Protein Alignment cdm and tsr-1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650682.1
• Gene: cdm / 42171
• FlyBaseID: FBgn0261532
• Length: 971
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001370995.1
• Gene: tsr-1 / 173601
• WormBaseID: WBGene00006647
• Length: 829
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 905
• Identity: 156/905 - (17%)
• Similarity: 340/905 - (37%)
• Gaps: 175/905 - (19%)

  Fly   149 LEVLTAIPEEAQVIH--TSVKRVVLRAEIAKRVQLVI----HTVERYLKLQMNRVWDAEAYSN-- 205
            |.:|...|||.:.|.  ...:|..:|.|:|...|.:|    |.:|::             :||
 Worm     3 LTLLQVFPEEVEQIRGVGENRRHAIRNELAACEQPMITFLSHVLEKF-------------HSNAD 54

  Fly   206 -MNRAVKCVGTWIKNIGYTIE--GCVTITAVLLEVVHKCYWPCIHAGDGCMTADENELAESCL-K 266
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 Worm    55 VLKRVFKCLESNLQNHQMRTDHFAASPLISMIFHVI----------------ASIDPIIPSCLHE 103

  Fly   267 TMVNIIIQ-----PDCHNYPKTAFVLIKMFLDSLSEITKTEWKRENDNEDIIVHIYMLFVSSVER 326
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 Worm   104 TATNCIVQALYRVEDLEMHRKLAEVVHRGVISLVSAFEKAQ---QVEDFDRLQNIARIFVEMVE- 164

  Fly   327 HSTLLLSGITSADPELSILVHRIVQEILHCTDKPGIYPVEESCSTMALAFWYMLQDEVFAMSNDE 391
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 Worm   165 --SFYVQIVNEANPDPAAIGSLACFELLLLVAKHHDWALIE----MSFNVWYRITEELFKYDDDQ 223

  Fly   392 Q----KHKCWEYIKPLYAHLTRILVRKSEQPDEKSLAKWSSDDLECFRCYRQDISDTFMYCYDVL 452
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 Worm   224 YIGRFRPYAEKFIQCLYEH-----------------CKLDADDVDDLLDETSEFGEFRLKAVEAL 271

  Fly   453 NDYILEI----LAAMLDEAIADLQRHP-THWTKLEACIYSFQSVAEHFGGEEKRQIPRLMRVLAE 512
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 Worm   272 RDVVFIVNSDKCIQMMHQKLIECCHKPNASWEESESALFVMSAVVQNLLPESDTNMPEVLQLICS 336

  Fly   513 IPYEKLNVKLLGTALETMGSYCNWLMENPAYIPPAINLLVR-GLNSSMSAQATLGLKELCRDCQL 576
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 Worm   337 LPVQS-PPALIATSLSLISDLNDWFEQHSNLLEPVVRWTLQFATDTRYASHVALCFDRITSKCAV 400

  Fly   577 QLKPYADPLLNACHA--SLNTGRMKNSDSV-RLMFSIGKLMSLLRPEEIPKYLDIIVSPCFEELQ 638
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 Worm   401 QMTPLLPQLLTLIGVLEQTTTNGAKVEEAICSLTRAISMIASKLPAHEAKIAMEQLCEPIVRNLL 465

  Fly   639 AICQADSKTPAARIRTIFRLNMISTLFSSLNTDV---------------------DEQATDQPIV 682
            ....|...|.||               ||.|.:.                     ..:|......
 Worm   466 RATDATDATFAA---------------SSTNNNTAGAGAAGANKENEGAPPRGSKANEAWASLAT 515

  Fly   683 QPVLLVMQRTMPIFKRI---------AEM-W---VEE-IDVL-------EAACSAMKHAITNLRS 726
            :|:|.: .|...:||.:         ||: |   ::: ||.|       |.....::|:|.:.|.
 Worm   516 RPMLWI-DRCACVFKDVWTSGSKQPPAEIPWFTVIQQCIDALLKSTRKFEGTPRLIEHSIRSCRL 579

  Fly   727 SFQ-------PMLQDLCLFIVASFQTRCCAPTLEISKTAIVMFFKDEGCKPLMQQLLREFIQHSF 784
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 Worm   580 IFRALGAQSMPFVEPVVTMMIETYPKHRHSSYLYLASVIVDEYGQLDKMRPGLLQMLDTLARHTF 644

  Fly   785 KLFESTPEQNFSNISDTMETFFGCLTQIIKKIPQVLEDKTLAYDRLVFYAQRGMTLPESGAIRNS 849
            .|...   |...|..||::..|....:...:...:.....:: :.|...|...:.|....|.|:.
 Worm   645 PLLVG---QGAINHPDTVDDLFRLAQRFTMRATSIFFTDPVS-ELLFICAVLNIRLDHPDANRSV 705

  Fly   850 IQFLTHFVMQ-------SRNHAHVT--EVVLATGEQTLYTAMMCVGYLTPRSQVDK-FADILLAM 904
            .:|:...:.|       |...|.||  :.::....|::.|..:.:...:...|:.: .||::|.:
 Worm   706 NKFIMEVLEQLATAKKASYTDAGVTAAQTLVNRNAQSIVTNALSMCLFSHSGQIRREMADVVLQV 770

  Fly   905 NR----KYAAEMAVWMKSLMSTPNFPTQLITDADKTRYTALIIKEKVNKRLLQQHLSEMA 960
            .|    ||   ..:..:::.:.||.|.: .|....|.:...:.||: .:..:..|..::|
 Worm   771 GRNDPSKY---KQILTQAVAALPNDPVK-ATPQQLTEFVEAVCKER-ERHAVFNHTRDLA 825

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
cdm	NP_650682.1	IBN_N	29..93	CDD:197981
		Xpo1	98..>220	CDD:462459	19/79 (24%)
		Importin_rep	418..454	CDD:436727	4/35 (11%)
		Importin_rep_3	838..912	CDD:465873	18/87 (21%)
tsr-1	NP_001370995.1	None