Protein Alignment cdm and mtr10

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650682.1
• Gene: cdm / 42171
• FlyBaseID: FBgn0261532
• Length: 971
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_595725.2
• Gene: mtr10 / 2539916
• PomBaseID: SPBC11G11.07
• Length: 955
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1064
• Identity: 208/1064 - (19%)
• Similarity: 414/1064 - (38%)
• Gaps: 222/1064 - (20%)

  Fly     9 LEEAVVSFYRSNSQNQAI-THEWLTDAEASPQAWQFSWQLM-QLGKSQEVQFFGAITLHSKLMKH 71
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pombe     4 LLSALATLYANTDREQKLQANNYLEEFQKSPAAWQICFSILNQDDSSIEAKLFAAQTLRQKIVYD 68

  Fly    72 WHEVPPENREELKQKILESIVRFAGGPKIVLNRLCISLGAYIVHMLGEWPGAIEEVINTFQNQRM 136
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pombe    69 FHQLPKETHIEFRNSLLQLFLAAKDSPRPLLVSLAVCMAAIALHMT-EWHNVIADVFQACS---- 128

  Fly   137 PNVSADVQLWIMLEVLTAIPEEA---QVIHTSVKRVVLRAEIAKR------VQLVIHTVERYLKL 192
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pombe   129 ---SKDPSGRCVLQFLSVLPEEASDPRKTSLSWEELCIRVDELLRDNGPAVLELLVQYVDAV--- 187

  Fly   193 QMNRVWDAEAYSNMNRAVKCVGTWIKNIGYTIEGCVTITAVLLEVVHKCYWPCIHAGDGCMTADE 257
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pombe   188 ---RASGSPSSADLGLVLTSLISWLREIPLD----KVMASPLIELAFR-------------SLDD 232

  Fly   258 NELAESCLKTMVNIIIQPDCHNYPKTAFVLIKMFLDSLSEITKTEWKRENDNEDIIVHIYMLFVS 322
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pombe   233 DLLLEDAVE------------------------FLCALFNETK-------DVDETTDAILMLYPR 266

  Fly   323 SVERHSTLLLSGITSADPEL---------------SILVHRIVQEIL---HCTDKPGIYPVEESC 369
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pombe   267 LLELQPKLIAA---CDDPETFRALGRLFAEAGEAWVVLIARMPNDFLPLVNCIAQVAANDTELEA 328

  Fly   370 STMALAFWY----MLQDEVFAMSNDEQKHKCWEYIKPLYAHLTRILVRKSEQPDEKSLA---KWS 427
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pombe   329 IKFTFAFWWDLKQMVELDVYAEAR--------QLFAPIYLELVRIIVRHLHYPRTEDLAINEQMA 385

  Fly   428 SDDL--------ECFRCYRQDISDTFMYCYDV--LNDYILEILAAMLDEAIADLQRHPTHWTKLE 482
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pombe   386 SNEVLFEDRDAEDRFRSFRHEMGDVLKDCCVVAGVSSCLVQISSQLIKVLKIKESGLPYYWQDVE 450

  Fly   483 ACIYSFQSVAEHFGGEEKRQIPRLMRVLAEIPYEKLNVKLLGTALETMGSYCNWLMENPAYIPPA 547
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pombe   451 APLFALRAIGRMVPANEDQVIGSLFQILPQLP-ENNKVRYAATLF--LGRYTEWTAQHSEFLELQ 512

  Fly   548 INLLVRGL---NSSMSAQATLGLKELCRDCQLQL--------------KPY--ADPLLNACHASL 593
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pombe   513 LNYISAGFEVANKEVQSAAAQALKHFCYDCREQLVGHLSQLHMFYLNAKTYLAPDPLMEVAQGLA 577

  Fly   594 NTGRMKNSDSVRL---MFSIGKLMSLLRPEEIPKYLDIIVSPCFEELQAICQADSKTPAARIRTI 655
            :...::...:|..   .|....|.|:|..:       :.::|...||:|:  ||:..
pombe   578 HIVDIQPVANVYQSVHSFLAPSLQSILLAQ-------VKLNPTQAELEAL--ADNID-------- 625

  Fly   656 FRLNMISTLFSSLNTDVDEQATDQPIV---QPVLLVMQRTMPIFKRIAEMWVEEIDVLEAACSAM 717
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pombe   626 -----IVTIFLSLVHPPSPAGELHPIVRLFQDIWPILSRTLDTFS----------DVL--ICERI 673

  Fly   718 KHAITNLRSSFQ-------PMLQDLCLFIVASFQTRCCAPTLEISKTAIVMFFKDEGCKPLMQQL 775
            ...:.|...:|:       |::.:.   ::..|:.......|.:|...:..|    |...:.:|.
pombe   674 SKLLKNFIYTFKEKAIVTLPVITEA---LIKGFEKTQYGCFLWVSGACVRQF----GVPEMDEQT 731

  Fly   776 LR---EFI-QHSFKLFESTPEQNFSNISDTMETFFGCLTQIIKKIPQ-VLEDKTLAYDRLVFYAQ 835
            |.   .|: :....:|.....:|...|.|.::.||..:...:...|| |||.:.|  :.|:..|.
pombe   732 LSAVWSFVGKQCTNMFYYMSNKNPKEIPDVIDDFFRLMMDALLANPQMVLESQML--ESLIQAAM 794

  Fly   836 RGMTLPESGAIR---NSIQFLTHFVMQSRNHAHVTEV----------VLATGEQTLYTAMM-CVG 886
            ..:.|.:...::   |.:|.|..|.:.:..::.:..:          :|....|.||..:. .:.
pombe   795 MSLQLEQQEPLQTVLNFLQDLLAFALHTPPYSLIEPLPDSLLKSLADLLLKNSQELYIILFNGMV 859

  Fly   887 YLTPRSQVDKFADILLAMNR-KYAAEMAVWMKSLMST-PNFPTQLITDADKTRYTALIIKEKVNK 949
            :..||..:...:.:|:.:.| .:||:.::.:|.:.:. ...|...|...::.::.|...|...:.
pombe   860 FTFPRDNISDASAVLIPLIRLVFAADPSLCIKYMSNVLDQLPAMTIGQEEREKFLANFSKHCTSS 924

  Fly   950 RL--LQQHLSE-MAM-KTRGLTEK 969
            .:  |:.||.: .|| :.|.||.:
pombe   925 EMPRLRAHLQDWTAMYRRRVLTPR 948

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
cdm	NP_650682.1	IBN_N	29..93	CDD:197981	19/64 (30%)
		Xpo1	98..>220	CDD:462459	25/130 (19%)
		Importin_rep	418..454	CDD:436727	10/48 (21%)
		Importin_rep_3	838..912	CDD:465873	15/88 (17%)
mtr10	NP_595725.2	IBN_N	23..89	CDD:197981	19/65 (29%)
		Xpo1	95..243	CDD:462459	31/202 (15%)