DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc93AB and Dnah1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001262793.1 Gene:Dhc93AB / 42485 FlyBaseID:FBgn0013812 Length:4496 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001028827.2 Gene:Dnah1 / 171339 RGDID:621795 Length:4250 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4344 Identity:1369/4344 - (31%)
Similarity:2176/4344 - (50%) Gaps:551/4344 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   486 FASKSYDVLDPDDHE--FDEDFKGFQTRIL-ELDMKLAAILCQAFDDCHNLESIFKLISIVGSVL 547
            |..|:...:.|:|.:  .::...|..||:| :.|..|     |:::.  .::..|:::.      
  Rat   117 FTPKAESFVIPEDFQERVEQQSIGTTTRLLTQTDFPL-----QSYEP--KVQVPFQVLP------ 168

  Fly   548 DRPKIKEEFTQRYAEIVRMLDDEMTICESIYDKQM-----------ELKKVGDNLYPNY------ 595
            .|...|.|..:|..:.:|:..:::...|.|...::           .:::..|.|:|.|      
  Rat   169 GRCPRKIEIERRKQQYLRLDIEQLLANEGIDSNKLMPRHPDLQQPQTIEQGRDPLFPIYLPLKVF 233

  Fly   596 -----NCPPVAAFIRWCHQLETRITAPV------KNFKALQHEITKTEKSQEIVERYEILMVKLG 649
                 :|.....::....:.:.:...||      ....||.||   ..||||:..|:        
  Rat   234 DNEEFDCRTPTEWLNMGLEPDAQYRKPVPGKALLPTDDALGHE---DPKSQELDYRW-------- 287

  Fly   650 SCKTQFFDDWAGQLDGQIEENL-------KKSLI------------------------------- 676
             |:       .|.||...|:.|       |:.|:                               
  Rat   288 -CE-------VGVLDYDEEKKLYLVQKTDKRGLVRDEMGMPIVNGGVTPEGRPPLLDTQYWVPRI 344

  Fly   677 -----ARDRR--------HNSLILNFSAALFSILREVHYMQQMKIEGIPQIAIDFAEKSDVFRSY 728
                 |.|.|        .|:|..|..|.|...|    |:..|..||  |..|:  |:|      
  Rat   345 QLLFCAEDPRVFTQRVVQANALRKNTEALLLYNL----YVDCMPTEG--QRVIN--EQS------ 395

  Fly   729 TLNLEKTIDWYNS---IQEGSSPVE-LRLIEPEIKMIDD--LVEIGVNQLVWNSSDILSYLDKLR 787
               |.|...|..|   :::|.|.:| |..:..|:.:..:  :.:|..:|:|.:..:..|::....
  Rat   396 ---LSKIKQWALSTPRMRKGPSVLEHLSSLAREVNLDYERSMNKINFDQIVSSKPETFSFVTLPE 457

  Fly   788 KPVAALQN--------------RMDHTQGNLRQIRKIMGVWAKQPLFERRDCKKDTVLSIDERPD 838
            |....:.|              :.|.|..:|....:::...:|    .|.:|.|.|.:|:..  .
  Rat   458 KEEEKVPNQGLVSVPEYPFREQKEDFTFVSLLTRSEVITALSK----VRAECNKVTSMSLFH--S 516

  Fly   839 RTSK-----RYAEIQAASI-EIHKLLQD---NMLQFDMESKQDD----------AVWLSY----- 879
            ..||     .:.:||:.:. ::...|:|   :.|:..|.|...|          ..|..|     
  Rat   517 NLSKYSRLEEFEQIQSQTFSQVQMFLKDSWISTLKVAMRSSLRDMSKGWYNLYETNWEVYLMSKL 581

  Fly   880 ---VDFVDNIVYENILKTVGVSVGYLA--------------ENMD-----------PENNYAPLF 916
               ::.:..::.:.:...|..|:|..|              ::||           |..|  |||
  Rat   582 RKLMELIKYMLQDTLRFLVQDSLGSFAQFIGDACCSVLECIDDMDWGEDLINSPYKPRKN--PLF 644

  Fly   917 ESRLELVEPNLVFVPSLDPEDPMGFNNMLIELMRDIMKMGSLIKRLKPNEKRNYVEMIKENQD-- 979
            ...|.|....:.:...|:.     |..:|:.|    ...|.|.....|..::..:|.|..:.|  
  Rat   645 IVDLVLDNTGVHYSTPLEQ-----FEVILLNL----FDKGILATHAVPQLEKLVMEDIFISGDPL 700

  Fly   980 ----------IIDMRREILNGVDLVMEEASRFCRQFERYSYLWLDDREECMEYFLEYGRMLDPDE 1034
                      :.::|..|.|.:...|.....:.:::.:|               ||    |:.::
  Rat   701 LESVGLHEPLVEELRANITNAMHKAMIPLQAYAKEYRKY---------------LE----LNNND 746

  Fly  1035 IELILINDPNQPPPQPCQPTIEAFREQIDNY----ESLFNEIED---IGPFQVFSSWFQVDVRPF 1092
            |...|.....|     | |:.|..||.:..:    |.|.|.:..   ||||.:.....:..:...
  Rat   747 ISTFLKTYQTQ-----C-PSAEEVREVVITHLKEKEILDNSLPSSIIIGPFYINVDNVKQSLSKK 805

  Fly  1093 RQAL----LNTVCKWGNMFKEHLVTTVTSSLMNLSHFIRKADEGLLQTVKEKDYEGLVSIMAYLM 1153
            |:||    |:.:.|  |:..|  |.::.....::|..|.:....:.:..:.:|:  :..|...|:
  Rat   806 RKALATSMLDILAK--NLHNE--VDSICEEFRSISRKIYEKPNSIEELAELRDW--MKGIPEKLV 864

  Fly  1154 QVKERAAKTDEMFEPMQETIQLLKYYDMD-----------IPEEVNVLLQELPEQWANTKKI--- 1204
            .::||..|....:|.|.|....|...|.:           |..:::::.|:..|.....:||   
  Rat   865 ILEERIVKVMSDYEVMDEFFYNLTTDDFNDKWAANNWPTKILGQIDMVRQQHVEDEEKFRKIQLM 929

  Fly  1205 -ASTVKQQVSPLQATEVVSIRNKIALFESHIQLFREVFKTYDFFRFDCYKPYLLMDRINDDMFLC 1268
             .:..::::..||..        :|.|.:|:::.|                   ...|.:::...
  Rat   930 DQNNFQEKLEGLQLV--------VAGFSTHVEIAR-------------------AHEIANEVRRV 967

  Fly  1269 ESEMRDIQESGSLFE-----VNIPEFKVLKQCRKELRMLKQLWDYVNIVATSID------DWKTT 1322
            :.:::|.|:...|:.     ..:|    :....|..||:|:...|:::..|:.|      .|...
  Rat   968 KKQLKDCQQLAMLYNNRERIFGLP----ITNYDKLSRMVKEFQPYLDLWTTASDWLRWSESWMND 1028

  Fly  1323 PWRKVDVENMD---IE-------CKKFAKDIRLLDKEMRPWDTFINLESTVKNMLTSLRAVGELQ 1377
            |...:|.|.::   ||       |.|..|||....      |..:::.:.:......:..:..|:
  Rat  1029 PLSAIDAEQLEKNVIESFKTMHKCVKQFKDIPACQ------DVALDIRARIDEFKPYIPLIQGLR 1087

  Fly  1378 NPAIRERHWNQLMNSTKSLAALPKEVTVKFIMDHETTLAELLGLNLHECEEEVKNIVDKAVKEMS 1442
            ||.:|.|||..|.|          |:.:........|.|..|.:||.:..|.:..:.:.|.||.:
  Rat  1088 NPGMRNRHWEVLSN----------EININVRPKANLTFARCLEMNLQDYIESISKVAEVAGKEYA 1142

  Fly  1443 MEKILRDLNTTWTVMEFDHELHPRTGCNLLKASEELIETLEDNQVCLQNLITSKYIAHFLEEVST 1507
            :|:.|..:...|..:.|:...:..|...:||:.:|..:.|:|:.|..|::..|.|...|.:.:::
  Rat  1143 IEQALDKMEKEWASILFNVLPYKETDTYILKSPDEASQLLDDHIVMTQSMSFSPYKKPFEQRINS 1207

  Fly  1508 WQNKLMIADQVITVWFEVQRTWTHLESIFMSSEDIRKQLPVDSDRFDNIDAEFRVLMDEMSVSSN 1572
            |:.||.:..:|:..|...||:|.:||.|| |||||.:||||:|.|:..::..:|.:|.....:..
  Rat  1208 WETKLKLTQEVLEEWLNCQRSWLYLEPIF-SSEDITRQLPVESKRYQTMERIWRKIMKNAYENRE 1271

  Fly  1573 VVASTNRSGLIERLEHLQKELTLCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDVLSNGIQPEMVTK 1637
            |:...:...|::.|....|.|.|.:|.|:|||||||.|||||||:|..:||::||....|..|..
  Rat  1272 VINVCSDQRLLDSLRDCNKLLDLVQKGLSEYLETKRTAFPRFYFLSDDELLEILSQTKDPTAVQP 1336

  Fly  1638 HLTKLFDSIARLKFNRDESNEINTASGMYAKDGEYVEFNELASIRGPVEVWLNRIQAAMRASLRH 1702
            ||.|.|::||||.|..|  .||   :.||:.:||.|:.:........||.||..::.:|:||:..
  Rat  1337 HLRKCFENIARLLFQED--LEI---THMYSAEGEEVKLSFSIYPSSNVEDWLLEVERSMKASVHD 1396

  Fly  1703 YVMEAVIAYEEKQREQWLFDYPAQVSLCGSQIWWSTEVNIAFSRLEEGYDNAIKDYYKKQIS-QL 1766
            .:..|:.||....|.:|:..:|.||::.|.|.:|:.||..|...      ::|......|:| ||
  Rat  1397 IIEMAIKAYPTMLRTEWVLSWPGQVTIAGCQTYWTLEVAQALEA------SSISSSLFPQLSKQL 1455

  Fly  1767 SLLITLLLGELSKGDRQKIMTICTIDVHSRDVVAKMIQAKLDSGSAFMWQSQLRHRFDDVEKDCF 1831
            |.|:.|:.|:||:..|..:..:..|:||::|||:|:|...:.|...|.|.||||:.:  ...|.:
  Rat  1456 SDLVALVRGKLSRMQRMVLSALIVIEVHAKDVVSKLIDENVVSVHDFEWISQLRYYW--TNNDLY 1518

  Fly  1832 ANICDAEFQYCHEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRAI 1896
            ....:|||.|.:|||||:.||||||||||||:|||.:|||..||||||||||||||||||||:|:
  Rat  1519 IRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVITPLTDRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGKAL 1583

  Fly  1897 GISVYVFNCSEQMDYQSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRITVEVLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDK 1961
            .|...|||||:|:|:.:.|..:||||..|||.||||||||.:|||||||.|:.::|.|.:.:.::
  Rat  1584 AIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFFKGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRVER 1648

  Fly  1962 FNFMGEMISCVPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFQDAR 2026
            |.|.|..|..||:..:|||||||||||||||:||||||||.||:|||:.:|.||.|.:.||.:|.
  Rat  1649 FMFEGVEIPLVPSCAVFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMIAEISLYSFGFNEAN 1713

  Fly  2027 VLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPGRPEEEVLMRALRDFNIPKI 2091
            |||:|..|.:.|..|.||.|||||:|:||:|:|:..||:|||.:|...||.:.:||:||.|:||.
  Rat  1714 VLAKKITTTFKLSSEQLSSQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKRENPTMNEELICLRAIRDVNVPKF 1778

  Fly  2092 ITDDMPVFMGLISDLFPALDVPRKRDQDF---ERTVKQAASDLLLQPEDNFILKVVQLEELLEVR 2153
            :.:|:.:|.|::|||||   ..::.:.|:   ::.:::|.....|:..:.|::|.:||.|...||
  Rat  1779 LQEDLKLFSGIVSDLFP---TTKEEETDYGILDQAIRKACEKNNLKDVEGFLIKCIQLYETTVVR 1840

  Fly  2154 HSVFIVGNAGTGKTQVWKTLLRTYQNIKRKPIFND----------LNPKAVTNDELFGIINPATR 2208
            |.:.:||..|:||:..::.|.....::|.||..:.          ||||::|..:|:|..:..|.
  Rat  1841 HGLMLVGPTGSGKSNCYRILAAAMTSLKGKPSISGGVYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTH 1905

  Fly  2209 EWKDGLFSVLMRDQANITGDQPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTPSMRL 2273
            ||.||:|..|:|..|..:....||.:.||.:|.:|||::|||:||||.|.|:|.|.|.||.:|.:
  Rat  1906 EWTDGIFPSLIRAGAIASDTNKKWYMFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTM 1970

  Fly  2274 LFEISNLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWNPYVTSWVETRKIPA----EKSNLVMLFDKYIPPS 2334
            :||:.:|..|:||||||.|::|:.|..||..|:|..|:  :.:|:    .:.....||.|::..|
  Rat  1971 MFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMPFVECWL--KHLPSIIKPYEEQFKTLFVKFLESS 2033

  Fly  2335 LETIRVRFKKITPVAEMAHIQMLCHLLNCFL-----------IPANTPADCPKEWHELYFVFACI 2388
            :..:|...|::...........|..||:||.           ||:...:..| |..|.:|:|:.:
  Rat  2034 IAFVRTTVKEVVASTNSNLTMSLLKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEKLSHIP-ELIEPWFIFSLV 2097

  Fly  2389 WAFGSAMFQDQAIDYRVEFSKWWVNE--FKTVK--FPPGGTVFDYFLD----------------S 2433
            |:.|:......    |:.||:|...:  |:.:|  ||..|.|:||.||                |
  Rat  2098 WSVGATGDHSS----RLNFSQWLKIKMVFEQIKLAFPEEGLVYDYRLDDAGISSTEDDDEDDEES 2158

  Fly  2434 ETKTFLPWTEKIPKFELDSDLPLQAVIVHTSESIRLRFFLDLLMDKKHPVMLVGNAGCGKTVLVN 2498
            :...::.|.:....|.:..|.....:||.|.:::::.:.|.:|:....||:.:|..|.|||:.|:
  Rat  2159 KQVAWVKWMDYSVPFTMMPDTNYCNIIVPTMDTMQMSYLLGMLITNHKPVLCIGPTGTGKTLTVS 2223

  Fly  2499 EK-LQSLSENYAVTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPLEKKAGRNYGPPGNKLLCYFVDDINMPEVDA 2562
            .| |::|...|....:.|:..|::...|.:::..|:|:....:|||..:...:|:||:|||.::.
  Rat  2224 NKLLKNLPLEYISHFLTFSARTSANQTQDLIDSKLDKRRKGVFGPPLGRNFIFFIDDLNMPALET 2288

  Fly  2563 YGTVQPHTLMRQHLDYGHWYDRNKL-TLKDIHNCQYVACMNPTSGS-FTINPRLQRHFCVLAVSF 2625
            ||...|..|:||.:|:|.||||..: ..|::.:..:|..|.|..|. ..|.|||.|||..|:...
  Rat  2289 YGAQPPIELLRQWMDHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNAITPRLTRHFNYLSFIE 2353

  Fly  2626 PGPESITVMYSSILAQHFAN--AEQKF------TPIVTRMTPNIVAATIALHNKCLQVFLPTAIK 2682
            ....|...::|.||......  .|:.:      .|.:..||..:|.|||:::.......|||..|
  Rat  2354 MDEVSKKRIFSIILGCWMDGLLGEKSYREPVPGAPNIVHMTEPLVNATISIYAIITSQLLPTPAK 2418

  Fly  2683 SHYIFNLRDISNVFQGLLFSSTECLTGSTDLIRLWQHETQRVYSDKLTDDKD---IDSFTKMQHD 2744
            |||.|||||:|.||||:|.:....:.....|:|||.||..||:.|:|.:::|   .|...:|:.:
  Rat  2419 SHYTFNLRDLSKVFQGILMAEPAKVEDKVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRGWFDGLLEMKME 2483

  Fly  2745 IVKKSFEEIDESVIFDK-----PNIYCHFAGGIGDPK-YMPIKGWPELHKLLQEAMSSYNDL-VA 2802
                     |..|.|:|     |.:|..|.....|.| |..|....::.::::|.|..||.: .|
  Rat  2484 ---------DLGVAFNKVCPFQPILYGDFMSPGSDVKSYELITSENKMMQVIEEYMEDYNQINTA 2539

  Fly  2803 AMNLVLFEDAMMHVCRINRILESPRGSALLVGVGGSGKQSLARLAAFISSLEVVQIQLKKGYGVN 2867
            .:.||||.|||.|:|||:|.|....|:|||:||||||:.||.|||:.::..|..|::|.|.||::
  Rat  2540 KLKLVLFVDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQVELSKNYGMS 2604

  Fly  2868 DLKNEFSGLYLKAGLKNVGIMFLMTDAQIPSEDFLVLINDMLATGEIPDLFPDDEIENIIAGVRN 2932
            :.:.:...:.||||::|:.|.||.:|.||.:|.||..||::|.:|:||:|:..||.:.|:..:|.
  Rat  2605 EWREDVKKILLKAGMQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNILNSGDIPNLYSADEQDQIVNTMRP 2669

  Fly  2933 EVKGAGLVDTRENCWKFFIDRVRKQLKIVLCFSPVGSTLRVRSRKFPAIINATSINWFHEWPQEA 2997
            .::..||..|:.|....:..|||..:.:|||.||:|...|.|.|:||:::|..:|:||:|||.||
  Rat  2670 YIQEQGLQPTKANLMAAYTGRVRNNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQFPSLVNCCTIDWFNEWPAEA 2734

  Fly  2998 LISVAMNFLAQNKVLPENHRDS-----VAKFMAYVHTSVNTTSKVYLQNERRYNYTTPKSYLEQI 3057
            |.|||..||.:   :||....|     :.....|:|.||......||....|:||.|||||||.:
  Rat  2735 LQSVATRFLHE---IPELECSSEVIEGLIHVCVYIHQSVAKKCVEYLAELARHNYVTPKSYLELL 2796

  Fly  3058 NLYIKLLNHKNEDLQSKIERLENGLEKLRSTALQVADLKVKLAVQEIELKEKNEAADALIEI--- 3119
            |::..|:..|..:|::...|:::||:||..|:..||.::.:|.:....|:|  .|.|.|:.:   
  Rat  2797 NIFSILIGQKKMELKTAKHRMKSGLDKLLRTSEDVAKMQEELEIMRPLLEE--AAKDTLLTMDQI 2859

  Fly  3120 -----VGIETEK-VQTEKAVADEEEMKVALIADEVSKKQRDCEEDLLKAEPALMAAQDALNTLNK 3178
                 :..||.| ||.|:..|:|:..|...|||       |.::||.:|.|||.||..:|..|||
  Rat  2860 KVDTAIAEETRKSVQAEEIKANEKASKAQAIAD-------DAQKDLDEALPALDAALASLRNLNK 2917

  Fly  3179 ANLTELKSFGSPPGAVTNVTAAVMVLL----------SQGGKVPKDRSWKAAKIAMAKVDTFLDS 3233
            .::||:::...||..|..|..||.::.          ..|.||  |..|:..|..:.....||:|
  Rat  2918 NDVTEVRAMQRPPPGVKLVIEAVCIMKGIKPKKVPGEKPGSKV--DDYWEPGKGLLQDPGRFLES 2980

  Fly  3234 LINYDKENIHPEITKAIQPYLKDPEFEPEFVRSKSGAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRKAL 3298
            |..:||:||...:.||||||:.:.||:|..:...|.|...:|.||..:.|::.|...|||||:||
  Rat  2981 LFKFDKDNIGEAVIKAIQPYIDNEEFQPAAIAKVSKACTSICQWVRAMHKYHFVAKAVEPKRQAL 3045

  Fly  3299 AAANAELAAAQDKLAGIKRKVMSLEEQLGKLTADFEKATADKLRCQQEADATQATIALANRLVGG 3363
            ..|..:|...|..|...|..:..:|:.:..|.|.:.:....|...:.:.:..:..:..|::|:.|
  Rat  3046 REAQDDLEVTQRILEEAKHHLREVEDGISTLQAKYRECVTKKEELEMKCEQCEQRLGRADKLING 3110

  Fly  3364 LASENVRWAEAVNNFVKQGITLPGDILLITAFISYVGCFTKGFRIDLLLKMWTPFLKSIDPPIPT 3428
            ||.|.|||.:.|.|.......:.||:|:...|::|:|.||..:|. .|.:.|...|....  :|.
  Rat  3111 LADEKVRWQDTVENLENMLDNIFGDVLVAAGFVAYLGPFTGQYRA-ALYEYWVNQLTVYG--VPH 3172

  Fly  3429 TENLDPLSLLTDDTTIAIWTNEGLPSDRMSIENATILSNSDRWPLMIDPQLQGVKWIKQKYGED- 3492
            |.....:|.|.:...|..|...|||:|.:|:||..|...|.||...||||.|..||||....|. 
  Rat  3173 TSKPTLISTLGNPVKIRSWQIAGLPNDTLSVENGVINQFSQRWTHFIDPQGQANKWIKNMEKESG 3237

  Fly  3493 LKVIRLGQRSYLDIIEKSINAGCNVLIENIDENLDPVLDSLLGRNLIKK--GKAIKIGDKEIEYN 3555
            |.|.:|..|.:|..:|.:|..|...|:||:.|.|||.|:.:|.:...|:  ...:|:||..|.|:
  Rat  3238 LDVFKLSDRDFLRSMENAIRFGKPCLLENVGEELDPALEPVLLKQTYKQQGNTVLKLGDTVIPYH 3302

  Fly  3556 SNFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKAERPDLEELKADLTKQQND 3620
            .:||:.:.|||.||||.||:..:.||||||::..|||||||.:||..|||||||.|..|......
  Rat  3303 EDFRMYITTKLPNPHYSPEVSTKLTLINFTLSPSGLEDQLLGQVVAEERPDLEEAKNQLIISNAK 3367

  Fly  3621 FKIMLKKLEDDLLSRLSSAGENILGDTALVENLETTKSTASEIEQKVAEAKITSKEIDKAREYYR 3685
            .:..||.:||.:|.||||:..|.:.|..|::.||.:|..|:||:.||..|:.|.|:||..|..|.
  Rat  3368 MRQELKDIEDQILYRLSSSEGNPVDDVELIKVLEASKMKAAEIQAKVRIAEQTEKDIDLTRMEYI 3432

  Fly  3686 PAAARASLLYFILNELNTINPIYQFSLKAFSVVFQKAIAKAEPGDTLDLRVSNLIDCITYSVFQY 3750
            |.|.|..:|:|.:::|..::|:||:||:.|..:|...||.:|..|.|..|:.|:...:|:|::..
  Rat  3433 PVAVRTQILFFCVSDLANVDPMYQYSLEWFLNIFLSGIANSERADNLKKRIVNINRYLTFSLYSN 3497

  Fly  3751 TSRGLFECDKLIFASQMTFQILLMNEEVTSAELDFLL---------RFPIKPHVTSPVDFLTNQS 3806
            ..|.|||..||:||..:..:|::...::...|..:||         ..| .||      :|::::
  Rat  3498 VCRSLFEKHKLMFAFLLCVRIMMNEGKINQGEWRYLLSGGSIQTMSENP-APH------WLSDRA 3555

  Fly  3807 WGGICSLASKDEFRNLDRDIETSSKRWKKLVESELPEKEKFPQEWKN-KTALQRLCMIRALRPDR 3870
            |..|.:|::...|.....|......:::.:.:|..|.:|..|..|.. ....|:|.::|.||.|:
  Rat  3556 WRDILALSNLPAFSTFSTDFVQHLPKFQAIFDSAEPHREPLPGIWNTYLDEFQKLLILRCLRGDK 3620

  Fly  3871 MTYALADFIEEKLGSKYVESRAMEFAKSYEEASPSTPIFFILSPGVNPLKDVEALGKQMGFSMDL 3935
            :|.|:.||:...|..:::|.:....:..::|::.:||:.|:||||.:|..|:....::|.||..|
  Rat  3621 VTNAMQDFVANHLEPRFIEPQTANLSAVFKESNSTTPLIFVLSPGTDPAADLYKFAEEMKFSKKL 3685

  Fly  3936 GNFHNVSLGQGQEAIAEAAMDTAAKHGHWVVLQNIHLVRKWLPVLEKKLEYYAEDS-HPDYRMFL 3999
            .   .:||||||...|||.|..:.:.|.||..||.||...|:|.||:.:|:...|. |.|:|::|
  Rat  3686 S---AISLGQGQGPRAEAMMRNSIERGKWVFFQNCHLAPSWMPALERLIEHINPDKVHRDFRLWL 3747

  Fly  4000 SAEPASTPSAHIIPQGILESSIKITNEPPTGMLANLHKALDNFTQETLEMSGKEAEFKAILFSLC 4064
            ::.|::.     .|..||::..|:|.|||.|:.|||.|:.::.:.:.|....|..|||::|.|||
  Rat  3748 TSLPSNK-----FPVSILQNGSKMTIEPPRGVKANLLKSYNSLSDDFLHSCQKVVEFKSLLLSLC 3807

  Fly  4065 YFHAVVAERRKFGPQGWNKIYPFNVGDLNISVSVLYNYLEANAKVPWEDLRYLFGEIMYGGHITD 4129
            .||....|||||||.|:|..|.|..|||.|.:|.|..:|:....:|::.|:|..|||.|||.:||
  Rat  3808 LFHGNALERRKFGPLGFNIPYEFTDGDLRICISQLKMFLDEYEDIPYKVLKYTAGEINYGGRVTD 3872

  Fly  4130 DWDRRLCITYLEEYMQPDLVDGELFLAPS---FPAPPNTDYQGYHTYVDEMMPAESPYLYGLHPN 4191
            |||||..:..||::..|.::..|...:.|   ...||..|..||.:|:..:...:.|.::|||.|
  Rat  3873 DWDRRCVMNILEDFYNPAVLSPEHRYSKSGIYHQIPPTYDLNGYLSYIKSLPLNDMPEIFGLHDN 3937

  Fly  4192 AEIGFLTTRAENIFRTVFEMQPRDAGAGGGATVTREDKVKQIVDEIIEKLPEEFNMVEIMNK--- 4253
            |.|.|.......:|..:.::||:.:..||   .:||:.|:.:.::|:.::|:..::.|::||   
  Rat  3938 ANITFAQNETFALFGAILQLQPKSSSMGG---QSREELVEDVAEDILVQVPKPVDLEEVVNKYPV 3999

  Fly  4254 -VEERTPYVIVAFQECERMNFLTSEMKRSLKELDLGLKGELTITSDMEVLENSLFLDQVPPIWTQ 4317
             .||....|:|  ||..|.|.|...:.::|.::...:||.:.::.::|::..||:.:.||.:|..
  Rat  4000 LYEESMNTVLV--QEVIRYNKLLMVITQTLSDMLKAIKGLVVMSLELELMSTSLYNNAVPELWKS 4062

  Fly  4318 RAYPSLLGLNNWFIDLCLRLRELETWSTDFVLPSCVWLAGFFNPQSLLTAIMQSTARRNDLPLDK 4382
            :|||||..|.:|.:||..||..|.:|..:.: ||..|::|||.||:.||..:|:.||:..:.:|.
  Rat  4063 KAYPSLKPLASWIMDLLQRLNFLHSWIKNGI-PSVFWISGFFFPQAFLTGTLQNFARKFVISIDT 4126

  Fly  4383 MCLQCDVTKKQKEEFTTAPRDGCCVHGIFMEGARWDIQQGIIMESRLKELYPSMPVINIRAITQD 4447
            :.....|......|....|..||.::|:|:||||||.....:.|||.||||..|.||.:..:...
  Rat  4127 ITFDFKVLSYASSEIAERPSTGCYIYGLFLEGARWDPFDFQLAESRPKELYTEMAVIWLLPVANR 4191

  Fly  4448 KQDLRNMYECPVYKTRTRG--------PTTYVSNLNLKTKDKPGKWILAGVALL 4493
            |...::.|.||:|||.||.        .|.||..:.:.:......||..||||:
  Rat  4192 KVQNQDFYLCPIYKTLTRAGTLSTTGHSTNYVIAVEIPSNQPQRHWIKRGVALI 4245

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc93ABNP_001262793.1 DHC_N1 204..782 CDD:285571 72/383 (19%)
DHC_N2 1295..1708 CDD:285579 131/428 (31%)
P-loop_NTPase 1841..2071 CDD:304359 144/229 (63%)
P-loop_NTPase 2155..2290 CDD:304359 56/144 (39%)
P-loop_NTPase 2448..2720 CDD:304359 92/282 (33%)
P-loop_NTPase 2797..3064 CDD:304359 115/272 (42%)
MT 3076..3419 CDD:289543 115/361 (32%)
AAA_9 3447..3659 CDD:289547 95/214 (44%)
Dynein_heavy 3799..4486 CDD:281078 235/703 (33%)
Dnah1NP_001028827.2 DHC_N2 998..1401 CDD:400618 130/424 (31%)
DYN1 <1237..3883 CDD:227570 1007/2709 (37%)
AAA_6 1528..1854 CDD:403853 177/328 (54%)
Dynein_C 3944..4246 CDD:408026 99/308 (32%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5245
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.710

Return to query results.
Submit another query.