DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mrp5 and mrp-7

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262747.1 Gene:Mrp5 / 42362 FlyBaseID:FBgn0038740 Length:1408 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_507812.3 Gene:mrp-7 / 180289 WormBaseID:WBGene00003413 Length:1525 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1388 Identity:482/1388 - (34%)
Similarity:752/1388 - (54%) Gaps:157/1388 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    12 NPREKSNIFSSLMFCFAMPTFFKGRKKTLDENDLYRALQEHRSDHLGSK-LSAAWEKEVEKKRKK 75
            :|..:|:..:.|...:.....:.|.::.|:.:|::..     ::..|:: ||..||...|.||.|
 Worm   207 SPELQSSFLNRLTLWWFNSIPWTGARRDLEIDDIFEL-----NERSGTEFLSELWESFWEPKRLK 266

  Fly    76 ---------KK-----------TPSLLKASMNVFGWRLAGLGLVLFILEIGFRVTQPLFLGGLVA 120
                     ||           .||::.:...:|.|.......:.|:.:. .:...|..|..|:.
 Worm   267 YIHDTSIWAKKDPSEQEKDPVVIPSVVSSLFMMFRWEFLLASTLKFVSDT-MQFASPFLLHELLN 330

  Fly   121 YYA--DASNQEGDNQTKAYLYALGVILTSACNV--LFMHPYMLGMFHIGMKARIAMTSMIYRKAL 181
            :.:  :|...:|        .||.:::.|...:  |.::.|...||.:|.|.:.::|:.:|:|.|
 Worm   331 FISAKNAPFWKG--------MALSILMFSVSELRSLILNGYFYIMFRMGTKIQTSLTAAVYKKTL 387

  Fly   182 RLSRTALGDTTIGQVVNLISNDVGRLDVSVIHMNYLWLGPVEIGIITYLMYREIGISAFFGVAVM 246
            .:|.:|..|.|:|::|||::.||.|..:....:...|..|.:|......::..:|.||..||.:|
 Worm   388 LISNSARRDRTVGEIVNLMAIDVERFQMITPQIQQFWSCPYQITFALVYLFITLGYSALPGVVIM 452

  Fly   247 LLFIP---LQAYLGKKTSVLRLKTALRTDERVRMMNEIISGIQVIKMYAWEIPFSKMINYVRTKE 308
            ::|:|   :.:.:.:|..:.::|.   .|||.:|:||:::||:|:|:||||:|....|:.:||||
 Worm   453 VIFVPMNIISSMIVRKWQIEQMKL---KDERTKMVNEVLNGIKVVKLYAWEVPMEAYIDEIRTKE 514

  Fly   309 MNAIRNVNYIRGTLQSFIMFVTRISVFVSLVGFVLL--GKLLTAEKAFVITAYYNILRNTMTVYF 371
            :..|:....:|..|.||......:....|...|||.  ..|||.:.|||..|.:|.||:.||: .
 Worm   515 LALIKKSAMVRNILDSFNTASPFLVALFSFGTFVLSNPSHLLTPQIAFVSLALFNQLRSPMTM-I 578

  Fly   372 PMGISQFAELLVSIRRIQTFMLHEETKVRDKSEDLDEQKLGKAGLIAEPTVAQTTGVLKPSSRRT 436
            .:.|:|..:.:||.:|::.|::         :|:|||:.:.::..|                   
 Worm   579 ALLINQAVQAVVSNKRLKEFLV---------AEELDEKCVDRSVNI------------------- 615

  Fly   437 SEAEHSIV-ISKLKAKWDQKNT--DNTLDNISLKFKPRQLVAVIGPVGSGKSSLIQAVLGELNPD 498
             |..|:.| :..|.|.||.:..  :.||.::.|......|:||:|.||||||||:||:|||:...
 Worm   616 -ERSHNAVRVENLTASWDPEEAAGEKTLQDVDLTAPRNSLIAVVGKVGSGKSSLLQALLGEMGKL 679

  Fly   499 SGSVKVNGTLSYASQEPWLFTGTVRQNILFGLPMDKHRYRTVVKRCALERDFELLPYADKTIVGE 563
            .|.:.|||.::|..|:||:...|:|.||.||.|.|:.||..|:..|||:.|.::||..|:|.:||
 Worm   680 RGRIGVNGRVAYVPQQPWIQNMTLRDNITFGRPFDRKRYDQVLYACALKADIKILPAGDQTEIGE 744

  Fly   564 RGASLSGGQKARISLARAVYRKADIYLLDDPLSAVDTHVGRHLFDQCM--RGFLREEIVLLVTHQ 626
            :|.:||||||||:|||||||:..|:|||||||||||.|||||:|::.:  .|.|||:..:||||.
 Worm   745 KGINLSGGQKARVSLARAVYQNLDVYLLDDPLSAVDAHVGRHIFEKVIGPNGLLREKTRILVTHG 809

  Fly   627 LQFLEQADVIVIMDKGKISAMGTYESMAK-SGL--DFAQMLTDPSKKDEGAGDA----------- 677
            |.:.:.||.|::|.:|||...||:|.:.| .||  ||.:.....|.....||.:           
 Worm   810 LTYTKMADEILVMLEGKIEESGTFEHLIKRRGLFFDFMEEYKSGSDNSSEAGGSQDDDFEAIGGE 874

  Fly   678 ------PDKKSLSRQNS--------KLRDRHGSISSME------SAAESLAAESPMQTQEGRVEG 722
                  |:...|:..|.        :|..:..::||.|      |.|.:..:::.:..:||..:|
 Worm   875 IQDYMNPEDVVLTVTNDLDETIRTPELTTQISTMSSPEKPPTGTSPAAATESQNKLIKKEGIAQG 939

  Fly   723 RIGMKLYKKYFGANGYGLFIVFAFFCIGAQVLASGGDIFLSYWVNK-NGEAERDTFMARLRRAFP 786
            ::.:..|:.|..|.||.|.|.|..|.|....|    .|..|:|::. :.|.:.|:         |
 Worm   940 KVEIATYQLYVKAAGYLLSIAFIGFFIVYMTL----QILRSFWLSAWSDEYDPDS---------P 991

  Fly   787 ETRINADTDPVDIYYFTGINVSVIIFSLVRSMLFFYLAMRSSTTLHNTMFQGVTRAAMHFFNTNP 851
            .....|....:.:|...|.:.:...|..:.:::|  :..|:|..||..:...:.|:.|.|::|.|
 Worm   992 SAHPMAKGWRLGVYGALGFSETACFFVALLALVF--VGQRASKNLHGPLIHNLMRSPMSFYDTTP 1054

  Fly   852 SGRILNRFSKDLGQVDEILPS----VMMDVMQIFLAIVGIVVVLCIINVWYI-LATVFLVIVFYL 911
            .||||||.:||:..:|.:||.    ::|.|:|:...::.|::...:..|..: ||.::|:.:.| 
 Worm  1055 LGRILNRCAKDIETIDMMLPMNFRYLVMCVLQVAFTLIVIIISTPLFAVVILPLALIYLIFLRY- 1118

  Fly   912 LRVFYLSTSRDVKRLEAVTRSPIYSHLSASLNGLATIRAFGAQKELIAEFDNYQDMHSSGYYMFL 976
                |:.|||.:||||:|.|||||||...::.|.|:|||||...|...:.....|......|..|
 Worm  1119 ----YVPTSRQLKRLESVHRSPIYSHFGETIQGAASIRAFGKVDEFRQDSGRILDTFIRCRYSSL 1179

  Fly   977 ATSRAFGYWLDCV--CVVYIAVITLSFFLFSPENG-----GDVGLAITQAMGMTGMVQWGMRQSA 1034
            .::|.....|:.|  |:::.|.:   |.:.|.|.|     |.:|::::.|:.:|.::.:.:||.:
 Worm  1180 VSNRWLAVRLEFVGNCIIFFAAL---FAVLSKEFGWITSPGVIGVSVSYALNITEVLNFAVRQVS 1241

  Fly  1035 ELENTMTAVERVVEYEDLEPEGDFESKPNKKPPKDWPEDGKIVFDDLSLKYFPDKAADYVLRSLN 1099
            |:|..:.:||||.||.:...|..:..: .::|...||..|.:.||..|.:|  .:..|.||..::
 Worm  1242 EIEANIVSVERVNEYTNTPNEAPWRIE-GREPAPGWPSRGVVKFDGYSTRY--REGLDLVLHDIS 1303

  Fly  1100 IAIEGCEKVGIVGRTGAGKSSLINALFR-LSYNEGAILIDRRDTNDLGLHDLRSKISIIPQEPVL 1163
            ..:...||:||||||||||||...|||| :....|.|:||..:.:.:|||||||.|:||||:|||
 Worm  1304 ADVAAGEKIGIVGRTGAGKSSFALALFRMIEAAGGRIVIDDVEVSQIGLHDLRSNITIIPQDPVL 1368

  Fly  1164 FSGTMRYNLDPFDEYSDAKLWESLEEVKLKQVVADLPSGLQSKISEGGTNFSVGQRQLVCLARAI 1228
            ||||:|:|||||..|||.::|.:||...||...|.||.||..||||.|.|.||||||||.||||:
 Worm  1369 FSGTLRFNLDPFFTYSDDQIWRALELAHLKHFAAGLPDGLLYKISEAGENLSVGQRQLVALARAL 1433

  Fly  1229 LRENRILVMDEATANVDPQTDALIQTTIRNKFKDCTVLTIAHRLHTVMDSDKVLVMDAGKAVEFG 1293
            ||..|:||:|||||.||..||||||.|||.:||:|||.||||||:|:||.|:::|:|.|..:||.
 Worm  1434 LRHTRVLVLDEATAAVDVATDALIQETIREEFKECTVFTIAHRLNTIMDYDRIMVLDKGSILEFD 1498

  Fly  1294 SPFELLTTSEKKVFHSMVKQTGD 1316
            :| :.|...:...|..||....:
 Worm  1499 TP-DALMADKNSAFAKMVADAAE 1520

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mrp5NP_001262747.1 MRP_assoc_pro 79..1315 CDD:188098 465/1297 (36%)
mrp-7NP_507812.3 MRP_assoc_pro 14..1518 CDD:188098 482/1384 (35%)

Return to query results.
Submit another query.