DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment mRRF2 and Gfm2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_732771.2 Gene:mRRF2 / 42670 FlyBaseID:FBgn0051159 Length:740 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001094135.1 Gene:Gfm2 / 294672 RGDID:1309854 Length:779 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:750 Identity:305/750 - (40%)
Similarity:455/750 - (60%) Gaps:54/750 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    27 RSYSS---------------------KIRNIGILAHIDAGKTTTTERMLFYAGKTRALGEVHRGN 70
            |||||                     |||||||:|||||||||||||:|:|:|.||:||:|..|:
  Rat    43 RSYSSPPGIVGNEVKSLHSIINPPVAKIRNIGIMAHIDAGKTTTTERILYYSGYTRSLGDVDDGD 107

  Fly    71 TVTDYLTQERERGITICSSAVTFSWNDHRINLLDTPGHIDFTMEVEQSLYAVDGVVVVLDGTAGV 135
            ||||::.|||||||||.|:|||..|..:|:||:|||||:|||:|||:.|..:||.|.|.|.:|||
  Rat   108 TVTDFMAQERERGITIQSAAVTLDWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGV 172

  Fly   136 EAQTVTVWSQADKHKLPRLIFVNKMDRPDADFEKCVSDLKDKLETQPVCLQYPVKNEDGVLAIND 200
            ||||:|||.||||||:||:.|:||||:..|.|...|..:::||:.:|:.||.|:........:.|
  Rat   173 EAQTLTVWRQADKHKIPRICFLNKMDKTGASFNYAVESIREKLKAKPLILQLPIGEARTFQGVVD 237

  Fly   201 VITLERLSW-QQKDLGRSYRNVKLEPSDDLRLLQ---EKRNELIDQLSGLDDELADVVIS--TES 259
            |:..|:|.| ...|.|:.:....|..:.|..||:   |.||.||:|::.||||.||:|:.  :|.
  Rat   238 VVNREKLIWNSDSDDGKDFERKPLSEASDPTLLKETVEARNSLIEQVADLDDEFADLVLGEFSED 302

  Fly   260 FDNVDNALIERALRRATTQQKVVPVLLGSAYKNVGIQRLMDAVNAYLPAPEERNQ-IYDCFGTEV 323
            ||.|....::.|:.|.|..|..||||.|||.||.|:|.|:|||..|||:||||.. ....:..::
  Rat   303 FDLVPAEKLQAAIHRVTLAQAAVPVLCGSALKNKGVQPLLDAVTTYLPSPEEREHGFLQWYKGDL 367

  Fly   324 AGKVFKIVHDKQRGPLTLVRILRGEIKRGMRLISA-RGQAEVVSKLYEPLADEYREVSAVQSGDV 387
            ....||::||||||||..:||..|.:.....:.:. |...|.:|:|..|.||::.|:.::.:|::
  Rat   368 CALAFKVLHDKQRGPLVFLRIYSGTLTPQSAVHNVNRNCTERMSRLLLPFADQHVEIPSLTAGNI 432

  Fly   388 VICAGLKSTVTGDLLTSSQSALKNAQKRYKQSLGNTAAKVE-EDDELDESDELFAIDPQIPDAVY 451
            .:..|||.|.|||.:.||:|:...|.:|        |.|.| :...:.|::.:.....:||:.|:
  Rat   433 ALTVGLKQTATGDTIVSSKSSALAAARR--------AGKGERKPGRISEAESVLLAGVEIPEPVF 489

  Fly   452 FCSIEPPSVSSQTAMEQALKQLQREDPSLRVSYDSVTGQTVLGGMGELHMDIIKSRILSEYKIDV 516
            ||:|||||.:.|..::.||:.||||||||:|..|..:|||||.||||||::||..||..||.::.
  Rat   490 FCTIEPPSAAKQPDLDHALEHLQREDPSLKVKLDPDSGQTVLCGMGELHIEIIHDRIKREYGLET 554

  Fly   517 DLGPLQIAYKETIEAPALTTLSVEKEIAGSKQSVSITLEVVKNQAELFSLDKSPDNLPNL---NT 578
            .|||||:||:|||......|.::::.:...:......|||  ..||      .|..:..:   ::
  Rat   555 YLGPLQVAYRETILNSVRATDTLDRVLGDKRHFARAELEV--RPAE------EPCGVATIEYADS 611

  Fly   579 LRPRILQVLRKGSISALE----RGPRVGGQVVETQIRLHNATIGRGTADSFVMATAAQCVQKLLS 639
            :...:||..|:...:|:.    :||.:|..:.:..:.||:..|..||:.:.|.|..::||||.|.
  Rat   612 VGEDLLQAPREDIENAVHSACLQGPLLGSPIQDVAVTLHSLMIHPGTSTTMVTACISRCVQKALK 676

  Fly   640 TSGTRLLEPIMALQIVAPSERISGIMADLSRRRALINDVLPKGERNKMILVNAPLAELSGYSSAL 704
            .:..::|||:|:|::....|.:|.::|||::||..|.::..: :.||::|...||||:.|||:.|
  Rat   677 KADKQVLEPLMSLEVTVSREYLSPVLADLAQRRGNIQEIQTR-QDNKVVLGFVPLAEIMGYSTVL 740

  Fly   705 RTISSGTASMTMQPCGFSSMNSVDESLAERRAQGL 739
            ||::||:|:..::...:.:|:..|:.....:..||
  Rat   741 RTLTSGSATFALELSTYQAMSPQDQRTLLSQRSGL 775

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
mRRF2NP_732771.2 FusA 30..734 CDD:440248 300/740 (41%)
Gfm2NP_001094135.1 FusA 66..774 CDD:440248 298/724 (41%)

Return to query results.
Submit another query.