DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc93AB and Dnah10

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001262793.1 Gene:Dhc93AB / 42485 FlyBaseID:FBgn0013812 Length:4496 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008767494.2 Gene:Dnah10 / 117252 RGDID:619988 Length:4592 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4674 Identity:1484/4674 - (31%)
Similarity:2448/4674 - (52%) Gaps:441/4674 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    49 HKGIIKEFLDRNTPVVLIIILTPAAQLVPSTTFPLSQLKSKGVYFIKRYALPIPR--------ED 105
            :|.::|..::|   :.|.:.|||.::         ..|:...|:|::.....||.        |.
  Rat   133 NKRLVKRIINR---LELHVSLTPLSE---------EFLEQNVVFFLRSSKDAIPEASDMKEAMEI 185

  Fly   106 CGNFIIYGDLATRTIDQLSALVEEVLVPLLS--------------------NEDNYRNWPIMVAQ 150
            ....:.||.:.::.:..|..::.:|.:|.||                    :..:..:.|.|:.:
  Rat   186 MPETMEYGIINSQVLQFLKDIICQVFMPALSFNQHKSESGQVASPPEVQEFSSYDITDLPSMLGE 250

  Fly   151 ----------------DVQKHVHSLKSTVHQVKGQVSGETILAMP-VGVEKIVK---AAKELVET 195
                            ::||..::::.|:.|::|::.    |.|| :.||..|.   |..|||||
  Rat   251 TMEYHSIQLIRDEFLMNLQKFANNIQRTMQQLEGEIK----LEMPSISVEGEVSELVADPELVET 311

  Fly   196 -EQCQFDLYLKSAIEGVVIKWATQIHEVI----KESPSNAFANGQNPTPHTEFTFWNNRLKNLSF 255
             |||             ||.|..||...:    |:.|.   .||    |..|..||..|...||.
  Rat   312 LEQC-------------VINWLGQISYAVDSQLKKKPQ---GNG----PLAEIEFWRERNATLSA 356

  Fly   256 IYDQLRNERIRAMALILEYSMSAYHPCFQTLFKNVVTALAEAKDITLYLNPLKRPLQHLEEI--- 317
            :|:|.:...:|.:..:::.:.|......|.:...:.....||.|...:|:.::|   |.:.|   
  Rat   357 LYEQTKLPFVRKVLEVIKEAESMLTANVQPVLTELFKLHMEASDNVRFLSTVER---HFKNITHG 418

  Fly   318 -DFAECKPLLIPFMNTVGILWGNSRYYCQSAKITVLLQEICNLIIHQAKRYLDPSSIFHSDIDEA 381
             :|......:...|:.:.::|..||:|.:..::..|::.|...|..:..|.::..::|..:...|
  Rat   419 SNFHVVLDTIPSMMSALRMVWIISRHYNRDERMIPLMERIAWEIAERVCRVINLRTLFKENRANA 483

  Fly   382 MQRLTLSIQILKFFRELFDYYKERLATFFTEPEERPPILWTFHPNSVFKRFNAFLERLTTIQWFF 446
            ..:...:...||.:::  .|:..|.....:..|.|    |.|....:|:|.:........:....
  Rat   484 QFKTQEAKNTLKLWKK--SYFDIRAKIEASGREAR----WEFDRKRLFERTDYMANICQDLSDIL 542

  Fly   447 FTVIEFLKLEKVEIGGLRGRQLSTRITDVYVEFNQYFTAFASKSYDVLD----PDDHEFDEDFKG 507
            ..:.||..:...|:..:.|.  ..||.||....:.......:.::|..:    |......|||| 
  Rat   543 RVLEEFYNIFGPELKAVTGD--PKRIDDVLCRVDSLVAPMETLNFDPFNIRSAPYWKYVMEDFK- 604

  Fly   508 FQTRILELDMKLAAILCQAFDDCHNLESIFKLISIVGSVLDRPKIKEEFTQRYAEIVRMLDDEMT 572
              ..:|.::.:....:.::|....:.|:.|.::.....:..|..|..:...::.:|:.....|:.
  Rat   605 --LEVLVIEKEAKNFIDESFKTLRSAEAAFDMLLKFKHIRSREAINRQMMMKFNDILAQYYKEID 667

  Fly   573 ICESIYDKQMELKKVGDN--LYPNYNCPPVAAFIRWCHQLETRITAPVKNFKALQHEITKTEKSQ 635
            |...|:::.:      ||  ||.|:  ||||..|.|...|..||...:..|..:: |:..:|:.|
  Rat   668 IVNKIFEQNL------DNPPLYKNH--PPVAGAICWERSLFYRIKHTILRFMEVE-ELLDSERGQ 723

  Fly   636 EIVERYEILMVKLGSCKTQFFDDWAGQLDGQIEENLKKSLIARDR----------RHNSLILNFS 690
            |:.:||..:..|:...:...::.|....:..:...:||||:.::.          |....::|||
  Rat   724 EVKQRYLEVGRKMKEYEDVKYEHWKETTEQSLPNLMKKSLLTKNTITSEDSAVIDRGTMFVINFS 788

  Fly   691 AALFSILREVHYMQQMKIEGIPQIAIDFAEKSDVFRSYTLNLEKTIDWYNSIQEGSSPVELRLIE 755
            ..|..|:.|..|::|:... :|::|.:.|.:.|.|..||..:::.:|.|:.:....:..|..|::
  Rat   789 PVLREIINETKYLEQLGFT-VPELARNVALQEDKFLRYTEGIQRMLDHYHLLVNTLNEAESVLLD 852

  Fly   756 PEIKMIDDLVEIGVNQLVWNSSDILSYLDKLRKPVAALQNRMDHTQGNLRQIRKIMGVWAKQPLF 820
            ...:.:..:...|..:|.|||..|..|:.:.::.:...::.:.....|...|.      ::..|.
  Rat   853 DHSQELLRVFRSGYKRLNWNSLGIADYITRCKQAIGKFESLVHQIHKNAEDIN------SRLTLI 911

  Fly   821 ERRDCKKDTVLSIDERPDRTSKRYAEIQ-AASIEIHKLLQDNMLQFDMESKQDDAV--------- 875
            |..:..:..|:..:::.....:.:..|: ..|.::..:::..|....:.:|.:..|         
  Rat   912 ESINLFRSPVIKTEDKLPGVKEFFEYIERERSRDVDHMVRWYMAIGPLLTKVEGLVVHTNTGRAP 976

  Fly   876 -WLSYVDFVDNIVYENILKTVGVSVGYLAENMDPENNY----APLFESRLELVEPNLVFVPSLDP 935
             ..||.::.:..:|:.::|.:       .:|:...|:.    .|||::...|..|.::..|:.:.
  Rat   977 KLASYYEYWEGKIYDVLVKLI-------LKNLQAFNSLILRNVPLFQAETILSAPEIILHPNANE 1034

  Fly   936 EDPMGFNNMLIELMRDIMKM---------GSLIKRLKPNEKRNYVEM--------IKENQDIIDM 983
            .|     .|.:..:|..:::         ||.|:  .|.:|....|:        |.:|..|:|.
  Rat  1035 ID-----KMCVHCIRGCVEVTKYFVRWMNGSCIE--CPPQKGEEEEIVIISFYNDISQNSQIMDQ 1092

  Fly   984 RREILNGVDLVMEEASRFCRQFERYSYLWLDDREECMEYFLEYGRMLDPDEIELILINDPNQPPP 1048
            ...|...:..::....::.::::||..||..|:...||.|.                  ..:|  
  Rat  1093 AVMIPQNIHRLLVNIMKYLQRWKRYRPLWKLDKSIVMEKFA------------------AKKP-- 1137

  Fly  1049 QPCQPTIEAFREQIDNYESLFNEIEDIGPFQVFSSWFQVDVRPFRQALLNTVCKWGNMFKEHLVT 1113
             ||    .|:.|::..|..:..::.. .|........::.:.|    |.|||       :|:..:
  Rat  1138 -PC----VAYDEKLQFYAKIAADVMR-HPLVKDEHCIRLQLEP----LANTV-------QENAKS 1185

  Fly  1114 TVTS--SLMNLS-----HFIRKADEGLLQTVKE--KDYEGLVSIMAYLMQVKERAAKTDEMFEPM 1169
            .|||  .|:|.|     :.:|...|.|.:.:|:  ...:.|..::|.:.:::.::...:..::.:
  Rat  1186 WVTSLGKLLNESAREELYSLRDEIEHLAKNLKKSPNTLDDLKFVLATISEIRTKSLIMELRYKDV 1250

  Fly  1170 QETIQLLKYYDMDIPEEVNVLLQELPEQW-------ANTKKIASTVKQQVSPLQATEVVSIRNKI 1227
            ||..:.:..|.:..||....|:..:...|       .|.:.....:|:..:.:..:|:::.|:::
  Rat  1251 QERYRTMAIYSIFPPEAEQELVDNIENMWETLFTDSVNVEHALGGIKRTFTEITRSEIINYRSQV 1315

  Fly  1228 ALFESHIQLFREVFKTYDFFRF----------DCYKPYLLMDRINDDMFLCESEMRDIQESGSLF 1282
            ..|..               ||          |..|...|:.....::...|...:::..:..||
  Rat  1316 DEFAK---------------RFYSEGPGAVGEDLDKGSELLGSFEKELARHEKNRQELANAEKLF 1365

  Fly  1283 EVNIPEFKVLKQCRKELRMLKQLWDYVNIVATSIDDWKTTPWRKVDVENMDIECKKFAKDIRLLD 1347
            ::.|..:..|.:.:||:..|:.::|..:.:..:.::|..|.|..::|:.:....:.|.|::|.|.
  Rat  1366 DLPITMYPELMKVQKEMAGLRMIYDLYDSLKIAKEEWSQTLWINLNVQYLQEGIEGFLKNLRKLP 1430

  Fly  1348 KEMRPWDTFINLESTVKNMLTSLRAVGELQNPAIRERHWNQLMNSTKSLAALPKEVTVKFIMDHE 1412
            :.:|......:||:.:|....|:..:.:|::.|:|||||.:||..|          .|.|.|...
  Rat  1431 RHVRSLSVAFHLETKMKAFKDSIPLLLDLKHEALRERHWKELMEKT----------GVFFEMTET 1485

  Fly  1413 TTLAELLGLNLHECEEEVKNIVDKAVKEMSMEKILRDLNTTWTVMEFDHELHPRTGCNLLKASEE 1477
            .||..:..:.||:..|.:..||..||||:::||.::::..||..|:|       |.....|.::|
  Rat  1486 FTLDNMFAMELHKHTEVLNEIVTAAVKEVAIEKAVKEILDTWENMKF-------TVVKYYKGTQE 1543

  Fly  1478 ----------LIETLEDNQVCLQNLITSKYIAHFLEEVSTWQNKLMIADQVITVWFEVQRTWTHL 1532
                      :|:.|:||.|.||::..|:::..||:.|..|:..|.:..:||.:|..|||.|.:|
  Rat  1544 RGYILGSVDDIIQCLDDNTVNLQSISGSRFVGPFLQTVHKWEKTLSLIGEVIEIWMLVQRKWMYL 1608

  Fly  1533 ESIFMSSEDIRKQLPVDSDRFDNIDAEFRVLMDEM---SVSSNVVASTNRSGLIERLEHLQKELT 1594
            ||||:.. |||.|||.::.:||.||..|:.:|.:.   .|......:.||   :..|:.:.:.|.
  Rat  1609 ESIFIGG-DIRSQLPEEAKKFDVIDRIFKRIMGDTLKDPVIKRCCEAPNR---LHDLQTVSEGLE 1669

  Fly  1595 LCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDVLSNGIQPEMVTKHLTKLFDSIARLKFNRDESNEI 1659
            .|:|:|.:||::||.|||||:|:|..:||.:|.|. .|..|.:|:.|::|:||.|:|:..:|.| 
  Rat  1670 KCQKSLNDYLDSKRNAFPRFFFISDDELLSILGNS-DPLCVQEHMIKMYDNIAMLRFHDGDSGE- 1732

  Fly  1660 NTASGMYAKDGEYVEFNELASIRGPVEVWLNRIQAAMRASLRHYVMEAVIAY-EEKQREQWLFDY 1723
            ...|.|.:.:||.:.|.::....|.||.|:..:...||.:.|....||:..| |::.|..|:..|
  Rat  1733 KLVSAMISAEGEVMVFRKIVRAEGRVEDWMTTVLNEMRRTNRLITKEAIFRYCEDRSRVDWMMMY 1797

  Fly  1724 PAQVSLCGSQIWWSTEVNIAFSRLEEGYDNAIKDYYKKQISQLSLLITLLLGELSKGDRQKIMTI 1788
            ...|.|..||:||:.||...|:::::|...|:|:|.||...|:..|:|.:..:|||.||:|..|:
  Rat  1798 QGMVVLAASQVWWTWEVEDVFNKVKQGDKQAMKNYGKKMHRQIDDLVTRITMQLSKNDRKKYNTV 1862

  Fly  1789 CTIDVHSRDVVAKMIQAKLDSGSAFMWQSQLRHRFDDVEKDCFANICDAEFQYCHEYLGNTPRLV 1853
            ..||||:||:|...|:..:.....|.|:||||..:|....:.....|...|.|.:||:|...|||
  Rat  1863 LIIDVHARDIVDSFIRGSILEAREFEWESQLRFYWDREPDELNIRQCTGTFGYGYEYMGLNGRLV 1927

  Fly  1854 ITPLTDRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRAIGISVYVFNCSEQMDYQSCGNIY 1918
            |||||||.|:||||:|.:.:|||||||||||||||||||.:|:|:...|.||.|.|||::.|.|:
  Rat  1928 ITPLTDRIYLTLTQALSMYLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALGLLCVVTNCGEGMDYKAVGKIF 1992

  Fly  1919 KGLAQTGAWGCFDEFNRITVEVLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDKFNFMGEMISCVPTVGIFITMNP 1983
            .||||.||||||||||||...||||::.|::::::|:..:...|.|.|:.||....:||||||||
  Rat  1993 SGLAQCGAWGCFDEFNRIDASVLSVISSQIQTIRNALIHQLTTFQFEGQEISLDSRMGIFITMNP 2057

  Fly  1984 GYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFQDARVLARKFITLYTLCKELLSKQDH 2048
            ||||||||||::||||||..::|||.:.||||||.:|||..|:.||:|...||.|.:|.||||.|
  Rat  2058 GYAGRTELPESVKALFRPVVVIVPDLQQICEIMLFSEGFLGAKTLAKKMTVLYKLAREQLSKQHH 2122

  Fly  2049 YDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPGRPEEEVLMRALRDFNIPKIITDDMPVFMGLISDLFPALDVP 2113
            ||:||||:|||||:||.||||.....|:.||||||||.|:||.:.:|:|:|:||||||||.||.|
  Rat  2123 YDFGLRALKSVLVMAGELKRGSADLQEDVVLMRALRDMNLPKFVFEDVPLFLGLISDLFPGLDCP 2187

  Fly  2114 RKRDQDFERTVKQAASDLLLQPEDNFIL------KVVQLEELLEVRHSVFIVGNAGTGKTQVWKT 2172
            |.|..||    ..|..|:|  .|:.::|      ||||:.|.:..||:..:||..|.||:.|..|
  Rat  2188 RVRYPDF----NDAVEDVL--EENGYVLLPVQVDKVVQMFETMLTRHTTMVVGPTGGGKSVVINT 2246

  Fly  2173 LLRTYQNIKRKPIFNDLNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSVLMRDQANITG-DQPKWIVLD 2236
            |.:....:........||||||:..||:||::|.||:|.||:.|.:.|:....|. .:.|:|:.|
  Rat  2247 LCQAQTKLGILTKLYILNPKAVSVIELYGILDPTTRDWTDGVLSNIFREINKPTDKKERKYILFD 2311

  Fly  2237 GDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTPSMRLLFEISNLRTATPATVSRAGILYINPQDL 2301
            ||:|.:|:|::|:||||||:||||:.|||.|.....||||:.:|:.|:||||||.|::|::|::|
  Rat  2312 GDVDALWVENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLQSHCALLFEVGDLQYASPATVSRCGMVYVDPKNL 2376

  Fly  2302 GWNPYVTSWVETRKIPAEKSNLVMLFDKYIPPSLETI---------RVRFKKITPVAEMAHIQML 2357
            .:.||...|::..:...|:..|..||:||:|..::.|         ..:.|.:.|..::..:..|
  Rat  2377 KYQPYWKKWLQQIQNKVEQKYLNDLFEKYVPILIDLIIEGILDGRQGEKLKMVVPQTDLNMVTQL 2441

  Fly  2358 CHLLNCFLIPANTPADCPKEWHELYFVFACIWAFGSAMFQDQAIDY-----------RVEFSKWW 2411
            ..:::..|.......|.    .|.:|:.|...:.||::.::..|.:           ..|....|
  Rat  2442 TKMMDSLLEGEIEDPDL----LECFFLEALYCSLGSSLLEEGRIKFDECIKNLSSMPTAETEGNW 2502

  Fly  2412 VNEFKTVKFPPG--GTVFDYFLDSETKTFLPWTEKIPKFELDSDLPLQAVIVHTSESIRLRFFLD 2474
            ....:.    ||  .|::::..||:...::||.:.:|::..:.......::|||.::.|..:.|:
  Rat  2503 ARPGEL----PGHLPTLYEFHFDSKRNYWIPWNKLVPEYVHNHQKRFVDILVHTVDTTRTTWILE 2563

  Fly  2475 LLMDKKHPVMLVGNAGCGKTVLVNEKLQSLS-ENYAVTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPLEKKAGR 2538
            .::..||||:.||.:|..||......|::|: |...|..:.|:..|||..:|:.||..:||:...
  Rat  2564 QMVKIKHPVLFVGESGTSKTATTQNFLKNLNEETNIVLMVNFSSRTTSLDIQRNLEANVEKRTKD 2628

  Fly  2539 NYGPPGNKLLCYFVDDINMPEVDAYGTVQPHTLMRQHLDYGHWYDRNK-LTLKDIHNCQYVACMN 2602
            .||||..|.|..|:||:|||:||.|||.||..|::..|:.|:.|||.| |..|.|.:..::|.|.
  Rat  2629 TYGPPMGKRLLVFMDDMNMPKVDEYGTQQPIALLKLLLEKGYLYDRGKELNCKSIRDLGFIAAMG 2693

  Fly  2603 PTSGSFT-INPRLQRHFCVLAVSFPGPESITVMYSSILAQHFANAEQKFTPIVTRMTPNIVAATI 2666
            ...|... ::||....|.|..|.||..||:.::|.|||..|.:.    |...::.::..:...|:
  Rat  2694 KAGGGRNEVDPRFLSLFSVFNVPFPSEESLHLIYYSILKGHTST----FAESISGVSRKLTFCTL 2754

  Fly  2667 ALHNKCLQVFLPTAIKSHYIFNLRDISNVFQGLLFSSTECLTGSTDLIRLWQHETQRVYSDKLTD 2731
            .|:...:|...||..|.||||||||:|.||.||:.::.:.....:.::|:|::|..||:.|:|.:
  Rat  2755 TLYKNIVQDLPPTPSKFHYIFNLRDLSRVFNGLVLTNPDRFQTVSQMVRVWRNECLRVFHDRLIN 2819

  Fly  2732 DKDIDSFTKMQHDIVKKSFEEIDESVIFDKPNIYCHFAGGIGDPK---YMPIKGWPELHKLLQEA 2793
            :.|.........::||:.|.:..|.|:.| |.::..|...:.:.:   |..|:.:.....|.:|.
  Rat  2820 EVDKQLVQDYIGNLVKEHFNDDYEMVMRD-PILFGDFRTALQEEEPRIYEDIQDYEAAKALFEEI 2883

  Fly  2794 MSSYNDLVAAMNLVLFEDAMMHVCRINRILESPRGSALLVGVGGSGKQSLARLAAFISSLEVVQI 2858
            :..||::...||||||:||:.|:.|::||:...||.||||||||||||||||||||.:..||.:|
  Rat  2884 LEEYNEVNTKMNLVLFDDALEHLTRVHRIIRMDRGHALLVGVGGSGKQSLARLAAFTAGYEVFEI 2948

  Fly  2859 QLKKGYGVNDLKNEFSGLYLKAGLKNVGIMFLMTDAQIPSEDFLVLINDMLATGEIPDLFPDDEI 2923
            .|.:||..|:.:::...||:|.||:|..::||.|||.:..|.||.|||:||.:|.:|.||.::|.
  Rat  2949 LLSRGYSENNFRDDLKNLYMKLGLENKLMIFLFTDAHVAEEGFLELINNMLTSGMVPALFTEEEK 3013

  Fly  2924 ENIIAGVRNEVKGAGLVDTRENCWKFFIDRVRKQLKIVLCFSPVGSTLRVRSRKFPAIINATSIN 2988
            :||::.:..|....|:...:|:.|:||:::....|.|||..||||.|||.|.|.||.::|.|.|:
  Rat  3014 DNILSQIGQEALKHGMGPAKESVWQFFVNKSANNLHIVLGMSPVGDTLRTRCRNFPGLVNNTGID 3078

  Fly  2989 WFHEWPQEALISVAMNFLAQNKVLPENHRDSVAKFMAYVHTSVNTTSKVYLQNERRYNYTTPKSY 3053
            ||..||.:||.:||.:||..|.::|....:.:.:.:..||.||...||.:.|..||.||.|||:|
  Rat  3079 WFMPWPPQALHAVAKSFLGNNSMIPSEKLEDLVEHVVLVHQSVGEFSKQFQQKLRRSNYVTPKNY 3143

  Fly  3054 LEQINLYIKLLNHKNEDLQSKIERLENGLEKLRSTALQVADLKVKLAVQEIELKEKNEAADALIE 3118
            |:.||.|.|||:.|.:...::.:|||.||:||:...:|:.:|..|||.|:|.|.||:.|.:.|:|
  Rat  3144 LDFINTYSKLLDEKTQYNIAQCKRLEGGLDKLKEATIQLDELNQKLAEQKIVLAEKSAACETLLE 3208

  Fly  3119 IVGIET------EKVQTEKAVADEEEMKVALIADEVSKKQRDCEEDLLKAEPALMAAQDALNTLN 3177
            .:...|      :|:..|||:..||:.|:      ::.::.:.|..|.:..|.|.||:..|..|:
  Rat  3209 EIATNTAIAEEKKKLAEEKAIEIEEQNKI------IAVEKAEAETALAEVMPILEAAKLELQKLD 3267

  Fly  3178 KANLTELKSFGSPPGAVTNVTAAVMVLLSQGGKVPKDRSWKAAKIAMAKVDTFLDSLINYDKENI 3242
            |:::||::||..||..|..|...::::     |..|:.:||.|| .|.....||.||:..|.::|
  Rat  3268 KSDVTEIRSFAKPPKQVQTVCECILIM-----KGYKELNWKTAK-GMMSDPNFLRSLMELDFDSI 3326

  Fly  3243 HPEITKAIQPYLKDPEFEPEFVRSKSGAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRKALAAANAELAA 3307
            .....|.|:..||......|.:.:.|.|..|:..:|..::.:.:|:.:::|||..:|........
  Rat  3327 TQGQVKNIKGLLKTLNTTIEEMEAVSKAGLGMLKFVEAVMGYCDVFREIKPKRDKVARLERNFFL 3391

  Fly  3308 AQDKLAGIKRKVMSLEEQLGKLTADFEKATADKLRCQQEADATQATIALANRLVGGLASENVRWA 3372
            .:.:|..|:.::.:::::|..|.|.:|.|..:|.:.|:||:..:..:..|::|:.||.||||||.
  Rat  3392 TKRELERIQNELAAIQKELEALGAKYEAAILEKQKLQEEAEIMERRLIAADKLISGLGSENVRWL 3456

  Fly  3373 EAVNNFVKQGITLPGDILLITAFISYVGCFTKGFRIDLLLKMWTPFLKSIDPPIPTTENLDPLSL 3437
            ..::..:.:.:.|.||.||..||:||.|.||..||..::.:.|...:  :|..||.::.....:|
  Rat  3457 NDLDELMHRRVKLLGDCLLCAAFLSYEGAFTWEFRDAMVNQEWRNDI--LDRDIPLSQPFRLENL 3519

  Fly  3438 LTDDTTIAIWTNEGLPSDRMSIENATILSNSDRWPLMIDPQLQGVKWIKQK-YGEDLKVIRLGQR 3501
            ||||..|:.|.::|||.|.:|::|..:.:.:.|:||.||||.|.:.|||:| ...:|:|......
  Rat  3520 LTDDVEISRWGSQGLPPDELSVQNGILTTRASRFPLCIDPQQQALNWIKRKEERNNLRVASFNDP 3584

  Fly  3502 SYLDIIEKSINAGCNVLIENIDENLDPVLDSLLGRNL-IKKGKA-IKIGDKEIEYNSNFRLILHT 3564
            .:|..:|.||..|...|..::||.:|||:|::|.:|: |.:|:. |.:||||::|:|||||.|:|
  Rat  3585 DFLKQLEMSIKYGTPFLFHDVDEYIDPVIDNVLEKNIKISQGRQFIILGDKEVDYDSNFRLYLNT 3649

  Fly  3565 KLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKAERPDLEELKADLTKQQNDFKIMLKKLE 3629
            |||||.|.|.:..:..:||:|||..|||||||:.:|..||.:|||.:..|.::.::.|.:||.||
  Rat  3650 KLANPRYSPSVFGKAMVINYTVTLKGLEDQLLSVLVAYERRELEEQREHLIQETSENKNLLKDLE 3714

  Fly  3630 DDLLSRLSSAGENILGDTALVENLETTKSTASEIEQKVAEAKITSKEIDKAREYYRPAAARASLL 3694
            |.||..|:::..|:|.:..||:.||.|||.|:|:.:|:..|:.|:.:||:.|:.|||||.|.::|
  Rat  3715 DSLLRELATSTGNMLDNVELVQTLEETKSKATEVSEKLKLAEKTALDIDRLRDGYRPAARRGAIL 3779

  Fly  3695 YFILNELNTINPIYQFSLKAFSVVFQKAIAKAEPGDTLDLRVSNLIDCITYSVFQYTSRGLFECD 3759
            :|:|:|:..:|.:||:||.||..||..::.|:.|...|..|:.|::|.:|::::.|...||||..
  Rat  3780 FFVLSEMALVNSMYQYSLIAFLEVFGLSLKKSLPDSILLKRLKNIMDTLTFNIYNYGCTGLFEKH 3844

  Fly  3760 KLIFASQMTFQILLMNEEVTSAELDFLLRFPI---KPHVTSPVDFLTNQSWGGICSLASK--DEF 3819
            ||:|:..||.:|......|...||||.|:..|   |.....|..:|::|.|..|..|:.|  |.|
  Rat  3845 KLLFSFNMTIKIEQAEGRVPQDELDFFLKGNISLEKSKWKKPCTWLSDQGWEDIILLSEKFSDIF 3909

  Fly  3820 RNLDRDIETSSKRWKKLVESELPEKEKFPQEWKNK-TALQRLCMIRALRPDRMTYALADFIEEKL 3883
            .||..|||.:...|::..:.:..|:..||..:.:. ||.|:|.::|..|.||:..|:.|::...:
  Rat  3910 GNLPFDIEHNLPTWQEWYDKDSLEQFPFPLRYDDHITAFQKLLILRCFRVDRVYRAVTDYVTLTM 3974

  Fly  3884 GSKYVESRAMEFAKSYEEASPSTPIFFILSPGVNPLKDVEALGKQMGFSMDLGNFHNVSLGQGQE 3948
            |.|||:...:.|...:|:::|::||.||||||.:|..|:..|.::.||......|  :::|||||
  Rat  3975 GEKYVQPPMISFEAIFEQSTPNSPIVFILSPGSDPASDLMKLAERSGFGGTRLKF--LAMGQGQE 4037

  Fly  3949 AIAEAAMDTAAKHGHWVVLQNIHLVRKWLPVLEKKLEYYAEDSHPDYRMFLSAEPASTPSAHIIP 4013
            .:|...::||...|.|::|||.||:.|||..|||.||...: .|||:|::|:.:|...     .|
  Rat  4038 KVALQLLETAVARGQWLMLQNCHLLVKWLKDLEKSLERITK-PHPDFRLWLTTDPTKG-----FP 4096

  Fly  4014 QGILESSIKITNEPPTGMLANLHKALDNFTQETLEMSGKEAEFKAILFSLCYFHAVVAERRKFGP 4078
            .|||:.|:|:..|||.|:..|:.......:.:.||.....| ||.:::.|.:|||||.||||||.
  Rat  4097 IGILQKSLKVVTEPPNGLKLNMRATYFKISHDMLEQCPHTA-FKPLVYVLAFFHAVVQERRKFGK 4160

  Fly  4079 QGWNKIYPFNVGDLNISVSVLYNYL-----EANAKVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCIT 4138
            .|||..|.||..|..:.:.:|..||     :.:.::||..|:||.||:||||...|.:|||:..|
  Rat  4161 IGWNVYYDFNESDFQVCMEILNTYLTKAFQQHDPRIPWGSLKYLIGEVMYGGRAIDSFDRRILTT 4225

  Fly  4139 YLEEYMQPDLVDGELFLAPSFPAPPNTDYQGYHTY----VDEMMP-----------------AES 4182
            |::||:...:.|               .:|.:|.:    ||..:|                 |.:
  Rat  4226 YMDEYLGDFIFD---------------TFQPFHFFRNKDVDYKIPVGDVKDKFVEAIEALPLANT 4275

  Fly  4183 PYLYGLHPNAEIGFLTTRAENIFRTVFEMQPRDAGAGGGATVTREDKVKQIVDEIIEKLPEEFNM 4247
            |.::|||.|||||:.|..|.:::..:.|:||:...:..|  |:|:|.:.|:..:|..|:|:.|::
  Rat  4276 PEVFGLHSNAEIGYYTQAARDMWGHLLELQPQTGESSSG--VSRDDYIGQVAKDIENKMPKIFDL 4338

  Fly  4248 VEIMNKVE-ERTPYVIVAFQECERMNFLTSEMKRSLKELDLGLKGELTITSDMEVLENSLFLDQV 4311
            .::...:. ..:|..:|..||..|.|.|...|.|||.||...|.||:.::::::.:..||||..:
  Rat  4339 DQVRKHLGLNISPTSVVLLQELGRFNKLVIRMTRSLAELQRALAGEVGMSNELDDVARSLFLGHI 4403

  Fly  4312 PPIWTQRAYPSLLGLNNWFIDLCLRLRELETWSTDFVLPSCVWLAGFFNPQSLLTAIMQSTARRN 4376
            |.||.:.|..:|..|.||.:....|..:...|.|:.. ||.:||:|...|:|.|||::|:|.|||
  Rat  4404 PHIWRKLAPDTLKTLGNWMVYFLRRFNQYTLWVTESE-PSVMWLSGLHIPESYLTALVQATCRRN 4467

  Fly  4377 DLPLDKMCLQCDVTKKQ-KEEFTTAPRDGCCVHGIFMEGARWDIQQGIIMESRLKELYPSMPVIN 4440
            ..|||:..|...|||.| .:|.......||.|.|:::|||.|||::|.:::|:.|.|...:|::.
  Rat  4468 GWPLDRSTLFTQVTKFQDADEVNERAGQGCFVSGLYLEGADWDIERGCLVKSKPKVLVVDLPILK 4532

  Fly  4441 IRAITQDKQDLRNMYECPVYKTRTRGPTT---YVSNLNLKTKDKPGKWILAGVALLLQT 4496
            |..|...:..|:|.:..|||.|..|....   .|...:|.|......|:|.||.|.|.:
  Rat  4533 IIPIEGHRLKLQNTFRTPVYTTSMRRNAMGVGLVFEADLFTAKHISHWVLQGVCLTLNS 4591

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc93ABNP_001262793.1 DHC_N1 204..782 CDD:285571 127/601 (21%)
DHC_N2 1295..1708 CDD:285579 134/425 (32%)
P-loop_NTPase 1841..2071 CDD:304359 143/229 (62%)
P-loop_NTPase 2155..2290 CDD:304359 60/135 (44%)
P-loop_NTPase 2448..2720 CDD:304359 95/274 (35%)
P-loop_NTPase 2797..3064 CDD:304359 125/266 (47%)
MT 3076..3419 CDD:289543 108/348 (31%)
AAA_9 3447..3659 CDD:289547 93/214 (43%)
Dynein_heavy 3799..4486 CDD:281078 246/720 (34%)
Dnah10XP_008767494.2 DHC_N1 309..879 CDD:400611 133/613 (22%)
DHC_N2 1375..1780 CDD:400618 134/427 (31%)
DYN1 <1616..4234 CDD:227570 1030/2664 (39%)
AAA_6 1915..2241 CDD:403853 189/331 (57%)
AAA_8 2894..3153 CDD:403858 122/258 (47%)
Dynein_C 4291..4589 CDD:408026 101/300 (34%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D1492at2759
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 00.000 Not matched by this tool.
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
11.010

Return to query results.
Submit another query.