DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG31213 and Abca5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_732473.2 Gene:CG31213 / 42382 FlyBaseID:FBgn0051213 Length:1809 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_775429.1 Gene:Abca5 / 286970 RGDID:628661 Length:1642 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1885 Identity:436/1885 - (23%)
Similarity:786/1885 - (41%) Gaps:433/1885 - (22%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 RNLTYCQKYRLLLWKDIKLQLTNWVELVMIIFLSALMPIFFSIGTKVAKSIFP-------PDIEM 60
            |::...::.|.||.|:..::.......|..|    |.|:||.....:...:.|       .|||:
  Rat     6 RDVGVWRQTRTLLLKNYLVKCRTKKSSVQEI----LFPLFFLFWLILISMMHPNKKYEEVSDIEL 66

  Fly    61 EKSPGPKSVNTSLFVDLYFTP----NNGILEQLITQLANISEFKSVEVFDTNSELYL-QLMINRN 120
              ||..||:.::|.  |.:||    .:.:::::.|.  ::.:....|.:.:..||.. .|....|
  Rat    67 --SPMDKSILSNLI--LGYTPVTNTTSSVMQRVSTD--HLPDVLVTEEYASEKELLASSLSKPSN 125

  Fly   121 AIGIAFPSEW-YDIKSCPEVLNLTIFMPLSIKRKDFK-----------YFESGFLLLQERISKIF 173
            .:|:.|.... |:::..|::      :|:|....|.:           |:.|||..||..|....
  Rat   126 FVGVVFKDVMSYELRFFPDM------VPVSSVYMDSRAGCSKSCDAAQYWSSGFTALQASIDAAI 184

  Fly   174 IFFKNAGN-------------GKIPRVLMNHFPYPSYVPNHYAESAKAMTYMTLISFFLPC-ITI 224
            |..|...:             |:...|.::.||             :.:..:.|:..|.|. ..:
  Rat   185 IQLKTNVSLWRELESTKAVIMGEAAVVEIDTFP-------------RGVILIYLVIAFSPFGYFL 236

  Fly   225 AKYVVAEKERHQKAVLTAMGFSNSIHWLAWYTKSMLLLLLCLLIMISIFSIGLIYEFSSLVCLMT 289
            |.::|||||:..|..|..||..::..||:|......|:.|..|:|..|.:...::..||.:.:..
  Rat   237 AIHIVAEKEKRLKEFLKIMGLHDTAFWLSWVLLYTSLIFLMSLLMAVIATASSLFPQSSSIVIFL 301

  Fly   290 IFLVYIHSLVLFAFFISSFFSRSLSAVV----ATILMYFSTALPFLIVGAENS-----SVAAQTA 345
            :|.:|..|.|.||..::..|.:|....|    .|::..|...|..|:.....|     |...|.|
  Rat   302 LFFLYGLSSVFFALMLTPLFKKSKHVGVVEFFVTVVFGFVGLLIVLVESFPRSLVWLFSPLCQCA 366

  Fly   346 ASIGLNSALFYILDSVAVMEMQ--SVGAQWYTIDNTASSGYKLSIVGYMLIMISISWIELLICLY 408
            ..||:          ..||.::  :.||.:.::   ....|.|.|...||.:.|:.:  .|:.:|
  Rat   367 FLIGI----------AQVMHLEDFNEGALFSSL---TEGPYPLIITLTMLALDSVFY--ALLAVY 416

  Fly   409 IEAVRTGEFEVPQPWSYPFQRRYWCPLRYGSSVFHQGALLPLAGKNSEGNLPAAHPTRQPIIYLD 473
            ::.|..|||.:.:...|..:..||...:.......:|        |..||: :.:...:|:    
  Rat   417 LDQVIPGEFGLRRSSLYFLKPSYWSKNKRNYKELSEG--------NINGNI-SLNEIVEPV---- 468

  Fly   474 DRTQENFQRVNISKKIG---IEVRSLSKTFGFRN----VVKDLFFNVYENEITALVGHKGSGKTT 531
                       .|:.||   |.:..:.|.:..:|    .:::|.|::||.:||||:||.|:||:|
  Rat   469 -----------SSEFIGKEAIRISGIQKAYRKKNETVEALRNLSFDIYEGQITALLGHSGTGKST 522

  Fly   532 IIMMLCGILQPTTGTVLINGYDI--VTEAKVAKSSLGICPQHSVIFKGMSARDHIYFFSRVKGYN 594
            ::.:|||:..|:.|...|.|:.:  :.|...|:..:|||||..:.|..::..:::...:.|||..
  Rat   523 LMNILCGLCPPSDGFASIYGHRVSEIDEMFEARKMIGICPQSDMNFDVLTVEENLSILASVKGIP 587

  Fly   595 KTEAMMESNIYISKLGLVDSQKWDAMRLSPGNQRRLSLACALCAGSKVILCDEPSSGLDPIGRHE 659
            ....:.|....:..|.:...:...|.:||.|.:|:|||..|:....|::|.|||::|:||..||.
  Rat   588 ANNIIQEVQKVLLDLDMQAIKDNQAKKLSGGQKRKLSLGIAVLGNPKILLLDEPTAGMDPCSRHI 652

  Fly   660 LMRFLQKEKHGRTILMTTQQLEEGEILADRIAIMNDGQILCYGTLGYLKQLPFTSYTLSCQMAPN 724
            :...|:..|..|..:.:|..::|.:|||||.|:::.|.:.|.|:..:||......|.||..:...
  Rat   653 VWNLLKYRKANRVTVFSTHFMDEADILADRKAVISQGMLKCVGSSIFLKSKWGIGYRLSMYIDRY 717

  Fly   725 SKADNLTDLVRLYMTTTTSPVFHGVDVSYKLPRSQIDRFPEFFQQLEENKKSLNVVSFGVSDSTL 789
            ...::|:.|||.::........:...:.|.||...:|:|...|..|:.: .:|.|:|:|||.:||
  Rat   718 CATESLSSLVRQHIPAAALLQQNDQQIVYSLPFKDMDKFSGLFSALDIH-SNLGVISYGVSMTTL 781

  Fly   790 DGIYLSLDYGQGSSRLRGGADPGVNDKVEFGVQTDKAIRTKDRANNSLVRYQHQVDPPNETIL-- 852
            :.::|.|:.            ....|:.::.|.|.:. |.::..:.|.       |...:::|  
  Rat   782 EDVFLKLEV------------EAEIDQADYSVFTQQP-REEETDSKSF-------DEMEQSLLIL 826

  Fly   853 -NTKTP-INPIEIWRPIDREKGSCMAQWQAMFIKKKNYTASRALIFILILI-IPLFYYIIVLGTA 914
             .||.. ::.:.:|    :::.|.:|::..:.:|:::.:....|:.:||.. :.:|.:::     
  Rat   827 SETKASLVSTMSLW----KQQVSTIAKFHFLSLKRESKSVRSVLLLLLIFFAVQIFMFLV----- 882

  Fly   915 ASEKCAHRTDKQPVLPLSLDYYSYDDMIILLEVDKQLYKSEGEAYVQLVKEPATVESVDSIFSHL 979
                  |.:.|..|:|:.|    ..|:..|...||. :|.:....:|        .|.||..:.|
  Rat   883 ------HHSFKNAVVPIKL----VPDLYFLKPGDKP-HKYKTSLLLQ--------NSTDSDINDL 928

  Fly   980 LKAPPIIRRDIKRKYVCGASFNNASTITAWFNSDAFEHSAP--IALNLVYNALGKAVFEDQDFSI 1042
            :.                 .|...:.|.|.||...:..:||  .|||:|.:.      :|..|:.
  Rat   929 ID-----------------FFTQQNIIVAMFNDSDYVSAAPHSAALNVVQSE------KDYVFTA 970

  Fly  1043 LVNRGDLHDFIWLNNASSMRRRYKRQNDPDYTDYSDYEIQEY-DVVVKPNSSSTSGQHNKSNPGD 1106
            :.|...::....:.|..|....|..........:|...|||. |:|.|                 
  Rat   971 VFNSTMVYSLPVMMNIISNYYLYHLNVTDTIQIWSTPFIQEITDIVFK----------------- 1018

  Fly  1107 DNIITVQMSIIEAASTLYNEKGKRKQLFGTLIIITA---YIALCLSIFSIFVTKERVEHFKM--- 1165
                      :|    ||.:..    |.|  ||:||   |.|:           |..|:.|:   
  Rat  1019 ----------VE----LYFQAA----LLG--IIVTAMPPYFAM-----------ENAENHKIKAY 1052

  Fly  1166 -QQEIYGVTLFYFWSTHFVGD----FLIYAIYMGALTIAIYHFTIWYQV---VVMLLLIGF--AC 1220
             |.::.|:....:|....|.|    |::..:.:|:| .|.:|...:|.|   .|:..||.:  :.
  Rat  1053 TQLKLSGLLPSAYWIGQAVVDIPLFFVVLTLMLGSL-FAFHHGLYFYPVKFLAVVFCLIAYVPSV 1116

  Fly  1221 LPFVYLCSLLFSLPNIAFAGIFAILVMTGGMLFSFMYMLT-----LITDVNF------TTVF--- 1271
            :.|.|:.|..|.            .::.....:||:|.:|     .:|::.|      |.||   
  Rat  1117 ILFTYIASFTFK------------KILNTKEFWSFIYSVTALACVAVTEITFFLGYGVTAVFHYT 1169

  Fly  1272 --AILPMYVGTFGLFKCL------AWREYCNREVLPPIEELDCKFGNCNVFCACKP-ERTWMEVW 1327
              ..:|:|    .|..||      :|:.      :|..|.            |..| :|..:.|.
  Rat  1170 FCIAIPIY----PLLGCLISFIKGSWKN------IPKTEN------------AYNPWDRLLVAVI 1212

  Fly  1328 LLMVHCLVWFIFLWFSNFGYEIGYRFKPKLSNRIWHNNEKH----------IRVLDEERRVGLIP 1382
            :..:.|::| |||                    :.|..:||          .|.|.:        
  Rat  1213 MPYLQCVLW-IFL--------------------LQHYEKKHGGRSIRKDPLFRALSQ-------- 1248

  Fly  1383 KYEHEDYP---------------------------------IIVDQVTKNYCRAKN--------- 1405
            |.:|:.:|                                 |:|..:.|.|...|:         
  Rat  1249 KAKHKKFPEPPINEDEDEDVKAERLKVKELMGCQCCEEKPAIMVYNLHKEYDDKKDFLHSRKTTK 1313

  Fly  1406 -AVQLVSFAIRPGDTFGLLGAQGAGKTSIFQMIAGETSMSHGNIYV---RGHSLREHRNAAKMEV 1466
             |.:.|||.::.|:..||||..||||::|..::.|:...:.|.|::   ..||..:..:...|  
  Rat  1314 VATKYVSFCVKKGEILGLLGPNGAGKSTIINILVGDVEPTSGKIFLGDYGSHSNEDDESTKCM-- 1376

  Fly  1467 GFCPQGDNAPKYLTGRQLLRIHCLLHGVPKDHIKAVSEQMAIEFNFKDQLDRPIHTYSGGKKRKL 1531
            |:|||.:.....:|.::...|:..:.|:....:|.|..::....:.|:.|.:.:.....|.||||
  Rat  1377 GYCPQTNPLWPDITLQEHFEIYGAVKGMSSGDMKEVISRITKALDLKEHLQKTVKKLPAGIKRKL 1441

  Fly  1532 NIALA-IDSGSVLCLDDTNGSVDHATQRFIWRKLE-AVKRSGRPVLLTTQSMEEANAVCSRVAFL 1594
            ..||: :.:..|..||:.:..:|...::.:||.:. |.|...|..||||..||||.|||.|||.:
  Rat  1442 CFALSMLGNPQVTLLDEPSTGMDPRAKQHMWRAIRTAFKNKKRAALLTTHYMEEAEAVCDRVAIM 1506

  Fly  1595 VAGEMMFIGSLQQVRSEVSNTIVIRLRV-----NPSDGKLKRRFQQLIADMAELFPLATLHEALE 1654
            |:|::..||::|.::|:......:.:::     |....:|:|..|.       :||.|:..|:..
  Rat  1507 VSGQLRCIGTVQHLKSKFGKGYFLEIKLKDWIENLEIDRLQREIQY-------IFPNASRQESFS 1564

  Fly  1655 TCLIYHI-NINVTTLANLFYQMEKIRNEGLLEDYSITQVSLDEIYRIL---NDEEDPNLVDLDST 1715
            :.|.|.| ..:|.:|:..|.::|:.::...:|:||.:|.:|::::..|   .:|||.:...|:||
  Rat  1565 SILAYKIPKEDVQSLSQSFAKLEEAKHTFAIEEYSFSQATLEQVFVELTKEQEEEDNSCGTLNST 1629

  Fly  1716  1715
              Rat  1630  1629

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG31213NP_732473.2 rim_protein <118..1698 CDD:130324 401/1736 (23%)
Abca5NP_775429.1 rim_protein <107..1618 CDD:130324 406/1761 (23%)

Return to query results.
Submit another query.