Protein Alignment qin and rnf17

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650735.3
• Gene: qin / 42236
• FlyBaseID: FBgn0263974
• Length: 1857
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_021334643.1
• Gene: rnf17 / 334519
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-6451
• Length: 1521
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1860
• Identity: 360/1860 - (19%)
• Similarity: 632/1860 - (33%)
• Gaps: 545/1860 - (29%)

  Fly   139 VKCSECGNATASGECRQ---------CNAFYCRRCFDAVHKRSRVLKSHIFRNST---------- 184
            |.|..||:.....|...         |...:|..|..|:..:..|:.....:..|
Zfish     6 VTCKICGSPYTLPEDEAVGNLPHVLLCGHIFCCTCLRALQSQGNVITCPECQMDTRTSEEGVDGL 70

  Fly   185 EQDSSF----------SKKLRVGD----QYFTLPSQNLCIHHRMPKDKYCMKCYRSHCQICSTVH 235
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Zfish    71 EVDSRIIGLIYTARMNTKKGHSGDKWKSQKFKSPPSSAAVH----------------------TE 113

  Fly   236 HSGHRIRKLIEINQSYASEIPTTLNSLNMAHIHVLNG----------------KQVVQRAKQ--- 281
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Zfish   114 ENAEGKPDVVKVLDEALTKATENLNQLDKLHQTLANGVHGQLRKERSRIIREIDEAVEKAKSILL 178

  Fly   282 KLNDYATETLASISKRFSHLHGLLQVAELQVIEKLRESSLPPQLKLNEAMGQLSGYETV--IERL 344
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Zfish   179 KRRSMLVSTLSSVDLLFS--GGQMECKRIE--ERIKE--LRTAIQKARHVRQVPSLETYCDLEKI 237

  Fly   345 TKSLNSGVGNDMAVPRDV------SLRWLLKLICEHL------EKIPTTVQVSKVDEN--PYRVT 395
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Zfish   238 LETLH--------IPVDLESYDMSSLTLRSGLSC-HLQVDGFTESVKVFLKITDTDDNCIVEEIT 293

  Fly   396 CSRFMDISNIFKCEFVNPNIQVCFKTDLEISRSLSSSPKGEITFLTSSSSSKENFDPHSRKLLLA 460
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Zfish   294 VEPFQHV----------------VKSGVEMWDNSSQSVQGKADAIPRKSNNTRRF---------- 332

  Fly   461 QNSKLKKATQVSQSQKKRGKNATEVAQSSLNSTAAIIDEFPAKDLDFLHNFS-SLDITKRNKTTE 524
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Zfish   333 -------------MEKMMEDTCPEIADTRVN--AGLGRNLPVHEPRRMERYNKGYRKQRRPQFEK 382

  Fly   525 DSSDWFKTDTLVRVRSVQSPEDFYVQGI---HAAQRLREELDTFA------HTLSDSSSVPPTIV 580
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Zfish   383 PTNPQPKLVQYVVTTHIVNPGHFYVRYMAEHKLGQKLTKKISEFCSGERSFFTFSDE------IT 441

  Fly   581 VGQNYIIHHKDKDRYYRALVSQKLTNENLYN-------------VFLTDI--------------- 617
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Zfish   442 TGSLLFISWKD-DMWCRVKVTELFQKECFQSVTKCLASEVSRLCVYFLDYGFFKGFSIPSDGGLS 505

  Fly   618 GVHLHVRCSDFRVVPERISHLPYSAVHCSLSELMPKNGESEWDSKASAFLKQIVQNNPVRVIV-- 680
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Zfish   506 GLNECLRRPDGITLIEMANWAPL-AIKCSLKDIIPADLVKGWSSEASEEMRNVLRNETAEMQVFG 569

  Fly   681 --KKALTYELHGVDLITSNYDTNISVRDSFLYCGLA------ISRDGAPLWLPPAPTALRLPRIS 737
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Zfish   570 EDGDALLVDLKKTSMADLKKNSMVSLREHLVFMELARFYCPVITTGSAPLLFYPSVQ----PSLN 630

  Fly   738 FRFGDVYMVQMLHVEDPQEFYVMRHDYEKKRLWLQFSLQEAMDRINISQLQNIFLGQLHLGCVLQ 802
            ....    ..:.||..|.:|||...:..:..| |...||:..::...:....::...|...||..
Zfish   631 VEVN----AMVSHVNTPSDFYVQLVENTEYPL-LHSKLQDCYNQPKSNNECQVYCPSLSQACVAF 690

  Fly   803 SGGQWKRASIEQILPDGYVLVHLVDEGPSQKV-------FWDQLFVLPQKFWDTGLAIKCCLADV 860
            ...:|.|..:........|.|..||.|..:.:       ..|:.||||:      :|:.|.|.||
Zfish   691 HDQEWSRVQVTGFPGGRMVEVRFVDFGYKRTLSVKDLRHIKDEFFVLPE------MALWCNLNDV 749

  Fly   861 ETRAEHSYTWTPEGTTLFKQLTSNPRLYMDVIS----CTEDLVYVSLHFERSNSET-TSVGVQLV 920
            .:..|   ||..|....||:|....  .|.|::    .:...|.|.| ||.|:..| .|:|.:||
Zfish   750 ISSQE---TWANEACESFKELVEGK--LMTVVAKKNVPSSKPVPVCL-FEISDDCTGASIGDELV 808

  Fly   921 AHGHCTSSGESS-RMITP-TVSNRSVRFDEETKKFIAQQKVRPVELSP-YRMPDNTERNKRTTVN 982
            ..|:...:.::. |...| ..::....|:||....:........||.| ..:|...   |...|.
Zfish   809 KKGYAVYNKDTQVRDAQPLETTSWDPPFEEEALPVVMTPSSASEELKPSLSLPSCL---KDIRVR 870

  Fly   983 ILYVRKPDEFYVTLPHFQKAINNLQKSVQKAAAAMYQNMLPR-TDWQVGDMCYARVQANCDSQAL 1046
            :.:|..|....|.|..|    :|..|.:......::....|: ..|:      |.:....::..:
Zfish   871 VTHVTSPGNICVQLLQF----DNQLKRIHDTLKNLFSKSEPQEMQWE------AEMYCAVNNTGV 925

  Fly  1047 WYRGVVTGVIPPGITCPIVRYQVHLRDLGELIDDVHSSSLANIDEADMRISSSAKRCHLHGIRPI 1111
            |.||.|..|    .||.:.  :|...|.|..: .:|..:|..: ..|: |.|....|:|.|:||.
Zfish   926 WERGQVCSV----STCGVA--EVLRCDFGNTV-KLHVDNLRPL-HPDL-IGSFLLECNLSGVRPA 981

  Fly  1112 G--DEWSKDAIDFFMDQLKAYNEIHVTGRGRTENSLSVILWGSLSILT--GPFS-PATIKYVNIN 1171
            |  ..|:..|.||                      :|..|.|:::::.  .|.: |..:.....|
Zfish   982 GGRSTWTATACDF----------------------ISHYLTGAMALMAIKEPSTRPVLVSLFCSN 1024

  Fly  1172 KA---------LLMAGMAEKDHNSDSEDDQQSMPENVSVNSEEAAKANDWESCLSKIDGTSKTND 1227
            :|         |:..|:|.|:..::            .|.|||:....:.:..:|........:.
Zfish  1025 RAGQNVSFADFLISEGLALKERKAE------------MVFSEESVLVTEPQPVISPTQTPPTPSR 1077

  Fly  1228 SLNLIESRSVTVGFEHNEDMPPLALLEDLGNTKNTTGETTPPAGWTTRRKCDKSVFTAIATNVTY 1292
            .:|....|..|..:      ||..|               ||.|
Zfish  1078 RINPPPERVKTHSY------PPPEL---------------PPCG--------------------- 1100

  Fly  1293 ECCIYLTLASDKPFIEHMGNLLVREYKPLMDKQKE------RSTSYTYK--VGQAVVVTYHMDNM 1349
            ...:.::..|::..|..|.:..|.|:..|.::.::      |..:|.:|  :|.||:.|   |..
Zfish  1101 HILMSISAVSEQGVIYAMTHQAVCEFDRLRERLQQHIKTLPRQKNYNWKGVLGCAVMGT---DMF 1162

  Fly  1350 IYRGIVQRLENNHNEYTVYYVDYGNMELVKADEMLPYAPFPDLNAMCFLVELHGVR--SKQGKYS 1412
            .|||.||.:...|  ..|.|||.|.:|.:....:.|.....|:..:|...:::||.  .|..::.
Zfish  1163 WYRGQVQEVIGGH--VKVRYVDQGLVESIPVCHVYPMVLCEDVPQLCVPCQINGVLPIGKGWQWD 1225

  Fly  1413 ----LKEMDTVHLNLVMKLSGVRIVDDETVGPNKIPKCQIKVGNVDIATMMIDSGMSVPIEKQTI 1473
                :||:      |:.:...|:|::.        ||.......|:|   |:| ||::
Zfish  1226 AVVLMKEL------LLGRSVNVQIMEH--------PKDPCGCVTVEI---MVD-GMAL------- 1265

  Fly  1474 KNNTKYLPSQKFL--EDFKVFDELDHLAAGEGELSDKEAPPTQRKHDSISSVQQPPTKKFLVDQE 1536
                     .|.:  ..:..||                 |....:.|   .|.:||....
Zfish  1266 ---------SKIMVHHQYATFD-----------------PAISSQED---YVVKPPMPDL----- 1296

  Fly  1537 EVEAFECDQDFDCQQAAQKMHLNNNFYLGDFGKYADETTARDEDEPHSNSSKSIDMEVFANVNDS 1601
                    .|:|         ||              |...:|..|.....|.:.:.
Zfish  1297 --------DDWD---------LN--------------TEGLEEQPPVLGVYKELHIP-------- 1322

  Fly  1602 QLEPLNSFATEQLIRRIALRQQEIKDSITFSPIDTSSVRSFYDASASFKTLSLPNGVKEFYCTVD 1666
                                    |:...|              .|..|.:..||.|  |.|.:|
Zfish  1323 ------------------------KERKHF--------------PAKVKHIRTPNEV--FLCVLD 1347

  Fly  1667 NVLSDTELQIAPCLSEFTKHEISLIQETSTLIKDAEPLMEPKVGDLCLARYSRDKQWYRANI--- 1728
            ..|         |..|..:.....:::.:..|::...|.:..:..||||.|| |.::|||.|
Zfish  1348 KSL---------CKLEQDESMEETLEQVNENIENLSLLTDFPIECLCLAEYS-DGKYYRAKILGF 1402

  Fly  1729 KEISPILSPTSEQVTVFYIDFHDTEKVSFNHLKVMPSQLFMFPLRSFCVKLHGIKRNKSFKEKSV 1793
            .|::|     |.::.|.::||...:.:..:.|:.:|:.|..||..:..|||.|      ||..:|
Zfish  1403 SEVTP-----SVKLLVRHVDFGSDDIIPLHKLRQLPASLHHFPCAAVYVKLAG------FKPTNV 1456

  Fly  1794 RQALQACLCQHPLVFARVHYPLNYYPNRPNCDADLIEVEL 1833
            ...|:           |:.|.|::.........||:..||
Zfish  1457 SSDLE-----------RIPYSLDWTMKAMMEMIDLLNGEL 1485

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
qin	NP_650735.3	zf-RING_5	25..76	CDD:434085
		Bbox1	140..178	CDD:380815	9/46 (20%)
		Bbox2	208..244	CDD:380814	1/35 (3%)
		TUDOR	536..648	CDD:425754	30/148 (20%)
		TUDOR	742..859	CDD:425754	28/123 (23%)
		Tudor_SF	989..1139	CDD:470623	34/152 (22%)
		TUDOR	1296..1403	CDD:425754	29/114 (25%)
		TUDOR	<1703..1781	CDD:425754	26/80 (33%)
rnf17	XP_021334643.1	RING_Ubox	6..66	CDD:473075	11/59 (19%)
		TUDOR	394..534	CDD:425754	29/147 (20%)
		Tudor_SF	659..749	CDD:470623	21/95 (22%)
		Tudor_SF	894..965	CDD:470623	15/84 (18%)
		Tudor_TDRD4_rpt4	1148..1215	CDD:410488	21/71 (30%)
		Tudor_TDRD4_rpt5	1376..1481	CDD:410489	35/127 (28%)