DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dys and Utrn

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001036722.1 Gene:Dys / 42327 FlyBaseID:FBgn0260003 Length:3598 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006227699.1 Gene:Utrn / 25600 RGDID:3947 Length:3424 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3815 Identity:1094/3815 - (28%)
Similarity:1739/3815 - (45%) Gaps:803/3815 - (21%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     8 DERQHIQKKTFTKWINSHLIDTQCTPVKDLFLDLRDGHRLLALLSTLTQTNLKPEKGRMRVHHIN 72
            ||...:||||||||||:....:...|:.|:|.||:||.:||.||..||.|:|..|:|..|||.:|
  Rat    32 DEHNDVQKKTFTKWINARFSKSGKPPINDMFSDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALN 96

  Fly    73 NLNKVITEIQQHGVKLVNISSDDIVGGNAKLTLGLIWLIALEFNGQHLVKSHSSN----GVEKSL 133
            |:|:|:..:.|:.|:||||...|||.||.||||||:|.|.|.:..:.::|...|:    ..||.|
  Rat    97 NVNRVLQVLHQNNVELVNIGGTDIVDGNPKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDIMSDLQQTNSEKIL 161

  Fly   134 LAWARQYTEPHGLQLN--DFSSSWSDGRAFLMILDAHVEEL-NLQAALQQHALKRLHLAFDLAHR 195
            |:|.||.|.|:. |:|  :|::||:||.||..:|..|..:| :....::....:||..||..||.
  Rat   162 LSWVRQTTRPYS-QVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDRVVKMSPTERLEHAFSKAHT 225

  Fly   196 HFKIEKLLDAEDVHTHKPDNKSIQMYVMCLYHAMESMRTRQQEQEQDEGQDQDPGRVPCTSITDL 260
            :..||||||.|||....||.|||.||:..|:..:                   |.:|...:|.::
  Rat   226 YLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSLFEVL-------------------PQQVTIDAIREV 271

  Fly   261 DEVPLDNDQTSLGLYTSDSAGSMEQRSSGELKTHSMRPL----STATNASVEISGYQSALEAVLT 321
            :.:|..        |..:..|......|..|......|.    ||.|...:::..||.|||.|||
  Rat   272 ETLPRK--------YKKECEGEEINIQSAVLTEEGQSPRAETPSTVTEVDMDLDSYQIALEEVLT 328

  Fly   322 LLLEDEQLLSQNLPDPQDFQTAKLQFHENESFMLKLTEHQEYVGEALEEGSNLINESQKAGAGLS 386
            .||..|....:......|.:..|.||..:|:||::||.||..||..|:.|:.|:.:..     ||
  Rat   329 WLLSAEDTFQEQDDISDDVEDVKEQFATHETFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLMTQGT-----LS 388

  Fly   387 QEDQNEVRQQMVLLNERWETLRLRALDVQAKILMRLAEFQKQKLEQLRQFLTSVEDRISHMSD-- 449
            .|::.|:::||.|||.|||.||:.:::.|:::...|.|.||::|:||..:||..|:||..|..  
  Rat   389 DEEEFEIQEQMTLLNARWEALRVESMERQSRLHDALMELQKKQLQQLSGWLTLTEERIQKMESLP 453

  Fly   450 IGPTLEEAEKQLLEAQKLKADLSEQQELVDSLSSMVVIVNDTSGNFND--LEDRLSALGERWSHV 512
            :|..|...:..|.|.:.|::||..:|..|:||:.|||||::.||....  |||:|..|||||:.|
  Rat   454 VGDDLPSLQNLLEEHKSLQSDLEAEQVKVNSLTHMVVIVDENSGESATAVLEDQLQKLGERWTAV 518

  Fly   513 VKWSDLRKEKLQQY----------KC-ISRWLDAREQDLKLMES---RDVTDVGGITQRINELNY 563
            .:|::.|..:||:.          :| :..||..:|:.|..:::   :|..::|...:|:..|  
  Rat   519 CRWTEERWNRLQEINILWQELLEEQCLLEAWLTEKEEALNKVQTGNFKDQKELGVSVRRLAIL-- 581

  Fly   564 CAKDLLELQRYLIDLRQMVAATLQDGDDKG---------ERVLIQLESYEDRLDALKQIVEVQTV 619
              |:.:|::|..:|....:      |.|.|         |::....|....|.|:|.|.:|..:.
  Rat   582 --KEDMEMKRQTLDQLSEI------GQDVGQLLSNPKASEKMNSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSN 638

  Fly   620 RIETKGFNFGRDRASYDD---SRVVRPEGW--------------------VDYQMIIRFGEDDSQ 661
            ::.......|..:....|   :..||.:|.                    ||.:...:|  |.:.
  Rat   639 QVTQAVAKLGMSQIPQKDLLETVHVREQGMIKKPKQELPPPPPPKKRQIHVDVEAKKKF--DATS 701

  Fly   662 EDDDEHDLASKKRKLRNADNFNALENHIMEHFGYVQEV------------EQKLQQLQRQSLRQQ 714
            .:.....|.||.          ||:|..|..:...||.            |||.:..|...|.|.
  Rat   702 AELQSWILRSKA----------ALQNTEMNEYKKSQETSGVRKKWKGLEKEQKEKIPQLDELNQT 756

  Fly   715 CELLKELQAENSRRCGTLPELKKLYEVCELEDPSRNLLLEETHIKQLEQRYANLSQKLSSQQSES 779
            .::|:|...:.    |.|.|        |:.|....:|||   .|.:.|:..:|.:|:..|:..:
  Rat   757 GQILQEQMGKE----GLLAE--------EINDVLERVLLE---WKMISQQLEDLGRKIQLQEDIN 806

  Fly   780 HTLLAKEKYYNSLTGFKLVLADSRDWYKQHAGSASGNELEQRLSHMESLASEISEAKTATEELDD 844
                   .|:..|...:..:....:|.:    .||.:|..||  .:.||..      :...||.|
  Rat   807 -------AYFRQLDALEKTIRAKEEWLR----DASFSESPQR--SLPSLKD------SCQRELTD 852

  Fly   845 NLIEWKQDFGLFYDSWHDMKQALQALIQ------------QRGGESLSRQLKQIQDFVTKVSNQK 897
            .|       ||     |...:.|.|...            |:|.:.|.|..:.:|          
  Rat   853 LL-------GL-----HPRIEILCASCSALRSQPSVPGFVQQGFDDLRRHYQAVQ---------- 895

  Fly   898 VRVSNLEVMQE-QQHFLNQLLDEMESLRLTYDNIPKHLIGEELQTAWNRLPEQLN-----ERVIK 956
                  :.::| ||...|:|..:.|...|...|..|.::.|..:.|...| ..||     |:.::
  Rat   896 ------KALEEYQQQLENELKSQPEPAYLDTLNTLKKMLSESEKAAQASL-SALNDPSAVEQALQ 953

  Fly   957 QTTAIE--------NLNHFAAEYNAIIA-MLRSA----------ADSKLNGSDGASSQDLRKLEI 1002
            :..|::        .|:..:.|..|:.. ||...          |..|.|......|:|||.||.
  Rat   954 EKKALDETLENQKPTLHKLSEETKALEKNMLPDVGKTYRQEFDDAQGKWNKVKTKVSRDLRSLEE 1018

  Fly  1003 DVISARNF---SEILIK------------EAEPAQKESLQSQIRALNTLYDQVEQVH---REKKE 1049
            .:...|:|   ||::.|            :|......:||.|:....|..:::|.:.   :..::
  Rat  1019 IIPRLRDFKADSEVIEKWTNGVKDFLMKEQAAQGDTTALQRQLDQCTTFANEIETIESSLKNLRD 1083

  Fly  1050 QQTVLQ--------------------------SHIDLIQLRLK--------------ETDQWLT- 1073
            .:|.||                          ..||:.:.||.              |..:|:. 
  Rat  1084 IETSLQRCPVTGVKTWVQTRLADYQSQLEKFSQEIDIQKSRLSDSQEKAMNLKKDLAEMQEWMAQ 1148

  Fly  1074 --------DLESNTP---KSGISDIVNSNE-LFQSKSRFQTLKETCERETTQFRDLNERGGELLL 1126
                    |.|..:|   :|.:.::..:.| :.|.:.|.:.||::.:....:.    ..||:   
  Rat  1149 AEEDYLERDFEYKSPEELESAVEEMKRAKEDVLQKEVRVKILKDSIKLVAARV----PSGGQ--- 1206

  Fly  1127 QMDELQDQDRESRYGSLAKQFTRINARWTEVTELVYAKTALLEHISTQLGEFKKFMVSETGYLDK 1191
                           .|..:|..:...:..:...:..|...||.:.:...|...::..||.:|:.
  Rat  1207 ---------------ELTSEFNEVLESYQLLCNRIRGKCHTLEEVWSCWVELLHYLDLETSWLNT 1256

  Fly  1192 LENKIRNTPENAADAEEIMEELDDLENVLRSHSEEWLDKIQEIGNELIDNEFMADSIRRDIDETV 1256
            ||.::::|......||.:.:.|:.||:||| |..:...:|:|:|..|||...:.|.|...::...
  Rat  1257 LEERMQSTEALPERAEAVHDALESLESVLR-HPADNRTQIRELGQTLIDGGILDDIISEKLEAFN 1320

  Fly  1257 QRWTQLQQQAKKRTELLEQKVSEAEQSEKCIVQFEKWLTRVDDILSDHLDNDVTIVDQPEEFQRL 1321
            .|:.:|...|:.:...||:::....:::..:...::.|..:|..|:.:|.:.:.....|:|.|::
  Rat  1321 SRYEELSHLAESKQISLEKQLQVLRETDHMLQVLKESLGELDKQLTTYLTDRIDAFQLPQEAQKI 1385

  Fly  1322 AHEFVANEKNFKEISELIDEHTRNGKVGAANRLQEQLNLMEVRFKYCQAK--LSKCTAIQHSYES 1384
            ..|..|:|...:|:.:.:.........|...|...|::|::.:.:....|  |.:..|   ::|.
  Rat  1386 QAEISAHELTLEELKKNVRPQPPTSPEGRTTRGGSQMDLLQRKLREVSTKFQLFQKPA---NFEQ 1447

  Fly  1385 RLNRAYTDLRNVERSTEVVDVASAGPNTVQTQYQKCLQIYRTLSEIKSEIESTIKTGRRVCEDRY 1449
            |:......|..|:....|:.|....|:.:||...||:::|:||||:|.|:|:.|||||.:.:.:.
  Rat  1448 RMLDCKRVLDGVKAELHVLSVKDVDPDVIQTHLDKCMKLYKTLSEVKLEVETVIKTGRHIVQKQQ 1512

  Fly  1450 TKSPKQLSQRIDALKHLYNTLGENVTQSKATLERLLTLARQLE-------ECFDSAD-NLIRRFE 1506
            |.:||.:.:::.:||.|||.||..||:.|..|||...|:|:|:       |...:.: .|:::..
  Rat  1513 TDNPKGMDEQLTSLKVLYNDLGAQVTEGKQDLERASQLSRKLKKEAAILSEWLSTTEAELVQKST 1577

  Fly  1507 SPQEVHDRNSILLEFEDVLRRCEDHYNEYNKSCDQSCMVETRQRIDGLKATYHKLTSADIIKRLT 1571
            |...:.|.::.:...:::|:..|                  |:::|              :..:|
  Rat  1578 SEGVIGDLDTEISWAKNILKDLE------------------RRKVD--------------LNAIT 1610

  Fly  1572 EMKTTLQNL----DNISLETL----------RAMEHDLKEINVPSNPEIEKLQQQVIAIVVDVLK 1622
            |....||:|    :::..:||          |....|.:...:....::|.....|..|     .
  Rat  1611 ESSAALQHLVVGSESVLEDTLCVLNAGWSRVRTWTEDWRNTLLNHQNQLEVFDGHVAHI-----S 1670

  Fly  1623 TRFNEATTLAARNTSSPDNDDTEIV-----------VVSDTVRQR-----RARTPQSGE--SPSS 1669
            |...:|..|.......|.:...|||           :..:.||::     .||...|.|  .|..
  Rat  1671 TWLYQAEALLDEIEKKPASKQEEIVKRLLSELSDASIQVENVREQAIVLVNARGSSSRELVEPKL 1735

  Fly  1670 AHTSSS-ESPTKGVENSPGAVGDQVMPDLLPPQTFR----LAESSTLFSQISLNPQKVTNTPPPK 1729
            |..|.: |..::.:.::...:|..      |..|..    .::..:|.|.|. |..||..     
  Rat  1736 AELSKNFEKVSQHINSAQMLIGQD------PAGTVEAVGPFSDLESLESDIE-NMLKVVE----- 1788

  Fly  1730 PAKTKRKAPSSP-------AQVVEI----------RVKNIQNDKMSVQ---------NIDLEPQQ 1768
                |...||:.       ||:.|:          .:::.:.:|:.:|         .|...||:
  Rat  1789 ----KHLDPSNDEKMDEERAQIEEVLQRGEHLLHEPMEDSKKEKIRLQLLLLHTRYNKIKAIPQR 1849

  Fly  1769 GEIVDTVNILESVEPFVPEY-VETVQIVDLSEDSDSSVRVDSQGKEMRRSKSKHSLNETPLPKVS 1832
            ..|..:..|:.|..|  .:| ||..:|:...:|.:.|:.:.             .||.|..    
  Rat  1850 KTIPLSSGIMSSALP--ADYLVEINKILLTLDDIELSLNIP-------------ELNTTVY---- 1895

  Fly  1833 DNDEDSAEQEEDLLRPSAENTSTPFLRVEKRRISFDEKRKRVANERDILRDS-EEEEPKTPDT-- 1894
               ||.:.||:.|                          ||:.::.|.|.:. .....|.||.  
  Rat  1896 ---EDFSFQEDSL--------------------------KRIKDQLDRLGEQLAAVHEKQPDVIL 1931

  Fly  1895 ----PRAAQVSKPKRWRQLQPEMDALEPESPGRDSFYSPDKESGF------------DAEPLV-- 1941
                |.|.|:.  ....||..:.|.:       :..|| |:...|            |.:.|.  
  Rat  1932 EASGPEAIQIR--DMLSQLNAKWDRV-------NRLYS-DRRGSFARAVEEWKQFHCDLDDLTQW 1986

  Fly  1942 FSDDEDIPRFSLEMTSTIDSDSDTSRIMTPSTKNPNPFLSKVLESLSSPVDDSNVTLKSPISEEQ 2006
            .|:.||:    |..|...|...|..:..|                       ..:.|:..:|..|
  Rat  1987 LSEAEDL----LVGTCAPDGSLDLEKART-----------------------HQLELEDGLSSHQ 2024

  Fly  2007 PQNLDDRVREFDKQAKQMIYKLKLTKAKIEQCHESEAEDLRLLIAPDAATLISQGDSLVLETHGR 2071
            |..:|     .:::.:.::.:|:          .|:|..|:    ...|:|..:..:||.|    
  Rat  2025 PCLID-----VNQKGEDIVQRLR----------PSDASFLK----DKLASLNQRWSALVAE---- 2066

  Fly  2072 QGSISRLVMRTQIILREQFREVQQARSKTSGSGAPAPPLDSVNIEELV---TKGLRRINVLIEKT 2133
                   |...|..|:.:.::|...|.:               ::|:|   ||        :|..
  Rat  2067 -------VKDLQPRLKGESKQVSGYRKR---------------LDEVVCWLTK--------VENA 2101

  Fly  2134 VDLKSSTDLEKRMEDINERHDDLQVIVSAIGKNAQMPKVTPLMMNEIE--KTKNNLIAHADSIEL 2196
            |..:|:.|.|:...::.:...::         :||...:..|...|:|  ..||..:...|::..
  Rat  2102 VQKRSTPDPEENPWELTDLAQEM---------DAQAENIKWLNRAELEMLSDKNLSLCERDNLSE 2157

  Fly  2197 SLTEL--------RNGPRISNGKER-------------PDASSAATMSCRSEYNNEPSGTGALAG 2240
            ||..:        |..|.:...:.:             |:....|.:|..|:        ..|.|
  Rat  2158 SLRNVNTMWTKICREVPSLLKTRTQDPCSAPQTRIAAHPNVQKVALVSSASD--------APLRG 2214

  Fly  2241 -------SFDKSVLQISDWLTWEQNMIKIQSVLVDDGDAVRLAIEKQEKVLRELKMKKPQLNELV 2298
                   ..||::.:::|||.....|:|...|.|.|...:...:.:.:....:|:.:.|||:.:.
  Rat  2215 PEISVPADLDKTITELADWLVLIDQMLKSNIVTVGDVKEINKTVSRMKITKADLEQRHPQLDFVF 2279

  Fly  2299 HTAEVLKGDVKRQQLQEKELKQFSLAPHCSADLDYMRCCL--KVTRLREHWDETSQCVLQRAAQL 2361
            ..|:.||....                  |:||   |..:  |:.:|:..|:.|...|..|..||
  Rat  2280 TLAQNLKNKAS------------------SSDL---RTAITEKLEKLKTQWESTQHGVELRRQQL 2323

  Fly  2362 KNMLSDSQRFEAKRLELEKWLARME------QRAERMGTIATTADILEAQQKEQKSFHAELHQNK 2420
            ::|:.||.:::..|.|.|:.:.:.|      |:|.|        |.|..|..:.:....||....
  Rat  2324 EDMVVDSLQWDDHREETEELMRKHEARFYMLQQARR--------DPLSKQVSDNQLLLQELGSGD 2380

  Fly  2421 QHFDIFNELTQKLIAVYPNDDTTRIKKMTEVINQRYANLNSGVINRGKQLHAAVHSLQSFDRAMD 2485
            .....|:.:.|||:..|.:|||..:::.||.:...:.||...:.:|...|.|.:.::|:..|.::
  Rat  2381 GVIMAFDNVLQKLLEEYSSDDTRNVEETTEYLKTSWINLKQSIADRQSALEAELRTVQTSRRDLE 2445

  Fly  2486 QFLAFLSETETLC---------ENAESDIE-----RNPLMFKDLQSEIETHRVVYDRLDGTGRKL 2536
            .|:.:|.|.||..         |||..|..     |..::  |:|:||:.|..::..:||..:|:
  Rat  2446 NFVKWLQEAETTANVLADASQRENALQDSVLARQLRQQML--DIQAEIDAHNDIFKSIDGNRQKM 2508

  Fly  2537 LGSLTSQEDAVMLQRRLDEMNQRWNNLKSKSIAIRNRLESNSEHWNALLLSLRELTEWVIRKDTE 2601
            :.:|.:.|:|.|||.|||:||||||:||:||.:||..||:::|.||.||.||.||.:|:..||.|
  Rat  2509 VKALGNSEEATMLQHRLDDMNQRWNDLKAKSASIRAHLEASAEKWNRLLASLEELIKWLNMKDEE 2573

  Fly  2602 LSTLGLGPVRGDAVSLQKQLDDHKAFRRQLEDKRPIVESNLTSGRQYIANEAAVSDTSDTEANHD 2666
            |..  ..|:.||..:||.|.|..|..||:|::|...|.:.:...|.::|:: .:....:...|..
  Rat  2574 LKK--QMPIGGDVPALQLQYDHCKVLRRELKEKEYSVLNAVDQARVFLADQ-PIEAPEEPRRNPQ 2635

  Fly  2667 SDSRYMSAEEQSRELTRSIRREVGKLSEQWNNLIDRSDNWKHRLDEYMTKMRQFQKILEDLSSRV 2731
            |.:. ::.||:::::.:::|::..::.|:|.:|...:..|:.::.:.:.|:|..|..::||.:.:
  Rat  2636 SKTE-LTPEERAQKIAKAMRKQSSEVREKWESLNAVTSTWQKQVGKALEKLRDLQGAVDDLDADM 2699

  Fly  2732 ALAEQTKTSWLPPSS--VGEANEQMQQLQRLRDKMTTASALLDDCNEQQSFFTANQVLVPTPCLS 2794
            ...|..:..|.|...  :....:.:::....|:::...:..:...|:..|..:... |.|:|.:|
  Rat  2700 KEVEAVRNGWKPVGDLLIDSLQDHIEKTLAFREEIAPINLKVKTMNDLSSQLSPLD-LHPSPKMS 2763

  Fly  2795 K-LEDLNTRMKLLQIAMDERQKVLCQAGAQQTHENGDDGRTTSNSGTIGPLPN--LGQSVKPPWE 2856
            : |:|||.|.||||:::::|.|.|     |:.|.:            .||...  |..||:.||:
  Rat  2764 RQLDDLNMRWKLLQVSVEDRLKQL-----QEAHRD------------FGPSSQHFLSTSVQLPWQ 2811

  Fly  2857 RATTAANVPYYIDHERETTHWDHPEMIELMKGLADLNEIRFSAYRTAMKLRSVQKRLALDRISMS 2921
            |:.:...|||||:|:.:||.||||:|.||.:.|.|||.:||||||||:|:|.:||.|.||.:.::
  Rat  2812 RSISHNKVPYYINHQTQTTCWDHPKMTELFQSLGDLNNVRFSAYRTAIKIRRLQKALCLDLLELN 2876

  Fly  2922 TACESFDRHGLRAQNDKLIDIPDMTTVLHSLYVTI-----DKIDLTLMLDLAINWILNVYDSQRT 2981
            |..|.|.:|.|. |||:|:.:||:...|.:.|..:     |.:::.|.:|:.:||:|||||:.||
  Rat  2877 TTNEVFKQHKLN-QNDQLLSVPDVINCLTTTYDGLEQLHKDLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRT 2940

  Fly  2982 GQIRVLSFKVGLVLLCKGHLEEKYRYLFRLVADTDRRADQRRLGLLLHDCIQVPRQLGEVAAFGG 3046
            |:|||.|.|:||:.|.||.||||||.||:.||......|||:|||||||.||:||||||||||||
  Rat  2941 GKIRVQSLKIGLMSLSKGLLEEKYRCLFKEVAGPTEMCDQRQLGLLLHDAIQIPRQLGEVAAFGG 3005

  Fly  3047 SNIEPSVRSCLEQAGISQEAIDGNQDISIELQHFLGWLQHEPQSLVWLPVLHRLAAAEAAKHQAK 3111
            ||||||||||.:|         .|....|.::.|:.|::.||||:||||||||:||||.||||||
  Rat  3006 SNIEPSVRSCFQQ---------NNNKPEISVKEFIDWMRLEPQSMVWLPVLHRVAAAETAKHQAK 3061

  Fly  3112 CNICKEYPIVGFRYRCLKCFNFDMCQKCFFFGRNAKNHKLTHPMHEYCTTTTSTEDVRDFTRALK 3176
            ||||||.||||||||.||.||:|:||.|||.||.||.|||.:||.|||..|||.|||||||:.||
  Rat  3062 CNICKECPIVGFRYRSLKHFNYDVCQSCFFSGRTAKGHKLHYPMVEYCIPTTSGEDVRDFTKVLK 3126

  Fly  3177 NKFKSRKYFKKHPRVGYLPVQSVLEGDALESPAP---------SPQHTTHQLQNDMHSRLEMYAS 3232
            |||:|:|||.||||:||||||:|||||.||:|..         .|..:.....:|.|||:|.||:
  Rat  3127 NKFRSKKYFAKHPRLGYLPVQTVLEGDNLETPITLISMWPEHYDPSQSPQLFHDDTHSRIEQYAT 3191

  Fly  3233 RLAQVEYGG----TGSNSTPDS-DDEHQLIAQYCQALPGTSNGSAPKSPVQVMAAMDAEQREELE 3292
            ||||:|...    |.|:||..| :|||.||.||||.|.|.|..|.|:||.|::.:::.|:|.|||
  Rat  3192 RLAQMERTNGSFLTDSSSTTGSVEDEHALIQQYCQTLGGESPVSQPQSPAQILKSVEKEERGELE 3256

  Fly  3293 AIIRDLEEENANLQAEYQQLCSKEQS-------GMPEDSNGMQHSSSSMTGLSGQGEQGQDMMAE 3350
            .||.|||||..|||.||:||  |||.       |.|.||....:.:|          :..:::||
  Rat  3257 RIIADLEEEQRNLQVEYEQL--KEQHLRRGLPLGSPPDSIVSPYHTS----------EDSELIAE 3309

  Fly  3351 AKLLRQHKGRLEARMQILEDHNRQLEAQLQRLRQLLDEPNG----GGSSATSSGLPSAPGSALNS 3411
            ||||||||||||||||||||||:|||:||.||||||::|:.    .|.|..:|  |..|..:.:.
  Rat  3310 AKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQPDSDSRINGVSPWAS--PQHPSLSYSL 3372

  Fly  3412 KPNTLQTRSVTASQ--------LNTDSPAKMNQQNGHYEHNSKGI 3448
            .|:........||:        .:||....|.|.|..:...|..:
  Rat  3373 DPDPGPQSHQAASEDLLAPPHDTSTDLTDVMEQLNSTFPSCSPNV 3417

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DysNP_001036722.1 CH_DMD-like_rpt1 12..118 CDD:409035 54/105 (51%)
CH_SF 129..229 CDD:469584 44/102 (43%)
SPEC 312..525 CDD:238103 86/216 (40%)
PRK03918 <716..1238 CDD:235175 124/629 (20%)
SMC_prok_B <995..1279 CDD:274008 70/354 (20%)
SPEC 1174..1365 CDD:238103 44/190 (23%)
SPEC 1289..1485 CDD:413338 58/197 (29%)
SPEC 2369..2576 CDD:238103 69/226 (31%)
SPEC 2477..2714 CDD:238103 81/250 (32%)
WW 2852..2882 CDD:238122 15/29 (52%)
EFh_DMD_like 2919..3085 CDD:320000 85/170 (50%)
EF-hand-like motif 2919..2958 CDD:320000 13/43 (30%)
EF-hand-like motif 2961..2995 CDD:320000 19/33 (58%)
EF-hand-like motif 3001..3037 CDD:320000 23/35 (66%)
EF-hand-like motif 3050..3085 CDD:320000 12/34 (35%)
ZZ_dystrophin 3110..3158 CDD:239074 35/47 (74%)
UtrnXP_006227699.1 CH_UTRN_rpt1 36..142 CDD:409081 54/105 (51%)
CH_UTRN_rpt2 157..260 CDD:409083 44/122 (36%)
SPEC 315..533 CDD:238103 87/222 (39%)
SPEC 548..>651 CDD:413338 23/112 (21%)
SPEC 696..909 CDD:238103 60/286 (21%)
SPEC 808..1020 CDD:238103 54/252 (21%)
SMC_prok_B 885..1832 CDD:274008 212/1042 (20%)
SPEC 1137..1341 CDD:238103 47/226 (21%)
SPEC 1240..1451 CDD:238103 49/214 (23%)
SPEC 1972..2174 CDD:238103 49/290 (17%)
SPEC 2222..2434 CDD:238103 59/240 (25%)
SPEC 2442..2682 CDD:238103 80/245 (33%)
SPEC 2684..>2800 CDD:238103 31/133 (23%)
WW 2809..2837 CDD:238122 15/27 (56%)
EFh_UTRO 2874..3035 CDD:320005 85/170 (50%)
EF-hand-like motif 2874..2913 CDD:320005 13/39 (33%)
EF-hand-like motif 2920..2954 CDD:320005 19/33 (58%)
EF-hand-like motif 2960..2996 CDD:320005 23/35 (66%)
EF-hand-like motif 3009..3035 CDD:320005 12/34 (35%)
ZZ_dystrophin 3060..3108 CDD:239074 35/47 (74%)

Return to query results.
Submit another query.