Protein Alignment PolA1 and cdc6

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_536736.2
• Gene: PolA1 / 42553
• FlyBaseID: FBgn0259113
• Length: 1488
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_596124.1
• Gene: cdc6 / 2540255
• PomBaseID: SPBC336.04
• Length: 1086
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1204
• Identity: 262/1204 - (21%)
• Similarity: 489/1204 - (40%)
• Gaps: 277/1204 - (23%)

  Fly   306 EKSAPKKETTGSPKESESEDISRLLNNWESICQMDDDFEKSVLTTEQDSTISSDQQLRFW----- 365
            :|.:..||.|.|.::..:|..|          |:|.|..||          |.|||   |
pombe    47 KKGSSSKEKTSSFEDELAEYAS----------QLDQDEIKS----------SKDQQ---WQRPAL 88

  Fly   366 ----------YWEAYEDPVKMPGEV---FLFGRTADGKSVCLRVQNINRVLYLLPRQFLLDPISK 417
                      |::..:......|.|   .|||.|.:|.|:.:      .|:..||..::..|:..
pombe    89 PAINPEKDDIYFQQIDSEEFTEGSVPSIRLFGVTDNGNSILV------HVVGFLPYFYVKAPVGF 147

  Fly   418 EPTKQKVTVADIYKEFDSEVANQLKLEFFRSRKVTKSFAHHAIGIEVPQSCDYLEVHYDGKKPLP 482
            .|...:....|:....:..|.:...:|          ...:..|.:..:...::::.....:.|.
pombe   148 RPEMLERFTQDLDATCNGGVIDHCIIE----------MKENLYGFQGNEKSPFIKIFTTNPRILS 202

  Fly   483 ---NLSADKKYNSIAHIF----GAT-----TNALERFLLDRKIKGPCWLQVTGFKVS---PTPMS 532
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pombe   203 RARNVFERGEFN-FEELFPVGVGVTTFESNTQYLLRFMIDCDVVGMNWIHLPASKYQFRYQNRVS 266

  Fly   533 WCNTEVTLTEPKNVELVQDKGKPAPPPPLTLLSLNV----RTSMNPKTSRNEICMISMLTHNRFH 593
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pombe   267 NCQIEAWINY-KDLISLPAEGQWSKMAPLRIMSFDIECAGRKGVFPDPSIDPVIQIASI------ 324

  Fly   594 IDRPAPQPAFNRHM-CALTRPAVVSWPLDLNFEMAKYKSTTVHKHDSERALLSWFLAQYQKIDAD 657
            :.:......|.|:: |..|...:|              .|.|::..::..:||.:....:.:|.|
pombe   325 VTQYGDSTPFVRNVFCVDTCSQIV--------------GTQVYEFQNQAEMLSSWSKFVRDVDPD 375

  Fly   658 LIVTFDSMDCQLNVITDQIVALKIPQWSRMGRLR-----------LSQSFGKR--LLEHFVGRMV 709
            :::.::..:..:..:.|:..:|:|..:..:||:.           .|:::|.|  ......||:.
pombe   376 VLIGYNICNFDIPYLLDRAKSLRIHNFPLLGRIHNFFSVAKETTFSSKAYGTRESKTTSIPGRLQ 440

  Fly   710 CDVKRSAEECIRARSYDLQTLCKQVL-KLKESERMEVNADDLLEMYEKG--ESITKLISLTMQDN 771
            .|:.:..:...:.|||.|..:|.|.| :.||.....:..|     .:.|  :|..:|....::|
pombe   441 LDMLQVMQRDFKLRSYSLNAVCSQFLGEQKEDVHYSIITD-----LQNGTADSRRRLAIYCLKD- 499

  Fly   772 SYLL-----RLMCELNIMPLALQITNICGNTMTRTLQGGRSERNEFLLLHAFHEKNYIVPDKKPV 831
            :||.     :|||.:|...:| ::|.:..|.:   |..|:..:....|.....:.:.:||:.:
pombe   500 AYLPQRLMDKLMCFVNYTEMA-RVTGVPFNFL---LARGQQIKVISQLFRKALQHDLVVPNIR-- 558

  Fly   832 SKRSGAGDTDATLSGADATMQTKKKAAYAGGLVLEPMRGLYEKYVLLMDFNSLYPSIIQEYNICF 896
                        ::|.|        ..|.|..|:||::|.|:..:..:||:||||||:|.:|:|:
pombe   559 ------------VNGTD--------EQYEGATVIEPIKGYYDTPIATLDFSSLYPSIMQAHNLCY 603

  Fly   897 TT-----------VQQPVDADELPTLPDSKTEP----GILPLQLKRLVESRKEVKKLMAAPDLSP 946
            ||           ::|.||....|. .|...:|    |:||:.|..|:.:||:.|     .||..
pombe   604 TTLLDSNTAELLKLKQDVDYSVTPN-GDYFVKPHVRKGLLPIILADLLNARKKAK-----ADLKK 662

  Fly   947 EL----QMQYHIRQMALKLTANSMYGCLGFAHSRFFAQHLAALVTHKGREILTNTQQLVQK---- 1003
            |.    :.....||:|||::|||:||..|..:.|.....:::.||..||:::..|:.:|:|
pombe   663 ETDPFKKAVLDGRQLALKVSANSVYGFTGATNGRLPCLAISSSVTSYGRQMIEKTKDVVEKRYRI 727

  Fly  1004 ---MNYD--VVYGDTDSLMINTNITDYDQVYKIGHNIKQSVNKLY-KQLELDIDGVFGCLLLLKK 1062
               .::|  |:||||||:|:...:....:..|:|......|:..: ..::|:.:.|:...||:.|
pombe   728 ENGYSHDAVVIYGDTDSVMVKFGVKTLPEAMKLGEEAANYVSDQFPNPIKLEFEKVYFPYLLISK 792

  Fly  1063 KKYAAIKLSKDSKGNLRREQEHKGLDIVRRDWSQLAVMVGKAVLDEVLSEKPLEEKLDAVHAQLE 1127
            |:||.:..::....:   :.:.||::.||||...|.    ..|:|..|.:..:::.::......:
pombe   793 KRYAGLFWTRTDTYD---KMDSKGIETVRRDNCPLV----SYVIDTALRKMLIDQDVEGAQLFTK 850

  Fly  1128 KIKTQIAEGVVPLPLFVITKQLTRTPQEYANSASLPHVQVALRM-NRERNRRYKKGDMVDYVICL 1191
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pombe   851 KVISDLLQNKIDMSQLVITKALSKT--DYA--AKMAHVELAERMRKRDAGSAPAIGDRVAYVIIK 911

  Fly  1192 DGTTNAAMQRAYHLDELKTSED------KKLQLDTNYYLGHQIHPVVTRMVEVLEGTDASRIAEC 1250
            ....:....|         |||      ..:.:|..|||.:|:...:.|:.|.:.|..||.:.
pombe   912 GAQGDQFYMR---------SEDPIYVLENNIPIDAKYYLENQLSKPLLRIFEPILGEKASSLL-- 965

  Fly  1251 LGMDPTKFRQNAQRTQRENTEQSEGESLLKTTLQLYRLCEPFRFQCVTCKTEQLMASAYRPGPSN 1315
                      :...|:..:........::|..:::.        .|:.||      :..:.|.:
pombe   966 ----------HGDHTRTISMAAPSVGGIMKFAVKVE--------TCLGCK------APIKKGKT- 1005

  Fly  1316 SHIAVLQQCAKSECQTAPIQYLASVRNQLQLSMRQYVQ------RFYKNWLVCD------HPDCN 1368
               |:.:.|               :....:|..||..|      ||.:.|..|.      |.|..
pombe  1006 ---ALCENC---------------LNRSAELYQRQVAQVNDLEVRFARLWTQCQRCQGSMHQDVI 1052

  Fly  1369 FNTR---THSLRKKSHRPLCQKCRSGSLLRQYTE 1399
            ..:|   ...:|...|:.|.|   |..||:::.|
pombe  1053 CTSRDCPIFYMRIAEHKKLQQ---SVDLLKRFDE 1083

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
PolA1	NP_536736.2	pol2	52..1237	CDD:273159	231/1025 (23%)
		zf-DNA_Pol	1286..1459	CDD:462651	25/129 (19%)
cdc6	NP_596124.1	PTZ00166	85..1083	CDD:240301	244/1141 (21%)