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Protein Alignment PolE1 and TIL1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524462.2 Gene:PolE1 / 42758 FlyBaseID:FBgn0264326 Length:2236 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_172303.5 Gene:TIL1 / 837346 AraportID:AT1G08260 Length:2161 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:2262 Identity:924/2262 - (40%)
Similarity:1341/2262 - (59%) Gaps:195/2262 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    40 DKIDSKYGFDRVKDSQERTGYLINMHSNEVLDEDR-RLIAALDLFFIQMDGSRFKCTVAYQPYLL 103
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plant    27 DELESKLGFGLFSEGETRLGWLLTFSSSSWEDRDTGKVYSCVDLYFVTQDGFSFKTKYKFRPYFY 91

  Fly   104 IRPEDNMHLEVARFLGRKYSGQISGLEHITKEDLDLPNHLSGLQQQYIKLSFLNQTAMTKVRREL 168
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plant    92 AATKDKMELELEAYLRRRYERQVADIEIVEKEDLDLKNHLSGLQKKYLKISFDTVQQLMEVKRDL 156

  Fly   169 MSAVKRNQERQKSNTYYMQMLATSLAQSSAGSEDATLGKRQ---QDYMDCIVDIREHDVPYHVRV 230
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plant   157 LHIVERNQAKFDALEAYESILA---------------GKREQRPQDCLDSIVDLREYDVPYHVRF 206

  Fly   231 SIDLRIFCGQWYNIRCRSGVELPTITCRPDILDRPEPVVLAFDIETTKLPLKFPDAQTDQVMMIS 295
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plant   207 AIDNDVRSGQWYNVSISSTDVI--LEKRTDLLQRAEVRVCAFDIETTKLPLKFPDAEYDQIMMIS 269

  Fly   296 YMIDGQGYLITNREIISSNVDDFEYTPKPEFEGNFIVFNEENEMQLLQRFFDHIMEVRPHIIVTY 360
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plant   270 YMVDGQGFLIINRECVGEDVEDLEYTPKPEFEGYFKVTNVKNEVELLQRWFYHMQELKPGIYVTY 334

  Fly   361 NGDFFDWPFVETRAAVYDLDMKQEIGF-SKLRDGNYLSRPAIHMDCLCWVKRDSYLPVGSQGLKA 424
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plant   335 NGDFFDWPFIERRASHHGIKMNEELGFRCDQNQGECRAKFACHLDCFAWVKRDSYLPQGSHGLKA 399

  Fly   425 VAKAKLRYDPVELDPEDMCRMAVEQPQVLANYSVSDAVATYYLYMKYVHPFIFALNTIIPMEPDE 489
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plant   400 VTKAKLGYDPLEVNPEDMVRFAMEKPQTMASYSVSDAVATYYLYMTYVNPFIFSLATIIPMVPDE 464

  Fly   490 ILRKGSGTLCETLLMVEAYHAQIVYPNKHQSELNKLSNEGHVLDSETYVGGHVEALESGVFRADI 554
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plant   465 VLRKGSGTLCEMLLMVEAYKANVVCPNKNQADPEKF-YQNQLLESETYIGGHVECLESGVFRSDI 528

  Fly   555 PCRFRLDPAMVKQLQEQVDAVLRHAIEVEEGIPLEKVLNLDEVRQEIVQGLQGLHDIPNRLEQPV 619
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plant   529 PTSFKLDSSAYQQLIDNLGRDLEYAITVEGKMRMDSISNYDEVKDEIKEKLEKLRDDPIREEGPL 593

  Fly   620 IYHLDVGAMYPNIILTNRLQPSAMVSDLDCAACDFNKPGVRCKRSMDWLWRGEMLPASRNEFQRI 684
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plant   594 IYHLDVAAMYPNIILTNRLQPPSIVTDEICTACDFNRPGKTCLRKLEWVWRGVTFMGKKSDYYHL 658

  Fly   685 QQQLETEKFPPLFPGG----PQRAFHELSKEDQAAYEKKRLTDYCRKAYKKTKLTK--LETRTST 743
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plant   659 KKQIESE----FVDAGANIMSSKSFLDLPKVDQQSKLKERLKKYCQKAYKRV-LDKPITEVREAG 718

  Fly   744 ICQKENSFYVDTVRAFRDRRYEYKGLTKVAKASVNAAVASGDAAEIKAAKGREVLYDSLQLAHKC 808
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plant   719 ICMRENPFYVDTVRSFRDRRYEYKTLNKVWKGKLSEAKASGNSIKIQEAQDMVVVYDSLQLAHKC 783

  Fly   809 ILNSFYGYVMRRGARWHSMPMAGIVCLTGSNIITKAREIIERVGRPLELDTDGIWCILPGSFPQE 873
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plant   784 ILNSFYGYVMRKGARWYSMEMAGVVTYTGAKIIQNARLLIERIGKPLELDTDGIWCCLPGSFPEN 848

  Fly   874 FTIHTSHEKKKKINISYPNAVLNTMVKDHFTNDQYHEL----RKDKENNLPKYDIRDENSIFFEV 934
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plant   849 FTFKTI--DMKKLTISYPCVMLNVDVAKNNTNDQYQTLVDPVRK-------TYKSHSECSIEFEV 904

  Fly   935 DGPYLAMVLPAAKEEGKKLKKRYAVFNFDGTLAELKGFEVKRRGELQLIKNFQSSVFEAFLAGST 999
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plant   905 DGPYKAMIIPASKEEGILIKKRYAVFNHDGTLAELKGFEIKRRGELKLIKVFQAELFDKFLHGST 969

  Fly  1000 LEECYASVAKVADYWLDVLYSRGSNLPDSELFELISENKSMSKKLEEYGAQKSTSISTAKRLAEF 1064
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plant   970 LEECYSAVAAVADRWLDLLDNQGKDIADSELLDYISESSTMSKSLADYGEQKSCAVTTAKRLAEF 1034

  Fly  1065 LGEQMVKDAGLACKYIISKKPEGAPVTERAIPLAIFQSEPSVRRHHLRRWLKDNTMGDADIRDVL 1129
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plant  1035 LGVTMVKDKGLRCQYIVACEPKGTPVSERAVPVAIFTTNPEVMKFHLRKWCK--TSSDVGIRLII 1097

  Fly  1130 DWNYYIERLGGTIQKIITIPAALQGLANPVPRVQHPDWLHKKMLEKNDVLKQRRINEMFTSRPKP 1194
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plant  1098 DWSYYKQRLSSAIQKVITIPAAMQKVANPVPRVLHPDWLHKKVREKDDKFRQRKLVDMFSSANKD 1162

  Fly  1195 KPLATE----EDKLADMEDLAGKDGGEGAAGCPIVTKRKRIQLEEHDDEEAQPQATTWRQALGAP 1255
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plant  1163 VVLDTDLPVTKDNVEDIEDFC-KENRPSVKGPKPIARSYEVNKKQSECEQQESWDTEFHDI---- 1222

  Fly  1256 PPIGETRKTI--VEWVRFQKKKWKWQQDQRQRNRQASKRTRGE------DPPVVRATGSTATLGG 1312
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plant  1223 -SFQNIDKSVNYQGWLELKKRKWKVTLEKKKKRRLGDLRSSNQVDTHEINQKVGQGRGG---VGS 1283

  Fly  1313 FLRRAQRTLLDQPWQIVQLVPVDDLGHFTVWALIGEELHKIKLTVPRIFYVNQRSAAPPEEGQLW 1377
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plant  1284 YFRRPEEALTSSHWQIIQLVPSPQSGQFFAWVVVEGLMLKIPLSIPRVFYIN--SKVPIDEYFQG 1346

  Fly  1378 RKVNRVLPRSRPVFNLYRYSVPEQLFRDNSLGMLADLATPDIEGIYETQMTLEFRALMDMGCICG 1442
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plant  1347 KCVNKILPHGRPCYSLTEVKIQEDQFKKESKKRAALLADPGVEGIYETKVPLEFSAICQIGCVCK 1411

  Fly  1443 VQREEARRLAQLATKDLETFSIEQLEQRPQTQVKYLASANNRLRKIYLYQHNTPTAKKEIWSLIL 1507
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plant  1412 IDNKAKHRNTQ------DGWEVGELHMKTTTECHYL---KRSIPLVYLY--NSTSTGRAIYVLYC 1465

  Fly  1508 MPSKKAFVFALDTVRANQMPNMRQLYTAERLALLKNLTAEEQDKIPVEDYTFEVLIEVDVKQIYR 1572
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plant  1466 HVSKLMSAVVVDPFNGNEL-----LPSALERQFRDSCLELSLDSLSWDGIRFQVHYVDHPEAAKK 1525

  Fly  1573 HIQRALTTYKQEHQGPTILCLQTALSARKLSLAMPILLEFPQAEIHISDDASLLSGLDWQRQGSR 1637
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plant  1526 IIQRAISEYREENCGPTVAVIECP-DFTFMKEGIKALDDFPCVRIPFNDDDNSYQPVSWQRPAAK 1589

  Fly  1638 AVIRHFLNLNNVLDLMLDQCRYFHVPIGNMPPDTVLFGADLFFARLLQRHNFVLWWSASTRPDLG 1702
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plant  1590 IAMFRCAAAFQWLDRRITQSRYAHVPLGNFGLDWLTFTIDIFLSRALRDQQQVLWVSDNGVPDLG 1654

  Fly  1703 GREADDSRLLAEFEESISVVQNKAGFYPDVCVELALDSLAVSALLQSTRIQEMEGAS-SAITFDV 1766
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plant  1655 GINNEEAFFADEVQQTSLVF---PGAYRKVSVELKIHNLAVNALLKSNLVNEMEGGGFMGFEQDV 1716

  Fly  1767 MPQVSLEEMIGTVPAATLPSYDETALCSAAFRVMRSMVNGWLREVSINRNIFSDFQIVHFYRWVR 1831
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plant  1717 NPR--------GINSNDNTSFDETTGCAQAFRVLKQLIHSCLTDVRKSKNIYADSILQRLSWWLC 1773

  Fly  1832 SSNALLYDPALRRSLNNLMRKMFLRIIAEFKRLGATIIYADFNRIILSSGKKTVSDALGYVDYIV 1896
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plant  1774 SPSSKLHDPALHLMLHKVMQKVFALLLTDLRRLGAIIIYADFSKVIIDTVKFDLSAAKAYCESLL 1838

  Fly  1897 QSLRNKEMFHSIQLSFEQCWNFMLWMDQANFSGIRGKLPKGIDETVSSIVSTTMIRDSERNQDDD 1961
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plant  1839 STVRNSDIFEWILLEPVHYWHSLLFMDQYNYAGIRA------DDEISL----------------- 1880

  Fly  1962 EDEEEDSENRDPVESNEAEQDQEDELSLELNWTIGEHLPD----------------------ENE 2004
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plant  1881 -----------------------DEVTIEPKWSVARHLPEYIERDFIIIIAKFIFDPWKFAIENK 1922

  Fly  2005 CREKFESLLTLFMQSLAEK------KTTEQAIKDI-SHCAFDFILKLHKNYGKG-KPSPGLELIR 2061
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plant  1923 -KGSSESLEAQMIEYLREQIGSTFINMLVKKVDDIMSHMKEINVSDASRVSGQAPKGDYSLEFIQ 1986

  Fly  2062 TLIKALSVDKTLAEQINELRRNMLRLVGIGEFSDLAEWEDPCDSHIINEVICKACNHCRDLDLCK 2126
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plant  1987 VISAVLALDQNVQQDVLVMRKSLLKYIKVKECAAEAEFLDPGPSFILPNVACSNCDAYRDLDICR 2051

  Fly  2127 DKHRAMKDGVPV------WLCA--QCYVAYDNEEIEMRMLDALQRKMMSYVLQDLRCSRCSEIKR 2183
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plant  2052 D---------PALLTEKEWSCADTQCGKIYDREQMESSLLEMVRQRERMYHMQDVVCIRCNQVKA 2107

  Fly  2184 ENLAEFCTCAGNFVPLISGKDIQTLLGTFNKVAANHKMQLLQQTVHQALTTP 2235
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plant  2108 AHLTEQCECSGSFRCKESGSEFSKRMEIFMDIAKRQKFRLLEEYISWIIYGP 2159

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PolE1NP_524462.2 DNA_polB_epsilon_exo 266..469 CDD:99822 131/203 (65%)
POLBc_epsilon 529..1154 CDD:99918 352/634 (56%)
DUF1744 1529..1930 CDD:462493 121/401 (30%)
TIL1NP_172303.5 DNA_pol_B_exo1 72..400 CDD:397292 172/344 (50%)
DNA_polB_epsilon_exo 240..444 CDD:99822 131/203 (65%)
POLBc_epsilon 505..1122 CDD:99918 352/632 (56%)
DUF1744 1489..1872 CDD:462493 119/394 (30%)

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