DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc93AB and Dnah17

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262793.1 Gene:Dhc93AB / 42485 FlyBaseID:FBgn0013812 Length:4496 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038943440.1 Gene:Dnah17 / 287845 RGDID:1563805 Length:4459 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4484 Identity:2703/4484 - (60%)
Similarity:3412/4484 - (76%) Gaps:33/4484 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    18 PDPRLELMGSFVIKSLKLKPEKWTRVVTVEEHKGIIKEFLDRNTPVVLIIILTPAAQLVPSTTFP 82
            ||||::.:.:.....||.||:||:::|..||:..:..||.|:....||::.|.||..::|...||
  Rat     2 PDPRIDYLETVSSALLKFKPDKWSKLVGAEENMALFTEFFDKTENPVLVMTLNPAGIIIPCLGFP 66

  Fly    83 LSQLKSKGVYFIKRYALPIPREDCGNFIIYGDLATRTIDQLSALVEEVLVPLLSNEDNYRNWPIM 147
            .| ||:||||||:.....|.:::....:||||::...:|||.|:|||||..||:..:|...||.:
  Rat    67 ES-LKTKGVYFIRTKPENITKDNYKTRLIYGDISPTPVDQLIAVVEEVLYSLLNQNENMDGWPRV 130

  Fly   148 VAQDVQKHVHSLKSTVHQVKGQVSGETILAMPVGVEKIVKAAKELVETEQCQFDLYLKSAIEGVV 212
            |::|:.|.||.||:.:..:.|::.|:|:|.:|..:..: ....|.:|......|..|..:||.::
  Rat   131 VSEDIVKQVHRLKNEMFVMGGKIKGKTLLPIPEHLGSL-DGTLESMERIPSSLDNSLLHSIETII 194

  Fly   213 IKWATQIHEVIKESPSNAFANGQNPTPHTEFTFWNNRLKNLSFIYDQLRNERIRAMALILEYSMS 277
            |.|:.||.:|:.:..:.|..:|.:|.|..||.||:.||.||..|::||...::..:..|||.:.|
  Rat   195 IDWSHQIRDVLSKDSAQALLDGLHPLPRVEFEFWDARLMNLQCIHEQLNRPKVNKIVEILEKAKS 259

  Fly   278 AYHPCFQTLFKNVVTALAEAKDITLYLNPLKRPLQHLEEIDFAECKPLLIPFMNTVGILWGNSRY 342
            .|.|..|.::.||...|.||.||.|||.||:..|:.:|:.||......::..::|:..:|..|.:
  Rat   260 CYWPALQNVYMNVTQGLKEANDIVLYLKPLRILLEEMEQADFTVLPSFIVKVLSTICFIWATSEH 324

  Fly   343 YCQSAKITVLLQEICNLIIHQAKRYLDPSSI---FHSDIDEAMQRLTLSIQILKFFRELFDYYKE 404
            |...:::.|:|:|..|.||...:.||.|..:   ...:|:|.:..::.|:.:||.....:|:...
  Rat   325 YNTPSRVIVILREFSNQIIEMTRTYLSPEEVLKGLQGEIEEVLGGISQSVGVLKELFHAYDFCCA 389

  Fly   405 RLATFFTEPEERPPILWTFHPNSVFKRFNAFLERLTTIQWFFFTVIEFLKLEKVEIGGLRGRQLS 469
            .:..||   ::|||:.|.|..:..|.|.|||..|:.||:..:.|.||||||||:|:||:||..|.
  Rat   390 NMKLFF---KDRPPVPWEFPSSLAFSRMNAFFHRVQTIEDLYKTAIEFLKLEKIELGGVRGNILG 451

  Fly   470 TRITDVYVEFNQYFTAFASKSYDVLDPDDHEFDEDFKGFQTRILELDMKLAAILCQAFDDCHNLE 534
            ..:|.:|.|..:....||...||.|||.|..||:|:..|:|:|.:||.:||.|.|||||||:.:|
  Rat   452 NLVTQIYDEVFELVKVFAECKYDPLDPGDSSFDDDYNDFETKIQDLDRRLATIFCQAFDDCNCIE 516

  Fly   535 SIFKLISIVGSVLDRPKIKEEFTQRYAEIVRMLDDEMTICESIYDKQMELKKVGDNLYPNYNCPP 599
            |..||:.:.|.:|:||.|..|...||:.::.|.:.|:...:.:||.||...:.|.....:.|.||
  Rat   517 SSAKLLYMCGGLLERPLILVEVVPRYSVMLEMFNTELDNAKLMYDAQMAASEDGQIPPIHKNMPP 581

  Fly   600 VAAFIRWCHQLETRITAPVKNFKALQHEITKTEKSQEIVERYEILMVKLGSCKTQFFDDWAGQLD 664
            ||..::|..:|:.|:...:|..|.:.|.:..:.:::.:.::|:.::..|...:.:.:..|...:|
  Rat   582 VAGQLKWSLELQERLEVSMKYLKHIDHPVMSSVEAKLVYDKYDEMIGLLKGYREKKYQQWVEGVD 646

  Fly   665 GQIEENLKKSLIARDRRHNSLILNFSAALFSILREVHYMQQMKIEGIPQIAIDFAEKSDVFRSYT 729
            .....||.:.||.||...:.:.:|||.||.::||||.|:...:.:.||..|.....::::||.:.
  Rat   647 QDCHFNLGQPLIQRDPFSSLIQVNFSKALVAVLREVKYLNFQQQKEIPSSAEKLFSENEIFRKFV 711

  Fly   730 LNLEKTIDWYNSIQEGSSPVELRLIEPEIKMIDDLVEIGVNQLVWNSSDILSYLDKLRKPVAALQ 794
            .|||..:.|||.|:.....||..||:.|::.||..:......|.||..:::.|:.::|:.:..||
  Rat   712 GNLELIVGWYNEIKTTVMEVEFPLIKSELEEIDVKLMSAETTLFWNGENVMEYIQEMREILHNLQ 776

  Fly   795 NRMDHTQGNLRQIRKIMGVWAKQPLFERRDCKKDTVLSIDERPDRTSKRYAEIQAASIEIHKLLQ 859
            ||:..|:.|:..|.:.|..|:..|||||:|.||:.:|.:|.|....:||||.::.|.:.|..::.
  Rat   777 NRIQKTKQNIEGITQAMQEWSANPLFERKDNKKEALLDLDGRVANLNKRYAAVKDAGVRIQAMVT 841

  Fly   860 DNMLQFDMESKQDDAVWLSYVDFVDNIVYENILKTVGVSVGYLAENMDPENNYAPLFESRLELVE 924
            :|...|..::....  |..||:::|.:|.:...:.:..|:.||.:||..:.|.|||||.|:||.|
  Rat   842 ENAELFKADTTSQP--WKDYVNYIDAMVLDEFDRFIRKSLNYLMDNMTMDENIAPLFEIRMELDE 904

  Fly   925 PNLVFVPSLDPEDPMGFNNMLIELMRDIMKMGSLIKRLKPNEKRNYVEMIKENQDIIDMRREILN 989
            ..|.|.|:|:..|...|.:::..|:.|:..:..||.||... :.||...:::..|:|:||.|:.:
  Rat   905 DGLTFNPTLEMGDEDSFLSLIEGLINDLYNVARLIPRLAKG-RINYKSDLEDITDLIEMREELSS 968

  Fly   990 GVDLVMEEASRFCRQFERYSYLWLDDREECMEYFLEYGRMLDPDEIELILINDPNQPPPQPCQPT 1054
            .|...|:.|..:...||||||||:||.:|.|:.||.:|....|:|::..:  |...|   ..|||
  Rat   969 LVIGAMKVAEEYQDSFERYSYLWVDDLQEFMKNFLIFGHAPTPEELDTKI--DDTIP---KTQPT 1028

  Fly  1055 IEAFREQIDNYESLFNEIEDIGPFQVFSSWFQVDVRPFRQALLNTVCKWGNMFKEHLVTTVTSSL 1119
            :..|::|||:||.|:.|:......:||..|.|.|.|||:||||||:.:|..:||.:|...|.:||
  Rat  1029 LAQFQQQIDSYEKLYEEVSRCENTKVFHGWLQCDCRPFKQALLNTIKRWSLLFKRYLSDHVINSL 1093

  Fly  1120 MNLSHFIRKADEGLLQTVKEKDYEGLVSIMAYLMQVKERAAKTDEMFEPMQETIQLLKYYDMDIP 1184
            .:|..|:.....||.:.:||.||:|||.:|.:||:||||...||.||||:::||:|||.|..::|
  Rat  1094 ADLESFMGVTRTGLKKPLKEGDYDGLVEVMGHLMKVKERQVATDSMFEPLKQTIELLKSYGEEMP 1158

  Fly  1185 EEVNVLLQELPEQWANTKKIASTVKQQVSPLQATEVVSIRNKIALFESHIQLFREVFKTYDFFRF 1249
            ||..:.||||||||.||||:|..|||.|:||||.||..:|.|...||.....|||.|:....|.|
  Rat  1159 EETYLKLQELPEQWTNTKKLAIQVKQNVAPLQANEVNILRRKCQQFELKQHEFREKFRRDAPFTF 1223

  Fly  1250 DCYKPYLLMDRINDDMFLCESEMRDIQESGSLFEVNIPEFKVLKQCRKELRMLKQLWDYVNIVAT 1314
            ....||..:::....:...|..|..:.:|||||||.:|::|.||.|.||:|:||:|||.:.:|.|
  Rat  1224 SDPDPYKSLNKQQKSISAMEGVMEALCKSGSLFEVTVPDYKQLKACHKEVRLLKELWDMIVMVNT 1288

  Fly  1315 SIDDWKTTPWRKVDVENMDIECKKFAKDIRLLDKEMRPWDTFINLESTVKNMLTSLRAVGELQNP 1379
            ||||||||.|:.::||.|||:|||||||:|.|||||:.||.|:.|::|||||:||||||.|||||
  Rat  1289 SIDDWKTTKWKDINVEQMDIDCKKFAKDVRSLDKEMKAWDAFVGLDNTVKNMITSLRAVSELQNP 1353

  Fly  1380 AIRERHWNQLMNSTKSLAALPKEVTVKFIMDHETTLAELLGLNLHECEEEVKNIVDKAVKEMSME 1444
            |||||||.|||.:|:          |||.|..|||||:||.||||:.|:||:|||||||||..||
  Rat  1354 AIRERHWQQLMQATQ----------VKFEMSEETTLADLLQLNLHKYEDEVRNIVDKAVKESGME 1408

  Fly  1445 KILRDLNTTWTVMEFDHELHPRTGCNLLKASEELIETLEDNQVCLQNLITSKYIAHFLEEVSTWQ 1509
            |:|:.|::||:.|||:||||||||..|||:.|.|:||||||||.||||:.|||::|||:||::||
  Rat  1409 KVLKTLDSTWSTMEFEHELHPRTGTMLLKSDELLVETLEDNQVQLQNLMMSKYLSHFLKEVTSWQ 1473

  Fly  1510 NKLMIADQVITVWFEVQRTWTHLESIFMSSEDIRKQLPVDSDRFDNIDAEFRVLMDEMSVSSNVV 1574
            .||..||.||::||||||||:||||||:.|||||.|||.||.|||:||.||:.||::...:.|||
  Rat  1474 QKLSTADSVISIWFEVQRTWSHLESIFIGSEDIRAQLPEDSRRFDSIDQEFKALMEDAVKTPNVV 1538

  Fly  1575 ASTNRSGLIERLEHLQKELTLCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDVLSNGIQPEMVTKHL 1639
            .:||:.||.::||.|:|.|.:|||||||||||||||||||||||||||||:||||..|..|::||
  Rat  1539 EATNKPGLYDKLERLKKSLAVCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDILSNGNDPVEVSRHL 1603

  Fly  1640 TKLFDSIARLKFNRDES-NEINTASGMYAKDGEYVEFNELASIRGPVEVWLNRIQAAMRASLRHY 1703
            :|||||:.:|||..|.| |.|....|||:|:.||::|::...:.|.|||||||:...|.|:|||.
  Rat  1604 SKLFDSLCKLKFRLDASGNPIKVGLGMYSKEDEYMDFDKECDLSGQVEVWLNRVLDRMCATLRHE 1668

  Fly  1704 VMEAVIAYEEKQREQWLFDYPAQVSLCGSQIWWSTEVNIAFSRLEEGYDNAIKDYYKKQISQLSL 1768
            :.|||:.||||.||||:|||||||:|..:||||:|||.:||:||||||:||||||.|||||||:.
  Rat  1669 IPEAVVTYEEKPREQWIFDYPAQVALTCTQIWWTTEVGLAFARLEEGYENAIKDYNKKQISQLNA 1733

  Fly  1769 LITLLLGELSKGDRQKIMTICTIDVHSRDVVAKMIQAKLDSGSAFMWQSQLRHRFDDVEKDCFAN 1833
            |||||:|.||.|||.|||||||||||:||||||||.||::|..||.||||||||:|:.:|.||||
  Rat  1734 LITLLIGNLSAGDRMKIMTICTIDVHARDVVAKMITAKVESSQAFTWQSQLRHRWDEEKKHCFAN 1798

  Fly  1834 ICDAEFQYCHEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRAIGI 1898
            ||||:.||.:||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||:|.
  Rat  1799 ICDAQIQYSYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLIMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGT 1863

  Fly  1899 SVYVFNCSEQMDYQSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRITVEVLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDKFN 1963
            .||||||||||||:||||||||||||||||||||||||:||||||:|||||.||||||.||.|||
  Rat  1864 MVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVIAVQVKCVQDAIRAKKKKFN 1928

  Fly  1964 FMGEMISCVPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFQDARVL 2028
            |:|||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:||:|
  Rat  1929 FLGEMISLIPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFLEARLL 1993

  Fly  2029 ARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPGRPEEEVLMRALRDFNIPKIIT 2093
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|::||||||||||||||:|
  Rat  1994 ARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPTRAEDQVLMRALRDFNIPKIVT 2058

  Fly  2094 DDMPVFMGLISDLFPALDVPRKRDQDFERTVKQAASDLLLQPEDNFILKVVQLEELLEVRHSVFI 2158
            ||:|||||||.|||||||||||||.:||:.:||:..:|.||.||:|:||||||||||:||||||:
  Rat  2059 DDLPVFMGLIGDLFPALDVPRKRDLNFEKIIKQSIVELKLQAEDSFVLKVVQLEELLQVRHSVFV 2123

  Fly  2159 VGNAGTGKTQVWKTLLRTYQNIKRKPIFNDLNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSVLMRDQA 2223
            :||||:||:||.|:|.:||||:||||:..||:|||||.||||||||||||||||||||.:|||.|
  Rat  2124 IGNAGSGKSQVLKSLNKTYQNMKRKPVAVDLDPKAVTCDELFGIINPATREWKDGLFSTIMRDLA 2188

  Fly  2224 NITGDQPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTPSMRLLFEISNLRTATPATV 2288
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..:|||:||||:|||||||||
  Rat  2189 NITHDGPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNRTMRLVFEISHLRTATPATV 2253

  Fly  2289 SRAGILYINPQDLGWNPYVTSWVETRKIPAEKSNLVMLFDKYIPPSLETIRVRFKKITPVAEMAH 2353
            ||||||||||.||||||.|:||:|.||:.:||:||::|||||:|..|:.:|..||:||||.|:..
  Rat  2254 SRAGILYINPADLGWNPVVSSWIERRKVQSEKANLIILFDKYLPTCLDKLRFGFKRITPVPEITV 2318

  Fly  2354 IQMLCHLLNCFLIPANTPADCPKEWHELYFVFACIWAFGSAMFQDQAIDYRVEFSKWWVNEFKTV 2418
            ||.:.:||.|.|...|.|.|.|||.:||||||||.||||.||||||.|||||||||||:|||||:
  Rat  2319 IQTILYLLECLLTEKNAPPDSPKELYELYFVFACFWAFGGAMFQDQLIDYRVEFSKWWINEFKTI 2383

  Fly  2419 KFPPGGTVFDYFLDSETKTFLPWTEKIPKFELDSDLPLQAVIVHTSESIRLRFFLDLLMDKKHPV 2483
            |.|..||:|||::|.|||.|||||:|:|.||||.|:||||.:|||:|:||:|:|:||||.|..||
  Rat  2384 KLPSQGTIFDYYIDPETKKFLPWTDKVPNFELDPDIPLQASLVHTTETIRIRYFMDLLMAKAWPV 2448

  Fly  2484 MLVGNAGCGKTVLVNEKLQSLS-ENYAVTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPLEKKAGRNYGPPGNKL 2547
            |||||||.||:||:.:||::|| ::|.|..:|||:||||.|||.:||||||||:||||||||.|.
  Rat  2449 MLVGNAGTGKSVLMGDKLENLSTDDYLVQAVPFNFYTTSAMLQGVLEKPLEKKSGRNYGPPGTKK 2513

  Fly  2548 LCYFVDDINMPEVDAYGTVQPHTLMRQHLDYGHWYDRNKLTLKDIHNCQYVACMNPTSGSFTINP 2612
            |.||:||:||||||.||||.||||:|||:|:.|||||.||||||:||||||||||||||||||:|
  Rat  2514 LIYFIDDMNMPEVDKYGTVAPHTLIRQHMDHRHWYDRQKLTLKDVHNCQYVACMNPTSGSFTIDP 2578

  Fly  2613 RLQRHFCVLAVSFPGPESITVMYSSILAQHFANAEQKFTP-IVTRMTPNIVAATIALHNKCLQVF 2676
            ||||||||.||||||.|::..:|::|||||.:   .:..| ::.|:..::|.|.:|||.|....|
  Rat  2579 RLQRHFCVFAVSFPGHEALITIYNTILAQHLS---YRSAPSVIQRLCSHLVTAALALHQKVAATF 2640

  Fly  2677 LPTAIKSHYIFNLRDISNVFQGLLFSSTECLTGSTDLIRLWQHETQRVYSDKLTDDKDIDSFTKM 2741
            ||||||.||||||||:||:|||:|||:.|.|....|::|||.||.:|||.||:.|:||.::..::
  Rat  2641 LPTAIKFHYIFNLRDLSNIFQGILFSTLEILRTPLDIVRLWLHEAERVYGDKMVDEKDQETLRRV 2705

  Fly  2742 QHDIVKKSFEEIDESVIFDKPNIYCHFAGGIGDPKYMPIKGWPELHKLLQEAMSSYNDLVAAMNL 2806
            .....||.|:::.|..:|.||||:|||..|||||||.|:.....|:|||::.:.|||::.|.|||
  Rat  2706 TMASTKKFFDDLGEEHLFAKPNIFCHFTQGIGDPKYFPVTDVAHLNKLLKDVLDSYNEVNAVMNL 2770

  Fly  2807 VLFEDAMMHVCRINRILESPRGSALLVGVGGSGKQSLARLAAFISSLEVVQIQLKKGYGVNDLKN 2871
            ||||||:.|:||||||||||||:||||||||||||||:||||:||:|:|.||.|||||.:.|||.
  Rat  2771 VLFEDAVAHICRINRILESPRGNALLVGVGGSGKQSLSRLAAYISALDVFQITLKKGYAIPDLKM 2835

  Fly  2872 EFSGLYLKAGLKNVGIMFLMTDAQIPSEDFLVLINDMLATGEIPDLFPDDEIENIIAGVRNEVKG 2936
            :.:..|:|:.:|||..:|||||:|:..|.|||||||:||:||||.||.||::||||:.:|.:||.
  Rat  2836 DLAAQYIKSAVKNVPSVFLMTDSQVAEEQFLVLINDLLASGEIPGLFGDDDLENIISSMRPQVKS 2900

  Fly  2937 AGLVDTRENCWKFFIDRVRKQLKIVLCFSPVGSTLRVRSRKFPAIINATSINWFHEWPQEALISV 3001
            .|:.||||.||||||::||||||::||||||||.||||:|||||::|.|:|:||||||::||:||
  Rat  2901 LGMTDTREACWKFFIEKVRKQLKVILCFSPVGSVLRVRARKFPAVVNCTAIDWFHEWPEDALVSV 2965

  Fly  3002 AMNFLAQNKVLPENHRDSVAKFMAYVHTSVNTTSKVYLQNERRYNYTTPKSYLEQINLYIKLLNH 3066
            :..||.:.:.:....:.|::.||:||||:||..||.||..||||||||||::||||.||..||..
  Rat  2966 SARFLQETQGIQPEVKTSISLFMSYVHTTVNEMSKTYLATERRYNYTTPKTFLEQIKLYQNLLAK 3030

  Fly  3067 KNEDLQSKIERLENGLEKLRSTALQVADLKVKLAVQEIELKEKNEAADALIEIVGIETEKVQTEK 3131
            |..:|.:|||||||||.||:|||.||.|||.||||||.|||:|||.||.||::||:|||||..||
  Rat  3031 KRMELVAKIERLENGLMKLQSTASQVDDLKAKLAVQEAELKQKNENADKLIQVVGVETEKVSKEK 3095

  Fly  3132 AVADEEEMKVALIADEVSKKQRDCEEDLLKAEPALMAAQDALNTLNKANLTELKSFGSPPGAVTN 3196
            |:|||||:||.:|...|::||:.||.||.||||||:|||:||:||||.||||||||||||.||.|
  Rat  3096 AIADEEEIKVEVINKNVTEKQKACETDLAKAEPALLAAQEALDTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVN 3160

  Fly  3197 VTAAVMVLLSQGGKVPKDRSWKAAKIAMAKVDTFLDSLINYDKENIHPEITKAIQPYLKDPEFEP 3261
            ||||||:|.:.|||:|||:|||||||.|.|||||||||..:|||:|.....||.:||..:|.|:|
  Rat  3161 VTAAVMILTAPGGKIPKDKSWKAAKIMMGKVDTFLDSLKRFDKEHIPEACLKAFKPYQGNPTFDP 3225

  Fly  3262 EFVRSKSGAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRKALAAANAELAAAQDKLAGIKRKVMSLEEQL 3326
            ||:||||.||||||:|.|||::||||||||.|||:||..||||||.|||||:.||.|:..|...|
  Rat  3226 EFIRSKSTAAAGLCSWCINIVRFYEVYCDVAPKRQALEEANAELAEAQDKLSRIKNKIAELNANL 3290

  Fly  3327 GKLTADFEKATADKLRCQQEADATQATIALANRLVGGLASENVRWAEAVNNFVKQGITLPGDILL 3391
            ..||:.||||||:|::||||||||...|:||||||||||||||||||:|.||..||:||.||:||
  Rat  3291 NNLTSAFEKATAEKIKCQQEADATNRVISLANRLVGGLASENVRWAESVENFRSQGVTLCGDVLL 3355

  Fly  3392 ITAFISYVGCFTKGFRIDLLLKMWTPFLKSIDPPIPTTENLDPLSLLTDDTTIAIWTNEGLPSDR 3456
            |:||:||||.|||.:|.:|:.|.|.|::.::..|||.||.||||:|||||..:|.|.|:||||||
  Rat  3356 ISAFVSYVGYFTKKYRNELMEKFWIPYVNNLKVPIPITEGLDPLTLLTDDADVATWNNQGLPSDR 3420

  Fly  3457 MSIENATILSNSDRWPLMIDPQLQGVKWIKQKYGEDLKVIRLGQRSYLDIIEKSINAGCNVLIEN 3521
            ||.||||||.|::||||::|.||||:||||.|||.:||.|||||:|||||||::|:.|..:||||
  Rat  3421 MSTENATILCNTERWPLIVDAQLQGIKWIKNKYGSELKAIRLGQKSYLDIIEQAISEGDTLLIEN 3485

  Fly  3522 IDENLDPVLDSLLGRNLIKKGKAIKIGDKEIEYNSNFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTV 3586
            |.|.:|||||.|||||.||||:.|||||||:||:.:||||||||..|||||||||||.|||||.|
  Rat  3486 IGETVDPVLDPLLGRNTIKKGRFIKIGDKEVEYHPSFRLILHTKYFNPHYKPEMQAQCTLINFLV 3550

  Fly  3587 TRDGLEDQLLAEVVKAERPDLEELKADLTKQQNDFKIMLKKLEDDLLSRLSSAGENILGDTALVE 3651
            |||||||||||.||..||||||:|||:|||.||:|||:||:|||.||:|||:|..|.||||||||
  Rat  3551 TRDGLEDQLLAAVVAKERPDLEQLKANLTKSQNEFKIVLKELEDSLLARLSAASGNFLGDTALVE 3615

  Fly  3652 NLETTKSTASEIEQKVAEAKITSKEIDKAREYYRPAAARASLLYFILNELNTINPIYQFSLKAFS 3716
            ||||||.||:|||:||.|||||..:|::|||.||||||||||||||||:||.||||||||||||:
  Rat  3616 NLETTKHTANEIEEKVQEAKITETKINEARENYRPAAARASLLYFILNDLNKINPIYQFSLKAFN 3680

  Fly  3717 VVFQKAIAKAEPGDTLDLRVSNLIDCITYSVFQYTSRGLFECDKLIFASQMTFQILLMNEEVTSA 3781
            |||:|||.|..|.:.:..||.||.|.|||||:.||:|||||.|||||.:|:|||:|.|.:|:...
  Rat  3681 VVFEKAIQKTPPAEEVRQRVINLTDEITYSVYMYTARGLFERDKLIFLAQVTFQVLSMKKELNPV 3745

  Fly  3782 ELDFLLRFPIKPHVTSPVDFLTNQSWGGICSLASKDEFRNLDRDIETSSKRWKKLVESELPEKEK 3846
            |||||||||.|..|.||||||.:||||||.:|:..|||:|||.|||.|:||||||||||.||||.
  Rat  3746 ELDFLLRFPFKAGVVSPVDFLQHQSWGGIKALSEMDEFKNLDSDIEGSAKRWKKLVESEAPEKEI 3810

  Fly  3847 FPQEWKNKTALQRLCMIRALRPDRMTYALADFIEEKLGSKYVESRAMEFAKSYEEASPSTPIFFI 3911
            ||:|||||||||:|||:|.:||||||||:.:|:|||:|||:||.|::||:|||||:|||||||||
  Rat  3811 FPKEWKNKTALQKLCMVRCMRPDRMTYAVKNFVEEKMGSKFVEGRSVEFSKSYEESSPSTPIFFI 3875

  Fly  3912 LSPGVNPLKDVEALGKQMGFSMDLGNFHNVSLGQGQEAIAEAAMDTAAKHGHWVVLQNIHLVRKW 3976
            |||||:||||||||||::||::|.|..||||||||||.:||.|:|.||:.||||:|||||||.:|
  Rat  3876 LSPGVDPLKDVEALGKKLGFTIDNGKLHNVSLGQGQEVVAEDALDVAAEKGHWVILQNIHLVARW 3940

  Fly  3977 LPVLEKKLEYYAEDSHPDYRMFLSAEPASTPSAHIIPQGILESSIKITNEPPTGMLANLHKALDN 4041
            |.:|:||:|.|:..||.|||:|:|||||.:...|||||||||::|||||||||||.||||||||.
  Rat  3941 LSILDKKVERYSSGSHEDYRVFISAEPAPSVETHIIPQGILENAIKITNEPPTGMYANLHKALDL 4005

  Fly  4042 FTQETLEMSGKEAEFKAILFSLCYFHAVVAERRKFGPQGWNKIYPFNVGDLNISVSVLYNYLEAN 4106
            |||:||||..||.|||.|||:|||||||||||||||.||||:.||||.|||.||::|||||||||
  Rat  4006 FTQDTLEMCTKEIEFKCILFALCYFHAVVAERRKFGAQGWNRSYPFNNGDLTISINVLYNYLEAN 4070

  Fly  4107 AKVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCITYLEEYMQPDLVDGELFLAPSFPAPPNTDYQGYH 4171
            .||||:||||||||||||||||||||||||.|||.|:::.::::||:.|||.|..|||.||:|||
  Rat  4071 PKVPWDDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLIEFIRVEMLEGEVLLAPGFQIPPNLDYKGYH 4135

  Fly  4172 TYVDEMMPAESPYLYGLHPNAEIGFLTTRAENIFRTVFEMQPRDAGAGGGATVTREDKVKQIVDE 4236
            .|:||.:|.||||||||||||||||||..:|.:||||.||||::..:|.|..|:||:|||.::|:
  Rat  4136 EYIDENLPPESPYLYGLHPNAEIGFLTVTSEKLFRTVLEMQPKETDSGAGTGVSREEKVKAVLDD 4200

  Fly  4237 IIEKLPEEFNMVEIMNKVEERTPYVIVAFQECERMNFLTSEMKRSLKELDLGLKGELTITSDMEV 4301
            |:||:||.|||.|||.|..|:||||:||||||||||.||:||:||||||:||||||||||:|||.
  Rat  4201 ILEKIPETFNMAEIMAKAAEKTPYVVVAFQECERMNILTNEMRRSLKELNLGLKGELTITTDMED 4265

  Fly  4302 LENSLFLDQVPPIWTQRAYPSLLGLNNWFIDLCLRLRELETWSTDFVLPSCVWLAGFFNPQSLLT 4366
            |..:||.|.||..|..|||||::||..|:.||..|:||||:|:|||.||:.|||||||||||.||
  Rat  4266 LSTALFYDTVPETWVARAYPSMMGLAAWYSDLLQRIRELESWTTDFALPTTVWLAGFFNPQSFLT 4330

  Fly  4367 AIMQSTARRNDLPLDKMCLQCDVTKKQKEEFTTAPRDGCCVHGIFMEGARWDIQQGIIMESRLKE 4431
            |||||.||:|:.|||||||..:||||.:|:.|..||:|..|:|:||||||||.|.|:|.|::||:
  Rat  4331 AIMQSMARKNEWPLDKMCLSVEVTKKTREDMTAPPREGSYVYGLFMEGARWDTQTGVIAEAKLKD 4395

  Fly  4432 LYPSMPVINIRAITQDKQDLRNMYECPVYKTRTRGPTTYVSNLNLKTKDKPGKWILAGVALLLQ 4495
            |.|.||||.|:||..|:.:.:|:|||||||||.||| |||...|||||:|..|||||.||||||
  Rat  4396 LTPVMPVIFIKAIPVDRMETKNIYECPVYKTRIRGP-TYVWTFNLKTKEKAAKWILAAVALLLQ 4458

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc93ABNP_001262793.1 DHC_N1 205..782 CDD:462457 195/579 (34%)
DHC_N2 1292..1707 CDD:462462 263/415 (63%)
DYN1 1305..4143 CDD:227570 2001/2840 (70%)
AAA_6 1841..2167 CDD:463697 283/325 (87%)
MT 3076..3419 CDD:463699 236/342 (69%)
Dynein_C 4198..4494 CDD:465677 190/295 (64%)
Dnah17XP_038943440.1 DHC_N1 187..764 CDD:462457 195/579 (34%)
DHC_N2 1266..1672 CDD:462462 263/415 (63%)
DYN1 1493..4124 CDD:227570 1859/2633 (71%)
AAA_6 1806..2132 CDD:463697 283/325 (87%)
MT 3040..3383 CDD:463699 236/342 (69%)
Dynein_C 4162..4457 CDD:465677 190/295 (64%)

Return to query results.
Submit another query.