DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc93AB and Dnah14

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262793.1 Gene:Dhc93AB / 42485 FlyBaseID:FBgn0013812 Length:4496 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038947405.1 Gene:Dnah14 / 690288 RGDID:1582826 Length:4606 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4789 Identity:1249/4789 - (26%)
Similarity:2122/4789 - (44%) Gaps:966/4789 - (20%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   485 AFASKSYDVLDPDDHEFD--------------EDFKGFQTRILELDMKLAAILCQAFDD----CH 531
            :|......|..||.:|.:              :|....|.|:.:......:::.:..||    ..
  Rat     3 SFIPVDLPVQKPDVNEKERNSRRRHLLYKDRWKDCGSSQNRLAKAKTSSESLISEGADDQDYYPD 67

  Fly   532 NLESIFKLISIVGSV-----LDRPKIKEEFTQRYAEIVRMLDDEMTICESIYDKQMELKK----V 587
            .||..|....:|||.     :.:.|.|.|.|.|    ||....::|:.:|...|:.:..|    :
  Rat    68 YLEQKFSRQCVVGSKPFLPDIKKAKEKPEKTAR----VRRKWPQVTLYDSTEPKETDAVKHIIRL 128

  Fly   588 GDNL------YP---NYNCPPVAA--------------FIRWCHQLE-TR----------ITA-P 617
            .:.|      :|   .|: |.:.|              || :|..|| ||          ::| .
  Rat   129 REKLEWENPSFPRSLKYS-PKITAPKHTLKACLKDDGEFI-YCLPLENTRGMFNEYDLQAVSAHK 191

  Fly   618 VKNFK-------ALQHEITKTEKSQEIVER-------------YEILMVKLGSCKTQFFD----- 657
            .||.|       :...:||||..:.|.||.             |.:|..|:      |::     
  Rat   192 AKNCKVFWMVSASFVSKITKTGVNTEEVELIPTVEWLSERHYFYLLLQFKI------FYNFRINK 250

  Fly   658 ---DWAGQLDGQIEENLKKSL---------------------------IARDRRHN----SLILN 688
               .|...:..|..|:.:..|                           :.::::.|    .||..
  Rat   251 AFVTWKLNVKRQKTESSRSYLYSHLFSADELFQTSLLYVRGLCEDALTLKKNKKDNPSAICLIKV 315

  Fly   689 FSAALFSI-----------LREVHYMQQMKIEGIPQI---AIDFAEKSDV---FRSYTLNLEKT- 735
            .::..:|:           .:.|..:::|:.:.|.:|   |:..|||.||   |.|....::.| 
  Rat   316 DTSRTYSLEKFCEEQLQQATQAVVQLEEMRSKAIVEIKSTALKVAEKKDVKEYFESKPAEIDTTH 380

  Fly   736 --IDWYNSIQEGSSPVELRLIEPEI-KMIDDLVEIGVNQLVWNSSDILSYLDKLRKPVAALQNRM 797
              :..|..:.|.:... |:||:... ::|..|:...:|||:    |:.::  ..|.|.:     .
  Rat   381 FKLPQYRCLLETNMKF-LKLIDYLFQELIRQLMNSALNQLL----DLFTH--SARTPFS-----K 433

  Fly   798 DHTQGNLRQIRKIMGVWAKQPLFER-----------RDCKKDTVLSIDERPDRTSKRYA------ 845
            :....:|.:.|||         |.|           |...:|:.|..|...:.||.|:.      
  Rat   434 ERRNESLMRDRKI---------FSRKISDDGEFVHSRLTAQDSELKQDTNVNETSNRHTAKTDLK 489

  Fly   846 EIQAASIEIHKLLQ--------DNMLQFDMESKQDDAVWLSYVDFVDNIV--------------- 887
            :..||..||...|:        :::.:...::||.....|.|.:..:|.|               
  Rat   490 KAYAAIFEISFCLRTPTVSDSPEDLEENTQKTKQSREESLMYEEEQENRVRTVSEDLLSQYYQPS 554

  Fly   888 -YENILKTVGVSVGYLAENMDPENNYAPLFESRLEL-VEPNLVFVPSLDPEDPMGFNNM------ 944
             :..:||.:....|.|.|: :.|..|..|.|....| :|||.:       :....|.||      
  Rat   555 KFGVLLKRILSDTGLLLES-EQERFYNKLSEFPTNLFMEPNRL-------DFSTQFQNMIAAIEK 611

  Fly   945 ----LIELMRDIMKMGSLIKRLK----PNEKRNYVEMIKENQ----------------DIIDMRR 985
                |:.|.|| .::.:|:..:.    .|:.:..|:..|..|                .|:.:..
  Rat   612 YITTLVPLQRD-PRLSTLVDLVSVPDLSNQTKGRVKYKKHAQWPDYYILFDTDADYQNKIVSLLA 675

  Fly   986 EILNGVDLVMEEASRFCRQFERYSYLWLDDREECMEYFLEYGRMLDPDEIELILINDPNQPPPQP 1050
            .|.|.|.||    |.:..:|.:|.|:....:..|.:..|    |::...||.             
  Rat   676 LIGNSVGLV----SGYSYRFLKYCYMVEKAKVMCTKLPL----MMNLTSIEF------------- 719

  Fly  1051 CQPTIEAFREQIDNYESLFNEIEDIGPFQVFSSWFQVDVRPFRQALLNTVCKWGNMFKEHLVTTV 1115
             :..|..||..:....::..|:. :|.|.|.:..:|:...|:..:::       .|....|..|:
  Rat   720 -KNIIHKFRSYLKQIVTMAVEMR-LGIFCVKTLDYQLACLPYVDSII-------QMSYNLLRCTI 775

  Fly  1116 TSSLMNLSHFIRKADEGLLQTVKEK-DYEGLVSIMAYLMQVKERAAKTDEMFEPMQETIQLLKYY 1179
            .....||...:   :..|.|...|. :.|..|....:|.::.....:.::.|..:.|...::::|
  Rat   776 EDRSANLLEIL---ESSLRQLDAEPIEVEQFVEHFNFLDEISSSVTQIEKDFCTITELYSVVRHY 837

  Fly  1180 DMDIPEE----------------VNVLLQELPEQWANTKKIASTVKQQVSPLQATEVVSIRNKI- 1227
            .:||.||                .:|.|....:: ||..|...:::..:..|: .:|.::::|| 
  Rat   838 HVDISEEQIAIYKIIFMKFNYLKTSVKLVATSKE-ANLTKFRDSLEAYIVSLR-VDVSNLKDKIR 900

  Fly  1228 ----ALFESHIQLFREVF--------------KTYDFFRFDCYK-PYLLMDRINDDMF--LCESE 1271
                ....:.:|..:::.              |||..:: |.|. .:..|:.:|.|.|  |..:|
  Rat   901 SPILLSTSTPVQQAKDIIQSLSAETESLTLKVKTYSTYQ-DYYDYAHFHMNALNVDEFTQLVMTE 964

  Fly  1272 MRDIQESGSLFEVNIPEFKVLKQCRKELRMLKQLWDYVNIVATSIDDWKT--TPWRKVDVENMDI 1334
            :.||                  :|  :|.:.|.||:       :.::|.|  ..||...::.:||
  Rat   965 ISDI------------------EC--DLMLRKLLWE-------AQEEWGTYFWEWRNCTLQGIDI 1002

  Fly  1335 E-----CKKFAKDIRLLDKEMRPWDTFINLESTVKNMLTSLRAVGELQNPAIRERHWNQLMNSTK 1394
            :     ..|:...|.:|:|.:...|....|:.:|.:....|..:..|.||.::.|||..|     
  Rat  1003 DVVKNNVSKWLHIIIVLEKGLPKNDMVALLKQSVLDFKQELPIITALGNPYLKARHWEAL----- 1062

  Fly  1395 SLAALPKEVTVKFI-MDHETTLAELLGLNLHECEEEVKNIVDKAVKEMSMEKILRDLNTTWTVME 1458
                  :|:|.|.| :|...::.:||.|.:...|:::..|...|..|.|:|::|..:...|....
  Rat  1063 ------QEITGKSISLDKSLSVEKLLALKMFPYEKKIIEISVSATNEASLERMLFKVIELWNTSP 1121

  Fly  1459 FDHELHPRTGCNLL--KASEELIETLEDNQVCLQNLITSKYIAHFLEEVSTWQNKLMIADQVITV 1521
            .....|...|.::|  .::::||..|||:|..|..:..|.|:......|:.|...|.:..|.|..
  Rat  1122 LHLVPHITDGRSILIISSTDDLIAQLEDSQAILSTIKGSSYLRPIKHLVNEWNQNLTLFSQTIDE 1186

  Fly  1522 WFEVQRTWTHLESIFMSSEDIRKQLPVDSDRFDNIDAEFRVLMDEMSVSSNVVASTNRSGLIERL 1586
            |...||.|..||.:|.|.| |:|||..::..|..:...:|.:|..:....|.:..|..:|:::.|
  Rat  1187 WMTCQRNWLSLEPVFQSLE-IQKQLAAETKIFSQVLLTWREIMSRVLNKLNALHITITTGILDSL 1250

  Fly  1587 EHLQKELTLCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDVLSNGIQPEMVTKHLTKLFDSIARLKF 1651
            :.....|...:|:|.||||.||:.||||||:|:.:|||:|:|...||.|..||.|.|:::..:..
  Rat  1251 KSCNGHLESIKKSLEEYLELKRMNFPRFYFLSNDELLDILANSRDPESVQPHLVKCFENVRHVLL 1315

  Fly  1652 NRDESNEINTASGMYAKDGEYVEFNELASIRGPVEVWLNRIQAAMRASLRHYVMEAVIAYEEKQR 1716
            .:..... .:...:.:.:||.:...:...:|..:|.|:..::.:|...|:.::.:.:..::....
  Rat  1316 WKQGIGP-PSVKMLISAEGEGLVLPKKIRVRAAIEQWMVNVEKSMFDVLKKFITQGIEDWKFHTF 1379

  Fly  1717 EQWLFDYPAQVSLCGSQIWWSTEVNIAF------SRLEEGYDNAIKDYYKKQISQLSLLITLLLG 1775
            ..|:..:|.||.|..|||.:..:....|      .:||     |:......|:..:::|:|....
  Rat  1380 SDWVMSHPGQVVLTVSQIMFYNDCLKGFMSYNPREKLE-----AVHARVLHQLDDIAMLVTQNTS 1439

  Fly  1776 ELSKGDRQKIMTICT--IDVHSRDVVAKMIQAKLDSGSAFMWQSQLRHRFDDVEKDCFANICDAE 1838
            .|    |.|.|...|  |.||.||::..::...:.:...|.|...|::::::.:|.|:....:..
  Rat  1440 NL----RTKTMLAATLIIYVHCRDILTDLLVKNIFNMQDFEWCRHLQYKWNEKQKLCYVLQANTS 1500

  Fly  1839 FQYCHEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRAIGISVYVF 1903
            |.|.:||||..|||||||||:||:::|:::|:..:||..||.||||||||.|||.::.|....||
  Rat  1501 FVYGYEYLGCAPRLVITPLTERCWLSLSEALYFNLGGCTAGRAGTGKTETVKDLAKSFGKHCVVF 1565

  Fly  1904 NCSEQMDYQSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRITVEVLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDKFNFMGEM 1968
            ||.|.:||:..|.::.||.|:|||.||||||||.:|||||:|.|:..::||......:|...|..
  Rat  1566 NCFEDLDYKIIGKLFFGLVQSGAWCCFDEFNRIDIEVLSVIASQILMIKDAKDSYSVRFLLDGRE 1630

  Fly  1969 ISCVPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFQDARVLARKFI 2033
            :....:..:.||:||||.||.|||.|||:|||..||:||.:::|.|:.|.:.||:.::.|:.|.:
  Rat  1631 VRINMSCAVLITLNPGYRGRVELPSNLKSLFRSVAMMVPHYKMITEVTLFSFGFKSSKSLSGKIV 1695

  Fly  2034 TLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKR------GDPGRPEEE--VLMRALRDFNIPK 2090
            :||.|..:.||||:|||:|:|.:|:||::....|.      |:.....||  :::.|:::.::.|
  Rat  1696 SLYDLADKQLSKQEHYDFGMRTLKTVLIMTEKKKLEHKCTVGEHLSELEESLIIIEAIQEASMSK 1760

  Fly  2091 IITDDMPVFMGLISDLFPALDVPRKRDQDFERTVKQAASDLLLQPEDNFILKVVQLEELLEVRHS 2155
            .:.:|:..|..:|.|:||.:.|.:.:....|:.:..|...|.||.......|::|..:.|:....
  Rat  1761 FLPEDVLPFERIIEDVFPGITVSKTQHLALEKAIHSATEQLGLQQWPPQKAKIIQFYKQLQACVG 1825

  Fly  2156 VFIVGNAGTGKTQVWKTL---LRTYQNIKRKPIFND-----------------LNPKAVTNDELF 2200
            |.:||..|.|||.|.|.|   |.|.......||...                 ||||.:|..||:
  Rat  1826 VILVGPTGGGKTTVRKILEKALITLPVTSALPIKERQSDSKSTGKKGKVDVCVLNPKCITLGELY 1890

  Fly  2201 GIINPATREWKDGLFSVLMRDQANI-TGDQPK--------------------------------- 2231
            |.:|..|.||.|||.|..:|:..:| |.|..|                                 
  Rat  1891 GQLNINTMEWNDGLLSAAIRNYVHINTTDYSKKGSDLGMSGVTDLSNIFQVSFSTIADMDNNIFM 1955

  Fly  2232 ------------------WIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTPSMRLLFEIS 2278
                              ||||||.:|.:|||:||||:|:.:.|.||::|||:||..:||:||:.
  Rat  1956 NKLEKSFKTPETYDFDWQWIVLDGPVDILWIENLNTVLDETRTLCLANSERISLTNKIRLVFEVD 2020

  Fly  2279 NLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWNPYVTSW-VETRKIPAEKSN--LVMLFDKYIPPSLETIRV 2340
            .|..|||:.|:|..::|::|.||||.||:.|| :.|.|...::..  |.::.:|.:...::.:: 
  Rat  2021 TLFNATPSIVTRCAVVYMDPVDLGWEPYIKSWLLRTSKSLNQQGMQCLEIMINKSVDEGMKFLK- 2084

  Fly  2341 RFKKI--TPVAEMAHIQMLCHLLNCFL----IPANTPAD-------CPKE--------------- 2377
            :.||.  .|:.|:..:..||.:|:.|.    |...||..       .|.|               
  Rat  2085 KHKKFLPCPIQEVTVVMTLCRILDAFFEFMHIKRETPKSHEATDNGSPTETKALRVKFKEEKSYN 2149

  Fly  2378 -----WH------------ELYFVFACIWAFGSAMFQ----DQAIDYRVEFS-------KWWVNE 2414
                 |.            :..||||..||||..:.:    ::.:.:|.:|.       .:..:.
  Rat  2150 KDERTWFLERNPEKLPLMIQKIFVFAFTWAFGGILKREDQHEEDLLFRSDFEHDSPAEVTYNFDN 2214

  Fly  2415 FKTVKFP-----------PGG--TVFDYFLDSETKTFLPWTEKIPK--------------FELDS 2452
            |....|.           ||.  ::|.||:|.:...|:||::.:|.              |:...
  Rat  2215 FAREVFEDDSDKGIGIRLPGSEQSIFGYFVDLQQCEFMPWSDLVPNAQTLIQKGTSVLTDFQRSG 2279

  Fly  2453 DLPLQ-------AVIVHTSESIRLRFFLDLLMDKKHPVMLVGNAGCGKTVLVN---EKLQ----- 2502
            :..|:       .....|.:::.|.|.:.||:....||:|.|:.|.|||..:|   |||:     
  Rat  2280 ENVLRMKEYGEYVNYTATRDTVCLSFLMSLLLRNSCPVLLTGDCGVGKTTAINRMLEKLEGQGTF 2344

  Fly  2503 --------------------SLSEN--------------------------------------YA 2509
                                ||.:|                                      ..
  Rat  2345 DIKYGSILGKVLLHNEIKRSSLRQNINVLIGETGKVVGVGLDQGAKTEEDKGDDDSTVKNDKGII 2409

  Fly  2510 VTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPLEKKAGRNYGPPGNKLLCYFVDDINMPEVDAYGTVQPHTLMRQ 2574
            |:|:.|....|:...::::.:.|.:|.....|.|.|..:..|:||:|||..|..|...|..|:||
  Rat  2410 VSTVNFTTTMTAAKTKELILQKLVRKTKDILGAPKNNRIVVFIDDLNMPLPDECGAQPPLELIRQ 2474

  Fly  2575 HLDYGHWYDRNKLTLKDIHNCQYVACMNPTSGSFTINPRLQRHFCVLAVSFPGPESITVMYSSIL 2639
            .||.|..||..:...|.|.:...:|...|::|...|:|||.:||.||.:..|....:..::.:.|
  Rat  2475 LLDMGGIYDTERNVWKSIQDLSLIAACTPSAGGKDISPRLLKHFSVLVLPHPPQSVLCTVFQAHL 2539

  Fly  2640 AQHFANAEQKFTPIVTRMTPNIVAATIALHNKCLQVFLPTAIKSHYIFNLRDISNVFQGLLFSST 2704
            ..:|  :...|...|.:....||..::|::.:..:..|||..|.|||||.||:..:..||:.:..
  Rat  2540 GLYF--SLHNFVTEVQKCRDQIVFCSLAIYYEVCKKMLPTPTKCHYIFNPRDMFKLLLGLMQADK 2602

  Fly  2705 ECLTGSTDLIRLWQHETQRVYSDKLTDDKDIDSF-----TKMQ-HDIVKKSFEEIDESVIFDKPN 2763
            ..:.....:..|..||..||:.|:|.:.|:...|     |::| |..|..|.|.     :.:.|.
  Rat  2603 SVINSKETVALLLVHEASRVFHDRLIEPKEKSLFYQILSTELQNHMQVSWSQES-----LMNNPV 2662

  Fly  2764 IYCHFAGGIGDPK----YMPIKGWPELHKLL---QEAMSSYNDLVAAMNLVLFEDAMMHVCRINR 2821
            ::..|. .:..|.    |.....:.:|..:|   |:.:.| ..|..:.::|.|::|:.|:.|..|
  Rat  2663 LFVDFM-DVNKPHRKRIYQNTDNYDKLLNILTEFQQKLGS-TSLEMSHSVVFFKEAIEHITRTTR 2725

  Fly  2822 ILESPRGSALLVGVGGSGKQSLARLAAFISSLEVVQIQLKKGYGVNDLKNEFSGLYLKAGLKNVG 2886
            :|..|....|::|:.|.||::...:|.:::..::.::.:...|.:::.|.....::::|||:...
  Rat  2726 VLRQPGSHMLMIGMDGCGKETYGTIACYVAEYKICKVPISHNYAISEFKEMLKKVFIQAGLEETP 2790

  Fly  2887 IMFLMTDAQIPSEDFLVLINDMLATGEIPDLFPDDEIENIIAGVRNEVKGAGLVDTRENCWKFFI 2951
            .:.::.:.......||..:|.::..|:|.::|.::|:::|:..||...:.:..:|.|:.....|.
  Rat  2791 TVVMVANLLEEHVSFLEDLNYIINAGKISNMFENEELDSIVMRVRTFAEQSSCMDDRKYLLSLFQ 2855

  Fly  2952 DRVRKQLKI-VLCFSPVGSTLRVRSRKFPAIINATSINWFHEWPQEALISVAMNFLAQNKVLPEN 3015
            .||.|.|.: ::|  ..|...|...|.:|::|::.:|:||..||.||.:.||.::| :.|:..||
  Rat  2856 KRVSKNLHVCMMC--TTGPNFRHSCRVYPSMISSCTIDWFQRWPDEAFLIVANSYL-EEKLNVEN 2917

  Fly  3016 HRDSVAKF---MAYVHTSVNTTSKVYLQNERRYNYTTPKSYLEQINLYIKLLNHKNEDLQSKIER 3077
            ..:.:.:|   ...:|.|:...|..|.:...|:.|.||..|.:.:..:...|..:.|::|:|..|
  Rat  2918 KENKIRQFAPTCVEIHKSMKDLSIKYFEETGRHYYITPSCYFKFLETFTHSLRVRQEEMQTKRNR 2982

  Fly  3078 LENGLEK-LRSTALQVADLKVKLAVQEIELKEKNEAADALIEIVGIET---EKVQTEKAVADEEE 3138
            ...||.| |.:||| |.|::.:|.|...::::|.:..:.|:|.:..::   ||||.  .|..:||
  Rat  2983 FYMGLSKILEATAL-VTDMQEELLVIGPQIEQKAKEKEILMEKLRKDSQIVEKVQV--LVKQDEE 3044

  Fly  3139 M---KVALIADEVSKKQRDCEEDLLKAEPALMAAQDALNTLNKANLTELKSFGSPPGAVTNVTAA 3200
            :   :|.::.|...|...:.:..|    |:|..|..|||.|:|::::||:.:..||..|..|..|
  Rat  3045 IVAEQVKIVEDYAQKTANELKSVL----PSLDKAIVALNALDKSDISELRVYTRPPYLVLTVMNA 3105

  Fly  3201 VMVLLSQGGKVPKDRSWKAAKIAMAKVDT-FLDSLINYDKENIHPEITKAIQPYLKDPEFEPEFV 3264
            |.:||.      |..:|..||:.::  || ||..|||.||::|..::...::..|..|:|.|..:
  Rat  3106 VCILLE------KKPNWTTAKLLLS--DTSFLKRLINLDKDSIPDKVFLRLKKILNLPDFNPSKI 3162

  Fly  3265 RSKSGAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRKALAAANAELAAAQDKLAGIKRKVMSLEEQLGKL 3329
            ...|.|...:|.|||.:..::||...|.||:..:|.|...|..|:.:|...:|.:..:||.|..|
  Rat  3163 AMVSVACCSMCQWVIALNNYHEVQKVVRPKQAQVAEAQNVLQIAKQRLFEKQRGLQLIEEHLQFL 3227

  Fly  3330 TADFEKATADKLRCQQEADATQATIALANRLVGGLASENVRWAEAVNNFVKQGITLPGDILLITA 3394
            ...:.....:|.:...........:..|:.|:..|..|.:||.|.:|....:...:.|||.|.:|
  Rat  3228 HTSYRDIVTEKHQLANRKKLATKRLQCASVLLTVLEDEKIRWQETINEIDNKLKGICGDIFLSSA 3292

  Fly  3395 FISYVGCFTKGFRIDLLLKMWTPFLKSIDPPIPTTENLDPLSLLTDDTTIAIWTNEGLPSDRMSI 3459
            .::|.|..|..|| .|:::.|..|....:  |..:.|...:.::.:...|..|.|:|||..:.|.
  Rat  3293 CLAYSGVLTPEFR-QLVMQKWKDFCTQAE--IILSPNFSLIDVMAEKNEIRRWHNQGLPLGQHSA 3354

  Fly  3460 ENATILSNSDRWPLMIDPQLQGVKWIKQKYGEDLKVIRLGQRSYLDIIEKSINAGCNVLIENIDE 3524
            |||.::.::.:|||:|||..|.:.||:|..|..|:.|.....:|...:..::.:|.:||::||.|
  Rat  3355 ENAILMKSTKQWPLLIDPHKQALCWIRQMEGSRLQEISAQDSNYTKKLVFAMQSGDSVLLQNIPE 3419

  Fly  3525 NLDPVLDSLLGRNLIK-KGKA-IKIGDKEIEYNSNFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVT 3587
            ...|.|.::|.:::.: :|:: |:|.|.|||||..|||.|.|:|.|||:.|.:....|:||||||
  Rat  3420 MFPPTLRAMLKKDICQTRGQSYIRIDDTEIEYNEKFRLYLSTELENPHFFPSVYNFVTIINFTVT 3484

  Fly  3588 RDGLEDQLLAEVVKAERPDLEELKADLTKQQNDFKIMLKKLEDDLLSRLSSAGENILGDTALVEN 3652
            ..||:|:||:.||..|.|.||..:|.|.:..:...|.|::|||..|:.|.....::|.|..:||.
  Rat  3485 FQGLQDELLSTVVSHEVPHLENQRAQLLESISLDAITLEELEDKTLTLLQKTEGSVLDDEEIVET 3549

  Fly  3653 LETTKSTASEIEQKVAEAKITSKEIDKAREYYRPAAARASLLYFILNELNTINPIYQFSLKAFSV 3717
            |..:|.|::||.:::.:.:....||...|:.|.|.|.|.:||||::..|..:..:|||||:....
  Rat  3550 LRKSKITSNEISKRIKKTEKAESEIQATRKNYLPIATRGALLYFVVASLRQVGYMYQFSLEWLRK 3614

  Fly  3718 VF-QKAIAKAE----------------------PGDTLDL---------RVSNLIDCITYSVFQY 3750
            || ...::|.:                      |.|..:|         .:.|:||.:|.:||:.
  Rat  3615 VFVSSTVSKTKDEKPDWKTDDTSQEKVDEVSLSPSDQENLESERTPLAENIKNVIDTLTRNVFKV 3679

  Fly  3751 TSRGLFECDKLIFASQMTFQILL--MNEEVTSAELDFLLR------------------------- 3788
            .|..||...||.|:.::...|:.  .::.:|:.::.||..                         
  Rat  3680 VSSALFNEHKLCFSFRLCTTIMRDHSSDTLTADDIGFLPEEEWNIFLYTGILINIKNIFSKPRLN 3744

  Fly  3789 --FPI--KPHVTSPVD-------FLTNQ--SWGGIC-SLASKDEFRNLDRDIETSSKRWKKLVE- 3838
              |.|  |.|:...:|       :::||  |:..:| ||.|.::..|..||    ||....|:. 
  Rat  3745 SIFEIRRKEHLQWVLDLRWRQCQYISNQMESFSLLCKSLLSNEQQWNAFRD----SKAVYSLLSL 3805

  Fly  3839 ---SELPEKEKFPQE--------------------WKNKTALQRLCMIRALRPDRMTYALADFIE 3880
               |:.|..:|.|:.                    |:..|..|||.:|:.|||||:..::..||.
  Rat  3806 PFFSDEPSLQKTPRSAKEAELLDENDEMLHPITFPWEKLTQFQRLILIKILRPDRLESSIKKFIT 3870

  Fly  3881 EKLGSKYVESRAMEFAKSYEEASPSTPIFFILSPGVNPLKDV------EALGKQMGFSMDLGNFH 3939
            ||:||:|:....:...:|:.|::..||:....|.|:: |.::      |..|.....:|      
  Rat  3871 EKMGSEYIPDTTINLKESFSESTAQTPLILTCSYGID-LNNLLLRFAQEFKGTTPQVTM------ 3928

  Fly  3940 NVSLGQGQEAIAEAAMDTAAKHGH-WVVLQNIHLVRKWLPVLEKKLEYYAEDS---HPDYRMFLS 4000
             :|||:.|...||..:..|.|..| ||.|||.||...::|.|...::.::...   .||:|::||
  Rat  3929 -ISLGRDQATKAEQLIFKAVKKKHQWVFLQNCHLAASFMPRLTAIIDSFSSPDMVLDPDFRLWLS 3992

  Fly  4001 AEPASTPSAHIIPQGILESSIKITNEPPTGMLANL-----HKALDNFTQETLEMSGKEAEFKAIL 4060
            :.     :....|..||:..:||..|||.|:.:||     :......|:|..:.......:|.||
  Rat  3993 SR-----AYGFFPITILQKGVKIAVEPPQGLKSNLLQMFGYGGSGEVTEEVFDKPDCGPWWKKIL 4052

  Fly  4061 FSLCYFHAVVAERRKFGPQGWNKIYPFNVGDLNISVSVLYNYLEANAKVPWEDLRYLFGEIMYGG 4125
            ||||.|.||:.||:.:|..|||..|.|:..||.:|:.||.|.|...::|||:::.||..|:.|||
  Rat  4053 FSLCLFSAVLNERKAYGTLGWNIPYQFSSSDLEVSIKVLANVLSGQSEVPWKEVNYLISEVTYGG 4117

  Fly  4126 HITDDWDRRLCITYLEEYMQPDLVDGELFLAPSFPAPPNTDYQG-------------YHTYVDEM 4177
            .:||:||:|.......::..|::      |..:|....|..||.             ..::.|: 
  Rat  4118 RVTDEWDKRCLKALFYKFCNPEI------LKDNFSFSSNVMYQAVPSSASLKDCISIIQSFPDD- 4175

  Fly  4178 MPAESPYLYGLHPNAEIGFLTTRAENIFRTVFEMQPRDAGAGGGATV----TREDKVKQIVDEII 4238
               :||.:.|:||.|.......:|:.....:..|||:|  |.|...:    :.:|.|.:|:.:|:
  Rat  4176 ---DSPEILGIHPEATYTCNEIKAQKYIENLICMQPKD--APGTPMINPEQSNDDLVMEILSDIM 4235

  Fly  4239 EKLP-----EEFNMVE-------IMN-----KVEER-----------------TP-------YVI 4262
            .:||     ||.:.:|       ||:     |:.|.                 :|       .|:
  Rat  4236 MQLPLTVENEEVSGLENQCTFKFIMSSPMWEKLHENIQGEQQLWAPPTWQPGASPGYDPLIHSVL 4300

  Fly  4263 VAF--QECERMNFLTSEMKRSLKELDLGLKGELTITSDMEVLENSLFLDQVPPIWTQRAYPSLLG 4325
            :.|  .|.||.|.|.|.:.:|||:|.|.:|||..:|.|:|...:|....:||.:|.:.||.|...
  Rat  4301 IPFLKNEIERFNKLLSVIHKSLKDLQLSIKGESILTPDLEETYDSFLRARVPMLWQKNAYKSCRP 4365

  Fly  4326 LNNWFIDLCLRLRELETWS-----------TDFV-----------------------LPSCVWLA 4356
            |:.|..:|..|:....||:           ..|:                       .|:..||:
  Rat  4366 LSFWVSNLIQRVNFFNTWAKVAYTTIHHRYMMFITTWKRLGQKSKHYPDSGSEVTEGFPARYWLS 4430

  Fly  4357 GFFNPQSLLTAIMQSTARRNDLPLDKMCL----------------------QCDVTKKQKEEFTT 4399
            .||:||:.|||::|...|...:.:|.:..                      :.::.|:..::...
  Rat  4431 AFFSPQAFLTAVLQDYGRAQGISMDALTFTHKVIYNSDGSQEDDLSKFLQKRLNIVKRAFQQHQE 4495

  Fly  4400 APRDGCCVHGIFMEGARWDIQQGIIMESRLKELYPSMPVINI--RAITQ-----DKQDLRNMYEC 4457
            ...:|..:.|:::||||||.||.::.::...:|....|.|:.  ..||:     |:.:|:. :||
  Rat  4496 HHHEGVYIFGLYIEGARWDPQQEVLEDALPAQLCCEFPDIHFLPTKITEIPEDSDQSELQT-FEC 4559

  Fly  4458 PVYKT--RTRG----PTTYVSNLNLKTKDKPGKWILAGVALLLQ 4495
            |||.|  |||.    ||:.:::::|.||..|..||...||||.:
  Rat  4560 PVYYTPERTRNATGLPTSLLTSVHLPTKKPPSHWITMQVALLCE 4603

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc93ABNP_001262793.1 DHC_N1 205..782 CDD:462457 86/438 (20%)
DHC_N2 1292..1707 CDD:462462 114/424 (27%)
DYN1 1305..4143 CDD:227570 925/3233 (29%)
AAA_6 1841..2167 CDD:463697 136/333 (41%)
MT 3076..3419 CDD:463699 104/350 (30%)
Dynein_C 4198..4494 CDD:465677 105/411 (26%)
Dnah14XP_038947405.1 DHC_N2 965..1370 CDD:462462 116/444 (26%)
DYN1 1194..4189 CDD:227570 879/3063 (29%)
AAA_6 1503..1837 CDD:463697 136/333 (41%)
Dynein_C 4196..4602 CDD:465677 105/408 (26%)

Return to query results.
Submit another query.