DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DNApol-epsilon255 and POLE

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_524462.2 Gene:DNApol-epsilon255 / 42758 FlyBaseID:FBgn0264326 Length:2236 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_011533097.1 Gene:POLE / 5426 HGNCID:9177 Length:2298 Species:Homo sapiens


Alignment Length:2267 Identity:1257/2267 - (55%)
Similarity:1624/2267 - (71%) Gaps:118/2267 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSDSSKGKVLQNTGKFVSENRTEGDDFFNEAGYR--QSRENDKIDSKYGFDRVKDSQERTGYLIN 63
            ||..|.|:...:.|.....:|.:|......|..|  :|:..||:|.::||:|:|:..|:||:|||
Human     1 MSLRSGGRRRADPGADGEASRDDGATSSVSALKRLERSQWTDKMDLRFGFERLKEPGEKTGWLIN 65

  Fly    64 MHSNEVLDEDRRLIAALDLFFIQMDGSRFKCTVAYQPYLLIRPEDNMHLEVARFLGRKYSGQISG 128
            ||..|:||||:||.:|:|.:|||.||||||..:.|:||..|........||:.||.:|:.|:|:.
Human    66 MHPTEILDEDKRLGSAVDYYFIQDDGSRFKVALPYKPYFYIATRKGCEREVSSFLSKKFQGKIAK 130

  Fly   129 LEHITKEDLDLPNHLSGLQQQYIKLSFLNQTAMTKVRRELMSAVKRNQERQKSNTYYMQMLATSL 193
            :|.:.||||||||||.||::.||:|||.....:.|||:|:..|||:|:|:..::..|..:|::.|
Human   131 VETVPKEDLDLPNHLVGLKRNYIRLSFHTVEDLVKVRKEISPAVKKNREQDHASDAYTALLSSVL 195

  Fly   194 AQSSAGSEDATLGKRQQDYMDCIVDIREHDVPYHVRVSIDLRIFCGQWYNIRCRSGVELPTITCR 258
            .:....:::....|:..|.:|.|||:||:|||||:|:||||:|....|||:|.|.......||.|
Human   196 QRGGVITDEEETSKKIADQLDNIVDMREYDVPYHIRLSIDLKIHVAHWYNVRYRGNAFPVEITRR 260

  Fly   259 PDILDRPEPVVLAFDIETTKLPLKFPDAQTDQVMMISYMIDGQGYLITNREIISSNVDDFEYTPK 323
            .|:::||:||||||||||||||||||||:|||:|||||||||||||||||||:|.:::|||:|||
Human   261 DDLVERPDPVVLAFDIETTKLPLKFPDAETDQIMMISYMIDGQGYLITNREIVSEDIEDFEFTPK 325

  Fly   324 PEFEGNFIVFNEENEMQLLQRFFDHIMEVRPHIIVTYNGDFFDWPFVETRAAVYDLDMKQEIGFS 388
            ||:||.|.||||.:|..|:||:|:|:.|.:|.|:||||||||||||||.||||:.|.|:|||||.
Human   326 PEYEGPFCVFNEPDEAHLIQRWFEHVQETKPTIMVTYNGDFFDWPFVEARAAVHGLSMQQEIGFQ 390

  Fly   389 KLRDGNYLSRPAIHMDCLCWVKRDSYLPVGSQGLKAVAKAKLRYDPVELDPEDMCRMAVEQPQVL 453
            |...|.|.:...||||||.||||||||||||..|||.|||||.|||||||||||||||.||||.|
Human   391 KDSQGEYKAPQCIHMDCLRWVKRDSYLPVGSHNLKAAAKAKLGYDPVELDPEDMCRMATEQPQTL 455

  Fly   454 ANYSVSDAVATYYLYMKYVHPFIFALNTIIPMEPDEILRKGSGTLCETLLMVEAYHAQIVYPNKH 518
            |.||||||||||||||||||||||||.|||||||||:||||||||||.||||:|:||.|::|||.
Human   456 ATYSVSDAVATYYLYMKYVHPFIFALCTIIPMEPDEVLRKGSGTLCEALLMVQAFHANIIFPNKQ 520

  Fly   519 QSELNKLSNEGHVLDSETYVGGHVEALESGVFRADIPCRFRLDPAMVKQLQEQVDAVLRHAIEVE 583
            :.|.|||:::|||||||||||||||||||||||:|||||||::||....|.::|:..||||:|.|
Human   521 EQEFNKLTDDGHVLDSETYVGGHVEALESGVFRSDIPCRFRMNPAAFDFLLQRVEKTLRHALEEE 585

  Fly   584 EGIPLEKVLNLDEVRQEIVQGLQGLHDIPNRLEQPVIYHLDVGAMYPNIILTNRLQPSAMVSDLD 648
            |.:|:|:|.|.:||..||...|..|.|:|:|:|.|:|||||||||||||||||||||||||.:..
Human   586 EKVPVEQVTNFEEVCDEIKSKLASLKDVPSRIECPLIYHLDVGAMYPNIILTNRLQPSAMVDEAT 650

  Fly   649 CAACDFNKPGVRCKRSMDWLWRGEMLPASRNEFQRIQQQLETEKFPPLFPGGPQRAFHELSKEDQ 713
            ||||||||||..|:|.|.|.||||.:||||:|:.|||.|||:||||||||.||.|||||||:|:|
Human   651 CAACDFNKPGANCQRKMAWQWRGEFMPASRSEYHRIQHQLESEKFPPLFPEGPARAFHELSREEQ 715

  Fly   714 AAYEKKRLTDYCRKAYKKTKLTKLETRTSTICQKENSFYVDTVRAFRDRRYEYKGLTKVAKASVN 778
            |.|||:||.|||||||||..:||:|.|.:||||:||||||||||||||||||:|||.||.|..::
Human   716 AKYEKRRLADYCRKAYKKIHITKVEERLTTICQRENSFYVDTVRAFRDRRYEFKGLHKVWKKKLS 780

  Fly   779 AAVASGDAAEIKAAKGREVLYDSLQLAHKCILNSFYGYVMRRGARWHSMPMAGIVCLTGSNIITK 843
            |||..|||||:|..|..||||||||||||||||||||||||:||||:||.||||||.||:||||:
Human   781 AAVEVGDAAEVKRCKNMEVLYDSLQLAHKCILNSFYGYVMRKGARWYSMEMAGIVCFTGANIITQ 845

  Fly   844 AREIIERVGRPLELDTDGIWCILPGSFPQEFTIHTSHEKKKKINISYPNAVLNTMVKDHFTNDQY 908
            |||:||::|||||||||||||:||.|||:.|...|::.||.|:.||||.|:||.|||:.||||||
Human   846 ARELIEQIGRPLELDTDGIWCVLPNSFPENFVFKTTNVKKPKVTISYPGAMLNIMVKEGFTNDQY 910

  Fly   909 HELRKDKENNLPKYDIRDENSIFFEVDGPYLAMVLPAAKEEGKKLKKRYAVFNFDGTLAELKGFE 973
            .||   .|.:...|..|.|||||||||||||||:|||:|||||||||||||||.||:||||||||
Human   911 QEL---AEPSSLTYVTRSENSIFFEVDGPYLAMILPASKEEGKKLKKRYAVFNEDGSLAELKGFE 972

  Fly   974 VKRRGELQLIKNFQSSVFEAFLAGSTLEECYASVAKVADYWLDVLYSRGSNLPDSELFELISENK 1038
            |||||||||||.||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||:.:|:||||||||||||:
Human   973 VKRRGELQLIKIFQSSVFEAFLKGSTLEEVYGSVAKVADYWLDVLYSKAANMPDSELFELISENR 1037

  Fly  1039 SMSKKLEEYGAQKSTSISTAKRLAEFLGEQMVKDAGLACKYIISKKPEGAPVTERAIPLAIFQSE 1103
            |||:|||:||.|||||||||||||||||:||||||||:|:||||:||||:|||||||||||||:|
Human  1038 SMSRKLEDYGEQKSTSISTAKRLAEFLGDQMVKDAGLSCRYIISRKPEGSPVTERAIPLAIFQAE 1102

  Fly  1104 PSVRRHHLRRWLKDNTMGDADIRDVLDWNYYIERLGGTIQKIITIPAALQGLANPVPRVQHPDWL 1168
            |:||:|.||:|||.:::.|.|||.:|||:|||||||..||||||||||||.:.||||||:|||||
Human  1103 PTVRKHFLRKWLKSSSLQDFDIRAILDWDYYIERLGSAIQKIITIPAALQQVKNPVPRVKHPDWL 1167

  Fly  1169 HKKMLEKNDVLKQRRINEMFT------------SRPKPKPLATEEDKLADMEDLAGKDGGEGAAG 1221
            |||:||||||.||::|:|:||            |...|:|.|      .||||.........|| 
Human  1168 HKKLLEKNDVYKQKKISELFTLEGRRQVTMAEASEDSPRPSA------PDMEDFGLVKLPHPAA- 1225

  Fly  1222 CPIVTKRKRIQLEEHDDEEAQPQATTWRQALGAPPPIGETRKTIVEWVRFQKKKWKWQQDQR--Q 1284
             |:..||||:..|..::.:.......|::.||.||.:|.:::..:.|:||.||||:.|..||  :
Human  1226 -PVTVKRKRVLWESQEESQDLTPTVPWQEILGQPPALGTSQEEWLVWLRFHKKKWQLQARQRLAR 1289

  Fly  1285 RNRQASKRTRGEDPPVVRATGSTATLGGFLRRAQRTLLDQPWQIVQLVPVDDLGHFTVWALIGEE 1349
            |.||..:...|...|.....|....||.||||..|::||.||||||:......|.|.:|||:|.:
Human  1290 RKRQRLESAEGVLRPGAIRDGPATGLGSFLRRTARSILDLPWQIVQISETSQAGLFRLWALVGSD 1354

  Fly  1350 LHKIKLTVPRIFYVNQRSAAPPEEGQLWRKVNRVLPRSRPVFNLYRYSVPEQLFRDNSLGMLADL 1414
            ||.|:|::||:|||||| .|..|||..:||||||||||..|:|||.|||||.:::::...:.|:|
Human  1355 LHCIRLSIPRVFYVNQR-VAKAEEGASYRKVNRVLPRSNMVYNLYEYSVPEDMYQEHINEINAEL 1418

  Fly  1415 ATPDIEGIYETQMTLEFRALMDMGCICGVQREEARRLAQLATKDLETFSIEQLEQRPQTQVKYLA 1479
            :.|||||:||||:.|.||||:.:||:|.|.::..|.|:..   :.|||::|.||.|...|..||.
Human  1419 SAPDIEGVYETQVPLLFRALVHLGCVCVVNKQLVRHLSGW---EAETFALEHLEMRSLAQFSYLE 1480

  Fly  1480 SANNRLRKIYLYQHNTPTAKKEIWSLILMPSKKAFVFALDTVRANQMPNMRQLYTAERLALLKNL 1544
            ..:  :|.||||.|  ..|.|.::.:.:...::|.||.|||||:||||::..||:||...||:.:
Human  1481 PGS--IRHIYLYHH--AQAHKALFGIFIPSQRRASVFVLDTVRSNQMPSLGALYSAEHGLLLEKV 1541

  Fly  1545 TAEEQDKIPVEDYTFEVLIEVDVKQIYRHIQRALTTYKQEHQGPTILCLQTALSARKLSLAMPIL 1609
            ..|   .:|...:||||..|.|:|.|.|.|||.|..||:|.:|||::.:|::...::|:..:|:|
Human  1542 GPE---LLPPPKHTFEVRAETDLKTICRAIQRFLLAYKEERRGPTLIAVQSSWELKRLASEIPVL 1603

  Fly  1610 LEFPQAEIHISDDASLLSGLDWQRQGSRAVIRHFLNLNNVLDLMLDQCRYFHVPIGNMPPDTVLF 1674
            .|||...|.::|..: ...|||||.|:|.:|||:|||:..|....:..||||:||||:|.|...|
Human  1604 EEFPLVPICVADKIN-YGVLDWQRHGARRMIRHYLNLDTCLSQAFEMSRYFHIPIGNLPEDISTF 1667

  Fly  1675 GADLFFARLLQRHNFVLWWSASTRPDLGGREADDSRLLAEFEESISVVQNKAGFYPDVCVELALD 1739
            |:||||||.|||||.:||.|.:.||||||:||||:.|:.||::..:|..|.:|.|..|||||.|.
Human  1668 GSDLFFARHLQRHNHLLWLSPTARPDLGGKEADDNCLVMEFDDQATVEINSSGCYSTVCVELDLQ 1732

  Fly  1740 SLAVSALLQSTRIQEMEGASS-AITFDVMPQVSLEEMIGTVPAATLP-SYDETALCSAAFRVMRS 1802
            :|||:.:|||..:.:||||.| .|:|||:.|.|||:||....||:.| |||||||||..||:::|
Human  1733 NLAVNTILQSHHVNDMEGADSMGISFDVIQQASLEDMITGGQAASAPASYDETALCSNTFRILKS 1797

  Fly  1803 MVNGWLREVSINRNIFSDFQIVHFYRWVRSSNALLYDPALRRSLNNLMRKMFLRIIAEFKRLGAT 1867
            ||.||::|::...||::|.|::|||||:||.::||:||||.|:|:|:|:|:||::||||||||::
Human  1798 MVVGWVKEITQYHNIYADNQVMHFYRWLRSPSSLLHDPALHRTLHNMMKKLFLQLIAEFKRLGSS 1862

  Fly  1868 IIYADFNRIILSSGKKTVSDALGYVDYIVQSLRNKEMFHSIQLSFEQCWNFMLWMDQANFSGIRG 1932
            :|||:||||||.:.|:.|.||:.||:||..|:.:||.|||:.:||.:||.|:||||.:|:.||:|
Human  1863 VIYANFNRIILCTKKRRVEDAIAYVEYITSSIHSKETFHSLTISFSRCWEFLLWMDPSNYGGIKG 1927

  Fly  1933 KLPKGIDETVSSIVSTTMIRDSER--NQDDDEDEEEDSENRDPVESNEAEQDQEDELSLELNWTI 1995
            |        |||.:... ::||::  ..:|:::.|:|.|.||..|..|||:...::| ||.||.|
Human  1928 K--------VSSRIHCG-LQDSQKAGGAEDEQENEDDEEERDGEEEEEAEESNVEDL-LENNWNI 1982

  Fly  1996 GEHLPDENECREKFESLLTLFMQSLAE------------------------KKTTEQAI------ 2030
            .:.||....|:..|..:::.::.::..                        .:..|.|:      
Human  1983 LQFLPQAASCQNYFLMIVSAYIVAVYHCMKDGLRRSAPGSTPVRRRGASQLSQEAEGAVGALPGM 2047

  Fly  2031 ---------KDISHCAFDFILKLHKNYGKGKPS-------------------PGLELIRTLIKAL 2067
                     .:::...|....|:.|.....:.|                   |.||.|:.:.|.|
Human  2048 ITFSQDYVANELTQSFFTITQKIQKKVTGSRNSTELSEMFPVLPGSHLLLNNPALEFIKYVCKVL 2112

  Fly  2068 SVDKTLAEQINELRRNMLRLVGIGEFSDLAEWEDPCDSHIINEVICKACNHCRDLDLCKDKHRAM 2132
            |:|..:..|:|:|.|::||||.:||||:.|::.|||.|:::.||||::||.|||||||||...: 
Human  2113 SLDTNITNQVNKLNRDLLRLVDVGEFSEEAQFRDPCRSYVLPEVICRSCNFCRDLDLCKDSSFS- 2176

  Fly  2133 KDG--VPVWLCAQCYVAYDNEEIEMRMLDALQRKMMSYVLQDLR----CSRCSEIKR 2183
            :||  :|.|||:.|...||:..|||.:::.||:|:|::.|||||    ..:|.|.:|
Human  2177 EDGAVLPQWLCSNCQAPYDSSAIEMTLVEVLQKKLMAFTLQDLRKEADTPKCEEKER 2233

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DNApol-epsilon255NP_524462.2 DNA_polB_epsilon_exo 266..469 CDD:99822 154/202 (76%)
POLBc_epsilon 529..1154 CDD:99918 466/624 (75%)
DUF1744 1529..1930 CDD:369900 205/402 (51%)
POLEXP_011533097.1 PolB 99..1165 CDD:223494 745/1068 (70%)
DNA_polB_epsilon_exo 268..471 CDD:99822 154/202 (76%)
POLBc_epsilon 531..1153 CDD:99918 466/624 (75%)
DUF1744 1529..1925 CDD:285663 205/399 (51%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C165158695
Domainoid 1 1.000 417 1.000 Domainoid score I653
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG0417
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H4539
Inparanoid 1 1.050 2471 1.000 Inparanoid score I32
Isobase 1 0.950 - 0 Normalized mean entropy S834
OMA 1 1.010 - - QHG55019
OrthoDB 1 1.010 - - D16244at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004282
OrthoInspector 1 1.000 - - oto91852
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101586
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR10670
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R346
SonicParanoid 1 1.000 - - X3018
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
User_Submission 00.000 Not matched by this tool.
1817.750

Return to query results.
Submit another query.