Protein Alignment cdm and AT1G12930

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650682.1
• Gene: cdm / 42171
• FlyBaseID: FBgn0261532
• Length: 971
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_563920.1
• Gene: AT1G12930 / 837851
• AraportID: AT1G12930
• Length: 1005
• Species: Arabidopsis thaliana
• Alignment Length: 982
• Identity: 197/982 - (20%)
• Similarity: 387/982 - (39%)
• Gaps: 179/982 - (18%)

  Fly     8 RLEEAV-VSFYRSNSQNQAITHEWLTDAEASPQAWQFSWQLM--QLGKSQEVQFFGAITLHSKLM 69
            ::.||: |..:...|.|:...::||...:.:|.||..|..|:  .:....::|||.|..|..|:.
plant     6 KVAEAIHVLNHDPESSNRVAANQWLVQFQLTPAAWDVSTSLLTSPIVSLFDLQFFAAQILRRKIQ 70

  Fly    70 KHWHEVPPENREELKQKILESIVRFAGGPKIVLNRLCISLGAYIVHMLGEWPGAIEEVINTFQNQ 134
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plant    71 NEASNLQSTAKDALLNALLLAAKRYSSGVPQLLTQICLALSALLLHS-DPYSKPFDKLMFALQNL 134

  Fly   135 RM---PNVSADVQLWIMLEVLTAIPEEAQVIHTSVKRVVLRAEIAKRVQLVIHTVERYLKLQMNR 196
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plant   135 QAHDDGNV-------VLLELLTVLPEEISDTRHFSHHSDLRQELLSHTSMVLD----FLLQQSEN 188

  Fly   197 VWDAEAY--SNMNRAVKCVGTWIKNIGYTIEGC---VTITAV----LLEVVHKCYWPCIHAGDGC 252
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plant   189 QFVSPLYPHDNNRKILRCLLSWVR------AGCFSEIPQGAVPSHPLLNYV-------------- 233

  Fly   253 MTADENELAESCLKTMVNIIIQPDCHNYPKTAFVLIKMFLDSLSEITKTEWKRENDNEDI-IVHI 316
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plant   234 FNALQGTTFDLAIEVLVELVTRHE--DLPQVLLYKVQFLRDTL-------LKPALINADLKIISG 289

  Fly   317 YMLFVSSVERHSTLLLSGITSADPELSILVHRIVQEILHCTDKPGIYPVEE-SCSTMALAFWYML 380
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plant   290 LACLMSEIGQAAPCL---IVEASSEALIL----TDAILSCV----TFPSEDWEIADSTVQFWSTF 343

  Fly   381 QDEVFAMSNDEQ--KHKCWEYIKPLYAHLTRILVRKSEQPDEKSLAKWSSDDLECFRCYRQDISD 443
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plant   344 ATYILSLGGNRQNDRTRVKDTFLPVFSALVDALVLRA-QVDEFT----SSDESPGL-----DLPD 398

  Fly   444 TFMYCYDVLNDYILEILAAMLDEAIADLQRHPTHWT------------------KLEACIYSFQS 490
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plant   399 GLLHFRNNLLELLVDICQLL----------HPTTFVSKLFFGGVPSSSVSMPLREIEAKLFALTA 453

  Fly   491 VAEHF--GGE--EKRQIPRLMRVLAEIPYEKLN--VKLLGTAL-ETMGSYCNWLMENPAYIPPAI 548
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plant   454 VSEIILQEGEAFDFALIMQLVSAFSVRPSSELKGFISVVYRSLADVVGSYSRWISVFPSNARPLL 518

  Fly   549 NLLVRGLNSSMSAQA-TLGLKELCRDCQLQLKPYAD-PLLNACHASLNTGRMKNSDSVRLMFSIG 611
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plant   519 LFLAGGISEPICSHACASALRKICEDAPAVIQETSNLDILMWIGECLEQWDLTLEDEEEVITAIT 583

  Fly   612 KLMSLLRPEEIP-KYLDIIVSPCFEELQAICQADS-----KTPAARIRTIFR----LNMISTLFS 666
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plant   584 VILGSVANKELQNKLLTQLLSSSYGVLSKLVDEDAESSGRQSPATYTRMLSSVTRGLYRIGTVFS 648

  Fly   667 SLNTDVDEQATDQPIVQ----PVLLVMQRTMPIFKRI-AEMWVEEIDVLEAACSAMKHAITNLRS 726
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plant   649 HL-------ATSLPSVPVADGPILSLLTVFWPILEKLFRSEHMESGSLAAAACRALSVAVQSSGE 706

  Fly   727 SFQPMLQDL--CL---FIVASFQTRCCAPTLEISKTAIVM---FFKDEGCKPLMQQLLREFIQHS 783
            .|..:|..:  ||   |:  |||::.|     ..:||.|:   |...|....|.......|.|.|
plant   707 HFMLLLPSVLDCLSRNFL--SFQSQEC-----YIRTACVIAEEFCHKEEYGSLFITTFERFTQAS 764

  Fly   784 FKLFESTPEQNFSNI----SDTMETFFGCLTQIIKKIPQVLEDKTLAYDRLVFY-AQRGMTLPES 843
                 |....|.|.|    .|.:|.:....:.:|:...:.|...:.....:.|: |....|....
plant   765 -----SLMGINSSYICDQEPDLVEAYVNFASALIRSCHKELLGTSGTLLEISFHKAAICCTAMHR 824

  Fly   844 GAIRNSIQFLTHFVMQSRNHAHVT--------------EVVLATGEQTLYTAMMCVGYLTPRSQV 894
            ||...::.:|:.|:..|.:....|              :||...||..|...:..:..:...|:|
plant   825 GAALAAMSYLSGFLEVSLSSMIETVNSISDGSFSVVSVQVVSHCGEGLLSNLVYALLGVAAMSRV 889

  Fly   895 DKFADIL 901
            .|.:.||
plant   890 HKCSTIL 896

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
cdm	NP_650682.1	IBN_N	29..93	CDD:197981	15/65 (23%)
		Xpo1	98..>220	CDD:462459	26/126 (21%)
		Importin_rep	418..454	CDD:436727	8/35 (23%)
		Importin_rep_3	838..912	CDD:465873	17/78 (22%)
AT1G12930	NP_563920.1	Xpo1	118..249	CDD:462459	29/161 (18%)