DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc93AB and Dnah6

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001262793.1 Gene:Dhc93AB / 42485 FlyBaseID:FBgn0013812 Length:4496 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038964640.1 Gene:Dnah6 / 117250 RGDID:621797 Length:4156 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4173 Identity:1323/4173 - (31%)
Similarity:2162/4173 - (51%) Gaps:447/4173 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   568 DDEMTICESIYDKQMELKKVGDNLYPN--YNCPPVAAFIRWCHQLETRITAPVKNFKALQHE--- 627
            |.|..:..:|.|....:|.|.:|.:..  |..|.|.         ::.|.....|.|.:.:|   
  Rat   183 DREEVVKANIRDPLQIIKIVHENEHLGFLYMIPAVP---------KSSIEYDTYNLKVVSYENIN 238

  Fly   628 ------ITK---------------TEK-SQEIVERYEILMVKLGSC--KTQFFDDWAGQLDGQIE 668
                  |:|               ||: .||.:...|:..:.:.|.  |.:.|..|...:..:..
  Rat   239 KNDYYTISKDAVTHVFNDDIEYIETERWEQEYLYHRELTKIPIFSLFRKWKAFSVWRKNVRSKKI 303

  Fly   669 ENLKKSLIARDRRHNSLILN--FSAALFSILREVHYMQQMKIEGIPQIAIDFAEKSDVFRSYTLN 731
            ...:|:|     |.|..|:|  ...||..| .::.|  |:...|:..|     ||   |.:|||.
  Rat   304 TGCRKAL-----RKNLFIVNPYLRPALLKI-NDMCY--QLSFMGLCYI-----EK---FHTYTLQ 352

  Fly   732 LEKTIDWYNSIQEGSSPVELRLIEP----------------------EIKMIDDLVEIGVNQLVW 774
            ..|...... :||.:..:|....|.                      |::..:|..:|.:...:.
  Rat   353 EFKAAQVVR-VQEVTERLEYFRFEAKDVVRKSCRFALRAAGFIPDDCEVETHEDYFKINIASFID 416

  Fly   775 NSSDILSYLDKLRKPVAALQNRMDHTQGNLRQIRKIMGVWAKQPLFERRDCKKDT-VLSIDERPD 838
            ..||:.:|.:         ..:|.:|:    |..|            |..|.:.| .:.:::...
  Rat   417 APSDLPTYGE---------SEKMTYTE----QASK------------RHHCMRLTCFIRLNDYLI 456

  Fly   839 RTSKRYAEIQAASIEIHKLLQDNMLQFDMESKQDDAVWLSYVDFVDNIVYENILKTVGVSVGYLA 903
            :.:.....:..|| .:...|.|.:       |:..:     .|.:...:.|:..:.:......:.
  Rat   457 QNTLHVLTVNTAS-SLLNYLSDKL-------KRTPS-----ADVIQKWITEDKPEVIEKKGAPMM 508

  Fly   904 ENMDPENNYAPLFESRLELVEPNLVFVPSLDPEDPM-GFNNMLIELMRDIMKMGSLIK------- 960
            |..:.:.:..|:|.:.|.|...:|:|.|||  ||.: |.:.::......::.:.:|:.       
  Rat   509 EKQEEDESLIPMFLTELILTVQSLLFEPSL--EDFLDGISGIINHFENTVLSVPNLVPDSYFNAF 571

  Fly   961 -----RLKPNEKR-----NYVEMIKENQDIIDMRREILNGVDLVMEEASRFCRQFERYSYLWLDD 1015
                 ..|..||.     :...:.:::::.:.:.::|...:....:.|..:...||::       
  Rat   572 TSPFINKKVEEKTCGPGPSLSAVFEDDRNFLTIIQQIKETIHSAFDSARLYAATFEKF------- 629

  Fly  1016 REECMEYFLEYGRMLDPDEIELILINDPNQPPPQPCQPTIEAFREQIDNYESLFNEIEDIGPFQV 1080
                 :.|.:....||.:.:             :..:|.:|.|..|::.|.....:         
  Rat   630 -----QIFFKENESLDLEAL-------------KEEEPDVEFFSSQLEKYHKQHKD--------- 667

  Fly  1081 FSSWFQVDVRPFRQA---LLNTVCKWGNMFKEHLVTTVTSSL----MNLSHFIRKADEGLLQTVK 1138
                 .|.::|.|..   |::|     ...||.|:.:....|    :.|....:|..:.::...:
  Rat   668 -----SVALKPTRNVGLLLIDT-----KQLKEKLIPSPLRCLEVLNLMLPRLSKKKVDAIISEAQ 722

  Fly  1139 EKDYE---------GLVSIMAYLMQVKERAAKTDEMFEPMQETIQLLKYYDMDIPEEVNVLLQEL 1194
            :.:|:         ..|:.:.:|.:::||....:|....:.:..:|::.|.:..|          
  Rat   723 DAEYKLEFVPTTTIEYVNSLVFLDEIQERIETLEEEGNTVVQMYKLIEQYQVLTP---------- 777

  Fly  1195 PEQWANTKKIASTVKQQVSPLQATEVVSIRNKIALFESHIQLF--------REVFKTYDFFRFDC 1251
            ||.:|    :.:|:|..::.::.....|:.::    ||.|:.|        .::....:..:...
  Rat   778 PEDFA----VFATMKPSITAVRNAIDKSVGDR----ESSIKQFCLHLGRDLEDLNNEVNEVKLLA 834

  Fly  1252 YKPYLL-----MDRINDDMFLCESEMRDIQESG-------SLFEVNIPEFKVLKQCRKELRMLKQ 1304
            ..|.:|     .::|...:...:|.:.|:|:..       ..|:|.:.:|..|::...|||:.:.
  Rat   835 QDPQILDISADPEKIKTMLSDLQSVLDDLQKRAFQYKSYQKNFKVEVSKFDALEEVCAELRLKQL 899

  Fly  1305 LWDYVNIVATSIDDWK--TTPWRK-----VDVENMDIECKKFAKDIRLLDKEMRPWDTFINLEST 1362
            |||       |:.:|.  ...|.|     :|.|.::.:..|:||.:..|:|.:.|......|:..
  Rat   900 LWD-------SLSEWDKLQQEWLKSKFDCLDPEVLNGQVTKYAKFVTQLEKGLPPNSVVPQLKQK 957

  Fly  1363 VKNMLTSLRAVGELQNPAIRERHWNQLMNSTKSLAALPKEVTVKFIMDHE--TTLAELLGLNLHE 1425
            |:.|...|..:.:|:||.::.|||:.:..:..:|           ::|.|  .||..|..|::.:
  Rat   958 VERMKEKLPVINDLRNPTLKPRHWSAIEQTVDAL-----------LVDIEIPLTLERLSELHVFD 1011

  Fly  1426 CEEEVKNIVDKAVKEMSMEKILRDLNTTWTVMEFDHELHPRTGCN---LLKASEELIETLEDNQV 1487
            ..:|:::|..:|..|.::|.||:.:..:|...||  .:.|.....   :|..::::...|:|:.:
  Rat  1012 FAQEIQDISGQASGEAALEIILKKVEDSWKTTEF--VILPHRDSKDVFILGGTDDIQVLLDDSTI 1074

  Fly  1488 CLQNLITSKYIAHFLEEVSTWQNKLMIADQVITVWFEVQRTWTHLESIFMSSEDIRKQLPVDSDR 1552
            .:..:.:|:|:......|..||.:|.:.:|.:..|...||.|.:||||| ::.||::|||.::..
  Rat  1075 NVATIASSRYVGPLKTRVDDWQKQLSLFNQTLEEWLNCQRNWLYLESIF-NAPDIQRQLPAEAKM 1138

  Fly  1553 FDNIDAEFRVLMDEMSVSSNVVASTNRSGLIERLEHLQKELTLCEKALAEYLETKRLAFPRFYFV 1617
            |..:|..::.:|.:::...|.:.:..:.||:|..::....|...:|.|..|||:||:.||||||:
  Rat  1139 FLQVDKSWKEIMRKVNRLPNALRAATQPGLLETFQNNNALLDQIQKCLEAYLESKRVIFPRFYFL 1203

  Fly  1618 SSADLLDVLSNGIQPEMVTKHLTKLFDSIARLKF--------------NRDESNEINTASGMYAK 1668
            |:.:||::|:....|:.|..||.|.||||::|:|              ...|....|....|.:.
  Rat  1204 SNDELLEILAQTRNPQAVQPHLRKCFDSISKLEFALMPPTEGKIPGIDTEPEKVFTNDILAMLSP 1268

  Fly  1669 DGEYVEFNELASIRGPVEVWLNRIQAAMRASLRHYVMEAVIAYEEKQREQWLF-DYPAQVSLCGS 1732
            :||.|...:....||.||.||.:::.||.:|||.....|:..|:.|.|.:|:. .:|:||.|..|
  Rat  1269 EGERVGLGKGLKARGNVEEWLGKVEEAMFSSLRRLCKAAIADYQGKLRTEWVIAGHPSQVILTIS 1333

  Fly  1733 QIWWSTEVNIAFSRLEEGYDNAIKDYYKKQISQLSLLITLLLGELSKGDRQKIMTICTIDVHSRD 1797
            ||.|..::..:. ..|:.:..|::.:.:....:|:.|..::.|.|.|..|..|..:.|||||:||
  Rat  1334 QIMWCRDLTESL-ECEDNHLEALEKFEQVNFERLNALAAIVRGSLPKLHRNIITALITIDVHARD 1397

  Fly  1798 VVAKMIQAKLDSGSAFMWQSQLRHRFDDVEKDCFANICDAEFQYCHEYLGNTPRLVITPLTDRCY 1862
            :|::::|:|:||..:|.||.|||:.:|....:|.|.:..:::.|.:||||..|||||||||||||
  Rat  1398 IVSELVQSKVDSAESFDWQRQLRYYWDVDLDNCVARMALSQYTYAYEYLGACPRLVITPLTDRCY 1462

  Fly  1863 ITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRAIGISVYVFNCSEQMDYQSCGNIYKGLAQTGAW 1927
            :.|..:|.|.:|||||||||||||||||||.:|:.|...|||||:.:||:..|..:.||||:|||
  Rat  1463 LCLMGALQLDLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALAIQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQSGAW 1527

  Fly  1928 GCFDEFNRITVEVLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDKFNFMGEMISCVPTVGIFITMNPGYAGRTELP 1992
            .||||||||.:|||||:|.|:.::::|...|..:|.|.|..|..|.|...|||||||||||||||
  Rat  1528 CCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLITIRNAKAAKLSRFMFEGREIKLVMTCAAFITMNPGYAGRTELP 1592

  Fly  1993 ENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFQDARVLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIK 2057
            :||||||||.||:||::.||.|::|.:|||:.:::||||...:|.||.|.||:|||||:|:||:|
  Rat  1593 DNLKALFRPMAMMVPNYALIAEVILYSEGFESSKILARKMTQMYKLCSEQLSQQDHYDFGMRAVK 1657

  Fly  2058 SVLVVAGSLKRGDPGRPEEEVLMRALRDFNIPKIITDDMPVFMGLISDLFPALDVPRKRDQDFER 2122
            ||||:||||||.:|...|:.||:|||||.|:||.:|||..:|.|:||||||.:.:|.........
  Rat  1658 SVLVMAGSLKRENPDLSEDVVLIRALRDSNLPKFLTDDALLFSGIISDLFPGVQIPEHDYGILHS 1722

  Fly  2123 TVKQAASDLLLQPEDNFILKVVQLEELLEVRHSVFIVGNAGTGKTQVWKTLLRTYQNIKR----K 2183
            |:........||||...:.||:||.|.:.|||.|.:||..|.|||.|::.|..|..|:::    .
  Rat  1723 TIVDVMISQNLQPEICMVKKVIQLYETMLVRHGVMLVGPTGGGKTTVYQVLAETLGNLEKLNTGN 1787

  Fly  2184 PIFND-----LNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSVLMRDQANITGDQPKWIVLDGDIDPMW 2243
            |.:..     ||||::|..||:|.:|..|.||||||.::.:|...|.|.:..|||:.||.:|.:|
  Rat  1788 PFYQPVKTFVLNPKSITMGELYGEVNNVTLEWKDGLMALSVRAAVNDTSEDHKWIISDGPVDALW 1852

  Fly  2244 IESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTPSMRLLFEISNLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWNPYVT 2308
            ||::|||:||||:|.||::|||.|||.:.:|||:.:|:.|:||||||.|:::::|::|.|.|||.
  Rat  1853 IENMNTVLDDNKMLCLANSERIKLTPQVHMLFEVQDLKVASPATVSRCGMVFVDPEELKWMPYVK 1917

  Fly  2309 SWVET--RKIPAE-KSNLVMLFDKYIPPSLETIRVRFKKITPVAEMAHIQMLCHLLNCFLI---- 2366
            :|:.|  :|:..| :..|:.||::|:...|..:..:..:..|..:::.:..||.||...|:    
  Rat  1918 TWMSTLSKKLSEEIREYLLNLFNRYVDDGLRFVNKKCTQAIPQVDISKVTTLCCLLESLLLSKDG 1982

  Fly  2367 --------PANTPADCPKEWHELYFVFACIWAFGSAMFQDQAIDY----RVEFSKWWVNEFKTVK 2419
                    ..||.. |..      |||..:|:.|..:.::....:    |.:|     ::....:
  Rat  1983 NILSLEQMKLNTVV-CQT------FVFCYLWSLGGNLTENHWDSFDTFIRTQF-----DDNPDAR 2035

  Fly  2420 FPPGGTVFDYFLDSETKTFLPWTEKIPKFELDSDLPLQAVIVHTSESIRLRFFLDLLMDKKHPVM 2484
            .|..|.::...:|.:||...||...||.|:...::|...::|.|::::|..:.::.|:..:|.|:
  Rat  2036 LPSSGDLWSIHVDFDTKRLDPWERIIPTFKYSREVPFFEMLVPTADTVRYGYLMEKLLAVRHSVL 2100

  Fly  2485 LVGNAGCGKTVLVNEKLQSLSEN--YAVTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPLEKKAGRNYGPPGNKL 2547
            ..|..|.||:|:....|..:.|:  |....:.|:..|:|...|:|:|..||:|.....|.||||.
  Rat  2101 FTGTTGVGKSVIAKGLLNRIQESAGYVPVYLNFSAQTSSARTQEIIESKLERKRKNILGAPGNKQ 2165

  Fly  2548 LCYFVDDINMPEVDAYGTVQPHTLMRQHLDYGHWYDRNKLTLKDIHNCQYV-ACMNPTSGSFTIN 2611
            :..||||:|||.:|.||:..|..|:||:.|:|.:||||||..|:|.:...| ||..|..|...:.
  Rat  2166 VVIFVDDLNMPRLDRYGSQPPIELLRQYQDFGGFYDRNKLFWKEIQDVTIVSACAPPGGGRNPVT 2230

  Fly  2612 PRLQRHFCVLAVSFPGPESITVMYSSILAQHFANAEQKFTPIVTRMTPNIVAATIALHNKCLQVF 2676
            ||..|||.:|.:..|...|:..::.:||....|:    ||..|.:.:.|||.|.:.::|:.....
  Rat  2231 PRFIRHFSMLCLPMPSEHSLKQIFQAILNGFLAD----FTEAVKQTSSNIVEAAVEIYNRMSVDL 2291

  Fly  2677 LPTAIKSHYIFNLRDISNVFQGLLFSSTECLTGSTDLIRLWQHETQRVYSDKLTDDKDIDSFTKM 2741
            |||..||||:|||||:|...||:|......:.....:.||:.||.|||:.|:|.:::|...|..:
  Rat  2292 LPTPAKSHYVFNLRDLSKCVQGILQCDPGTIREEMQIFRLFCHECQRVFHDRLINNEDKHYFHVI 2356

  Fly  2742 QHDIVKKSFE-EIDESVIFDKPNI---YCHFAGGIGDPKYMPIKGWPELHKLLQEAMSSYN-DLV 2801
            ..::..|.|. .||......||.|   :..|.....|..|..:....::..:||:.:..|| ...
  Rat  2357 LTEMANKHFGIAIDLEYFLSKPIIFGDFIKFGADKADRIYDDLPDIEKIENVLQDYLDDYNLTNP 2421

  Fly  2802 AAMNLVLFEDAMMHVCRINRILESPRGSALLVGVGGSGKQSLARLAAFISSLEVVQIQLKKGYGV 2866
            ..:.||.|:||:.||.||.|::...||:||||||||:|||||.||||.|...:.:||:|.:||..
  Rat  2422 KEVKLVFFQDAIEHVSRIARMIRQERGNALLVGVGGTGKQSLTRLAAHICGYKCLQIELSRGYNY 2486

  Fly  2867 NDLKNEFSGLYLKAGLKNVGIMFLMTDAQIPSEDFLVLINDMLATGEIPDLFPDDEIENIIAGVR 2931
            :....:...||..||:::..::||.||.||..|:||..||::|.:||:|:||..||:|.::|..|
  Rat  2487 DSFHEDLRKLYKMAGVEDKNMVFLFTDTQIVVEEFLEDINNILNSGEVPNLFEKDELEQVLAATR 2551

  Fly  2932 NEVKGAGLVD-TRENCWKFFIDRVRKQLKIVLCFSPVGSTLRVRSRKFPAIINATSINWFHEWPQ 2995
            .:.|..|:.: .|:..:::||.|||::|.||||.||||...|.|.|.||:::|..:|:||.:||:
  Rat  2552 PKAKEVGISEGNRDEVFQYFISRVRQKLHIVLCMSPVGEAFRSRCRMFPSLVNCCTIDWFVQWPR 2616

  Fly  2996 EALISVAMNFLAQNKVLPENHRDSVAKFMAYVHTSVNTTSKVYLQNERRYNYTTPKSYLEQINLY 3060
            |||:||:.:|.:......|..::.::.....||.||:..:..|....||..||||.||||.||||
  Rat  2617 EALLSVSKSFFSVVDTGNEELKEKLSLMCVNVHLSVSHMADRYYSELRRRYYTTPTSYLELINLY 2681

  Fly  3061 IKLLNHKNEDLQSKIERLENGLEKLRSTALQVADLKVKLAVQEIELKEKNEAADALIEIVGIETE 3125
            :.:|..|.:.|.|..:|:.|||.||..|.:.|..:|:.|:..|..|.:|::..:||:|.:.::.|
  Rat  2682 LTMLTEKRKQLVSARDRVTNGLTKLLETNILVDKMKLDLSALEPVLFQKSQDVEALMEKLVVDQE 2746

  Fly  3126 KVQTEKAVADEEEMKVALIADEVSKKQRDCEEDLLKAEPALMAAQDALNTLNKANLTELKSFGSP 3190
            .....:.|..|:|....:.|:|......|.:.||.:|.|||.||..||::|:||:::|::.|..|
  Rat  2747 SADQVRNVVQEDEAIAKVKAEETQAIADDAQRDLEEALPALEAANKALDSLDKADISEIRVFTKP 2811

  Fly  3191 PGAVTNVTAAVMVLLSQGGKVPKDRSWKAAKIAMAKVDTFLDSLINYDKENIHPEITKAIQPYLK 3255
            |..|..|..|:.:||:      ....|..||..:.. ..||..|:.||||||.|:|...:|.|:.
  Rat  2812 PDLVMTVMEAISILLN------AKPDWPTAKQLLGD-SNFLRRLLEYDKENIKPQILSKLQRYIN 2869

  Fly  3256 DPEFEPEFVRSKSGAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRKALAAANAELAAAQDKLAGIKRKVM 3320
            :|:|.||.|...|.|...:|.||..:..:..|..:|||||:.|.||.|||.|....|...:..:.
  Rat  2870 NPDFVPEKVEKVSKACKSMCMWVRAMDLYSRVVKEVEPKRQKLRAAQAELDATITTLKEKQALLK 2934

  Fly  3321 SLEEQLGKLTADFEKATADKLRCQQEADATQATIALANRLVGGLASENVRWAEAVNNFVKQGITL 3385
            .:|||:..|..:::|...:|....:....|:|.:..|.:|...|..|.|||.|::..|.::...:
  Rat  2935 QVEEQIRALQEEYDKGVNEKESLAKTMALTKARLVRAGKLTAALGDEQVRWEESIEKFQEEIANI 2999

  Fly  3386 PGDILLITAFISYVGCFTKGFRIDLLLKMWTPFLKSIDPPIPTTENLDPLSLLTDDTTIAIWTNE 3450
            .|::.:..|.::|.|.||..:| .||::.|.....::|.||..:.:|  ::.|.|...|..|..:
  Rat  3000 VGNVFIAAACVAYYGAFTAQYR-QLLIECWIDSCLALDIPIDPSFSL--INTLGDPYEIRQWNAD 3061

  Fly  3451 GLPSDRMSIENATILSNSDRWPLMIDPQLQGVKWIKQKYGED-LKVIRLGQRSYLDIIEKSINAG 3514
            |||.|.:|.||..:::...|||||||||.|..:||:.|..:. ||||:|...::|.|:|.||..|
  Rat  3062 GLPRDLISTENGILVTQGRRWPLMIDPQDQANRWIRNKESKSGLKVIKLTDTNFLRILENSIRLG 3126

  Fly  3515 CNVLIENIDENLDPVLDSLLGRNLIKKG--KAIKIGDKEIEYNSNFRLILHTKLANPHYKPEMQA 3577
            ..||:|.:.|.|||.|:.:|.:.....|  ..|::||.:|:|:.:||..:.||:.||||.||:..
  Rat  3127 LPVLLEELREVLDPALEPILLKQTFMSGGRLLIRLGDSDIDYDKSFRFYMTTKMPNPHYLPEVCI 3191

  Fly  3578 QTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKAERPDLEELKADLTKQQNDFKIMLKKLEDDLLSRLSSAGEN 3642
            :.|:||||||:.|||||||::||:.|:|:||..:..|..:.|..|..||.:||.:|..|.::..|
  Rat  3192 KVTIINFTVTKSGLEDQLLSDVVRLEKPELEGQRVQLIVRINSDKNQLKSIEDKILKLLFTSEGN 3256

  Fly  3643 ILGDTALVENLETTKSTASEIEQKVAEAKITSKEIDKAREYYRPAAARASLLYFILNELNTINPI 3707
            ||.:..|::.|:.:|.|:..|:.::.||:.|...|:.|||.|||.|.:.|::||::..|:.|:|:
  Rat  3257 ILDNEELIDTLQDSKITSGAIKTRLKEAESTELMINIARERYRPVATQGSVMYFVIASLSEIDPM 3321

  Fly  3708 YQFSLKAFSVVFQKAIAKAEPGDTLDLRVSNLIDCITYSVFQYTSRGLFECDKLIFASQMTFQIL 3772
            ||:|||.|..:|...|..:|..|:|..|::.|:.....:.:...||||||..|||::..:...|:
  Rat  3322 YQYSLKYFKQLFNTTIETSEKSDSLQERLAILLQQTLLTAYTNVSRGLFEQHKLIYSFMLCVDIM 3386

  Fly  3773 LMNEEVTSAELDFLLR--------FPIKPHVTSPVDFLTNQSWGGICSLASKDE----FRNLDRD 3825
            ...|::|.||.:|.||        .|.||.    ..:|..|.|...|.|   :|    |..|.|.
  Rat  3387 RQQEQLTEAEWNFFLRGSAGMEKERPPKPE----APWLPIQMWFSCCDL---EEWFPIFEGLTRH 3444

  Fly  3826 I------------ET--SSKRWKKLVESELPEKEKFPQEW-KNKTALQRLCMIRALRPDRMTYAL 3875
            |            ||  :.:.|:...:....|:::  ..| .|.::..:|.:::..:.:::.:||
  Rat  3445 ILLHPISISLGSFETYINPQSWEGYPKQRHEEEKE--HVWGSNFSSFHKLILVKCCKEEKVVFAL 3507

  Fly  3876 ADFIEEKLGSKYVESRAMEFAKSYEEASPSTPIFFILSPGVNPLKDVEALGKQMGFSMDLGNFHN 3940
            .||:.|.||.:::|:..::.|..|::.|.|||:.||||.|.:|:...:...::.|::   ....:
  Rat  3508 TDFVIENLGKQFIETPPVDLATLYQDMSSSTPLVFILSTGSDPMGAFQRFARESGYA---ERVQS 3569

  Fly  3941 VSLGQGQEAIAEAAMDTAAKHGHWVVLQNIHLVRKWLPVLEKKLEYYAEDSH---PDYRMFLSAE 4002
            :||||||..|||..:..|.|.|:||.|||.||...|:..:|:.::.:.:.:.   ..:|:|||:.
  Rat  3570 ISLGQGQGPIAEKMIKDATKSGNWVFLQNCHLAVSWMLAMEELIKTFTDPNQSIKDTFRLFLSSM 3634

  Fly  4003 PASTPSAHIIPQGILESSIKITNEPPTGMLANLHKALDNFTQETLEMSGKEAEFKAILFSLCYFH 4067
            |.||     .|..:|::|:|:|||||.|:.||:.:|....|....|.:....:::.::|.:|:||
  Rat  3635 PCST-----FPVTVLQNSVKVTNEPPKGLRANIRRAFTEMTPSFFEENILGMKWRKLIFGICFFH 3694

  Fly  4068 AVVAERRKFGPQGWNKIYPFNVGDLNISVSVLYNYLEANAKVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWD 4132
            |::.||:||||.|||..|.||..|...::..|..|.. ..|:||:.|.|:.|||.|||.:||.||
  Rat  3695 AIIQERKKFGPLGWNICYEFNDSDRECALLNLNLYCH-EGKIPWDALIYITGEITYGGRVTDTWD 3758

  Fly  4133 RRLCITYLEEYMQPDLVDGELFLAPS--FPAPPNTDYQGYHTYVDEMMPAESPYLYGLHPNAEIG 4195
            :|...|.|:.:..|:.::.|...:.|  :.||.....|.:..|::::...:.|.::|:|.||.:.
  Rat  3759 QRCLRTVLKRFFSPETLEDEYTYSESGIYFAPLADSLQEFKDYIEDLPLIDDPEIFGMHENANLV 3823

  Fly  4196 FLTTRAENIFRTVFEMQPRDAGAGGGATVTREDKVKQIVDEIIEKLPEEFNMVEIMNKVEERTP- 4259
            |.......:..|:.|:|||.:..|.|.  :.::.|:::|..|..::||...|......:..:.| 
  Rat  3824 FQYKETNTLITTILEVQPRSSSGGEGK--SNDEIVQELVASIRTRVPESLQMEGASETLFVKDPQ 3886

  Fly  4260 -----YVIVAFQECERMNFLTSEMKRSLKELDLGLKGELTITSDMEVLENSLFLDQVPPIWTQRA 4319
                 ...|..||.:|.|.|...:..||:.|:..:.|.:.::.:||.:..|...:|||.:|:..|
  Rat  3887 GRLNSLTTVLGQEVDRFNNLLKLIHISLETLNKAIAGLVVMSEEMEKVYQSFLNNQVPSLWSNTA 3951

  Fly  4320 YPSLLGLNNWFIDLCLRLRELETWSTDFVL----PSCVWLAGFFNPQSLLTAIMQSTARRNDLPL 4380
            ||||..|.:|..||.||...::.|     |    |...|::|||.||..||..:|:.||:.:||:
  Rat  3952 YPSLKPLGSWVKDLILRTAFVDLW-----LKRGQPKSFWISGFFFPQGFLTGTLQNHARKYNLPI 4011

  Fly  4381 DKMCL----------QCDVTKKQKE-EFTT---------APRDGCCVHGIFMEGARWDIQQGIIM 4425
            |::..          |..|.:..|: :|.|         .|.||..|||:||:.:|||.:..||.
  Rat  4012 DELSFKYNMIPVYRDQALVIEAAKDIQFGTELPMDKELPTPEDGVLVHGMFMDASRWDDKDMIIE 4076

  Fly  4426 ESRLKELYPSMPVINIRAITQDKQDLRNMYECPVYKTRTRG--------PTTYVSNLNLKTKDKP 4482
            ::...::.|.:||::... .|:.:.::.:|..|:|||..|.        .|.:|..:.|.:|...
  Rat  4077 DALPGQMNPMLPVVHFEP-QQNYEPIQTLYHSPLYKTGARAGTLSTTGHSTNFVVTVLLPSKRPS 4140

  Fly  4483 GKWILAGVALLLQ 4495
            ..||..|.|||.|
  Rat  4141 DYWIAKGSALLCQ 4153

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc93ABNP_001262793.1 DHC_N1 204..782 CDD:285571 54/266 (20%)
DHC_N2 1295..1708 CDD:285579 123/438 (28%)
P-loop_NTPase 1841..2071 CDD:304359 143/229 (62%)
P-loop_NTPase 2155..2290 CDD:304359 65/143 (45%)
P-loop_NTPase 2448..2720 CDD:304359 96/274 (35%)
P-loop_NTPase 2797..3064 CDD:304359 117/268 (44%)
MT 3076..3419 CDD:289543 112/342 (33%)
AAA_9 3447..3659 CDD:289547 92/214 (43%)
Dynein_heavy 3799..4486 CDD:281078 223/748 (30%)
Dnah6XP_038964640.1 DHC_N2 887..1307 CDD:400618 124/440 (28%)
DYN1 <1127..3774 CDD:227570 1010/2691 (38%)
AAA_6 1441..1767 CDD:403853 185/325 (57%)
Dynein_C 3827..4152 CDD:408026 96/332 (29%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D1492at2759
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.820

Return to query results.
Submit another query.