DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc93AB and Dnah2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001262793.1 Gene:Dhc93AB / 42485 FlyBaseID:FBgn0013812 Length:4496 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008766120.1 Gene:Dnah2 / 303242 RGDID:1565087 Length:4508 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4644 Identity:1504/4644 - (32%)
Similarity:2411/4644 - (51%) Gaps:375/4644 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    18 PDPRLELMGSFVIKSL--KLKPEKWTRVVTVEEHKGIIKEFLDRNTPVVLIIILTPAAQLVPSTT 80
            ||...::...|:.:::  .|....||     .||..:::.|....:..||.|.:.|...|.....
  Rat    69 PDLSTDVKPIFLSRAMLTGLADSTWT-----AEHDAVLEHFAQDPSVPVLTIFVDPVFGLKLELG 128

  Fly    81 FPLSQLKSKGVYFIKRYALPIPREDCGNFIIYGDLATRTIDQLSALVEEVLVP-LLSNEDNYRNW 144
            .|: |.:::.||||::..:||..|:....:.||.:....|..|..|:..|.|| :..|    ::|
  Rat   129 MPV-QTQNQIVYFIRQAPVPITPENFEETVQYGTVRGAYIPALLRLLSGVYVPQIFMN----KSW 188

  Fly   145 PIMVAQDVQKHVHSLKSTVHQVKGQVSGETILAMPVGV----EKIVKAAKELVETEQCQFDLYLK 205
            |..:......|:|...:::...:.::.|.|:|.:|...    ..:|...||||:           
  Rat   189 PESIRNHFVSHLHRFLASLTDTRYKLEGHTVLYIPAEAITMDPAVVIKDKELVQ----------- 242

  Fly   206 SAIEGVVIKWATQIHEVIKESPSNAFANGQNPTPHTEFTFWNNRLKNLSFIYDQLRNERIRAMAL 270
             .:|..:|.|..||.||:  |...:...|:|..|..|..|||||..:||.|..||..:.::.:..
  Rat   243 -RLETSMIHWTRQIKEVL--SAQESVDTGENLGPLEEIEFWNNRCMDLSGISKQLVKQGVKHIES 304

  Fly   271 ILEYSMSAYHPCFQTLFKNVVTALAEAKDITLYLNPLKRPLQHL---EEIDFAECKPLLIPFMNT 332
            ||..:.|:|...|:.|.:.:.....:|:....:|:.|:.|.|.|   :..|.::..|.||   :.
  Rat   305 ILLLAKSSYLAPFRKLAQQIQDGSRQAQSNLTFLSILREPYQELAFMKPKDISDKLPKLI---SL 366

  Fly   333 VGILWGNSRYYCQSAKITVLLQEICNLIIHQAKRYLDPSSIFHSDIDEAMQRLTLSIQILKFFRE 397
            :.|:|.||.:|....::|.|.:::.|.||......:....||...:..:.:.|...|.....::|
  Rat   367 IRIIWVNSPHYNTRERLTGLFRKMSNEIIRLCCHSVSLDRIFEGYVSSSKEDLQGCISCCHAWKE 431

  Fly   398 LFDYYKERLATFFTEPEERPPILWTFHPNSVFKRFNAFLERLTTI------QWFFFTVIEFLKLE 456
               :|. |.....|:...|.   |.....|:|.:.:||::|...:      |:.|...::..:..
  Rat   432 ---HYL-RAVQMHTQFSNRG---WVLDQTSIFAQVDAFVQRCKDLIEVCDCQYHFARWLDGTQGP 489

  Fly   457 KVEIGGLRGRQLSTRITDVYVEFNQYFTAFASKSYDVLDPDDHEFDEDFKGFQTRILELDMKLAA 521
            .....|.:|.|::..:.::...|::......:....:||..:..:.||:..|:..|.:|::....
  Rat   490 LPCFFGAQGPQITRNLLEIEDIFHKNLQTLRAVRGGILDVKNTSWHEDYNKFRAGIKDLEVMTQN 554

  Fly   522 ILCQAFDDCHNLESIFKLISIVGSVLDRPKIKEEFTQRYAEIVRMLDDEMTICESIYDKQMELKK 586
            ::..||:...::|....|:.....:.:|..|...:.::..::..:.:.|:.:.....:|:     
  Rat   555 LITSAFELVRDVEHGVLLLDTFHRLANREAIMRTYEKKAVDLYMLFNSELALVNRELNKK----- 614

  Fly   587 VGDNLYPNYNCPPVAAF---IRWCHQLETRITAPVKNFKALQHEITKTEKSQEIVERYEILMVKL 648
                 :| |..|.:|.:   ..|...|..||.. |.|..:..|.:......:|.|..|:.::..:
  Rat   615 -----WP-YLEPYMAQYSGQAHWVRILRRRIDR-VMNCLSGAHFLPHIGTGEETVHTYQQMVQAI 672

  Fly   649 GSCKTQFFDDWAGQLDGQIEENLKKSLI-ARDRRHNSLILNFSAALFSILREVHYMQQMKIEGIP 712
            .....:.|.:|...||......|...|: ....:...|.:||...|..:..|:.|.:::..| .|
  Rat   673 DELVRKTFQEWTATLDKDCIRRLDMPLLRISQEKAGMLDVNFDKTLLILFVEIDYWERLLFE-TP 736

  Fly   713 QIAIDFAEKSDVFRSYTLNLEKTIDWYNSIQEGSSPVELRLIEPEIKMIDDLVEIGVNQLVWNSS 777
            ...::.|::::..|....||......||.|....||.|..|.:..|:.:|..:..|:.:|.|...
  Rat   737 HYVMNVADRAEDLRILRENLLLVARDYNRIIAMLSPDEQALFKERIRFLDKKIHPGLKKLNWALK 801

  Fly   778 DILS-YLDKLRKPVAALQNRMDHTQGNLRQIRKIMGVWAKQPLFE-------RRDCKKDTVLSID 834
            ...: ::.:.|...:.:|..::..:.:...|.     |..|.:.|       .:...:|......
  Rat   802 GASAFFITECRIHASKVQMIVNDFKASTLTIG-----WKAQEMSELLLVHITGKQVYRDLEFEEA 861

  Fly   835 ERPDRTSKRYAEIQAASIEIHK----LLQDNMLQFDMESKQDDAVWLSYVDFVDNIVYENILKTV 895
            :|..|.:     :|...:.:|:    :|.::...|..:..:....||.|...:|:::.:.:...|
  Rat   862 QREHRMA-----VQQKLVNLHQDVINILTNSFEVFKNDGPEIQQQWLLYTIRLDHMMEDALRLNV 921

  Fly   896 GVSVGYLAE--NMDPENNYAPLF------ESRLELVEPNLVFVPSLDPEDPMGFNNMLIELMRDI 952
            ..|:..|::  |.|.:.:..|||      :|.::.....:.|.|:|         ..|..::.||
  Rat   922 KWSLLELSKAINGDGKTSPNPLFRVLVILQSDVQGGGAQVEFSPTL---------QTLASVVNDI 977

  Fly   953 MKMGS---------------LIKRLKPNEKRNYVEMIKENQDIIDMRREILNGVDLVMEEASRFC 1002
               ||               |.||....|..:.|  ::.::||..::.:|.:|:.........:.
  Rat   978 ---GSHLFSTISVFRHLPDILTKRKMTREPIHVV--VERDEDIRKIQAQISSGMTNNASLLQNYL 1037

  Fly  1003 RQFERYSYLWLDDREECMEYFLEYGRMLDPDEIELILINDPNQPPPQPCQPTIEAFREQIDNYES 1067
            :.::.|..:|..:::   .:...|.|:                      .|.:.:|...|..|..
  Rat  1038 KTWDMYREIWEINKD---SFIRRYQRL----------------------NPPVSSFDADIARYTE 1077

  Fly  1068 LFNEI---EDIGPFQVFSSWFQVDVRPFRQALLNTVCKWGNMFKEHLVTTVTSSLMNLSHFIRKA 1129
            :.|.:   |.:...|    :..:|....:.:|:....:|.|.|...|.......||:|..:::..
  Rat  1078 VANNVQKEETVLNIQ----FVMLDCSHLKFSLVQHCNEWQNKFTTLLKEMAAGRLMDLHTYLKDN 1138

  Fly  1130 DEGLL---QTVKEKDYEGLVSIMAYLMQ-VKERAAKTDEMFEPMQETIQLLKYYDMDIPEEVNVL 1190
            .|.:.   ||::|      :.:...||. ::......:....|:.|...:|:.|::.:|:.|..:
  Rat  1139 AEKISRPPQTLEE------LGVSLQLMDTLQHDLPNLETQIPPIHEQFTILEKYEVPVPDTVLEM 1197

  Fly  1191 LQELPEQWANTKKIASTVKQQVSPLQATEVVSIRNKIALFESHIQLFREVFKT-----YDFFR-- 1248
            |:.|..:|...::|....:|                  :.:.|    :|.|||     .|.|:  
  Rat  1198 LESLNGEWLTFQQILLDSEQ------------------MLKKH----KEKFKTGLIHAADDFKKK 1240

  Fly  1249 -------FDCYKPY-------LLMDRI---NDDMFLCESEMRDIQESGSLFEVNIPEFKVLKQCR 1296
                   |:...|:       ..:|:|   ...:.....|..:::.:..:|::..|..|.|:...
  Rat  1241 AHNLLEDFELKGPFTSNVGHTAALDQIAQVRAMLMAMREEESNLRSNLGIFKIEQPISKDLQNLE 1305

  Fly  1297 KELRMLKQLWDYVNIVATSIDDWKTTPWRKVDVENMDIECKKFAKDIRLLDKEM--RPWDTFINL 1359
            |||..|:|:|:.......|.:.|||..:..:..|.|:.......:.:..|.||.  |.|:.....
  Rat  1306 KELDALQQVWEITRDWEESWNQWKTGCFLTLQTEAMESMAHGLFRRLTRLAKEYKDRNWEVIETT 1370

  Fly  1360 ESTVKNMLTSLRAVGELQNPAIRERHWNQLMNSTKSLAALPKEVTVKFIMDHET-TLAELLGLNL 1423
            .:.::....::..:.:|:|||:|||||:|          :.:|:..:|..:.|: ||.:::.|.:
  Rat  1371 RAKIEQFKRTMPLISDLRNPALRERHWDQ----------VKEEIQREFDQESESFTLEQIVKLGM 1425

  Fly  1424 HECEEEVKNIVDKAVKEMSMEKILRDLNTTWTVMEFDHELHPRTGCNLLKASEELIETLEDNQVC 1488
            .:..|::..|...|.||:::|..|:::..||...:.|...:...|.:.|:.:||:.:.||||||.
  Rat  1426 DQHVEKIAEISASATKELAIEVGLQNIAKTWDSTQLDIVPYKDKGHHRLRGTEEVFQALEDNQVA 1490

  Fly  1489 LQNLITSKYIAHFLEEVSTWQNKLMIADQVITVWFEVQRTWTHLESIFMSSEDIRKQLPVDSDRF 1553
            |..:..|:::..|.::|..|:..|.:..:||.:...|||.|.:||:||: .||||||||.:|..|
  Rat  1491 LSTMKASRFVKAFEKDVDHWERCLSLILEVIEMVLTVQRQWMYLENIFL-GEDIRKQLPNESALF 1554

  Fly  1554 DNIDAEFRVLMDEMSVSSNVVASTNRSGLIERLEHLQKELTLCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVS 1618
            |.::..::.:||.|:..:|.:.||:..||:|.|..:...|...:|:|..||||||..||||||:|
  Rat  1555 DQVNNNWKGIMDRMNKDNNALRSTHYPGLLETLIEMNTILEDIQKSLDMYLETKRHMFPRFYFLS 1619

  Fly  1619 SADLLDVLSNGIQPEMVTKHLTKLFDSIARLKFNR-DESNEINTASGMYAKDGEYVEFNELASIR 1682
            :.|||::|.....||.|..||.|.||:|..||..: ..|:....|.||::.||||::|.....:.
  Rat  1620 NDDLLEILGQSRNPEAVQPHLKKCFDNIKLLKIQKVGGSSSKWEAVGMFSGDGEYIDFLHPVLLE 1684

  Fly  1683 GPVEVWLNRIQAAMRASLRHYVMEAVIAYEE--KQREQWLFDYPAQVSLCGSQIWWSTEVNIAFS 1745
            |.||.||..::.|||.:||..:....:|.::  .:|::|:.|:..|:.:..|||.|:.:|.....
  Rat  1685 GAVESWLGDVERAMRMTLRDLLRNCRMALKKFLNKRDKWVKDWAGQMVITASQIQWTADVTKCLM 1749

  Fly  1746 RLEEGYDNAI-KDYYKKQISQLSLLITLLLGELSKGDRQKIMTICTIDVHSRDVVAKMIQAKLDS 1809
            ..:|..|..| |...|||:|.|:.....:.|.|:|..|.||:.:.||::|:|||:.|:.:..|..
  Rat  1750 TAKERSDKKILKVMKKKQVSILNKYSEAIRGNLTKIMRLKIVALVTIEIHARDVLEKLYKGGLMD 1814

  Fly  1810 GSAFMWQSQLRHRFDDVEKDCFANICDAEFQYCHEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLVMG 1874
            .:||.|.||||..::....||.....:.:|||.:|||||:.||||||||||||:|||.:|||..|
  Rat  1815 VNAFDWLSQLRFYWEKDVDDCIIRQTNTQFQYGYEYLGNSGRLVITPLTDRCYMTLTTALHLHRG 1879

  Fly  1875 GAPAGPAGTGKTETTKDLGRAIGISVYVFNCSEQMDYQSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRITVE 1939
            |:|.||||||||||.||||:|:|..|.|.||||.:||:|.|.:|.|||||||||||||||||.:|
  Rat  1880 GSPKGPAGTGKTETVKDLGKALGTYVIVVNCSEGLDYKSMGRMYSGLAQTGAWGCFDEFNRINIE 1944

  Fly  1940 VLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDKFNFMGEMISCVPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAM 2004
            ||||||.|:.|:..|:.....:|.|.|..|:.|.:.|||||||||||||||||||||::|||.||
  Rat  1945 VLSVVAQQILSILSALTANLTRFYFEGFEINLVWSCGIFITMNPGYAGRTELPENLKSMFRPIAM 2009

  Fly  2005 VVPDFELICEIMLVAEGFQDARVLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRG 2069
            ||||..||.||:|..|||.:.::||:|..|||:|..:.||:|||||:||||:.|:|..||..:|.
  Rat  2010 VVPDSTLIAEIILFGEGFGNCKILAKKVYTLYSLAVQQLSRQDHYDFGLRALTSLLRYAGKKRRL 2074

  Fly  2070 DPGRPEEEVLMRALRDFNIPKIITDDMPVFMGLISDLFPALDVP-----RKRDQDFERTVKQAAS 2129
            .|...:||||:.::||.||.|:.:.|:|:|..::.||||.:::|     :.||     |::|...
  Rat  2075 QPDLTDEEVLLLSMRDMNIAKLTSVDVPLFNAIVQDLFPNIELPVIDYGKLRD-----TIEQEIR 2134

  Fly  2130 DLLLQPEDNFILKVVQLEELLEVRHSVFIVGNAGTGKTQVWKTLLRTYQNIKR--KPIFN----- 2187
            ::.||.....:.||:||.|....|||..|||..|:.||..|:.|..:..::.|  :|.||     
  Rat  2135 EMGLQITPFTLTKVLQLYETKNSRHSTMIVGGTGSSKTTSWRILQASLTSLCRAGEPNFNIVKEF 2199

  Fly  2188 DLNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSVLMRDQANITGDQP--KWIVLDGDIDPMWIESLNTV 2250
            .|||||::..||:|..:..|.||.||:.|.:||  |....::|  |||:.||.:|.:||||:|:|
  Rat  2200 PLNPKALSLGELYGEYDLNTNEWTDGILSSVMR--AACADEKPDEKWILFDGPVDTLWIESMNSV 2262

  Fly  2251 MDDNKVLTLASNERIALTPSMRLLFEISNLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWNPYVTSWVETRK 2315
            |||||||||.:.||||:...:.||||:.||..|:||||||.|::|.:..||||.|||.||:|.|.
  Rat  2263 MDDNKVLTLINGERIAMPEQVSLLFEVENLAVASPATVSRCGMVYTDYVDLGWTPYVQSWLEKRP 2327

  Fly  2316 IPAEKSNLVMLFDKYIPPSLETIRVRFKKITPVAEMAHIQMLCHLLNCFLIPAN--TPADCPKEW 2378
             .||...|..:|:|:|...|...:....::.||.|.:.|..||.|......|.|  .|||  .|.
  Rat  2328 -KAEIEPLQRMFEKFINKILTFKKDNCNELVPVTEYSGIISLCKLYTVLATPENGVNPAD--TEN 2389

  Fly  2379 H----ELYFVFACIWAFGSAMFQD--QAIDYRVEFSKWWVNEFKTVKFPPGGTVFDYFLDSETKT 2437
            |    |:.|||:.||:..:::.:|  :.||.       ::.|.:. .||...||::|:::.:.:|
  Rat  2390 HAFMVEMTFVFSMIWSVCASVDEDGRKKIDS-------YLREIEG-SFPNKDTVYEYYVNPKMRT 2446

  Fly  2438 FLPWTEKIPK-FELDSDLPLQAVIVHTSESIRLRFFLDLLMDKKHPVMLVGNAGCGKTVLVNEKL 2501
            :..:.|::|| :....:.|...::|.|.:::|..:.:..|:..::||:|||..|.|||.:....|
  Rat  2447 WSSFEEQLPKSWRYPPNAPFYKIMVPTVDTVRYNYLVSTLVANQNPVLLVGPVGTGKTSIAQSVL 2511

  Fly  2502 QSL-SENYAVTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPLEKKAGRNYGPPGNKLLCYFVDDINMPEVDAYGT 2565
            ||| |..::|..:..:..|||..:|.|:|..:||:....|.|.|.|.:..|:||:|||..|.:|:
  Rat  2512 QSLPSSQWSVLVVNMSAQTTSNNVQSIIESRVEKRTKGVYVPFGGKSMITFMDDLNMPAKDMFGS 2576

  Fly  2566 VQPHTLMRQHLDYGHWYDRNKLTLKDIHNCQYVACMNPTSGSFT-INPRLQRHFCVLAVSFPGPE 2629
            ..|..|:|..:|||.||||.|.|:|.|.:...:|.|.|..|..| |:||||..|.::.::||...
  Rat  2577 QPPLELIRLWIDYGFWYDRVKQTIKHIRDMFLMAAMGPPGGGRTVISPRLQSRFNIINMTFPTES 2641

  Fly  2630 SITVMYSSILAQHFANAEQKFTPIVTRMTPNIVA-ATIALHNKCLQVFLPTAIKSHYIFNLRDIS 2693
            .|..::.:::.|...:.|::..||     .|:|. ||:.::|..:|.||||..|.||:|||||||
  Rat  2642 QIIRIFGTMINQKLQDFEEEVKPI-----GNVVTEATLDVYNTVVQRFLPTPAKIHYLFNLRDIS 2701

  Fly  2694 NVFQGLLFSSTECLTGSTDLIRLWQHETQRVYSDKLTDDKDIDSFTKMQHDIVKKSFEEIDESVI 2758
            .||||:|.::.:.......:.|||.||..||:||:|.|..|:::|..:..|.:...|:.....:.
  Rat  2702 KVFQGMLRANKDFHDTKASITRLWIHECFRVFSDRLVDTTDMEAFIGILSDKLGTFFDLTFHHLC 2766

  Fly  2759 FDK-PNIYCHFAGGIGDPK-YMPIKGWPELHKLLQEAMSSYN--DLVAAMNLVLFEDAMMHVCRI 2819
            .:| |.|:..|   :.:|| |..:.....|...::.|::.||  ..|..|.||||.:|:.|:.||
  Rat  2767 PNKRPPIFGDF---LKEPKVYEDLVDLSVLKTAMETALNEYNLSPSVVQMQLVLFREAIEHITRI 2828

  Fly  2820 NRILESPRGSALLVGVGGSGKQSLARLAAFISSLEVVQIQLKKGYGVNDLKNEFSGLYLKAGLKN 2884
            .|::..|||:.||||:||||:|||||||:.|......||::.|.|...:.:::...||.:||::.
  Rat  2829 VRVIGQPRGNMLLVGIGGSGRQSLARLASSICEYNTFQIEVTKHYRKQEFRDDIKRLYRQAGVEL 2893

  Fly  2885 VGIMFLMTDAQIPSEDFLVLINDMLATGEIPDLFPDDEIENIIAGVRNEVKGAGLVDTRENCWKF 2949
            ....||..|.||..|.||..||::|::||:|:|:..||.|.|...:.::.:...:.::.::.:.:
  Rat  2894 QATSFLFVDTQIADESFLEDINNILSSGEVPNLYKADEFEEIQNQIIDQARAEQISESSDSLFAY 2958

  Fly  2950 FIDRVRKQLKIVLCFSPVGSTLRVRSRKFPAIINATSINWFHEWPQEALISVAMNFLAQNKV-LP 3013
            .|:|||..|.||||.||||...|...|::||::|.|:||||.|||:|||:.||..:|....: ..
  Rat  2959 LIERVRNNLHIVLCLSPVGDPFRNWIRQYPALVNCTTINWFSEWPREALLEVAEKYLVGVDLGTQ 3023

  Fly  3014 ENHRDSVAKFMAYVHTSVNTTSKVYLQNERRYNYTTPKSYLEQINLYIKLLNHKNEDLQSKIERL 3078
            ||....||:....:|.||...|:..|...||:||.||.:|||.::.|.|||..|.::|..:..:|
  Rat  3024 ENIHRKVAQIFVTMHWSVAQYSQKMLLELRRHNYVTPTNYLELVSGYKKLLGEKRQELLDQANKL 3088

  Fly  3079 ENGL-------EKLRSTALQVADLKVKLAVQEIELKEKNEAADALIEIVGIETEKVQTEKAVADE 3136
            ..||       ||:...:|::.|.|.|:|    |.:::.|  :.|:.||..:.|..:.:|||...
  Rat  3089 RTGLFKIDETREKVEVMSLELEDAKKKVA----EFQKQCE--EYLVIIVQQKREADEQQKAVTAN 3147

  Fly  3137 ------EEMKVALIADEVSKKQRDCEEDLLKAEPALMAAQDALNTLNKANLTELKSFGSPPGAVT 3195
                  ||:|...:||..   |:|.||.|    |||..|..||.:|||.::.|:||:|.||..|.
  Rat  3148 SEKIAIEEVKCQALADNA---QKDLEEAL----PALEEAMRALESLNKKDIGEIKSYGRPPAQVE 3205

  Fly  3196 NVTAAVMVLLSQGGKVPKDRSWKAAKIAMAKVDTFLDSLINYDKENIHPEITKAIQPYLKDPEFE 3260
            .|..|||:|   .|..|   :|..||..:.: ..|:.|||.:||:||..::.|.|..|...|:|:
  Rat  3206 IVMQAVMIL---RGNEP---TWAEAKRQLGE-QNFIKSLIYFDKDNISDKVLKKIGAYCAQPDFQ 3263

  Fly  3261 PEFVRSKSGAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRKALAAANAELAAAQDKLAGIKRKVMSLEEQ 3325
            |:.:...|.||..||.||..:..:..:|..|||||..:.||.|:|...|..||..:.|:..:.|:
  Rat  3264 PDIIGRVSLAAKSLCMWVRAMELYGRLYRVVEPKRIRMNAAIAQLQEKQAALAEAQEKLREVAEK 3328

  Fly  3326 LGKLTADFEKATADKLRCQQEADATQATIALANRLVGGLASENVRWAEAVNNFVKQGITLPGDIL 3390
            |..|...:::..|.|...:::::..:..:..|..||.|||.|..||.|.|....:....|.||.|
  Rat  3329 LEMLKKQYDEKLAQKEELRKKSEEMELKLERAGMLVSGLAGEKARWEETVQGLEEDLGYLVGDCL 3393

  Fly  3391 LITAFISYVGCFTKGFRIDLLLKMWTPFLKSIDPPIPTTENLDPLSLLTDDTTIAIWTNEGLPSD 3455
            :..||:||:|.|...:|.:::.::|...:..:..|......:|  :.||:.|.:..|..:|||||
  Rat  3394 IAAAFLSYMGPFLTNYRDEIVNQIWIKKIWELQVPCSPRFAID--NFLTNPTKVRDWNIQGLPSD 3456

  Fly  3456 RMSIENATILSNSDRWPLMIDPQLQGVKWIKQKYG-EDLKVIRLGQRSYLDIIEKSINAGCNVLI 3519
            ..|.||..|::..:||.||||||.|.:||||...| :.||:|.|....||.::|.:|..|..||:
  Rat  3457 SFSTENGIIVTRGNRWALMIDPQAQALKWIKNMEGNQGLKIIDLQMHDYLRVLEHAIQFGFPVLL 3521

  Fly  3520 ENIDENLDPVLDSLLGRNLIKKG--KAIKIGDKEIEYNSNFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLI 3582
            :|:.|.|||.|:.:|.:::.:.|  ..::|.|||:|||.|||..|.|||:||||.||..|:||::
  Rat  3522 QNVQEYLDPSLNPVLNKSVARIGGRMLMRIADKEVEYNPNFRFYLTTKLSNPHYSPETSAKTTIV 3586

  Fly  3583 NFTVTRDGLEDQLLAEVVKAERPDLEELKADLTKQQNDFKIMLKKLEDDLLSRLSSAGENILGDT 3647
            ||.|...|||.|||..||:.|||:|||.|..|.......|..||:|||::|..|:.|..::|.|.
  Rat  3587 NFAVKEQGLEAQLLGIVVRKERPELEEQKDSLVINIAAGKRKLKELEDEILRLLNEATGSLLDDV 3651

  Fly  3648 ALVENLETTKSTASEIEQKVAEAKITSKEIDKAREYYRPAAARASLLYFILNELNTINPIYQFSL 3712
            .||..|:|:|.||:|:.:::..::.|...||.|||.|||.|.|||:|:|:||::..|:|:|||||
  Rat  3652 QLVNTLQTSKITATEVTEQLETSETTEINIDLAREAYRPCAQRASVLFFVLNDMGRIDPMYQFSL 3716

  Fly  3713 KAFSVVFQKAIAKAEPGDTLDLRVSNLIDCITYSVFQYTSRGLFECDKLIFASQMTFQILLMNEE 3777
            .|:..:|..:|.|:...:.|:.|:..|.|..||:|::||.|.|||..||:|:..|..:||..:.:
  Rat  3717 DAYISLFILSIDKSHRSNKLEDRIEYLNDYHTYAVYRYTCRTLFERHKLLFSFHMCAKILETSGK 3781

  Fly  3778 VTSAELDFLLRFPI----KPHVTSP-VDFLTNQSWGGICSLASKDEFRNLDRDIETSSKRWKKLV 3837
            :...|.:|.||..:    :..:.:| ..:|.:..|..|..|.....|..|....|...:.|....
  Rat  3782 LNMDEYNFFLRGGVVLDREGQMDNPCTSWLADAYWDNITELDKLTNFHGLMNSFEQYPRDWHLWY 3846

  Fly  3838 ESELPEKEKFPQEWKNK-TALQRLCMIRALRPDRMTYALADFIEEKLGSKYVESRAMEFAKSYEE 3901
            .:..|||...|.||:|. ..:||:.::|:||.||:.:.:..||...|||:::|...:......|:
  Rat  3847 TNSNPEKAMLPGEWENACNEMQRMLIVRSLRQDRVAFCVTSFIVSNLGSRFIEPPVLNMKLVMED 3911

  Fly  3902 ASPSTPIFFILSPGVNPLKDVEALGKQMGFSMDLGNFHNVSLGQGQEAIAEAAMDTAAKHGHWVV 3966
            ::|.:|:.|||||||:|...:..|.:..|.:   ..||.:||||||..||...:......||||.
  Rat  3912 STPRSPLVFILSPGVDPTSALLQLAEHTGMA---HRFHALSLGQGQAPIAARLLREGVNQGHWVF 3973

  Fly  3967 LQNIHLVRKWLPVLEKKLE-YYAEDSHPDYRMFLSAEPASTPSAHIIPQGILESSIKITNEPPTG 4030
            |.|.||...|:|.|:|.:| ...||.||.:|::||:.|...     .|..||::|||:|.|||.|
  Rat  3974 LANCHLSLSWMPNLDKLVEQLQVEDPHPSFRLWLSSSPHPD-----FPISILQASIKMTTEPPKG 4033

  Fly  4031 MLANLHKALDNFTQETLEMSGKEAEFKAILFSLCYFHAVVAERRKFGPQGWNKIYPFNVGDLNIS 4095
            :.||:.:.....|:.......|..::|.:||:||:||:::.||:||...|||.||.||..|..:|
  Rat  4034 LKANMTRLYQLMTEAQFTHCSKPTKYKKLLFALCFFHSILLERKKFLQLGWNIIYGFNDSDFEVS 4098

  Fly  4096 VSVLYNYLEANAKVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCITYLEEYM------QPDLVDGELF 4154
            .::|..||:...:.||:.|:||...:.||||:||||||||..||:.:|.      .|..   .|.
  Rat  4099 ENLLSLYLDEYEETPWDALKYLIAGVNYGGHVTDDWDRRLLTTYINDYFCDLSLTTPSY---RLS 4160

  Fly  4155 LAPSFPAPPNTDYQGYHTYVDEMMPAESPYLYGLHPNAEIGFLTTRAENIFRTVFEMQPR--DAG 4217
            :..::..|.:.....|..|:..:...:.|..:|.||||::....|.|..:|.|:..:||:  ...
  Rat  4161 VLDTYYIPKDGSLASYKEYISLLPSMDPPEAFGQHPNADVASQITEARTLFETLLSLQPQITPTR 4225

  Fly  4218 AGGGATVTREDKVKQIVDEIIEKLPEEFNMVEIMNKVE----ERTPYVIVAFQECERMNFLTSEM 4278
            .||   .:||:||.::..::.:|:||   |::.....:    :.:|..:|..||.:|.|.|...:
  Rat  4226 IGG---QSREEKVLELAADVKQKIPE---MIDYEGTRKLLALDPSPLNVVLLQEIQRYNKLMKTI 4284

  Fly  4279 KRSLKELDLGLKGELTITSDMEVLENSLFLDQVPPIWTQRAYPSLLGLNNWFIDLCLRLRELETW 4343
            ..||.:|:.|::|.:.:::.:|.:.|.:|...|||:| .:.|||...|.:|..||.:|:.:.|||
  Rat  4285 LFSLTDLEKGIQGLIVMSTSLEEIFNCIFDAHVPPLW-GKVYPSQKPLASWTRDLAVRVEQFETW 4348

  Fly  4344 STDFVLPSCVWLAGFFNPQSLLTAIMQSTARRNDLPLDKMCLQCDVTKKQKEEFTTAPRDGCCVH 4408
            :.....|...||:||..|...|||::||.||:|::.:|.:..:..|:..........|:||..|.
  Rat  4349 ANRAHPPVLFWLSGFTFPTGFLTAVLQSAARQNNISVDSLSWEFIVSTVDDSNLVYPPKDGVWVR 4413

  Fly  4409 GIFMEGARWDIQQGIIMESRLKELYPSMPVINIRAITQDKQDLRNMYECPVYKTRTRGPT----T 4469
            |:::|||.||.:...::|:...:|...||.|:.|.....|:..:.||.||.|....|..:    :
  Rat  4414 GLYLEGAGWDRKNSCLVEAEPMQLVCLMPTIHFRPAESRKKSAKGMYSCPCYYYPNRAGSADRAS 4478

  Fly  4470 YVSNLNLK----TKDKPGKWILAGVALLL 4494
            :|..::|:    |.|   .||..|.|||:
  Rat  4479 FVIGIDLRSGAMTSD---HWIKRGTALLM 4504

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc93ABNP_001262793.1 DHC_N1 204..782 CDD:285571 128/591 (22%)
DHC_N2 1295..1708 CDD:285579 140/416 (34%)
P-loop_NTPase 1841..2071 CDD:304359 147/229 (64%)
P-loop_NTPase 2155..2290 CDD:304359 67/143 (47%)
P-loop_NTPase 2448..2720 CDD:304359 100/274 (36%)
P-loop_NTPase 2797..3064 CDD:304359 111/269 (41%)
MT 3076..3419 CDD:289543 118/355 (33%)
AAA_9 3447..3659 CDD:289547 101/214 (47%)
Dynein_heavy 3799..4486 CDD:281078 230/708 (32%)
Dnah2XP_008766120.1 DHC_N1 239..806 CDD:285571 131/603 (22%)
DHC_N2 1304..1709 CDD:285579 140/415 (34%)
P-loop_NTPase 1846..2076 CDD:304359 147/229 (64%)
P-loop_NTPase 2162..2303 CDD:304359 67/142 (47%)
P-loop_NTPase 2462..2728 CDD:304359 100/270 (37%)
P-loop_NTPase 2813..3074 CDD:304359 108/260 (42%)
MT 3087..3419 CDD:289543 117/351 (33%)
AAA_9 3447..3663 CDD:289547 101/215 (47%)
Dynein_heavy 3805..4496 CDD:281078 231/711 (32%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D1492at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000396
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.820

Return to query results.
Submit another query.