DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc93AB and Dnah6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262793.1 Gene:Dhc93AB / 42485 FlyBaseID:FBgn0013812 Length:4496 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038964640.1 Gene:Dnah6 / 117250 RGDID:621797 Length:4156 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4173 Identity:1323/4173 - (31%)
Similarity:2162/4173 - (51%) Gaps:447/4173 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   568 DDEMTICESIYDKQMELKKVGDNLYPN--YNCPPVAAFIRWCHQLETRITAPVKNFKALQHE--- 627
            |.|..:..:|.|....:|.|.:|.:..  |..|.|.         ::.|.....|.|.:.:|   
  Rat   183 DREEVVKANIRDPLQIIKIVHENEHLGFLYMIPAVP---------KSSIEYDTYNLKVVSYENIN 238

  Fly   628 ------ITK---------------TEK-SQEIVERYEILMVKLGSC--KTQFFDDWAGQLDGQIE 668
                  |:|               ||: .||.:...|:..:.:.|.  |.:.|..|...:..:..
  Rat   239 KNDYYTISKDAVTHVFNDDIEYIETERWEQEYLYHRELTKIPIFSLFRKWKAFSVWRKNVRSKKI 303

  Fly   669 ENLKKSLIARDRRHNSLILN--FSAALFSILREVHYMQQMKIEGIPQIAIDFAEKSDVFRSYTLN 731
            ...:|:|     |.|..|:|  ...||..| .::.|  |:...|:..|     ||   |.:|||.
  Rat   304 TGCRKAL-----RKNLFIVNPYLRPALLKI-NDMCY--QLSFMGLCYI-----EK---FHTYTLQ 352

  Fly   732 LEKTIDWYNSIQEGSSPVELRLIEP----------------------EIKMIDDLVEIGVNQLVW 774
            ..|...... :||.:..:|....|.                      |::..:|..:|.:...:.
  Rat   353 EFKAAQVVR-VQEVTERLEYFRFEAKDVVRKSCRFALRAAGFIPDDCEVETHEDYFKINIASFID 416

  Fly   775 NSSDILSYLDKLRKPVAALQNRMDHTQGNLRQIRKIMGVWAKQPLFERRDCKKDT-VLSIDERPD 838
            ..||:.:|.:         ..:|.:|:    |..|            |..|.:.| .:.:::...
  Rat   417 APSDLPTYGE---------SEKMTYTE----QASK------------RHHCMRLTCFIRLNDYLI 456

  Fly   839 RTSKRYAEIQAASIEIHKLLQDNMLQFDMESKQDDAVWLSYVDFVDNIVYENILKTVGVSVGYLA 903
            :.:.....:..|| .:...|.|.:       |:..:     .|.:...:.|:..:.:......:.
  Rat   457 QNTLHVLTVNTAS-SLLNYLSDKL-------KRTPS-----ADVIQKWITEDKPEVIEKKGAPMM 508

  Fly   904 ENMDPENNYAPLFESRLELVEPNLVFVPSLDPEDPM-GFNNMLIELMRDIMKMGSLIK------- 960
            |..:.:.:..|:|.:.|.|...:|:|.|||  ||.: |.:.::......::.:.:|:.       
  Rat   509 EKQEEDESLIPMFLTELILTVQSLLFEPSL--EDFLDGISGIINHFENTVLSVPNLVPDSYFNAF 571

  Fly   961 -----RLKPNEKR-----NYVEMIKENQDIIDMRREILNGVDLVMEEASRFCRQFERYSYLWLDD 1015
                 ..|..||.     :...:.:::::.:.:.::|...:....:.|..:...||::       
  Rat   572 TSPFINKKVEEKTCGPGPSLSAVFEDDRNFLTIIQQIKETIHSAFDSARLYAATFEKF------- 629

  Fly  1016 REECMEYFLEYGRMLDPDEIELILINDPNQPPPQPCQPTIEAFREQIDNYESLFNEIEDIGPFQV 1080
                 :.|.:....||.:.:             :..:|.:|.|..|::.|.....:         
  Rat   630 -----QIFFKENESLDLEAL-------------KEEEPDVEFFSSQLEKYHKQHKD--------- 667

  Fly  1081 FSSWFQVDVRPFRQA---LLNTVCKWGNMFKEHLVTTVTSSL----MNLSHFIRKADEGLLQTVK 1138
                 .|.::|.|..   |::|     ...||.|:.:....|    :.|....:|..:.::...:
  Rat   668 -----SVALKPTRNVGLLLIDT-----KQLKEKLIPSPLRCLEVLNLMLPRLSKKKVDAIISEAQ 722

  Fly  1139 EKDYE---------GLVSIMAYLMQVKERAAKTDEMFEPMQETIQLLKYYDMDIPEEVNVLLQEL 1194
            :.:|:         ..|:.:.:|.:::||....:|....:.:..:|::.|.:..|          
  Rat   723 DAEYKLEFVPTTTIEYVNSLVFLDEIQERIETLEEEGNTVVQMYKLIEQYQVLTP---------- 777

  Fly  1195 PEQWANTKKIASTVKQQVSPLQATEVVSIRNKIALFESHIQLF--------REVFKTYDFFRFDC 1251
            ||.:|    :.:|:|..::.::.....|:.::    ||.|:.|        .::....:..:...
  Rat   778 PEDFA----VFATMKPSITAVRNAIDKSVGDR----ESSIKQFCLHLGRDLEDLNNEVNEVKLLA 834

  Fly  1252 YKPYLL-----MDRINDDMFLCESEMRDIQESG-------SLFEVNIPEFKVLKQCRKELRMLKQ 1304
            ..|.:|     .::|...:...:|.:.|:|:..       ..|:|.:.:|..|::...|||:.:.
  Rat   835 QDPQILDISADPEKIKTMLSDLQSVLDDLQKRAFQYKSYQKNFKVEVSKFDALEEVCAELRLKQL 899

  Fly  1305 LWDYVNIVATSIDDWK--TTPWRK-----VDVENMDIECKKFAKDIRLLDKEMRPWDTFINLEST 1362
            |||       |:.:|.  ...|.|     :|.|.::.:..|:||.:..|:|.:.|......|:..
  Rat   900 LWD-------SLSEWDKLQQEWLKSKFDCLDPEVLNGQVTKYAKFVTQLEKGLPPNSVVPQLKQK 957

  Fly  1363 VKNMLTSLRAVGELQNPAIRERHWNQLMNSTKSLAALPKEVTVKFIMDHE--TTLAELLGLNLHE 1425
            |:.|...|..:.:|:||.::.|||:.:..:..:|           ::|.|  .||..|..|::.:
  Rat   958 VERMKEKLPVINDLRNPTLKPRHWSAIEQTVDAL-----------LVDIEIPLTLERLSELHVFD 1011

  Fly  1426 CEEEVKNIVDKAVKEMSMEKILRDLNTTWTVMEFDHELHPRTGCN---LLKASEELIETLEDNQV 1487
            ..:|:::|..:|..|.::|.||:.:..:|...||  .:.|.....   :|..::::...|:|:.:
  Rat  1012 FAQEIQDISGQASGEAALEIILKKVEDSWKTTEF--VILPHRDSKDVFILGGTDDIQVLLDDSTI 1074

  Fly  1488 CLQNLITSKYIAHFLEEVSTWQNKLMIADQVITVWFEVQRTWTHLESIFMSSEDIRKQLPVDSDR 1552
            .:..:.:|:|:......|..||.:|.:.:|.:..|...||.|.:||||| ::.||::|||.::..
  Rat  1075 NVATIASSRYVGPLKTRVDDWQKQLSLFNQTLEEWLNCQRNWLYLESIF-NAPDIQRQLPAEAKM 1138

  Fly  1553 FDNIDAEFRVLMDEMSVSSNVVASTNRSGLIERLEHLQKELTLCEKALAEYLETKRLAFPRFYFV 1617
            |..:|..::.:|.:::...|.:.:..:.||:|..::....|...:|.|..|||:||:.||||||:
  Rat  1139 FLQVDKSWKEIMRKVNRLPNALRAATQPGLLETFQNNNALLDQIQKCLEAYLESKRVIFPRFYFL 1203

  Fly  1618 SSADLLDVLSNGIQPEMVTKHLTKLFDSIARLKF--------------NRDESNEINTASGMYAK 1668
            |:.:||::|:....|:.|..||.|.||||::|:|              ...|....|....|.:.
  Rat  1204 SNDELLEILAQTRNPQAVQPHLRKCFDSISKLEFALMPPTEGKIPGIDTEPEKVFTNDILAMLSP 1268

  Fly  1669 DGEYVEFNELASIRGPVEVWLNRIQAAMRASLRHYVMEAVIAYEEKQREQWLF-DYPAQVSLCGS 1732
            :||.|...:....||.||.||.:::.||.:|||.....|:..|:.|.|.:|:. .:|:||.|..|
  Rat  1269 EGERVGLGKGLKARGNVEEWLGKVEEAMFSSLRRLCKAAIADYQGKLRTEWVIAGHPSQVILTIS 1333

  Fly  1733 QIWWSTEVNIAFSRLEEGYDNAIKDYYKKQISQLSLLITLLLGELSKGDRQKIMTICTIDVHSRD 1797
            ||.|..::..:. ..|:.:..|::.:.:....:|:.|..::.|.|.|..|..|..:.|||||:||
  Rat  1334 QIMWCRDLTESL-ECEDNHLEALEKFEQVNFERLNALAAIVRGSLPKLHRNIITALITIDVHARD 1397

  Fly  1798 VVAKMIQAKLDSGSAFMWQSQLRHRFDDVEKDCFANICDAEFQYCHEYLGNTPRLVITPLTDRCY 1862
            :|::::|:|:||..:|.||.|||:.:|....:|.|.:..:::.|.:||||..|||||||||||||
  Rat  1398 IVSELVQSKVDSAESFDWQRQLRYYWDVDLDNCVARMALSQYTYAYEYLGACPRLVITPLTDRCY 1462

  Fly  1863 ITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRAIGISVYVFNCSEQMDYQSCGNIYKGLAQTGAW 1927
            :.|..:|.|.:|||||||||||||||||||.:|:.|...|||||:.:||:..|..:.||||:|||
  Rat  1463 LCLMGALQLDLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALAIQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQSGAW 1527

  Fly  1928 GCFDEFNRITVEVLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDKFNFMGEMISCVPTVGIFITMNPGYAGRTELP 1992
            .||||||||.:|||||:|.|:.::::|...|..:|.|.|..|..|.|...|||||||||||||||
  Rat  1528 CCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLITIRNAKAAKLSRFMFEGREIKLVMTCAAFITMNPGYAGRTELP 1592

  Fly  1993 ENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFQDARVLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIK 2057
            :||||||||.||:||::.||.|::|.:|||:.:::||||...:|.||.|.||:|||||:|:||:|
  Rat  1593 DNLKALFRPMAMMVPNYALIAEVILYSEGFESSKILARKMTQMYKLCSEQLSQQDHYDFGMRAVK 1657

  Fly  2058 SVLVVAGSLKRGDPGRPEEEVLMRALRDFNIPKIITDDMPVFMGLISDLFPALDVPRKRDQDFER 2122
            ||||:||||||.:|...|:.||:|||||.|:||.:|||..:|.|:||||||.:.:|.........
  Rat  1658 SVLVMAGSLKRENPDLSEDVVLIRALRDSNLPKFLTDDALLFSGIISDLFPGVQIPEHDYGILHS 1722

  Fly  2123 TVKQAASDLLLQPEDNFILKVVQLEELLEVRHSVFIVGNAGTGKTQVWKTLLRTYQNIKR----K 2183
            |:........||||...:.||:||.|.:.|||.|.:||..|.|||.|::.|..|..|:::    .
  Rat  1723 TIVDVMISQNLQPEICMVKKVIQLYETMLVRHGVMLVGPTGGGKTTVYQVLAETLGNLEKLNTGN 1787

  Fly  2184 PIFND-----LNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSVLMRDQANITGDQPKWIVLDGDIDPMW 2243
            |.:..     ||||::|..||:|.:|..|.||||||.::.:|...|.|.:..|||:.||.:|.:|
  Rat  1788 PFYQPVKTFVLNPKSITMGELYGEVNNVTLEWKDGLMALSVRAAVNDTSEDHKWIISDGPVDALW 1852

  Fly  2244 IESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTPSMRLLFEISNLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWNPYVT 2308
            ||::|||:||||:|.||::|||.|||.:.:|||:.:|:.|:||||||.|:::::|::|.|.|||.
  Rat  1853 IENMNTVLDDNKMLCLANSERIKLTPQVHMLFEVQDLKVASPATVSRCGMVFVDPEELKWMPYVK 1917

  Fly  2309 SWVET--RKIPAE-KSNLVMLFDKYIPPSLETIRVRFKKITPVAEMAHIQMLCHLLNCFLI---- 2366
            :|:.|  :|:..| :..|:.||::|:...|..:..:..:..|..:::.:..||.||...|:    
  Rat  1918 TWMSTLSKKLSEEIREYLLNLFNRYVDDGLRFVNKKCTQAIPQVDISKVTTLCCLLESLLLSKDG 1982

  Fly  2367 --------PANTPADCPKEWHELYFVFACIWAFGSAMFQDQAIDY----RVEFSKWWVNEFKTVK 2419
                    ..||.. |..      |||..:|:.|..:.::....:    |.:|     ::....:
  Rat  1983 NILSLEQMKLNTVV-CQT------FVFCYLWSLGGNLTENHWDSFDTFIRTQF-----DDNPDAR 2035

  Fly  2420 FPPGGTVFDYFLDSETKTFLPWTEKIPKFELDSDLPLQAVIVHTSESIRLRFFLDLLMDKKHPVM 2484
            .|..|.::...:|.:||...||...||.|:...::|...::|.|::::|..:.::.|:..:|.|:
  Rat  2036 LPSSGDLWSIHVDFDTKRLDPWERIIPTFKYSREVPFFEMLVPTADTVRYGYLMEKLLAVRHSVL 2100

  Fly  2485 LVGNAGCGKTVLVNEKLQSLSEN--YAVTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPLEKKAGRNYGPPGNKL 2547
            ..|..|.||:|:....|..:.|:  |....:.|:..|:|...|:|:|..||:|.....|.||||.
  Rat  2101 FTGTTGVGKSVIAKGLLNRIQESAGYVPVYLNFSAQTSSARTQEIIESKLERKRKNILGAPGNKQ 2165

  Fly  2548 LCYFVDDINMPEVDAYGTVQPHTLMRQHLDYGHWYDRNKLTLKDIHNCQYV-ACMNPTSGSFTIN 2611
            :..||||:|||.:|.||:..|..|:||:.|:|.:||||||..|:|.:...| ||..|..|...:.
  Rat  2166 VVIFVDDLNMPRLDRYGSQPPIELLRQYQDFGGFYDRNKLFWKEIQDVTIVSACAPPGGGRNPVT 2230

  Fly  2612 PRLQRHFCVLAVSFPGPESITVMYSSILAQHFANAEQKFTPIVTRMTPNIVAATIALHNKCLQVF 2676
            ||..|||.:|.:..|...|:..::.:||....|:    ||..|.:.:.|||.|.:.::|:.....
  Rat  2231 PRFIRHFSMLCLPMPSEHSLKQIFQAILNGFLAD----FTEAVKQTSSNIVEAAVEIYNRMSVDL 2291

  Fly  2677 LPTAIKSHYIFNLRDISNVFQGLLFSSTECLTGSTDLIRLWQHETQRVYSDKLTDDKDIDSFTKM 2741
            |||..||||:|||||:|...||:|......:.....:.||:.||.|||:.|:|.:::|...|..:
  Rat  2292 LPTPAKSHYVFNLRDLSKCVQGILQCDPGTIREEMQIFRLFCHECQRVFHDRLINNEDKHYFHVI 2356

  Fly  2742 QHDIVKKSFE-EIDESVIFDKPNI---YCHFAGGIGDPKYMPIKGWPELHKLLQEAMSSYN-DLV 2801
            ..::..|.|. .||......||.|   :..|.....|..|..:....::..:||:.:..|| ...
  Rat  2357 LTEMANKHFGIAIDLEYFLSKPIIFGDFIKFGADKADRIYDDLPDIEKIENVLQDYLDDYNLTNP 2421

  Fly  2802 AAMNLVLFEDAMMHVCRINRILESPRGSALLVGVGGSGKQSLARLAAFISSLEVVQIQLKKGYGV 2866
            ..:.||.|:||:.||.||.|::...||:||||||||:|||||.||||.|...:.:||:|.:||..
  Rat  2422 KEVKLVFFQDAIEHVSRIARMIRQERGNALLVGVGGTGKQSLTRLAAHICGYKCLQIELSRGYNY 2486

  Fly  2867 NDLKNEFSGLYLKAGLKNVGIMFLMTDAQIPSEDFLVLINDMLATGEIPDLFPDDEIENIIAGVR 2931
            :....:...||..||:::..::||.||.||..|:||..||::|.:||:|:||..||:|.::|..|
  Rat  2487 DSFHEDLRKLYKMAGVEDKNMVFLFTDTQIVVEEFLEDINNILNSGEVPNLFEKDELEQVLAATR 2551

  Fly  2932 NEVKGAGLVD-TRENCWKFFIDRVRKQLKIVLCFSPVGSTLRVRSRKFPAIINATSINWFHEWPQ 2995
            .:.|..|:.: .|:..:::||.|||::|.||||.||||...|.|.|.||:::|..:|:||.:||:
  Rat  2552 PKAKEVGISEGNRDEVFQYFISRVRQKLHIVLCMSPVGEAFRSRCRMFPSLVNCCTIDWFVQWPR 2616

  Fly  2996 EALISVAMNFLAQNKVLPENHRDSVAKFMAYVHTSVNTTSKVYLQNERRYNYTTPKSYLEQINLY 3060
            |||:||:.:|.:......|..::.::.....||.||:..:..|....||..||||.||||.||||
  Rat  2617 EALLSVSKSFFSVVDTGNEELKEKLSLMCVNVHLSVSHMADRYYSELRRRYYTTPTSYLELINLY 2681

  Fly  3061 IKLLNHKNEDLQSKIERLENGLEKLRSTALQVADLKVKLAVQEIELKEKNEAADALIEIVGIETE 3125
            :.:|..|.:.|.|..:|:.|||.||..|.:.|..:|:.|:..|..|.:|::..:||:|.:.::.|
  Rat  2682 LTMLTEKRKQLVSARDRVTNGLTKLLETNILVDKMKLDLSALEPVLFQKSQDVEALMEKLVVDQE 2746

  Fly  3126 KVQTEKAVADEEEMKVALIADEVSKKQRDCEEDLLKAEPALMAAQDALNTLNKANLTELKSFGSP 3190
            .....:.|..|:|....:.|:|......|.:.||.:|.|||.||..||::|:||:::|::.|..|
  Rat  2747 SADQVRNVVQEDEAIAKVKAEETQAIADDAQRDLEEALPALEAANKALDSLDKADISEIRVFTKP 2811

  Fly  3191 PGAVTNVTAAVMVLLSQGGKVPKDRSWKAAKIAMAKVDTFLDSLINYDKENIHPEITKAIQPYLK 3255
            |..|..|..|:.:||:      ....|..||..:.. ..||..|:.||||||.|:|...:|.|:.
  Rat  2812 PDLVMTVMEAISILLN------AKPDWPTAKQLLGD-SNFLRRLLEYDKENIKPQILSKLQRYIN 2869

  Fly  3256 DPEFEPEFVRSKSGAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRKALAAANAELAAAQDKLAGIKRKVM 3320
            :|:|.||.|...|.|...:|.||..:..:..|..:|||||:.|.||.|||.|....|...:..:.
  Rat  2870 NPDFVPEKVEKVSKACKSMCMWVRAMDLYSRVVKEVEPKRQKLRAAQAELDATITTLKEKQALLK 2934

  Fly  3321 SLEEQLGKLTADFEKATADKLRCQQEADATQATIALANRLVGGLASENVRWAEAVNNFVKQGITL 3385
            .:|||:..|..:::|...:|....:....|:|.:..|.:|...|..|.|||.|::..|.::...:
  Rat  2935 QVEEQIRALQEEYDKGVNEKESLAKTMALTKARLVRAGKLTAALGDEQVRWEESIEKFQEEIANI 2999

  Fly  3386 PGDILLITAFISYVGCFTKGFRIDLLLKMWTPFLKSIDPPIPTTENLDPLSLLTDDTTIAIWTNE 3450
            .|::.:..|.::|.|.||..:| .||::.|.....::|.||..:.:|  ::.|.|...|..|..:
  Rat  3000 VGNVFIAAACVAYYGAFTAQYR-QLLIECWIDSCLALDIPIDPSFSL--INTLGDPYEIRQWNAD 3061

  Fly  3451 GLPSDRMSIENATILSNSDRWPLMIDPQLQGVKWIKQKYGED-LKVIRLGQRSYLDIIEKSINAG 3514
            |||.|.:|.||..:::...|||||||||.|..:||:.|..:. ||||:|...::|.|:|.||..|
  Rat  3062 GLPRDLISTENGILVTQGRRWPLMIDPQDQANRWIRNKESKSGLKVIKLTDTNFLRILENSIRLG 3126

  Fly  3515 CNVLIENIDENLDPVLDSLLGRNLIKKG--KAIKIGDKEIEYNSNFRLILHTKLANPHYKPEMQA 3577
            ..||:|.:.|.|||.|:.:|.:.....|  ..|::||.:|:|:.:||..:.||:.||||.||:..
  Rat  3127 LPVLLEELREVLDPALEPILLKQTFMSGGRLLIRLGDSDIDYDKSFRFYMTTKMPNPHYLPEVCI 3191

  Fly  3578 QTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKAERPDLEELKADLTKQQNDFKIMLKKLEDDLLSRLSSAGEN 3642
            :.|:||||||:.|||||||::||:.|:|:||..:..|..:.|..|..||.:||.:|..|.::..|
  Rat  3192 KVTIINFTVTKSGLEDQLLSDVVRLEKPELEGQRVQLIVRINSDKNQLKSIEDKILKLLFTSEGN 3256

  Fly  3643 ILGDTALVENLETTKSTASEIEQKVAEAKITSKEIDKAREYYRPAAARASLLYFILNELNTINPI 3707
            ||.:..|::.|:.:|.|:..|:.::.||:.|...|:.|||.|||.|.:.|::||::..|:.|:|:
  Rat  3257 ILDNEELIDTLQDSKITSGAIKTRLKEAESTELMINIARERYRPVATQGSVMYFVIASLSEIDPM 3321

  Fly  3708 YQFSLKAFSVVFQKAIAKAEPGDTLDLRVSNLIDCITYSVFQYTSRGLFECDKLIFASQMTFQIL 3772
            ||:|||.|..:|...|..:|..|:|..|::.|:.....:.:...||||||..|||::..:...|:
  Rat  3322 YQYSLKYFKQLFNTTIETSEKSDSLQERLAILLQQTLLTAYTNVSRGLFEQHKLIYSFMLCVDIM 3386

  Fly  3773 LMNEEVTSAELDFLLR--------FPIKPHVTSPVDFLTNQSWGGICSLASKDE----FRNLDRD 3825
            ...|::|.||.:|.||        .|.||.    ..:|..|.|...|.|   :|    |..|.|.
  Rat  3387 RQQEQLTEAEWNFFLRGSAGMEKERPPKPE----APWLPIQMWFSCCDL---EEWFPIFEGLTRH 3444

  Fly  3826 I------------ET--SSKRWKKLVESELPEKEKFPQEW-KNKTALQRLCMIRALRPDRMTYAL 3875
            |            ||  :.:.|:...:....|:::  ..| .|.::..:|.:::..:.:::.:||
  Rat  3445 ILLHPISISLGSFETYINPQSWEGYPKQRHEEEKE--HVWGSNFSSFHKLILVKCCKEEKVVFAL 3507

  Fly  3876 ADFIEEKLGSKYVESRAMEFAKSYEEASPSTPIFFILSPGVNPLKDVEALGKQMGFSMDLGNFHN 3940
            .||:.|.||.:::|:..::.|..|::.|.|||:.||||.|.:|:...:...::.|::   ....:
  Rat  3508 TDFVIENLGKQFIETPPVDLATLYQDMSSSTPLVFILSTGSDPMGAFQRFARESGYA---ERVQS 3569

  Fly  3941 VSLGQGQEAIAEAAMDTAAKHGHWVVLQNIHLVRKWLPVLEKKLEYYAEDSH---PDYRMFLSAE 4002
            :||||||..|||..:..|.|.|:||.|||.||...|:..:|:.::.:.:.:.   ..:|:|||:.
  Rat  3570 ISLGQGQGPIAEKMIKDATKSGNWVFLQNCHLAVSWMLAMEELIKTFTDPNQSIKDTFRLFLSSM 3634

  Fly  4003 PASTPSAHIIPQGILESSIKITNEPPTGMLANLHKALDNFTQETLEMSGKEAEFKAILFSLCYFH 4067
            |.||     .|..:|::|:|:|||||.|:.||:.:|....|....|.:....:::.::|.:|:||
  Rat  3635 PCST-----FPVTVLQNSVKVTNEPPKGLRANIRRAFTEMTPSFFEENILGMKWRKLIFGICFFH 3694

  Fly  4068 AVVAERRKFGPQGWNKIYPFNVGDLNISVSVLYNYLEANAKVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWD 4132
            |::.||:||||.|||..|.||..|...::..|..|.. ..|:||:.|.|:.|||.|||.:||.||
  Rat  3695 AIIQERKKFGPLGWNICYEFNDSDRECALLNLNLYCH-EGKIPWDALIYITGEITYGGRVTDTWD 3758

  Fly  4133 RRLCITYLEEYMQPDLVDGELFLAPS--FPAPPNTDYQGYHTYVDEMMPAESPYLYGLHPNAEIG 4195
            :|...|.|:.:..|:.::.|...:.|  :.||.....|.:..|::::...:.|.::|:|.||.:.
  Rat  3759 QRCLRTVLKRFFSPETLEDEYTYSESGIYFAPLADSLQEFKDYIEDLPLIDDPEIFGMHENANLV 3823

  Fly  4196 FLTTRAENIFRTVFEMQPRDAGAGGGATVTREDKVKQIVDEIIEKLPEEFNMVEIMNKVEERTP- 4259
            |.......:..|:.|:|||.:..|.|.  :.::.|:::|..|..::||...|......:..:.| 
  Rat  3824 FQYKETNTLITTILEVQPRSSSGGEGK--SNDEIVQELVASIRTRVPESLQMEGASETLFVKDPQ 3886

  Fly  4260 -----YVIVAFQECERMNFLTSEMKRSLKELDLGLKGELTITSDMEVLENSLFLDQVPPIWTQRA 4319
                 ...|..||.:|.|.|...:..||:.|:..:.|.:.::.:||.:..|...:|||.:|:..|
  Rat  3887 GRLNSLTTVLGQEVDRFNNLLKLIHISLETLNKAIAGLVVMSEEMEKVYQSFLNNQVPSLWSNTA 3951

  Fly  4320 YPSLLGLNNWFIDLCLRLRELETWSTDFVL----PSCVWLAGFFNPQSLLTAIMQSTARRNDLPL 4380
            ||||..|.:|..||.||...::.|     |    |...|::|||.||..||..:|:.||:.:||:
  Rat  3952 YPSLKPLGSWVKDLILRTAFVDLW-----LKRGQPKSFWISGFFFPQGFLTGTLQNHARKYNLPI 4011

  Fly  4381 DKMCL----------QCDVTKKQKE-EFTT---------APRDGCCVHGIFMEGARWDIQQGIIM 4425
            |::..          |..|.:..|: :|.|         .|.||..|||:||:.:|||.:..||.
  Rat  4012 DELSFKYNMIPVYRDQALVIEAAKDIQFGTELPMDKELPTPEDGVLVHGMFMDASRWDDKDMIIE 4076

  Fly  4426 ESRLKELYPSMPVINIRAITQDKQDLRNMYECPVYKTRTRG--------PTTYVSNLNLKTKDKP 4482
            ::...::.|.:||::... .|:.:.::.:|..|:|||..|.        .|.:|..:.|.:|...
  Rat  4077 DALPGQMNPMLPVVHFEP-QQNYEPIQTLYHSPLYKTGARAGTLSTTGHSTNFVVTVLLPSKRPS 4140

  Fly  4483 GKWILAGVALLLQ 4495
            ..||..|.|||.|
  Rat  4141 DYWIAKGSALLCQ 4153

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc93ABNP_001262793.1 DHC_N1 205..782 CDD:462457 54/266 (20%)
DHC_N2 1292..1707 CDD:462462 124/440 (28%)
DYN1 1305..4143 CDD:227570 1071/2934 (37%)
AAA_6 1841..2167 CDD:463697 185/325 (57%)
MT 3076..3419 CDD:463699 112/342 (33%)
Dynein_C 4198..4494 CDD:465677 96/333 (29%)
Dnah6XP_038964640.1 DHC_N2 887..1307 CDD:462462 124/440 (28%)
DYN1 <1127..3774 CDD:227570 1010/2691 (38%)
AAA_6 1441..1767 CDD:463697 185/325 (57%)
Dynein_C 3827..4152 CDD:465677 96/332 (29%)

Return to query results.
Submit another query.