Protein Alignment cdm and tnpo3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650682.1
• Gene: cdm / 42171
• FlyBaseID: FBgn0261532
• Length: 971
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_957381.1
• Gene: tnpo3 / 394062
• ZFINID: ZDB-GENE-040426-708
• Length: 923
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 950
• Identity: 192/950 - (20%)
• Similarity: 389/950 - (40%)
• Gaps: 145/950 - (15%)

  Fly    24 QAITHE-----------WLTDAEASPQAWQFSWQLMQLGKSQEVQFFGAITLHSKLMKHWHEVPP 77
            ||:.|:           ||.:.:.|..||:.|.||:||.:..|..:|.|.|:..|:...::|:||
Zfish    16 QALYHDPDPAGKERASVWLGELQRSMYAWEISDQLLQLKQDIESCYFAAQTMKMKIQTSFYELPP 80

  Fly    78 ENREELKQKILESIVRFAGGPKIVLNRLCISLGAYIVHMLGEWPGAIEEVINTFQNQRMPNVSAD 142
            ::...|:..:|..|........|::.:|.::: |.:...:..|.|.:..:|..:.|    :||:
Zfish    81 DSHTALRDSLLSHIQNLKDLSPIIVTQLALAI-ADLALQMASWKGCVHTLIEKYSN----DVSS- 139

  Fly   143 VQLWIMLEVLTAIPEEAQVIHTSVKRVVL--RAEIAKRVQLVIHTVERYLKLQMNRVWDAEAYSN 205
              :..::|:||.:|||   :|:...|:..  |.||.:.:.....||...|      |..||...:
Zfish   140 --MTFLIEILTVLPEE---VHSRSLRIGANRRTEIIEDLAYYSTTVVTLL------VTCAEKSGH 193

  Fly   206 ----MNRAVKCVGTWIKNIGYTIEGCVT---ITAVLLEVVHKCYWPCIHAGDGCMTADE-----N 258
                :.:..:|:|:|. |:|......:.   :..:|.:|:.:               ||     :
Zfish   194 DEKMLIKVFRCLGSWF-NLGVLDNNFMANNQLLMILFQVLQR---------------DETSTNLH 242

  Fly   259 ELAESC----LKTMVNIIIQPDCHNYPKTAFVLIKMFLDSLSEITKTEWKRENDNEDIIVHIYML 319
            |.|..|    |..:.|:.|     :.|    :.:::|...|:..|........::.|.:::...:
Zfish   243 EAASDCVCSALYAIENVAI-----HLP----LAMQLFQGVLTLETAYHMAVAREDLDKVLNYCRI 298

  Fly   320 FVSSVERHSTLLLSGITSADPELSILVHRIVQEILHCTDKPGIYPVEESCSTMALAFWYMLQDEV 384
            |....|   |.|...:.:....:..|  |.::.:|.|...|....||     ::..|||.|.:.:
Zfish   299 FTELCE---TFLEMTVRTPGQGMGDL--RTLELLLICAGHPQYEVVE-----ISFNFWYRLGEHL 353

  Fly   385 FAMSNDEQKHKCWEYIKPLYAHLTRILVRKSE-QPDEKSLAKWSSDDLECFRCYRQDISDTFMYC 448
            :.: ||...|..:   :|....|...|.|..: .||.:.:.: .:||...||          |..
Zfish   354 YKI-NDPALHNVF---RPYIQRLLHSLARHCQLDPDHEGVPE-DTDDFGEFR----------MRV 403

  Fly   449 YDVLNDYILEILAAMLDEAIADL-----QRHPTHWTKLEACIYSFQSVAEHFGGEEKRQIPRLMR 508
            .|::.|.|. ::.:|  |..|.|     :.:|. |...||.::...|:|::...|..   |.||.
Zfish   404 SDLVKDVIF-LVGSM--ECFAQLYSTLREGNPP-WEVTEAVLFIMASIAKNVDPENN---PTLME 461

  Fly   509 VLAEIPY--EKLNVKLLGTALETMGSYCNWLMENPAYIPPAINLLVRGLNSS-MSAQATLGLKEL 570
            ||.:|..  |.:::.:..|::|.:|.....:..||:.:...:|.|::||... :::.|...:..:
Zfish   462 VLEQIVLLPETVHLAVRYTSIELVGEMSEVIDRNPSMLDTVLNFLMKGLREKPLASAAAKAIHNI 526

  Fly   571 CRDCQLQLKPYADPLLNACHASLNTGRMKNSDSVRLMFSIGKLMSLLRPEEIPKYLDIIVSPCFE 635
            |..|:..:..:...||:... ||::..:....:|.|:.....:::.|..|:|.:.|:.:.:....
Zfish   527 CSVCRDHMAQHFQGLLDIAR-SLDSFALSTDAAVGLLKGTALVLARLPLEKIAECLNDLCAVQVM 590

  Fly   636 ELQAICQADSKTPAARIRTIFRLNMISTLFSSLNTDVDEQATDQPIVQPVLLVMQRTMPIFKRIA 700
            .|:.:...||.:..:...|:: |:.::.:|...|..|:...|     .|...|:|...|:.....
Zfish   591 ALKKLLAQDSSSGKSSDPTVW-LDRLAVIFRHTNPIVENGQT-----HPCQKVIQEIWPVLSETL 649

  Fly   701 EMWVEEIDVLEAACSAMKHAITNLRSSFQPMLQDLCLFIVASFQTRCCAPTLEISKTAIVMFFKD 765
            .....:..::|..|..::.|:..:......:||.|...:|:.:|....:..|.:....:..:..:
Zfish   650 NAHQSDNRIVERCCRCLRFAVRCVGKGSASLLQPLVTQMVSVYQLYPHSCFLYLGSILVDEYGME 714

  Fly   766 EGCKPLMQQLLREFIQHSFKLFESTPEQNFSNISDTMETFFGCLTQIIKKIPQVLEDKTLAYDRL 830
            |||:..:..:|:.....:|:|.|.  .....|..||::..|...|:.:::.|..|...::.. .:
Zfish   715 EGCRQGLLDMLQALCMPTFQLLEQ--PNGLRNHPDTVDDLFRLATRFVQRSPVTLLSSSIIV-HI 776

  Fly   831 VFYAQRGMTLPESGAIRNSIQFLTHFVMQSRNHAH----------VTEVVLATGEQTLYTAMMCV 885
            :..|....||....|..:.::|:...:.....:.|          :.:.:...|:|.:...:...
Zfish   777 IQCAIAATTLDHRDANCSVMKFIRDLIHTGVTNDHEDDFEVRKRLIGQAMEQHGQQLVNQLINTC 841

  Fly   886 GYLTPRSQVDKFADILLAMNRKYAAEMAVWMKSLMSTPNF 925
            .:..|...:...|::|             |...:...|.|
Zfish   842 CFCLPPYTLPDVAEVL-------------WEIMVFDRPTF 868

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
cdm	NP_650682.1	IBN_N	29..93	CDD:197981	21/74 (28%)
		Xpo1	98..>220	CDD:462459	29/127 (23%)
		Importin_rep	418..454	CDD:436727	8/35 (23%)
		Importin_rep_3	838..912	CDD:465873	10/83 (12%)
tnpo3	NP_957381.1	IBN_N	30..96	CDD:197981	21/65 (32%)
		Xpo1	120..249	CDD:462459	34/160 (21%)