DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG31213 and Abca14

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_732473.2 Gene:CG31213 / 42382 FlyBaseID:FBgn0051213 Length:1809 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038957098.1 Gene:Abca14 / 365362 RGDID:1561491 Length:1691 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1844 Identity:463/1844 - (25%)
Similarity:840/1844 - (45%) Gaps:342/1844 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 QKYRLLLWKDIKLQLTNWVELVMIIFLSALMPIFFSIGTKVAKSIFPPDIEMEKSP--GPKSVNT 71
            :::.:||||:..|:......||:.|.|..|:.::.....:::|..|.|.:.....|  .|..:|.
  Rat    18 RQFLVLLWKNFLLKSRKVFGLVVEIILIFLLFVWTLTVRRISKKKFIPAMIFNPIPLTLPGFLNQ 82

  Fly    72 SLFVDLYFTPNNGILEQLITQLA--------NISEFKSVE-------------------VFD--- 106
            :...:|.:.|::....:.||::.        .:..|.|.|                   |||   
  Rat    83 NFDYELAYVPSDSNAARNITEMVKKDLNFNFKVQGFSSEESFEKYIKYEDKAEHVLAAIVFDHKF 147

  Fly   107 --TNSELYLQ----LMINR--NAIGIAFPS------EWYDIKSCPEVLNLTIFMPLSIKRKDF-- 155
              :|..|.||    |...|  :...:..||      ||......|.|.:|.   |.::...|.  
  Rat   148 KTSNEPLPLQVKYSLRFGRMYDPENVLKPSERQKETEWNTSILFPSVPSLG---PRNVLENDGGN 209

  Fly   156 -KYFESGFLLLQERISKIFI----------FFKNAGNGKIPRVLMNHFPYPSYVPNHYAESAKAM 209
             .|...||||:|..:.|..:          .|.|.      .:....||||:::.:::..:...|
  Rat   210 PGYIREGFLLVQHSVDKAIMMHHSGRAAEAMFANT------TIYARRFPYPAFIHDNFLWTFIVM 268

  Fly   210 -TYMTLISFFLPCITIAKYVVAEKERHQKAVLTAMGFSNSIHWLAWYTKSMLL--LLLCLLIMIS 271
             .:..|.:|....:.|...::.|||:..|.....:|.||::.|::::...:|:  :::|||..|.
  Rat   269 FPWTILFTFTQMALDIIGTIMLEKEKRLKEYQLMVGLSNAMLWVSYFITFLLMYFIIICLLCGIL 333

  Fly   272 IFSI--GLIYEFSSLVCLMTIFLVYIHSLVLFAFFISSFFSRSLSAVVATILMYFSTALPFLIVG 334
            ...|  ..:::.|..:.:...||.:..|.:|..|.||:||:|:..|......::|.|..|:|||.
  Rat   334 FLKITHERVFQHSDPLFIAFYFLCFAISSMLLGFMISTFFNRASLATSIAGFLHFLTFFPYLIVF 398

  Fly   335 A--ENSSVAAQTAASIGLNSALFYILDSVAVMEMQSVGAQWYTIDNTASSGYKLSIVGYMLIMIS 397
            :  :.:|::.:.|..:..|:||.:..|.:..:||:..|||||......:....|::...:.:.:.
  Rat   399 SLYDQTSLSGKLALCLITNTALAFGTDLICKLEMKGHGAQWYNFATKVNPDDDLTLAHIIGMFLF 463

  Fly   398 ISWIELLICLYIEAVRTGEFEVPQPWSYPFQRRYWCPLRYGSSVFHQGALLPLAGKNSE-GNLPA 461
            .:::..|:..|::||..|::.||:||::..|:.||         |.:.|   |:.:.|: .:|| 
  Rat   464 SAFLYGLVAWYVDAVFPGKYGVPKPWNFFLQKTYW---------FGEPA---LSREESQVSDLP- 515

  Fly   462 AHPTRQPIIYLDDRTQENFQRVNISKKIGIEVRSLSKTFGFRN----VVKDLFFNVYENEITALV 522
                  |..:::...        :..:.||:::.|.|.|..:|    .||||..|:||.:||.|:
  Rat   516 ------PSDFMEPEP--------VDLEAGIQIQHLYKEFTLKNSTLMAVKDLSLNLYEGQITVLL 566

  Fly   523 GHKGSGKTTIIMMLCGILQPTTGTVLINGYDIVTEAKVAKSSLGICPQHSVIFKGMSARDHIYFF 587
            ||.|:||||.:.:|.|:..||.|.|.|:||||.::....:.|||:|||..::|..::..:|:||:
  Rat   567 GHNGAGKTTTLSILTGLYLPTKGKVYISGYDISSDMVQVRKSLGLCPQDDLLFPLLTVSEHLYFY 631

  Fly   588 SRVKGYNKTEAMMESNIYISKLGLVDSQKWDAMRLSPGNQRRLSLACALCAGSKVILCDEPSSGL 652
            ..:||.:.|....|.:..::..||:......:..||.|.:|:||:..||...:||::.|||:||:
  Rat   632 CVIKGISSTNRPREIHRMLTSFGLLQKSNTMSKDLSGGMKRKLSIIIALIGDTKVVILDEPTSGM 696

  Fly   653 DPIGRHELMRFLQKEKHGRTILMTTQQLEEGEILADRIAIMNDGQILCYGTLGYLKQLPFTSYTL 717
            ||:.|..:...||..|..||||:||..::|.::|.|||||:..|.:.|.|:..:||:|....|.|
  Rat   697 DPVSRRAIWDLLQHYKKDRTILLTTHHMDEADVLGDRIAILVMGVLKCCGSSLFLKKLYGVGYHL 761

  Fly   718 SCQMAPNSKADNLTDLVRLYMTTTTSPVFHGVDVSYKLPRSQIDRFPEFFQQLEENKKSLNVVSF 782
            .....|:|....::.|::.|:.|.........::|:.||:....||.|.|..|||.::.|.:..|
  Rat   762 VIVKTPDSDDGKISQLIKNYIPTAEMETNVAAELSFILPKEHTHRFAELFTDLEERQEELGISGF 826

  Fly   783 GVSDSTLDGIYLSLDYGQGSSRLRGGADPGVNDKVEFGVQTDKAIRTKDRANNSLVR------YQ 841
            |||.:|:|.::..:      |.|   ||..:|.::.....|.....:::..|.::.|      |.
  Rat   827 GVSMTTMDEVFFKV------SNL---ADLKLNTEIAQSASTVNPSTSENNENMNVPRNFERSGYS 882

  Fly   842 HQVDPPNETILNTKTPINPIEIWRPIDREKGSCMAQWQAMFIKKKNYT-ASRALIFILILIIPLF 905
            .:.   :::..|...|:               .|.|::|||||:..:: .:..|:.:.:|.:...
  Rat   883 GRY---SDSSFNAGWPL---------------YMQQFRAMFIKRVMFSWRNWKLLLLQLLALQGL 929

  Fly   906 YYIIVLGTAASEKCAHRTDKQPVLPLSLDYYSYDDMIILLEVDKQLYKSEGEAYVQLVKEPATVE 970
            .|:::.|...|      ..|:|...:.|:.|                   ||..|     |.:|.
  Rat   930 TYVLIKGIGFS------VPKEPARVMDLEQY-------------------GETTV-----PFSVS 964

  Fly   971 SVDSIFSHLLKAPPIIRRDIKRK-------------------YVCGASFN-----NASTITAWFN 1011
            ....:...|.|...|:.:|.|:|                   |.|..:|:     ...|.|.|||
  Rat   965 GDPPLTQKLTKNLEIMLKDKKQKVHEVQGGVQDYLLTNKDCIYSCIVAFSLDVTRKEKTFTFWFN 1029

  Fly  1012 SDAFEHSAPIALNLVYNALGKAVFEDQDFSILVNRGDLHDFIWLNNASSMRRRYKRQNDPDYTDY 1076
            ::|: |::|::|:::.|.:                                  :|..:.||.|  
  Rat  1030 NEAY-HASPLSLSILDNII----------------------------------FKYLSGPDAT-- 1057

  Fly  1077 SDYEIQEYDVVVKPNSSS-TSGQHNKSNPGDDNIITVQMSIIEAASTLYNEKGKRKQLFGTLIII 1140
                   ..|..||.... |.|:..:.:.....|:             :|      .|||     
  Rat  1058 -------ITVSNKPQPQPFTKGRSEERSASGIQIV-------------FN------LLFG----- 1091

  Fly  1141 TAYIALCLSIFSIFVTKERVEHFKMQQEIYGVTLFYFWST--------HFVGDFLIYAIYMGA-- 1195
               :::..|.|.:....|||...|..|.:.||....||.:        |||...|:..:::..  
  Rat  1092 ---MSIFTSGFCLMTVTERVSKAKHIQFVSGVYTLNFWLSALLWDLIIHFVACVLLLLVFLYTDV 1153

  Fly  1196 -LTIAIYHFTIWYQVVVMLLLIGFACLPFVYLCSLLFSLPNIAFAGIFAILVMTGGMLFSFMYML 1259
             :.:..|:|   ...:::|:|.|::.:||:||.|..::....|:..||......|.|......::
  Rat  1154 HILLENYNF---LDTMLILMLFGWSIIPFIYLLSFWYNNSTNAYIKIFVFNHCLGFMSIIVDAVV 1215

  Fly  1260 TLITDVNFTT------VFAILPMYVGTFGLFKCLAWREYCNREVLPPIEELDCKFGNCNVFCACK 1318
            .||.|:..:|      ...:||:|.....:||..:.:|         |.:|....|:.|.|..|:
  Rat  1216 ELIPDIKTSTKNLILNSLLLLPIYNFGMSIFKYYSIQE---------IRKLCSSLGSLNTFSGCQ 1271

  Fly  1319 PERT---------WMEVWLLMVHCLVWFIFL-------W--------FSNFG-YEIGYRFKPKLS 1358
            .|.|         ...|..:....|::|:|:       |        :..|| |:|.|  |.::|
  Rat  1272 HELTVYSMDKRAIGRHVTAMAATGLIYFLFIILLETTSWNLKAFIYRYVLFGIYKIFY--KARMS 1334

  Fly  1359 NRIWHNNEKHIRVLDE----ERRVGLIPKYEHEDYPIIVDQVTKNYCRAKN--AVQLVSFAIRPG 1417
            ..:..::|      ||    ||...|...:...:..:::.::.|.|.:...  ||:.:|..|:..
  Rat  1335 KELSGDSE------DEDVQNERETILQHSWHSLNSTVLIKKLIKIYFKIPPTLAVRNISLTIQKE 1393

  Fly  1418 DTFGLLGAQGAGKTSIFQMIAGETSMSHGNIYVRGHSLREHRNAAKMEVGFCPQGDNAPKYLTGR 1482
            :.|||||..|||||:.|:::.||...:.|::::.|:|:..:....:.::|:|||.|....|:|.|
  Rat  1394 ECFGLLGLNGAGKTTTFKILTGEEIATSGDVFIEGYSITRNILKVRSKIGYCPQFDALLDYMTSR 1458

  Fly  1483 QLLRIHCLLHGVPKDHIKAVSEQMAIEFNFKDQLDRPIHTYSGGKKRKLNIALAI-DSGSVLCLD 1546
            ::|.::..:.|:|:::|::....:......|.|.::.|:|.|||.||:|:.|:|| .:.||:.||
  Rat  1459 EILTMYARVWGIPENNIRSYVNNLLKMLYLKPQAEKFIYTLSGGNKRRLSTAIAIMGNSSVVFLD 1523

  Fly  1547 DTNGSVDHATQRFIWRKLEAVKRSGRPVLLTTQSMEEANAVCSRVAFLVAGEMMFIGSLQQVRSE 1611
            :.:..:|...:|.:|..:...:.||:.:::|:.||||..|:|:|:|.:|.|:::.:||.|.::::
  Rat  1524 EPSTGMDPLARRMLWNAVIRTRESGKVIIITSHSMEECEALCTRLAIMVQGKLVCLGSPQHLKNK 1588

  Fly  1612 VSN--TIVIRLRVNPSDGKLKRRFQQLIADMAELFPLATLHEALETCLIYHININVTTLANLFYQ 1674
            ..|  |:.|:.:....|..:    |.|...:||:||.:.|.:..:..|.|:|.....:...:|..
  Rat  1589 FGNIYTMNIKFKTGTDDDVV----QDLKNYIAEVFPGSDLKQENQGILNYYIPSKDNSWGKVFGI 1649

  Fly  1675 MEKIRNEGLLEDYSITQVSLDEIY 1698
            :||.:.:..||||||:|::|::::
  Rat  1650 LEKAKEDYNLEDYSISQITLEQVF 1673

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG31213NP_732473.2 rim_protein <118..1698 CDD:130324 432/1695 (25%)
Abca14XP_038957098.1 rim_protein <100..1681 CDD:130324 445/1762 (25%)

Return to query results.
Submit another query.