DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc93AB and Dnah12

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262793.1 Gene:Dhc93AB / 42485 FlyBaseID:FBgn0013812 Length:4496 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063131137.1 Gene:Dnah12 / 252959 RGDID:619990 Length:3962 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4223 Identity:1329/4223 - (31%)
Similarity:2106/4223 - (49%) Gaps:569/4223 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   547 LDRPKIKEEFTQRYAEIVRMLDDEMTI--CESIYDKQMELKKVGDNLYPNYNCPPVAAFIRWCHQ 609
            :|.||..|....|.::..:...:::.|  .:...||.:: |::.....|::  ||.         
  Rat    32 VDTPKQSELLNYRRSKEQQKKINQLVISAAKKSLDKTLD-KRIPPLPEPDF--PPT--------- 84

  Fly   610 LETRITAPVKNFKALQHEITKTEKSQEIVERYEILMVKLGSCKTQFFDDWAGQLDGQIEENLKKS 674
                :|:.:|. |.|.:...|     :.||...|:.::         ..|...:...|.|:||:.
  Rat    85 ----MTSEIKK-KGLNYIFMK-----QCVESSPIVPIQ---------PQWLDHMLMLIPEHLKEG 130

  Fly   675 LIARDRRHNSLILNFSAALFSILREVHYMQQMKIEGIPQIAIDFAEKSDVFRSYTL--------- 730
                 ::...|       |.|::.||              ::|| |||  .:.|.:         
  Rat   131 -----KKREEL-------LGSLINEV--------------SMDF-EKS--MKRYLVQSVLVKPPV 166

  Fly   731 ---------------NLEKTIDWYNSIQEGSSPV--ELRLIEPEIKMIDDLVEIGVNQLVWNSSD 778
                           .|:.:..|:::..:..|.:  .|.::.|.:|:   |:|:|....    ||
  Rat   167 KWLEDEWGPLPESPEGLDYSNPWHSNFVQARSQILANLHIVHPTMKL---LLELGYTTF----SD 224

  Fly   779 ILSYLD----KLRKPV--AALQNRMDHTQGNLRQIRK----IMGVWAKQPLFERRDCKKDTVLSI 833
            |: .||    :.|.|:  .||:|.:.      .|.||    ||..|  .|.......||:.:..|
  Rat   225 II-LLDLTGIRDRGPIDCEALRNDLS------IQARKAEERIMNTW--YPKVINLFTKKEALEGI 280

  Fly   834 DERPDRTSKRYAEIQAASIEIHKLLQDNMLQFDMESKQDDAVWLSYVDFVDNIVYENILKTVGVS 898
              :|::....|                |.:...|.::..|.:|.:..:||.......||:     
  Rat   281 --KPEKVDSFY----------------NCVSILMSNQLKDLLWRTVEEFVRLFDSRYILR----- 322

  Fly   899 VGYLAENMDPENNYAPLFESRLELVEPNLVFVPSL-DPEDPMGFNNMLIELMRDIMKMGSLIKRL 962
                          .|:|:..|...:..:.|.|:. |.||               :.:|      
  Rat   323 --------------LPIFKMELTFDDDKMEFYPTFQDLED---------------VVLG------ 352

  Fly   963 KPNEKRNYVEMIKENQDIIDMRREILNG----VDLVMEEASRFCRQFERYSYLWLDD-------- 1015
                   .:|.|.|....:......|:|    |:|..|..       |...|..|..        
  Rat   353 -------LIERISETLQTVQTVPSWLSGTTAPVNLDTELP-------EHVMYWALSTLRIAVHQN 403

  Fly  1016 ----REECMEYFLEYGRMLDPDEIELI-LINDPNQPPPQPCQPTIEAFREQIDNYESLFNEIEDI 1075
                |.....|...|..:||....::| .....|.        |.:.:.|.|:.:.||.:||   
  Rat   404 LEGVRAHYKTYVTNYNWLLDGTATKMIERFQSENH--------TFDEYTEFIERFFSLASEI--- 457

  Fly  1076 GPFQVFSSW-----FQVD-----------VRPFRQALLN-----------TVCKWGNMFKEHL-- 1111
               .:...|     .::|           .:.|...|||           ::|......|||.  
  Rat   458 ---MLLPQWAHYPMVRLDCEDLKTGLTNKAKAFANILLNDIASKHRKENESICSEFETIKEHALR 519

  Fly  1112 VTTVTSSLMNLSHFIRKAD----EGLLQTVKEKDYEGLVSIMAYLMQVKERAAKTDEMFEPMQET 1172
            |...|..:|.|..||.||.    :.|.|.::|...:     |.|.:                 :|
  Rat   520 VPETTEEMMELIAFIEKARTTGIQNLAQRIQESKRQ-----MGYFL-----------------DT 562

  Fly  1173 IQLLKYYDMDI-------PEEVNVLLQELPEQWANTKKIASTVKQQVSPLQATEVVSIRNKIALF 1230
            . ||...|:::       |.::|.:..|..|...|:|:           .:..|:::.|.|:.| 
  Rat   563 F-LLSQEDLNLNASVLLWPSKINPVFDENDELIENSKR-----------TKENELIAKREKLIL- 614

  Fly  1231 ESHIQLFREVFKTYDFFRF---DCYKPYL-----LMDRINDDMFLCESEMRDIQESGSLFEVNIP 1287
                ::.:|..:..:|..|   |..:.|:     |..||.|.    |..::.|.:...||:..:.
  Rat   615 ----EIEKESRRMEEFTEFAELDRMQQYVADVRHLQKRIQDS----EEAVQFINKEEELFKWELT 671

  Fly  1288 EFKVLKQCRKELRMLKQLWDYVNIVATSIDDWKTTPWRKVD-------VENMDIECKKFAKDI-- 1343
            ::..|::.:..:...::.:::|.       .|:.|..|.:|       .|:|:.:..:|::::  
  Rat   672 KYPELEKLKVTIEPYQKFFNFVL-------KWQRTEKRWMDGGFLDLNGESMEADIDEFSREVFK 729

  Fly  1344 -----------RLLDK----------EMRPWD-----TFINLESTVKNMLTSLR----AVGELQN 1378
                       .|.:|          |.:|.:     ..|.:.:||...:...:    .|..|.|
  Rat   730 TLKFFQTKQKKELQEKRKAARKRSLMEEKPEEEPKESPTITMCATVMEQIKVFKEYIPTVSILCN 794

  Fly  1379 PAIRERHWNQLMNSTKSLAALPKEVTVKFIMDHETTLAELLGLNLHECEEEVKNIVDKAVKEMSM 1443
            |.:|.|||.|          :.:.|......|..|||.::|.|||....|..:.|...|.||.|:
  Rat   795 PGMRARHWKQ----------MSEIVGYDLTPDSGTTLRKVLKLNLTPYLESFEVISAGASKEFSL 849

  Fly  1444 EKILRDLNTTWTVMEFDHELHPRTGCNLLKASEELIETLEDNQVCLQNLITSKYIAHFLEEVSTW 1508
            |:.:..:..||..:.|...|:..||..:|.:.:|:...|:|..:..|.:..|.:|..|..|:..|
  Rat   850 ERAMNAMIATWDDISFHISLYRDTGVYILSSVDEIQAILDDQIIKTQTMRGSPFIKPFENEIKAW 914

  Fly  1509 QNKLMIADQVITVWFEVQRTWTHLESIFMSSEDIRKQLPVDSDRFDNIDAEFRVLMDEMSVSSNV 1573
            :::|:...:.|..|.:||..|.:||.|| .||||.:|:|.:..:|..:|..::.:|...:....|
  Rat   915 EDRLIRIQETIDEWLKVQAQWLYLEPIF-CSEDIMQQMPEEGRQFQTVDRHWKDIMKFCAKDPKV 978

  Fly  1574 VASTNRSGLIERLEHLQKELTLCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDVLSNGIQPEMVTKH 1638
            :|:|:.:||:|:|::....|....|.|..|||.|||.||||:|:|:.::|::||....|..|..|
  Rat   979 LAATSLTGLLEKLQNCNDLLDKIMKGLNAYLEKKRLFFPRFFFLSNDEMLEILSETKDPLRVQPH 1043

  Fly  1639 LTKLFDSIARLKF--NRDESNEINTASGMYAKDGEYVEFNELAS---IRGPVEVWLNRIQAAMRA 1698
            |.|.|:.||:|:|  |.|       ...||:.:||.||...:.|   .||.||.||.:::..|..
  Rat  1044 LKKCFEGIAKLEFLTNLD-------IKAMYSSEGERVELISVISTSAARGAVEKWLIQVEDLMLR 1101

  Fly  1699 SLRHYVMEAVIAYEEKQREQWLFDYPAQVSLCGSQIWWSTEVNIAFSRLEEGYDNAIKDYYKKQI 1763
            |:...:..:.:||.|..|:.|:.::|.||.||.||::|::|.....|...||    :|.|||:..
  Rat  1102 SIHDVIAASRLAYPESARKDWVREWPGQVVLCVSQMFWTSETQEVISGGNEG----LKKYYKELQ 1162

  Fly  1764 SQLSLLITLLLGELSKGDRQKIMTICTIDVHSRDVVAKMIQAKLDSGSAFMWQSQLRHRFDDVEK 1828
            .||:.::.|:.|:|||..|..:..:.|||||:||||..||...:...:.|.|.:|||:.::  .:
  Rat  1163 YQLNDIVELVRGKLSKQTRITLGALVTIDVHARDVVMDMIDMGVSHDTDFQWLAQLRYYWE--YE 1225

  Fly  1829 DCFANICDAEFQYCHEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLG 1893
            :....|.:...:|.:|||||:|||||||||||||.||..:.:|.:||||.||||||||||||||.
  Rat  1226 NARVRIVNCNVKYAYEYLGNSPRLVITPLTDRCYRTLIGAFYLNLGGAPEGPAGTGKTETTKDLA 1290

  Fly  1894 RAIGISVYVFNCSEQMDYQSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRITVEVLSVVAVQVKSVQDAIRDK 1958
            :|:.:...|||||:.:||.:.|..:||||.:|||.||||||||.:|||||||.|:..:|.||:.|
  Rat  1291 KALAVQCVVFNCSDGLDYLAMGKFFKGLASSGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILCIQRAIQQK 1355

  Fly  1959 KDKFNFMGEMISCVPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFQ 2023
            .:.|.|.|..:...|...:.||||||||||:|||:|||.|||..||:||::.||.||.|.:.||.
  Rat  1356 LEVFVFEGTELRLNPNCFVAITMNPGYAGRSELPDNLKVLFRTVAMMVPNYALIAEISLYSYGFL 1420

  Fly  2024 DARVLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPGRPEEEVLMRALRDFNI 2088
            :|:.|:.|.:..|.||.|.||.|.|||:|:||:|:|||.||:||...|...|:.:|:|:::|.|.
  Rat  1421 NAKPLSVKIVMTYRLCSEQLSSQFHYDYGMRAVKAVLVAAGNLKLKYPNENEDILLLRSIKDVNE 1485

  Fly  2089 PKIITDDMPVFMGLISDLFPALDVPRKRDQDFERTVKQAASDLLLQPEDNFILKVVQLEELLEVR 2153
            ||.::.|:|:|.|:.|||||.:.:|....|:|.....:|.....|||...|:.|::|..|::.||
  Rat  1486 PKFLSHDIPLFNGITSDLFPGIKLPEADYQEFLECAYEACETQNLQPVKFFLEKIIQTYEMMIVR 1550

  Fly  2154 HSVFIVGNAGTGKTQVWKTLL--------RTYQNIKRKPIFNDLNPKAVTNDELFGIINPATREW 2210
            |...:||.....||:|...|.        |.|.: :.|.::..:|||::|..:|||..:|.:.||
  Rat  1551 HGFMLVGEPFAAKTEVLHILADTLTLMNERNYGD-EEKVMYRTVNPKSITMGQLFGQFDPVSHEW 1614

  Fly  2211 KDGLFSVLMRDQANITGDQPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTPSMRLLF 2275
            .||:.:...|:.|.......||:|.||.||.:||||:|||:||||.|.|.|.|.|.::|.|.|:|
  Rat  1615 TDGIVANTFREFALAESPDRKWVVFDGPIDTLWIESMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMSLIF 1679

  Fly  2276 EISNLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWNPYVTSWVETRKIP---AEKSNLVM-LFDKYIPPSLE 2336
            |..:|..|:||||||.|::|:.|..|||.|.|.||:.:.|.|   .|..||:. ||:..:.||||
  Rat  1680 ETMDLSQASPATVSRCGMIYLEPSQLGWEPIVASWLNSLKEPLNELEHQNLLKELFNWLVQPSLE 1744

  Fly  2337 TIRVRFKKITPVAEMAHIQMLCHLLNCFL--IPANTPADCP-KEWHELYFVFACIWAFGSAMFQD 2398
            ..|.:.|::.|...:..:..|..|:...|  :..|.|:... :.|....|||:.||:.|::...|
  Rat  1745 FRRKKCKELIPTGNINAVVALTRLIEILLCTVVENDPSSKHIRVWIMATFVFSLIWSVGASCDTD 1809

  Fly  2399 QAIDY-----------------RVEFSKWWVNEFKTVKFPPGGTVFDYFLDSETK-TFLPWTEKI 2445
            ..:.:                 .|..:||      ...|...|.|:||..:...: .::.|.:.|
  Rat  1810 GRLAFDNFLRSLVTGKNDKAPMPVFINKW------ECPFDEKGLVYDYMYELRNRGRWIHWNDLI 1868

  Fly  2446 PKFEL-DSDLPLQAVIVHTSESIRLRFFLDLLMDKKHPVMLVGNAGCGKTVLVNEKLQSLSE--N 2507
            ...:: |....:|.:||.|.::||..|.:||.:....|::.||..|.||:|.|.:||.:..|  .
  Rat  1869 KSSDIEDRRTKIQDIIVPTMDTIRYTFLMDLCISHAKPLLFVGPTGTGKSVYVKDKLMNHLEKGK 1933

  Fly  2508 YAVTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPLEKKAGRNYGPPGNKLLCYFVDDINMPEVDAYGTVQPHTLM 2572
            |....:.|:..|::..:|.|:...|:|:....:|||..|....|:||:|||.::.||...|..|:
  Rat  1934 YFPFYVNFSARTSANQVQNIIMARLDKRRKGVFGPPMGKKCVVFIDDMNMPSLEKYGAQPPIELL 1998

  Fly  2573 RQHLDYGHWY---DRNKLTLKDIHNCQYVACMNPTSGS-FTINPRLQRHFCVLAVSFPGPESITV 2633
            ||..|.||||   |..|:||.||   :.:|.|.|..|. ..:.||..|||.:..::....|::..
  Rat  1999 RQFFDCGHWYDLKDTTKITLVDI---ELIAAMGPPGGGRNAVTPRFIRHFNICTINSFSDETMVR 2060

  Fly  2634 MYSSILAQHFANAEQKFTPIVTRMTPNIVAATIALHNKCLQVFLPTAIKSHYIFNLRDISNVFQG 2698
            ::|||:.  |......|:|....:...||:||:.::.:.:...|||..||||.|||||.|.|.:|
  Rat  2061 IFSSIMM--FYLRTHDFSPEYFVLGHQIVSATMEIYKQSMGNLLPTPAKSHYTFNLRDFSRVIRG 2123

  Fly  2699 LLFSSTECLTGSTDLIRLWQHETQRVYSDKLTDDKDIDSFTKMQHDIVKKSFEEIDESVIFDKPN 2763
            .|....|.:.....:|||:.||..||:.|:|.:|:|.:....:..:::|..|:|..|       |
  Rat  2124 CLLIDKEAIESKHTMIRLFVHEVLRVFYDRLINDEDRNWLFLLIKNVIKDHFKESLE-------N 2181

  Fly  2764 IYCHFAGG----------------------IGDPK-YMPIKGWPELHKLLQEAMSSYNDL-VAAM 2804
            ::.|...|                      .||.: |:.|....:.::::.:.:..||.. ...|
  Rat  2182 VFSHLRRGNSSINEEDLRNLMFGDYMNPDLEGDDRVYIEILNIHQFNEVVDQCLDEYNQTHKRRM 2246

  Fly  2805 NLVLFEDAMMHVCRINRILESPRGSALLVGVGGSGKQSLARLAAFISSLEVVQIQLKKGYGVNDL 2869
            |||:|...:.|:.||.|||:...|:|||:|:||||:|||..||..::.:::.|.::.|.||:|:.
  Rat  2247 NLVVFRYVLEHLSRICRILKQSGGNALLIGLGGSGRQSLTSLATSMAKMQIFQPEISKSYGMNEW 2311

  Fly  2870 KNEFSGLYLKAGLKNVGIMFLMTDAQIPSEDFLVLINDMLATGEIPDLFPDDEIENIIAGVR--- 2931
            :.:...|....|:|....:||:||.||..|.||..|:.:|.|||:|::|..||.:.::.|||   
  Rat  2312 REDIKSLLRNVGVKGQKTVFLITDTQIKEEAFLEDIDSVLNTGEVPNIFAADEKQEVMEGVRPVA 2376

  Fly  2932 ------NEVKGAGLVDTRENCWKFFIDRVRKQLKIVLCFSPVGSTLRVRSRKFPAIINATSINWF 2990
                  .|:....|       :.||::|.:..|.:|:.|||:|...|.|.|:||::||..:|:||
  Rat  2377 QVGNKHGELSPLAL-------FAFFVNRCKDNLHVVVAFSPIGDAFRNRLRQFPSLINCCTIDWF 2434

  Fly  2991 HEWPQEALISVAMNFLAQNKVLPENHRDSVAKFMAYVHTSVNTTSKVYLQNERRYNYTTPKSYLE 3055
            ..||::||..||::|| :...|.|..|..:.....:.|||:...|:.:|:...|:||.|..||||
  Rat  2435 QPWPEDALERVAVSFL-ETVELTEVERHEIVPICKHFHTSIMNLSERFLEELGRHNYVTATSYLE 2498

  Fly  3056 QINLYIKLLNHKNEDLQSKIERLENGLEKLRSTALQVADLKVKLAVQEIELKEKNEAADA----L 3116
            .|..:.:||..|.:.:....:|..|||::|.....||.::|::|    :||:.|.|||..    :
  Rat  2499 LIGSFRQLLTKKRQSVMEAKQRYVNGLDQLAFAESQVGEMKLEL----VELQPKLEAAKVENARM 2559

  Fly  3117 IEIVGIETEKVQTEKAVADEEEMKVALIADEVSKKQRDCEEDLLKAEPALMAAQDALNTLNK--A 3179
            ::|:.||:.:|:.::.:...:|...:..|:|....:.:||.||.:|.|||.||..||:||.:  |
  Rat  2560 MQIIEIESAQVEAKRKIVKLDEEIASGKAEEAQALKNECESDLAEAIPALEAALSALDTLKESPA 2624

  Fly  3180 NLTELKSFGSPPGAVTNVTAAVMVL-----------LSQGGKVPKDRSWKAAKIAMAKVDTFLDS 3233
            ::|.:||..:||..|..|.|||.|:           ...|||:  ...|..:|..:..:: ||..
  Rat  2625 DITIVKSMKNPPAGVKLVMAAVCVMKDIKPEKISDPSGTGGKI--FDYWGPSKKLLGDMN-FLRD 2686

  Fly  3234 LINYDKENIHPEITKAIQ-PYLKDPEFEPEFVRSKSGAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRKA 3297
            |..||||||...:.:.|: .||.:|||:|..|...|.||.|||.|::.:..:..|...|.||:..
  Rat  2687 LREYDKENIPVAVMQKIRSEYLTNPEFDPPKVAKASSAAEGLCKWIMAMEVYDRVAKVVAPKKAR 2751

  Fly  3298 LAAANAELAAAQDKLAGIKRKVMSLEEQLGKLTADFEKATADKLRCQQEADATQATIALANRLVG 3362
            ||.|...||...:.|...:.::..:|..|..|...|::.|.:|...:.:.:.....:..|.:|:|
  Rat  2752 LAEAQKSLAETMELLNQKRGELAQVEHHLENLQKTFQEKTEEKAALEDQVELCAKKLERATKLIG 2816

  Fly  3363 GLASENVRWAEAVNNFVKQGITLPGDILLITAFISYVGCFTKGFRIDLLLKMWTPFLKSIDPPIP 3427
            ||..|..||::|.|:.......|.||:|:....|:|:|.||.|||.: ..:.|:...|  :...|
  Rat  2817 GLGGEKSRWSQAANDLQATYENLTGDVLVSAGVIAYLGAFTSGFRQE-CTEDWSKLCK--EKKFP 2878

  Fly  3428 TTENLDPLSLLTDDTTIAIWTNEGLPSDRMSIENATILSNSDRWPLMIDPQLQGVKWIKQKYGED 3492
            .:|.......|.|...|..|...|||:|..||:|..|::||.|||||||||.|..||||....::
  Rat  2879 CSEEFSLSKTLGDPVKIRAWNIAGLPTDTFSIDNGVIVNNSRRWPLMIDPQGQANKWIKNSEKDN 2943

  Fly  3493 -LKVIRLGQRSYLDIIEKSINAGCNVLIENIDENLDPVLDSLLGRNLIKKG--KAIKIGDKEIEY 3554
             |.||:|....|:..:|..|..|..||:||:.|:|||.|:.||.|...|:|  ..|::|:..|||
  Rat  2944 QLSVIKLSDSDYMRTLENCIQLGTPVLLENVGEDLDPSLEPLLLRQTFKQGGIDCIRLGEVIIEY 3008

  Fly  3555 NSNFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKAERPDLEELKADLTKQQN 3619
            :.:|:..:.|||.||||.||:..:.:|:||.:|.:|||||||..||..|||:|||.:..|..|..
  Rat  3009 SFDFKFYITTKLRNPHYMPELATKVSLLNFMITPEGLEDQLLGIVVAKERPELEEERNALILQSA 3073

  Fly  3620 DFKIMLKKLEDDLLSRLSSAGENILGDTALVENLETTKSTASEIEQKVAEAKITSKEIDKAREYY 3684
            ..|..||.:|..:|..||.:..|||.|.:.::.|::.|..::||.:|...|:.|..:|.::||.|
  Rat  3074 ANKKQLKDIETRILETLSCSEGNILEDESAIKVLDSAKMMSNEITKKQQVAEKTELKIAESREGY 3138

  Fly  3685 RPAAARASLLYFILNELNTINPIYQFSLKAFSVVFQKAIAKAEPGDTLDLRVSNLIDCITYSVFQ 3749
            ||.|..:|:|:|.:.:|..|:|:||:||..|..::..:|..:.....|:.|:..|.|..||:::.
  Rat  3139 RPIAKHSSVLFFSIADLANIDPMYQYSLTWFVNLYINSIHDSNRSKILEKRLRYLNDHFTYNLYC 3203

  Fly  3750 YTSRGLFECDKLIFASQMTFQILLMNEEVTSAELDFLLR--FPIKPHVTSP-VDFLTNQSWGGIC 3811
            ...|.|||.|||:|:..:...:||..:|:...||.|||.  ..:|....:| .::|.::||..||
  Rat  3204 NICRSLFEKDKLLFSFLLCANLLLAKKEIEYQELMFLLTGGVSLKSAEKNPDPNWLQDKSWEEIC 3268

  Fly  3812 SLASKDEFRNLDRDIETSSKRWKKLVESELPEKEKFPQEW-KNKTALQRLCMIRALRPDRMTYAL 3875
            ..:....|..|........:.|:.:..|:.|...|.|:.. |....||::.::|.||||::|.|:
  Rat  3269 RASELPVFHGLREHFCNHIREWEDIYNSKEPHNMKLPESMDKTLNELQKIIILRCLRPDKITPAI 3333

  Fly  3876 ADFIEEKLGSKYVESRAMEFAKSYEEASPSTPIFFILSPGVNPLKDVEALGKQMGFSMDLGN-FH 3939
            .:::.:|||.|:||....:..|||.:::.:.|:.|:||||.:|:..:.........|   || |.
  Rat  3334 TNYVTDKLGKKFVEPPPFDLTKSYLDSNCTIPLIFVLSPGADPMASLLKFANDKSMS---GNKFQ 3395

  Fly  3940 NVSLGQGQEAIAEAAMDTAAKHGHWVVLQNIHLVRKWLPVLEKKLEYYA-EDSHPDYRMFLSAEP 4003
            .:||||||..:|...:..|.:.|.||.|||.||...|:|.|||..|.:: |..:|.:|::|::.|
  Rat  3396 AISLGQGQGPVATKMITAAIEEGTWVCLQNCHLAVSWMPTLEKICEDFSPEICNPTFRLWLTSYP 3460

  Fly  4004 ASTPSAHIIPQGILESSIKITNEPPTGMLANLHKALDNFTQETLE-------MSGKEAEFKAILF 4061
            :..     .|..||::.:|:|||||||:..||   |.::..:.:.       ..|||..::.:||
  Rat  3461 SPK-----FPVTILQNGVKMTNEPPTGLRLNL---LQSYLSDPISDPEFFNGCPGKELAWEKLLF 3517

  Fly  4062 SLCYFHAVVAERRKFGPQGWNKIYPFNVGDLNISVSVLYNYLEANAKVPWEDLRYLFGEIMYGGH 4126
            .:|:|||:|.||:||||.|||..|.||..||.||:..|..::.....:|:|.:.||.||..|||.
  Rat  3518 GVCFFHALVQERKKFGPLGWNIPYGFNESDLRISIRQLQLFINEYDTIPFEAISYLTGECNYGGR 3582

  Fly  4127 ITDDWDRRLCITYLEEYMQPDLVDGELF-LAPS--FPAPPNTDYQGYHTYVDEMMPAESPYLYGL 4188
            :||||||||.:|.|.::....:::...: .:||  :.|||...|..|..::.::...:.|.::||
  Rat  3583 VTDDWDRRLLLTMLADFYNSLIIENPHYKFSPSGNYFAPPKGTYDEYIEFIKKLPFTQEPEIFGL 3647

  Fly  4189 HPNAEIGFLTTRAENIFRTVFEMQPRDAGAGG----GATVTREDKVKQIVDEIIEKLPEEFNMVE 4249
            |.|.:|.....:.:.:|.::...|      ||    |::.:.:..:.:|.::|:.:||.:|::..
  Rat  3648 HENVDISKDLQQTKLLFESLLLTQ------GGVKQTGSSGSTDQILLEITEDILTQLPNDFDIEA 3706

  Fly  4250 IMN----KVEERTPYVIVAFQECERMNFLTSEMKRSLKELDLGLKGELTITSDMEVLENSLFLDQ 4310
            .:.    :.||....|:|  ||.||.|.|...::.:|::|...:||.:.:.|.:|.|..||.:.:
  Rat  3707 ALRSYPVRYEESMNTVLV--QEMERFNNLIITIRNTLRDLKKAIKGVVVMDSALEALSGSLLIGK 3769

  Fly  4311 VPPIWTQRAYPSLLGLNNWFIDLCLRLRELETWSTDFVLPSCVWLAGFFNPQSLLTAIMQSTARR 4375
            ||.:|.||:||||..|.::..|...||:.||.|.| ...|:..|::|||..|:.||..||:.||:
  Rat  3770 VPEMWAQRSYPSLKPLGSYITDFLTRLKFLEDWFT-MGKPNVFWISGFFFTQAFLTGAMQNYARK 3833

  Fly  4376 NDLPLDKMCLQCDVTKKQKEEFTTAPRDGCCVHGIFMEGARWDIQQGIIMESRLKELYPSMPVIN 4440
            ..:|:|.:..:.:|.  ..:..|..|.||..:||::::||||:...|::.|...|.|:..||:|.
  Rat  3834 YTIPIDLLGYEFEVI--PSDNATNPPEDGVYIHGLYLDGARWNRTSGLLAEQHPKLLFDLMPIIW 3896

  Fly  4441 IRAITQDKQDLRNMYECPVYKTRTR--------GPTTYVSNLNLKTKDKPGKWILAGVALLLQ 4495
            |:...:.:....:.|.||:|||..|        ..|.:|..:.|:|:.....||..|||||.|
  Rat  3897 IKPNVKTEIVKTDAYVCPLYKTSERKGTLSTTGHSTNFVIAMLLRTELPAQHWIKRGVALLCQ 3959

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc93ABNP_001262793.1 DHC_N1 205..782 CDD:462457 48/262 (18%)
DHC_N2 1292..1707 CDD:462462 128/458 (28%)
DYN1 1305..4143 CDD:227570 1058/2988 (35%)
AAA_6 1841..2167 CDD:463697 167/325 (51%)
MT 3076..3419 CDD:463699 116/360 (32%)
Dynein_C 4198..4494 CDD:465677 96/311 (31%)
Dnah12XP_063131137.1 None

Return to query results.
Submit another query.