DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MED17 and MED17

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650686.1 Gene:MED17 / 42175 FlyBaseID:FBgn0038578 Length:642 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_319901.2 Gene:MED17 / 1280098 VectorBaseID:AGAMI1_004674 Length:645 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:652 Identity:466/652 - (71%)
Similarity:538/652 - (82%) Gaps:18/652 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSNSVNISVETTCENQIREIGYDGTELYQPPPTLSESLAKCAARIDFSKTSLD------DLKKEE 59
            ||.|.|||||...||||:||.|||||:||.||||||.|||||.:|||||||.|      .:|||:
Mosquito     1 MSLSANISVEAPIENQIQEIAYDGTEIYQLPPTLSEHLAKCATKIDFSKTSSDIDLLQQSIKKED 65

  Fly    60 KSAAAAADEDKDATQFQESLWPWDAVRNKLKDALTEICVLSDVISIAKDKRYLVLDPLLEEADDT 124
            :.....:.:.|:  |||.||||||:||||||:||||:||||||::|||:|||:||||:.:|..:.
Mosquito    66 EKKEEESKDPKE--QFQSSLWPWDSVRNKLKEALTEVCVLSDVLNIAKEKRYMVLDPIPQEPPEV 128

  Fly   125 KPIVQVYSRKKAISQAAQVLLSGAERLRNAHSEQ--RNRNVSDFHIELLRLRQNWRLKKVSNAII 187
            |.:|.||:||||::.||.:|.||.|||:...|:|  ...|.:||||||||||:|||||||||.||
Mosquito   129 KQMVLVYARKKALASAANILQSGVERLKAVQSDQGVSRSNSTDFHIELLRLRRNWRLKKVSNTII 193

  Fly   188 GDLSYRTAGSKFGMSGTFEVTKAEETGDEDTAS--SSNSSSSVSGNNGMQLKASSALRVIVPAEL 250
            ||||||||||||...|.|||||||   ||::.|  :|.|.|..:|..... |.:|||||.||.||
Mosquito   194 GDLSYRTAGSKFMHPGMFEVTKAE---DEESGSPPASPSGSGAAGTVACP-KINSALRVNVPTEL 254

  Fly   251 QGVAYIKVITQKDQEDLCTAQLNLMGHGPNITAQVGVWQKTLEFAQNVLFCKELFAQLAREAIQL 315
            ||||:|||||||||||||||.:|:|| ...:..|.|.||:|||:|||||||||||.||||||:||
Mosquito   255 QGVAFIKVITQKDQEDLCTATVNMMG-STQLVPQAGAWQQTLEYAQNVLFCKELFNQLAREAVQL 318

  Fly   316 QAPIPHVVIGNQIRATLLPNIQLIISLCHSTTFDSSQPA-PINDHDHVLEHSLHQLLREVHYKNS 379
            ||||||||:||||||||||.|||||||||||:.||:..: ||.||||||||||||||||.|:||:
Mosquito   319 QAPIPHVVVGNQIRATLLPGIQLIISLCHSTSSDSNNSSEPIKDHDHVLEHSLHQLLREFHHKNT 383

  Fly   380 HHPFPHPASAPLGPTKKRMLAGPMAADRETLLDMTKSQTILEQIIAQAQHIFMRKRTQYVLDTLA 444
            |||||||||.||||:||||||||.|.||..||:||||||:||||||||||||.|:||||||||:|
Mosquito   384 HHPFPHPASGPLGPSKKRMLAGPSAYDRHELLEMTKSQTLLEQIIAQAQHIFTRRRTQYVLDTVA 448

  Fly   445 RDVKDPQIVSHWNAMNSPTMSCVKINIVTHGYDAIGRTSLVIHVKERSLKCICRDGRVMRLSYEP 509
            ||||||.|.||||||||||||||||||.:|||||..|||||||||||||||||||||:|.:||||
Mosquito   449 RDVKDPMITSHWNAMNSPTMSCVKINITSHGYDANLRTSLVIHVKERSLKCICRDGRIMHMSYEP 513

  Fly   510 QELRDLILCQINSHQISCLISLARCMSWTVLSNSNHLGIGKVEPLGNASSCLLASPNSDRMIAVQ 574
            |||||||||||:.|||.||.:||:||:|.:||:|:|||||.||||||||||:||||||||:||||
Mosquito   514 QELRDLILCQISQHQIVCLQNLAKCMAWQILSSSSHLGIGSVEPLGNASSCVLASPNSDRLIAVQ 578

  Fly   575 IRCDPQIDVKVYIARSPRQDFFPSPLVPEKLWENLGGTFKEVRFDKIEGKSFLNKMEFLMASLTS 639
            :|||.||||||:||:||.:||||..||..:.||:|||.||||||||:|||:|.||||||||||||
Mosquito   579 VRCDSQIDVKVFIAQSPAKDFFPGSLVQGRHWEHLGGHFKEVRFDKMEGKNFHNKMEFLMASLTS 643

  Fly   640 NT 641
            .:
Mosquito   644 QS 645

Return to query results.
Submit another query.