Protein Alignment cdm and kap111

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650682.1
• Gene: cdm / 42171
• FlyBaseID: FBgn0261532
• Length: 971
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_593051.1
• Gene: kap111 / 2541467
• PomBaseID: SPAC22G7.02
• Length: 990
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1053
• Identity: 218/1053 - (20%)
• Similarity: 400/1053 - (37%)
• Gaps: 183/1053 - (17%)

  Fly     1 MEPIDIARLEEAVVSFYRSNSQNQAI--THEWLTDAEASPQAWQFSWQLMQLGKSQEV--QFFGA 61
            |:..:||..::.|...|..:....||  |.:.|..|:.|.|.|.....::|   |::|  |||||
pombe     1 MDGNEIAHAKKLVYDLYSGSLSPSAIAATEKELQKAQRSQQGWNIGLFMLQ---SKDVYEQFFGA 62

  Fly    62 ITLHSKLMKHWHEVPPENREELKQKILESIVRFAGGPKIVLNR-LCISLGAYIVHMLGEWPGAIE 125
            :||..|:......:..::..:|..::|:.::...|.|.:|..: :|......|.:.|.:...|..
pombe    63 LTLQMKINTQLETLSDKDLVQLFVQLLQKLLWDDGLPALVERKVICTLASLTIKYELEKKEEASL 127

  Fly   126 EVINTFQNQRMPNVSADVQLWIMLEVL--TAIPEEAQVIHTSVKRVVLRAEIAKRVQLVIHTVER 188
            :||......::...:||:....:|..|  .|....||:..:.:..::|....:      |:|.|.
pombe   128 KVIYCLFCNKLEFFNADMNAASVLNNLFPPASSRNAQLTASYINELLLELSFS------IYTKEN 186

  Fly   189 YLKLQMNRVW--------------------DAEAYSNMNRAVKCVGTWIKNIGYTIEGCVTITAV 233
            ...| .|.|:                    |.....|:....:.:...|....|..:..|::.:|
pombe   187 EDAL-FNNVFRPCSNIIVSVLVFIFTNYSLDLSKEKNVAALEEALNCMIAISSYLAKASVSVQSV 250

  Fly   234 LLEVVHKCYWPCIHAGDGCMTADE-NELAESCLKTMV----NIIIQPDCHNYPKTAFVLIKMFLD 293
            |     ..:..|:.....|:..|| :|.|.:||..::    |.|.||.               ::
pombe   251 L-----PAFTECMDLTVNCIALDEVSEKAMNCLADLLANYSNFITQPT---------------IE 295

  Fly   294 SLSEITKTEW-----KRENDNEDIIVHIYMLFVSSVERHSTLLLSGITSADPELSILVHRIVQE- 352
            .|..|....|     ::|.::.|          |..|...:.|...|..|:..|..::..|.:|
pombe   296 RLWTILTGPWGETHLQQELEDPD----------SGEENDYSFLNIVIGFAEAMLPQIIDHIQEEK 350

  Fly   353 -------ILHCTDKPGIYPVEESCSTMALAFWYMLQDEVFAMS---NDEQKHKCWEYIKPLYAHL 407
                   :......||...|||..|...|.||..|.:: |:||   .|..|.   |..|.:...:
pombe   351 SIRLLYILASLLSFPGYAIVEEKVSWRTLEFWTTLIED-FSMSKAATDPSKD---EIFKQIAFSV 411

  Fly   408 TRILVRKSEQPDEKSLAKWSSDDLECFRCYRQDISDTFMYCYDVLNDYILEILAAMLDEAIADLQ 472
            ......|...|..:....|.|...:.|..||:|:.|.....|.:..:.:..:....::...:|..
pombe   412 VEKAWWKMLLPSPEQWNSWPSSSRDSFNSYRRDLGDLLESSYSIFGERLYAMYITTIENFFSDGT 476

  Fly   473 RHPTHWTKLEACIYSFQSVAEHFGGEE---KRQIPRLMRVLAEIPYEKL-NVKLLGTALETMGSY 533
            ..|   ..||...|....:.|:...:.   ...:.||......|..... |.:||.|..:.:.|.
pombe   477 GSP---QSLEVSFYCLCCILEYDTNDSDTLDAWLTRLFETSFAIKASAFQNPQLLKTCSQLLSSC 538

  Fly   534 CNWLMENPAYIPPAINLLVRGLN-SSMSAQATL--GLKELCRDCQL--------------QLKP- 580
            ..:|..:|.|:..::.:|...|: |..|.|.|:  .:..||..|..              :|.|
pombe   539 SCFLQNHPQYLNISLPVLFDALHISETSIQMTVSRSIHTLCTTCASHLLTEIDGFMAVVEELTPK 603

  Fly   581 --YADPLLNACHASLN--TGRMKNSDSVR---LMFSIGKLMSLLRPEEIPKYLDI---IVSPCFE 635
              |...:|...::|:.  |.|:::.: :|   ||..:..:::.|:|...|. |:|   ::..|.:
pombe   604 LVYVPSVLEKIYSSVGYVTQRIEDIE-LRISYLMRLLNCILAQLQPSLYPN-LEIFENVLKSCLQ 666

  Fly   636 ELQAICQADSKTPAARIRTIFRLNMISTLFSSLNTDVDEQATDQPIV--QPVLLVMQRTMPIFKR 698
            .:..:  |.|::|......|               || ||:|.:...  |..:...|..:..|..
pombe   667 SVAGV--ALSQSPIGESPII---------------DV-EQSTQETTFWQQSCIAEFQAKLISFLT 713

  Fly   699 IAE-MWVEEIDVLEAACSAMKHAITNLRSSFQPMLQDLCLFIVASFQTRC-------CAPTLEIS 755
            .:| |.::..||:...|..|...:..:..|      ...|.||.:.|..|       .|..|.:.
pombe   714 HSESMALQYSDVVGLICKIMIAGLNEVEPS------PFSLPIVTTIQYFCDRFTEFPAAVLLTLG 772

  Fly   756 KTAIVMFFKDEGCKPLMQQLLREF---IQHSFKLFESTPEQNFSNISDTMETFFGCLTQIIKKIP 817
            ...:...:   |...::.::|.:.   ||:|..:..   |::|.|..|.....:...:.|::|.|
pombe   773 SAILTCPY---GQTDIIDKVLIDMCSSIQNSVVIIN---EESFMNNIDITVELYHFFSIILQKHP 831

  Fly   818 QVLEDKTLAYDRLVFYAQRGMTL---PESGAIRNSIQFLTHFVMQSRN---HAHVTEVVLATGEQ 876
            ..||.....:.:|:.  .|.:.|   ||......:.||:..|:...::   :.| |:.|.|....
pombe   832 SFLETMYPDFTQLIL--NRAINLLGKPERLLESAAGQFIISFITSEKSDLLNTH-TDFVNAIRSP 893

  Fly   877 TLYTAMMCVGYLTPRSQVDKFADILLAMN-RKYAAEMAVWMKSLMSTPNFPTQLITDADKTRYTA 940
            .:...::..|....||.:...:|||..:. :.::|..|...:|| ....||::.:::..|.|:..
pombe   894 LIAKILLGFGGNASRSSLPLLSDILGKLKAQNFSATRACLTQSL-EEEGFPSRNVSNEIKRRFLT 957

  Fly   941 LIIKEKVNKRLLQ 953
            .::|.::..::.|
pombe   958 DLLKARIKDKVKQ 970

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
cdm	NP_650682.1	IBN_N	29..93	CDD:197981	18/65 (28%)
		Xpo1	98..>220	CDD:462459	25/144 (17%)
		Importin_rep	418..454	CDD:436727	9/35 (26%)
		Importin_rep_3	838..912	CDD:465873	17/80 (21%)
kap111	NP_593051.1	Importin_rep	422..458	CDD:436727	9/35 (26%)
		Importin_rep_3	856..918	CDD:465873	13/62 (21%)