Protein Alignment cdm and TNPO3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650682.1
• Gene: cdm / 42171
• FlyBaseID: FBgn0261532
• Length: 971
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001369145.1
• Gene: TNPO3 / 23534
• HGNCID: 17103
• Length: 957
• Species: Homo sapiens
• Alignment Length: 1003
• Identity: 209/1003 - (20%)
• Similarity: 411/1003 - (40%)
• Gaps: 175/1003 - (17%)

  Fly    24 QAITHE-----------WLTDAEASPQAWQFSWQLMQLGKSQEVQFFGAITLHSKLMKHWHEVPP 77
            ||:.|:           ||.:.:.|..||:.|.||:|:.:..|..:|.|.|:..|:...::|:|.
Human    16 QALYHDPDPSGKERASFWLGELQRSVHAWEISDQLLQIRQDVESCYFAAQTMKMKIQTSFYELPT 80

  Fly    78 ENREELKQKILESIVRFAGGPKIVLNRLCISLGAYIVHMLGEWPGAIEEVINTFQNQRMPNVSAD 142
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Human    81 DSHASLRDSLLTHIQNLKDLSPVIVTQLALAI-ADLALQMPSWKGCVQTLVEKYSN--------D 136

  Fly   143 V-QLWIMLEVLTAIPEEAQVIHTSVKRVVL--RAEIAKRVQLVIHTVERYLKLQMNRVWDAEAYS 204
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Human   137 VTSLPFLLEILTVLPEE---VHSRSLRIGANRRTEIIEDLAFYSSTV---VSLLMTCVEKAGTDE 195

  Fly   205 NM-NRAVKCVGTWIKNIGYTIEGCVT---ITAVLLEVVHKCYWPCIHAGDGCMTADENELAESCL 265
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Human   196 KMLMKVFRCLGSWF-NLGVLDSNFMANNKLLALLFEVLQQ----------DKTSSNLHEAASDCV 249

  Fly   266 KTMVNIIIQPDCHNYPKTAFVLIKMFLDSLSEITKTEWKRENDNEDIIVHIYMLFVSSVERHSTL 330
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Human   250 CSALYAIENVET-NLP----LAMQLFQGVLTLETAYHMAVAREDLDKVLNYCRIFTELCE---TF 306

  Fly   331 LLSGITSADPELSILVHRIVQEILHCTDKPGIYPVEESCSTMALAFWYMLQDEVFAMSNDEQKHK 395
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Human   307 LEKIVCTPGQGLGDL--RTLELLLICAGHPQYEVVE-----ISFNFWYRLGEHLY-KTNDEVIHG 363

  Fly   396 CWE-YIKPLYAHLTRILVRKSE-QPDEKSLAKWSSDDLECFRCYRQDISDTFMYCYDVLNDYILE 458
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Human   364 IFKAYIQ----RLLHALARHCQLEPDHEGVPE-ETDDFGEFR----------MRVSDLVKDLIF- 412

  Fly   459 ILAAMLDEAIADL-----QRHPTHWTKLEACIYSFQSVAEH-----------------FGGEEKR 501
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Human   413 LIGSM--ECFAQLYSTLKEGNPP-WEVTEAVLFIMAAIAKSVDPKKPFSNAVCRHSLLFGQNITS 474

  Fly   502 QI--------------PRLMRVL---AEIPYEKLNVKLLGTALETMGSYCNWLMENPAYIPPAIN 549
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Human   475 EISNCEYLPPVLRENNPTLVEVLEGVVRLP-ETVHTAVRYTSIELVGEMSEVVDRNPQFLDPVLG 538

  Fly   550 LLVRGL-NSSMSAQATLGLKELCRDCQLQLKPYADPLLNACHASLNTGRMKNSDSVRLMFSIGKL 613
            .|::|| ...:::.|...:..:|..|:..:..:.:.||.... ||::..:....:|.|:.....:
Human   539 YLMKGLCEKPLASAAAKAIHNICSVCRDHMAQHFNGLLEIAR-SLDSFLLSPEAAVGLLKGTALV 602

  Fly   614 MSLLRPEEIPKYLDIIVSPCFEELQAICQADSKTPAARIR---TIFRLNMISTLFSSLNTDVDEQ 675
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Human   603 LARLPLDKITECLSEL---CSVQVMALKKLLSQEPSNGISSDPTVF-LDRLAVIFRHTNPIVENG 663

  Fly   676 ATDQPIVQPVLLVMQRTMPIFKRIAEMWVEEIDVLEAACSAMKHAITNLRSSFQPMLQDLCLFIV 740
            .|     .|...|:|...|:..........:..::|..|..::.|:..:......:||.|...:|
Human   664 QT-----HPCQKVIQEIWPVLSETLNKHRADNRIVERCCRCLRFAVRCVGKGSAALLQPLVTQMV 723

  Fly   741 ASFQTRCCAPTLEISKTAIVMFFKDEGCKPLMQQLLREFIQHSFKLFESTPEQN-FSNISDTMET 804
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Human   724 NVYHVHQHSCFLYLGSILVDEYGMEEGCRQGLLDMLQALCIPTFQLLE---QQNGLQNHPDTVDD 785

  Fly   805 FFGCLTQIIKKIPQVLEDKTLAYDRLVF----YAQRGMTLPESGAIRNSIQFLTHFVMQSRNHAH 865
            .|...|:.|::.|     .||...::|.    :|....||....|..:.::||...:.....:.|
Human   786 LFRLATRFIQRSP-----VTLLRSQVVIPILQWAIASTTLDHRDANCSVMRFLRDLIHTGVANDH 845

  Fly   866 ----------VTEVVLATGE----QTLYTAMMCVGYLTPRSQVDKFADILLAMNRKYAAEMAVWM 916
                      :.:|:...|:    |.|:|...|:    |...:...|::|..:.:........|:
Human   846 EEDFELRKELIGQVMNQLGQQLVSQLLHTCCFCL----PPYTLPDVAEVLWEIMQVDRPTFCRWL 906

  Fly   917 K-SLMSTPNFPT--------QLITDADK 935
            : ||...|...|        :.:||..|
Human   907 ENSLKGLPKETTVGAVTVTHKQLTDFHK 934

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
cdm	NP_650682.1	IBN_N	29..93	CDD:197981	19/74 (26%)
		Xpo1	98..>220	CDD:462459	30/125 (24%)
		Importin_rep	418..454	CDD:436727	8/35 (23%)
		Importin_rep_3	838..912	CDD:465873	15/87 (17%)
TNPO3	NP_001369145.1	IBN_N	33..96	CDD:197981	19/62 (31%)
		Xpo1	121..249	CDD:462459	36/152 (24%)