DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Irp-1A and Ireb2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_477371.1 Gene:Irp-1A / 42689 FlyBaseID:FBgn0024958 Length:902 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038938018.1 Gene:Ireb2 / 64831 RGDID:621539 Length:964 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:962 Identity:505/962 - (52%)
Similarity:672/962 - (69%) Gaps:106/962 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    24 KYFDLPSI-DSKYESLPFSIRVLLESAVRNCDNFHVLEKDVQSILGWTPSLKQETSDVEVSFKPA 87
            |:|::|.: .:||:.||:|||||||:||||||.|.:.::||.:||.|    |.:.|:|||.|.||
  Rat    25 KFFNVPKLGGTKYDILPYSIRVLLEAAVRNCDGFLMKKEDVINILDW----KTKQSNVEVPFFPA 85

  Fly    88 RVILQDFTGVPAVVDFAAMRDAVRELGGNPEKINPICPADLVIDHSVQVDF-------------- 138
            ||:||||||:||:|||||||:||:.|||:|:|::|.||.||.:|||:|:||              
  Rat    86 RVVLQDFTGIPAMVDFAAMREAVKTLGGDPKKVHPACPTDLTVDHSLQIDFSKCAIQNAPNPGGG 150

  Fly   139 -----------------------------------------------------------VRSSDA 144
                                                                       |...:.
  Rat   151 DLQKAGKLSPLKVQPKKLPCRGQTTCRGSCDSGELSRNSGTFSSQIENTPVLCPFHLQPVPEPET 215

  Fly   145 LTKNESLEFQRNKERFTFLKWGARAFDNMLIVPPGSGIVHQVNLEYLARVVFESDSSADGSKILY 209
            :.||:.:||.||:||..|.||.:.||.|:.::|||:|:.||||||:|:|||||   .||   :|:
  Rat   216 VLKNQEVEFGRNRERLQFFKWSSGAFKNVAVIPPGTGMAHQVNLEHLSRVVFE---EAD---LLF 274

  Fly   210 PDSVVGTDSHTTMINGLGVLGWGVGGIEAEAVMLGQSISMLLPEVIGYRLEGKLGPLATSTDLVL 274
            ||||:|||||.||:||||:|||||||||.||||||..:::.||||:|..|.|......||.|:||
  Rat   275 PDSVIGTDSHITMVNGLGILGWGVGGIETEAVMLGLPVTLTLPEVVGCELTGSSNAFVTSIDIVL 339

  Fly   275 TITKHLRQLGVVGKFVEFYGPGVAELSIADRATISNMCPEYGATVGYFPIDENTLSYMRQTNRSE 339
            .|||||||:||.||||||:|.||::|||.||.||:||||||||.:.:||:|..||.::..|...:
  Rat   340 GITKHLRQVGVAGKFVEFFGSGVSQLSIVDRTTIANMCPEYGAILSFFPVDNVTLRHLEHTGFDK 404

  Fly   340 KKIDIIRKYLKATRQLRDYSLVDQ---DPQYTESVTLDLSTVVTSVSGPKRPHDRVSVSSMCEDF 401
            .|::.:.:||||.:..|:    |:   :|:|::.:.::|:::|.||||||||.|||:|:.|..||
  Rat   405 TKLESMEEYLKAVKLFRN----DENSSEPEYSQVIQINLNSIVASVSGPKRPQDRVAVTDMKSDF 465

  Fly   402 KSCLISPVGFKGFAIPPSALAASGEFQWD------DGKSYKIGHGSVVIAAITSCTNTSNPSVML 460
            ::||...||||||.:       :.|.|.|      ||..||:.||||||||:.||||..||||||
  Rat   466 QACLNEKVGFKGFQV-------AAEKQSDTVSVRYDGSEYKLSHGSVVIAAVISCTNNCNPSVML 523

  Fly   461 GAGLLAKNAVQKGLSILPYIKTSLSPGSGVVTYYLRESGVIPYLEQLGFDIVGYGCMTCIGNSGP 525
            .||||||.||:.||.:.|||:||||||||:||:||..|||:|||.:|||:||||||.||:||:.|
  Rat   524 AAGLLAKKAVETGLRVKPYIRTSLSPGSGMVTHYLSSSGVLPYLSKLGFEIVGYGCSTCVGNTAP 588

  Fly   526 LDENVVNTIEKNGLVCCGVLSGNRNFEGRIHPNTRANYLASPLLVIAYAIAGRVDIDFEIEPLGV 590
            |.|.::|.:::..||.|||||||:|||||:....||||||||.||:||||||.|:|||:.||||.
  Rat   589 LSEAILNAVKQGDLVTCGVLSGNKNFEGRLCDCVRANYLASPPLVVAYAIAGTVNIDFQTEPLGT 653

  Fly   591 DSNGKEVFLRDIWPTRSEIQEVEHKHVIPAMFQEVYSKIQLGSRDWQTLEVSDSKLYPWSEISTY 655
            ||.||.::|.||||:|.|:.::|.:|||.:||:.:..|:::|::.|.:|:..||.|:||...|||
  Rat   654 DSTGKNIYLHDIWPSREEVHQIEEEHVILSMFKALKEKVEMGNKRWNSLDAPDSVLFPWDVKSTY 718

  Fly   656 IKLPPFFEGMTRALPKLKGIEKARCLLLLGDSVTTDHISPAGSIARKSPAARYLSERGLTPRDFN 720
            |:.|.||:.:|:.....:.||.|..||.||||||||||||||||||.|.||:||:.||||||:||
  Rat   719 IRCPSFFDKLTKEPAASQPIENAHVLLYLGDSVTTDHISPAGSIARSSAAAKYLTNRGLTPREFN 783

  Fly   721 SYGSRRGNDAVMARGTFANIRLVNKLASKTGPSTLHVPSGEEMDIFDAAERYASEGTPLVLVVGK 785
            |||:||||||||.|||||||:|.||...|..|.|:|.|||:.:|:|:|||.|..||.||:::.||
  Rat   784 SYGARRGNDAVMTRGTFANIKLFNKFIGKPAPKTIHFPSGQTLDVFEAAELYQKEGIPLIILAGK 848

  Fly   786 DYGSGSSRDWAAKGPFLLGIKAVIAESYERIHRSNLVGMGIIPLQFLPGQSADTLKLSGREVYNI 850
            .||||:|||||||||:|||:|||:|||||:||:.:|:|:||.||:||||::||:|.||||||:::
  Rat   849 KYGSGNSRDWAAKGPYLLGVKAVLAESYEKIHKDHLIGIGIAPLEFLPGENADSLGLSGREVFSL 913

  Fly   851 VLPEGELKPGQRIQV-DADGNVFETTLRFDTEVDITYYKNGGILNYMIRKML 901
            ..|| ||.||..:.: .:.|..|.....|:.:|:||.||:||:||::.||.|
  Rat   914 SFPE-ELFPGITLNIKTSTGKEFSVIAAFENDVEITLYKHGGLLNFVARKFL 964

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Irp-1ANP_477371.1 PTZ00092 1..901 CDD:240263 504/960 (53%)
Ireb2XP_038938018.1 PTZ00092 6..962 CDD:240263 502/958 (52%)

Return to query results.
Submit another query.