Protein Alignment cdm and IPO13

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650682.1
• Gene: cdm / 42171
• FlyBaseID: FBgn0261532
• Length: 971
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_055467.3
• Gene: IPO13 / 9670
• HGNCID: 16853
• Length: 963
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 987
• Identity: 277/987 - (28%)
• Similarity: 492/987 - (49%)
• Gaps: 81/987 - (8%)

  Fly     6 IARLEEAVVS-FYRSNSQNQAITHEWLTDAEASPQAWQFSWQLMQLGKSQEVQFFGAITLHSKLM 69
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Human    23 VENVEKALHQLYYDPNIENKNLAQKWLMQAQVSPQAWHFSWQLLQPDKVPEIQYFGASALHIKIS 87

  Fly    70 KHWHEVPPENREELKQKILESIVRFAGGPKIVLNRLCISLGAYIVHMLGE-WPGAIEEVINTFQN 133
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Human    88 RYWSDIPTDQYESLKAQLFTQITRFASGSKIVLTRLCVALASLALSMMPDAWPCAVADMVRLFQA 152

  Fly   134 QRMPNVSADVQLWIMLEVLTAIPEEAQVIH-TSVKRVVLRAEIAKRVQLVIHTVERYLKLQMNRV 197
            :..| |....:...:||:||.:|||.|... ...::.::|..:|.....|...:|:.|:
Human   153 EDSP-VDGQGRCLALLELLTVLPEEFQTSRLPQYRKGLVRTSLAVECGAVFPLLEQLLQ------ 210

  Fly   198 WDAEAYSNMNRAVKCVGTWIKNIGYTIEGCVTITAVLLEVVHKCYWPCIHAGDGCMTADENELAE 262
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Human   211 QPSSPSCVRQKVLKCFSSWVQ-LEVPLQDCEAL---------------IQAAFAAL--QDSELFD 257

  Fly   263 SCLKTMVNIIIQPDCHNYPKTAFVLIKMFLDSLSEITKTEWKRENDNEDIIVHIYMLFVSSVERH 327
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Human   258 SSVEAIVNAISQPDAQRYVNTLLKLIPLVLGLQEQLRQAV---QNGDMETSHGICRIAVALGENH 319

  Fly   328 STLLLSGITSADPELSILVHRIVQEILHCTDKPGIYPVEESCSTMALAFWYMLQDEVFAMSNDEQ 392
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Human   320 SRALLDQVEHWQSFLA-----LVNMIMFCTGIPGHYPVNETTSSLTLTFWYTLQDDI--LSFEAE 377

  Fly   393 KHKCWEYI-KPLYAHLTRILVRKSEQPDEKSLAKWSSDDLECFRCYRQDISDTFMYCYDVLNDYI 456
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Human   378 KQAVYQQVYRPVYFQLVDVLLHKAQFPSDEEYGFWSSDEKEQFRIYRVDISDTLMYVYEMLG--- 439

  Fly   457 LEILAAMLDE--AIADLQRHPTHWTKLEACIYSFQSVAEHFGGEEKRQIPRLMRVLAEIPYEKLN 519
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Human   440 AELLSNLYDKLGRLLTSSEEPYSWQHTEALLYGFQSIAETIDVNYSDVVPGLIGLIPRISIS--N 502

  Fly   520 VKLLGTALETMGSYCNWLMENPAYIPPAINLLVRGL-NSSMSAQATLGLKELCRDCQLQLKPYA- 582
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Human   503 VQLADTVMFTIGALSEWLADHPVMINSVLPLVLHALGNPELSVSSVSTLKKICRECKYDLPPYAA 567

  Fly   583 -------DPLLNACHASLNTGRMKNSDSVRLMFSIGKLMSLLRPEEIPKYLDIIVSPCFEELQAI 640
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Human   568 NIVAVSQDVLMKQIH--------KTSQCMWLMQALGFLLSALQVEEILKNLHSLISPYIQQLEKL 624

  Fly   641 CQADSKTPAARIRTIFRLNMISTLFSSLNTDVDEQATDQ--------PIVQ---PVLLVMQRTMP 694
            .: :...|:.::..:..|.::|.||::|  |:.....|.        |:.|   ||::|:|:...
Human   625 AE-EIPNPSNKLAIVHILGLLSNLFTTL--DISHHEDDHEGPELRKLPVPQGPNPVVVVLQQVFQ 686

  Fly   695 IFKRIAEMWVEEIDVLEAACSAMKHAITNLRSSFQPMLQDLCLFIVASFQTRCCAPTLEISKTAI 759
            :.:::...|:.:..|:||.|:..:.::..|...|.||:..||..:...:.|...|..|::::..:
Human   687 LIQKVLSKWLNDAQVVEAVCAIFEKSVKTLLDDFAPMVPQLCEMLGRMYSTIPQASALDLTRQLV 751

  Fly   760 VMFFKDEGCKPLMQQLLREFIQHSFKLFESTPEQNFSNISDTMETFFGCLTQIIKKIPQVLEDKT 824
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Human   752 HIFAHEPAHFPPIEALFLLVTSVTLTLFQQGPRDH----PDIVDSFMQLLAQALKRKPDLFLCER 812

  Fly   825 LAYDRLVFYAQRGMTLPESGAIRNSIQFLTHFVMQSRNHAHVTEVVLATGEQTLYTAMMCVGYLT 889
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Human   813 LDVKAVFQCAVLALKFPEAPTVKASCGFFTELLPRCGEVESVGKVVQEDGRMLLIAVLEAIGGQA 877

  Fly   890 PRSQVDKFADILLAMNRKYAAEMAVWMKSLMSTPNFPTQLITDADKTRYTALIIKEKVNKRLLQQ 954
            .||.:|.|||||.|:|:...:.:::|:|..:..|.||:..::...|..::..|::|:||||.:::
Human   878 SRSLMDCFADILFALNKHCFSLLSMWIKEALQPPGFPSARLSPEQKDTFSQQILRERVNKRRVKE 942

  Fly   955 HLSEMAMKTRGL 966
            .:.|..:..|||
Human   943 MVKEFTLLCRGL 954

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
cdm	NP_650682.1	IBN_N	29..93	CDD:197981	29/63 (46%)
		Xpo1	98..>220	CDD:462459	32/123 (26%)
		Importin_rep	418..454	CDD:436727	19/35 (54%)
		Importin_rep_3	838..912	CDD:465873	21/73 (29%)
IPO13	NP_055467.3	HEAT 1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	24..54		8/29 (28%)
		IBN_N	45..109	CDD:197981	28/63 (44%)
		HEAT 2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	56..88		19/31 (61%)
		HEAT 3. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	95..135		16/39 (41%)
		Xpo1	116..263	CDD:462459	38/171 (22%)
		HEAT 4. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	142..179		12/37 (32%)
		HEAT 5. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	194..231		7/42 (17%)
		HEAT 6. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	236..268		8/48 (17%)
		HEAT 7. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	276..325		11/51 (22%)
		HEAT 8. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	330..372		19/48 (40%)
		HEAT 9. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	375..438		24/62 (39%)
		Importin_rep	402..441	CDD:436727	19/41 (46%)
		HEAT 10. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	440..476		10/35 (29%)
		HEAT 11. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	487..522		11/36 (31%)
		HEAT 12. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	524..558		10/33 (30%)
		HEAT 13. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	562..600		13/45 (29%)
		Importin_rep_2	584..627	CDD:408557	15/43 (35%)
		HEAT 14. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	603..648		11/45 (24%)
		Importin_rep_2	631..669	CDD:408557	8/39 (21%)
		HEAT 15. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	676..716		9/39 (23%)
		HEAT 16. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	720..754		8/33 (24%)
		HEAT 17. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	761..803		9/45 (20%)
		HEAT 18. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	815..845		6/29 (21%)
		Importin_rep_3	826..900	CDD:465873	21/73 (29%)
		HEAT 19. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	860..893		12/32 (38%)
		HEAT 20. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20122403	897..931		6/33 (18%)