DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CCT1 and Tcp1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524450.2 Gene:CCT1 / 42649 FlyBaseID:FBgn0003676 Length:557 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_036802.1 Gene:Tcp1 / 24818 RGDID:3832 Length:556 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:555 Identity:406/555 - (73%)
Similarity:475/555 - (85%) Gaps:2/555 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 LASPLSIAGTRQSGASVRTQNVMAALSISNIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTVTNDGATILRLL 68
            :..|||:.|.|.:|.::|:||||||.||:||||||||||||||||||||||||:||||||||:||
  Rat     1 MEGPLSVFGDRSTGEAIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGATILKLL 65

  Fly    69 EVEHPAAKVLVELAQLQDEEVGDGTTSVVILAAELLKNADELVKQKIHPTSIISGYRIACKEACK 133
            ||||||||||.|||.|||:|||||||||||:||||||||||||||||||||:|||||:|||||.:
  Rat    66 EVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVR 130

  Fly   134 YISEHLTAPVDELGRDSLINIAKTSMSSKIIGADAEFFSAMVVDAAQSVKITDPRGQAAYSIKAI 198
            ||:|:|....||||||.|||.|||||||||||.:.:||:.|||||..:||.||.|||..|.:.::
  Rat   131 YINENLIINTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVVDAVLAVKYTDIRGQPRYPVNSV 195

  Fly   199 NVLKAHGKSARESVLIPGYALNCTIASQQMPKKIVNAKIACLDFSLQKTKMKMGVQVLINDPDKL 263
            |:|||||:|..||:||.||||||.:.||.|.|:|||||||||||||||||||:||||:|.||:||
  Rat   196 NILKAHGRSQIESMLINGYALNCVVGSQGMLKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKL 260

  Fly   264 EAIRARELDITKERINMILGTGVNVVLVSGGVDDLCMKYFVEAGAMAVRRVKKSDLKIIAKATGA 328
            :.||.||.|||||||..||.||.||:|.:||:||:|:||||||||||||||.|.|||.||||:||
  Rat   261 DQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGA 325

  Fly   329 AFITSLTNMDGEESFDASMVGEAAEVAQERICDDELILIKGTKARAAASIILRGPNDFYCDEMER 393
            :.:::|.|::|||:|:|:|:|:|.||.|||||||||||||.||||.:|||||||.|||.||||||
  Rat   326 SILSTLANLEGEETFEATMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASIILRGANDFMCDEMER 390

  Fly   394 SVHDALCVVKRVLESKKVVAGGGCVEAALSIYLENFATSLASREQLAIAEFAKSLLVIPKTLSVN 458
            |:||||||||||||||.||.|||.|||||||||||:|||:.|||||||||||:||||||.||:||
  Rat   391 SLHDALCVVKRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVN 455

  Fly   459 AAKDATDLVAKLRSYHNSSQTKPERSDLKWTGLDLIEGVVRDNKKAGVLEPAMSKIKSLKFATEA 523
            ||:|:||||||||::||.:|..|||.:|||.||||:.|..||||:|||.||.:.|:|||||||||
  Rat   456 AAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLVHGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEA 520

  Fly   524 AITILRIDDMIKLNPEDKSGK--SYADACAAGELD 556
            |||||||||:|||:||.|..|  .|.:|..:|.||
  Rat   521 AITILRIDDLIKLHPESKDDKHGGYENAVHSGALD 555

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CCT1NP_524450.2 TCP1_alpha 12..538 CDD:239451 394/525 (75%)
Tcp1NP_036802.1 TCP1_alpha 9..535 CDD:239451 394/525 (75%)

Return to query results.
Submit another query.