Protein Alignment cdm and T16G12.6

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650682.1
• Gene: cdm / 42171
• FlyBaseID: FBgn0261532
• Length: 971
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001366683.1
• Gene: T16G12.6 / 176420
• WormBaseID: WBGene00011807
• Length: 949
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1036
• Identity: 206/1036 - (19%)
• Similarity: 405/1036 - (39%)
• Gaps: 201/1036 - (19%)

  Fly     6 IARLEEAVVSFYRSNSQNQ-----AITHEWLTDAEASPQAWQFSWQLMQLGKSQEVQFFGAITLH 65
            ||.:.|    ||.:..:::     ||...:.||.|...........:.|...|..|::|||:.|:
 Worm    12 IATINE----FYTTTDEHRRHEIDAILCRFKTDYECMQTVGACMRIISQPTSSSIVRYFGAVALY 72

  Fly    66 SKLMKHWHEVPPENREELKQK--ILESIVRFA-GGPKIVLNRLCISLGAYIVHMLGE-WPGAIEE 126
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 Worm    73 DVIRVRSEECIANEAVQLSLKTFLIDSLKSGAYAQTTSVLNKLSAALALFSLYCVPDLWPTPVQD 137

  Fly   127 VINTFQNQRMPNVSADVQLWIMLEVLTAIPEE-AQVIHTSVKRVVLRAEIAKRVQLVIHTVERYL 190
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 Worm   138 L--------TPTLAGSPE--ILLKVLSDMAAEFSHVTMPLTQRSKLKGELHKFSENIISVLAVVL 192

  Fly   191 KLQMNRVWDAEAYSNMNRAVKCVGTWIKNIGYTIEGCV-TITAVLLEVVHKCYWPCIHAGDGCMT 254
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 Worm   193 -----RGGDTSSITK-QAAVECVEQWLRLPGMALDQWTHVLSDVLGAVVQDC------------- 238

  Fly   255 ADENELAESCLKTMVNIIIQPDCHNYPKTAFVLIKMFL-DSLSEITKTEWKRENDNEDIIVHIYM 318
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 Worm   239 --------TALASILDIIAENDEFHRNSTLIISICQYICFNVSGKIEEELGADASSEEIAT--LV 293

  Fly   319 LFVSSVERHS--TLLLSGITSADPELSILVHRIVQEILHCTDKPGIYPVEESCSTMALAFWYMLQ 381
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 Worm   294 AATCSVSENSVPTLVECAAQGGDSELVIRLSQVMQVL---ANMQGQYPLEEIVSDLPSIYFITLR 355

  Fly   382 DEVFAMSN-----DEQKHKCWEYIKPLYAHLTRILVRKSEQPDEKSLAKWSSDDLECFRCYRQDI 441
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 Worm   356 TEIMQTINSGIQIDKQ---ILSQIGQIYAKILEMSIKKLAFPSKEIWLSWNLEEREQFESYRKTR 417

  Fly   442 SDTFMYCYDVLNDYILEILAAMLDEAI--ADLQRHPTHWTKLEACIYSFQSVAEHFGGEEKRQIP 504
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 Worm   418 SEASYDSYHFSAAGTLDFLNQTLEQALGAGDVNR-------TESCIFQWECVADYLGETDYTAIL 475

  Fly   505 RLMRVLAEIPY------------EKLNVKLL---GTALETMGSYCNWLMENP-------AYIPPA 547
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 Worm   476 KCLEMCASSQLSAPPPSTSSSSSDKIDIDLNRRGETLMRLFYSLSHLIQEHEQAKELECALIPII 540

  Fly   548 INLLVRGLNSSMSAQATLGLKELCRDCQLQLKPYADPLLNACHASLNTGRMKNSDSVRLMFSIGK 612
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 Worm   541 LTYVSTRIPSVRQAIDT--LQKFSEDRPESLDIIGEQISTTCYEFFNSSNARDSDRLAALKCIGY 603

  Fly   613 LMSLLRPEEIPKYLDIIVSPCFEELQAICQADSKTPAARIRTIFRLNMISTLFSSLNTDVDEQAT 677
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 Worm   604 VLSRRKPSETMKIIGQILSQ-----QNINEPGIDDQTRHRRYAFQINTFSALFASLTNKKDSNST 663

  Fly   678 ------DQPIVQPVLLVMQRTMPIFKRIAEMWVEEID------VLEAACSAMKHAITNLRS---- 726
                  ::|.:..:|.   ..:|:|:.:.. ....:|      :::..|.|::.|:|:|..
 Worm   664 SLGENDEEPTIVQLLC---EAIPVFETLCS-GGSGLDGSNSGSLIQEVCKAVRSALTSLPEHYLP 724

  Fly   727 SFQPMLQDL---CLFIVASFQTRCCAPTLEISKTAI------------------VMFFKDEGCKP 770
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 Worm   725 SFFPFIVSLLNSSLFVTESVIAACA-----LAKSTVLQCGSLVGVDMANAFAQWILAFEQHVESP 784

  Fly   771 LMQ---QLLREFIQHSFKLFESTPEQNFSNISDTMETFFGCLTQIIKKIPQVLEDKTLAYDRLVF 832
            .:.   ||:.:.::.::|:....|:.:.:....:::.   |...|:..
 Worm   785 QVDEYLQLIYQVVRKNWKMIRKFPDPSMAAFQSSLKI---CSFIILNS----------------- 829

  Fly   833 YAQRGMTLPESGAIRNSIQFLTHFVMQSRNHAHVT-EVVLATGEQTLYTAMM--CVGYLTPRSQV 894
                  ::|..  :|::.|.|......:.:|..|. :...|.....|..|:.  ..|.|. |..|
 Worm   830 ------SVPTE--VRSASQILAALATYATSHDDVAMKSTFAENGPILIRAVFRRVQGELM-RPTV 885

  Fly   895 DKFADILLAMNRKYAAEMAVWMKSLMSTPNFPTQ-LITDADKTRYTALIIKEKVNKRLLQQ 954
            :..|||||.    |..|.....::|:|...:.|. |:|.         :.:|..|.|..:|
 Worm   886 EALADILLF----YFKEFTTDTRTLISGEPYGTSALVTS---------MFREIGNPRNFKQ 933

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
cdm	NP_650682.1	IBN_N	29..93	CDD:197981	14/65 (22%)
		Xpo1	98..>220	CDD:462459	27/123 (22%)
		Importin_rep	418..454	CDD:436727	8/35 (23%)
		Importin_rep_3	838..912	CDD:465873	19/76 (25%)
T16G12.6	NP_001366683.1	Xpo1	111..>214	CDD:462459	27/118 (23%)
		Importin_rep	393..>414	CDD:436727	4/20 (20%)
		Importin_rep_3	835..893	CDD:465873	15/58 (26%)