRSQRGRDPSASGASVSASVAGGLTPRMMSPGPPGAGG-----------GGGGGV 80
            :|:...:|..|.....|.......::....|....|...|||.....|           .|....
 Worm   100 RSSRKDKLKMSTHDDTRSSGGGDGTIHIPSADAKEPTPESPGSRSNYGEFYWDEYSRDTSGENNY 164

  Fly    81 SGGGSGDPSALLRQNQE------LRQRLADESHSYRRRLDTYKQAQHNQANLVSRLQSKIQQYRQ 139
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 Worm   165 HHTSSFDDDLLLEIDSSRGAAVARLDRTQDDLNKFRQRIDNNVEQQREYSEMMAALQNKVHEYRK 229

  Fly   140 RCSDLEERMHETIKPTAGVGPKLTTGPTNQVLCSTSLTLGQSSLPCSS-SLDSPPPSCSRDYVDD 203
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 Worm   230 HIAELEGRM-------VGARNRMLDDPTSNVMIFDNYDPGNTYITNHNVELWSP----ARGKRET 283

  Fly   204 VLVTGG----------------GAGAA-----------------ELCRKLEEEHQRCEQIVAQNS 235
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 Worm   284 ILGGGGAPGLTTVNVHAGAGYSGSGVAGYGGGVQAMVGDPNANYEMIARLDEERRRSDEYRMQWE 348

  Fly   236 ALRQQLEESNRTNEALTNDLQKLTNDWASLRDELLIKEDEFKEEEQAFKDYYNSEHNRLLKMWRE 300
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 Worm   349 NERQKSLSLEDENDRLRREFERYAND---SKD----KEKTFINRERNLAQYLSDEQRKMLDLWTE 406

  Fly   301 VVAVKRSFKEMQTAMKAEVAKMGQEINCVGKDINGSNATVAFAVQQAKRAADDELKQSQRSNDEL 365
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 Worm   407 LQRVRKQFSDLKTHTEEDLDKQKAEFTRAIRNVNNISRNAAFSAGAGDGLGLYGLEDGGDVNRTT 471

  Fly   366 QNQLATLKVQYESARHEIMER--------DQRLLELMNQLKKLE---DRCAQAESQAALASRYSD 419
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 Worm   472 NN--------YEKVFIETIKRMNGTGGAGSASSADLLEELRKIRGGGSSEGDAELHKELMTKYEE 528

  Fly   420 EIERL-------NNSMREIAQAVVQDAENADREADAEVTGGVMQHMH-LTRDAASVVGGAGGAGS 476
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 Worm   529 SIERNIELESRGDDSQRKIAELEAELRRNREKLNEAQ---GALKKLHEMAQDSEKNVDGTVSIKR 590

  Fly   477 TAG-GGGKSPRRNSTRASQAFAEGTISAVQAALHKYQLALHDMQVKFQNTSETLRTTKAQLETSE 540
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 Worm   591 TRSLSPGKTPLPPSE-----------------------ALRAVRNTFRNKDNDIQQLERKLKIAE 632

  Fly   541 GTKQLLTTKMQQLTEKLDSSNSKLSELLQERESLQRGLDDIRVQKQQ-------SEMGRADINSA 598
            ...:....|.:...|.....:.:.::..:|..:||:.:|:.....::       ||..|.....|
 Worm   633 SQVKEFLNKFENADEARRRLDKQFADAKREISNLQKSVDEAERNSRRTDDKLRASEAERVAAEKA 697

  Fly   599 FENLSSDYEKMQLNCGK-----LQKRIDSMEEDKKAVELEIQRILKDKNITELNLRSEE--DRSS 656
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 Worm   698 RKFLEDELAKLQASFQKSSTDDARKLRDEMDEHTNSIQEEFK-----TRIDELNRRVENLLRENN 757

  Fly   657 RLREETISLREELNRVSLNRDL-----LEQQRI-ESDNLINLLEKQKSDLEYDLDKLLLEKCDLQ 715
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 Worm   758 RLKSEVNPLKDKY------RDLENEYNSTQRRIEEKETQIRYSDDIRRNIQKDLD-------DLR 809

  Fly   716 EKHEKLSNNSCSTSDELKSVQNCLQEAQEERKKLRIQSVD-------QCNEIGELKKELAILDKA 773
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 Worm   810 EKYDRVHTDNEKILGELEHAQKAAHLAEQQLKEIKIQRDDYQKQKDEHARHLFDIRHKLETEIKG 874

  Fly   774 RLELETDNLSAGEKLKCLQLEKEKILQDLACVTRDRGDIHNQLTAMCRKKEALNEELMRTRQRLE 838
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 Worm   875 RQDLEKNGARNNDEL-------DKLRQTIS-------DYESQINLLRRHNDELDTTIKGHQGKIT 925

  Fly   839 Q-TTETNSR---------LNRNLEEMVKDVEEKQVVIDLHEKDTHRLNELLAALRSEKESLES-- 891
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 Worm   926 HLENELHSRSGEIEKLNDLNQRLQKEKQDILNQKLKLD---GDVQALKETIRKLENELEKLRNEN 987

  Fly   892 --------------------------VLFDTNTSLEATEERRSQLERDLQEALVREESLKNHVAR 930
                                      .|.||...|:.:.:...|||:|:::       ||..:|.
 Worm   988 KELVGKEARARDAANQQLSRANLLNKELEDTKQDLKHSTDVNKQLEQDIRD-------LKERLAN 1045

  Fly   931 LQK----------------------ELEQCQRKAQETKTQLLNAARAAES--------------- 958
            :.|                      ..:..:.:.....|..:.||...||
 Worm  1046 IGKGGRISRDSTTGTDGGAFGDRSSVADPSRTRGAAGSTVFVPAAEDIESRGGGEIDIPSSGDVI 1110

  Fly   959 ---------DFNQK----IANLQACAEEAAKR-----HGEEILQLR-NALEKRMQQALQALQTAK 1004
                     |...:    |.|.:...|...|.     |.:|:::.: ..:..|.::.|:.|:..|
 Worm  1111 HGRDGRDGRDAGNRGTHTITNTKERIERIEKNILDRYHDDELVEHKIREVNDRWKRELERLENEK 1175

  Fly  1005 DD---EIEKLQERLATL-------QAHLESLVQQHEEALIRAESEKQQALLIAHRDKQ------- 1052
            ||   .|.:|::.|:.:       :..:..|.::|     .||.:|.::.:.|..||.
 Worm  1176 DDLERRIRELEDELSQIGRGNDKTENDITELKRKH-----AAEIDKLKSDISALHDKHLSDLDDE 1235

  Fly  1053 -----AVAERLEAVSRDLKTEQESLDRS-----------RREANARDEKQRAAIAQ---LKDEMV 1098
                 ...|.|::|..||:.:..:|::.           .||....|||..:...|   :|||..
 Worm  1236 KEQYGKAVENLKSVEDDLRDKLNNLEKQLADSLNRENELEREKRDYDEKINSLYGQNQKIKDEWD 1300

  Fly  1099 QMRTKEEEHKIKLEECIRKQELQLSSLREERESLCRVSEELKMEIRLKEDRMESTNNELQDALRK 1163
            ..|...::.       |:|.:....::|.|.::|...:..||.:::...||::.....:.|...|
 Worm  1301 DFRNDADKE-------IQKWKTDAYTVRSEAKALETTNTALKAQLQAANDRIDHLTKTVNDHTSK 1358

  Fly  1164 SKEGEGFIDSLRKELTDCRRQLADSNIERDKYSGSNKELRDHVKRVESAKREQARAIEEALQKIS 1228
            .::....:..|..||.|.:..|....::.:......:.|.|....::|...:....::.||::..
 Worm  1359 VRDLTSQVRHLEDELADTKGNLVQKEMDLESTQNRLRSLEDQHSTLQSDANKWRGELDAALREND 1423

  Fly  1229 NLEDTKNSLENERTRLSTILKETENHFTKTTQDLNATKAQLQKAQVEFAQKDEGGKELQCKLVAE 1293
            .|:....::|.:.|||...||..|:...:....|:..|.:.::.|..|.:|.:....|. :|.::
 Worm  1424 ILKSNNTNMETDLTRLKNRLKSAEDALKELKNSLSHAKTEKERLQNAFREKTKQADHLN-QLASQ 1487

  Fly  1294 VELK-ERAQQELCQIKKQL--SDLEANLCATRQELGRARCQNNQEEHRFHAREQELAQRLEEGRG 1355
            .:.| .:.:.||.....:|  ||.|.|  |.|.||                  |:|:|.|:.|..
 Worm  1488 FDTKLTKLRNELQDTNDKLITSDTERN--ALRNEL------------------QKLSQELKFGNE 1532

  Fly  1356 REKR--------LEDQKHNLEVCLADATQQIQELKAR---LGGAEGRIRALDEQLSCVELH--KR 1407
            :.:|        ::|..|:..|........:|||:||   :.....|:.:.:::|:.::..  |.
 Worm  1533 QIQRKSDEYQTTIDDLAHSHRVSEDSRLNALQELEARKYEINDLTSRLDSTEQRLATLQQDYIKA 1597

  Fly  1408 DTEQKLSSVVHTLRRI-------------------------AGIQVDGSVNLSHRL--------- 1438
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 Worm  1598 DSERDILS--DALRRFQSSANRVINFHTFVDGGAGYVDGVPGGTSVIGGGPSAQRSGAYDPSSGG 1660

  Fly  1439 --------------------------------------LSPSRRFSPSR----SCG-----DYDN 1456
                                                  ..||..||..|    |.|     :.|.
 Worm  1661 VIGSGISGGPGGSDFGREIEIGRGDSDQSDVAYPRSVPFPPSADFSSGRPGAASAGGRVINNLDG 1725

  Fly  1457 RSTSQCPDGPIDVDPDLVRKGVRNLMHQVAQLEREKDDYKSQLGAAKKQLQDAADQQLRCDAKLG 1521
            .:|... :|..|:..  :...:::|::::.:||.|:::.:..|...||:..:......:.:.:..
 Worm  1726 TTTVNM-NGGFDIAN--LEGTLQSLLNKIEKLEMERNELRDTLARMKKKTTETHTTINQKETRYR 1787

  Fly  1522 KLQAMLRNLQEEKSNLETDRKMKISAIQALEEKLKHRNDECQMLRERLAQTEMQLAATSEENGQN 1586
            .::..|::.:||:..||:..:...:.:::.||.||.|::|.:.::.::...|:|......:....
 Worm  1788 NIEDNLQDAEEERRALESRLQSAKTLLRSQEEALKQRDEERRQMKSKMVAAELQARGKEAQLRHL 1852

  Fly  1587 EERLEKSRQQCSKLDNEKRQLQEELAKVEGRASKLELQRVAMEGDLTRLQMALQEKDCSIRQMAE 1651
            .|:|:..|........:.|.|:::..:.:....:||.:....:.|..:.|:.:...:...:.:.|
 Worm  1853 NEQLKNLRTDLDNAHTDIRSLRDKEEQWDSSRFQLETKMRESDSDTNKYQLQIASFESERQILTE 1917

  Fly  1652 RLENQNRALTQLEDRCTALKSTVDQLKERLQKSAVSETQLRGEIKTLQKELSEQGHCSQANEDKL 1716
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 Worm  1918 KIKELDGALRLSDSKVQDMKDDTDKLRRDLTKAESVENELR---KTIDIQ-SKTSHEYQLLKDQL 1978

  Fly  1717 KLVQKSLQTAENEKRILTERLDSAQTNLNELRRSQQAQLDGNQR---LQEQVTDLEVQRSALESQ 1778
            ...|..|..|.|.|:.|...|.:.:   :|:|..:|...|.|.|   ||.|:.|...:::.:|.:
 Worm  1979 LNTQNELNGANNRKQQLENELLNVR---SEVRDYKQRVHDVNNRVSELQRQLQDANTEKNRVEDR 2040

  Fly  1779 -LRIAKWNQESGGDKDLTNGNGGGNGEEELSRQLKSSQREKSELRSKLQTLQDKVKQLECDRK-- 1840
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 Worm  2041 FLSVEK------------VVNTMRTTETDLRQQLETAKNEKRVATKELEDLKRRLAQLENERRNS 2093

  Fly  1841 SKFSGG-------------------NAYDRAEKSNSFYGGAAESGEFDSNRYDVGGGNAGGGSFN 1886
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 Worm  2094 SQLSDGWKKEKITLLKKIELLENEKRRTDAAIRETALQREAIEK------------------SLN 2140

  Fly  1887 CGLDHSVIEQETRDLRLKVRRLETLLAEKESELARCKARMNDSAKCHDGLDGDRYRSAQMHAEKL 1951
                  .:|:|.::|.....:|:..:|:.|.|.......:.:..:........|.|..:...||:
 Worm  2141 ------AMERENKELYKNCAQLQQQIAQLEMENGNRILELTNKQREEQERQLIRMRQEKGQIEKV 2199

  Fly  1952 LDAREQSHRQQVLRLENQISMLREQLAQEAKRRQQYILRS-----SKANREMQHLRSTLGDS--- 2008
            ::.||::||.::.:||:||::||:||..|.:||::|:.||     .:....:..:|::.||:
 Worm  2200 IENRERTHRNRIKQLEDQIAILRDQLDGERRRRREYVDRSMVNDIGRLGSNVLGIRNSYGDNSID 2264

  Fly  2009 ------LRNVSQHPVD-------------------PHLLESESRRLDSAVSMSLPPSSCRD---- 2044
                  .|:|..:|..                   ||:.:..| .:|:..|...|.|:..|
 Worm  2265 AIINGGSRSVGFYPRSTFASNPLTPPLGSSTPTHRPHVTDFRS-AVDAGSSYRRPISTIEDSGSV 2328

  Fly  2045 -----YDRD 2048
                 .|||
 Worm  2329 YGGSIRDRD 2337

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Root	NP_651216.2	Rootletin	110..330	CDD:464459	55/253 (22%)
		Gp58	<336..>604	CDD:369586	52/294 (18%)
		SMC_prok_B	503..1314	CDD:274008	183/970 (19%)
		SMC_prok_B	991..>1779	CDD:274008	184/924 (20%)
lfi-1	NP_001371014.1	Rootletin	200..435	CDD:464459	55/252 (22%)
		SMC_N	<527..802	CDD:481474	62/311 (20%)
		SMC_prok_B	672..1600	CDD:274008	196/1002 (20%)
		SMC_prok_B	1244..2142	CDD:274008	191/973 (20%)
		CwlO1	1976..2362	CDD:443091	90/402 (22%)