Protein Alignment cdm and Tnpo-SR

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_650682.1
• Gene: cdm / 42171
• FlyBaseID: FBgn0261532
• Length: 971
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_061498765.1
• Gene: Tnpo-SR / 1274240
• VectorBaseID: AGAMI1_010185
• Length: 941
• Species: Anopheles gambiae
• Alignment Length: 955
• Identity: 179/955 - (18%)
• Similarity: 376/955 - (39%)
• Gaps: 162/955 - (16%)

  Fly     1 MEPIDIARLEEAVVSFYRS-NSQNQAITHEWLTDAEASPQAWQFSWQLMQLGKSQEVQFFGAITL 64
            |||.....:.:.|.:.|.. |:..:....:||.:.:.|..:|:.:.:|::.........|.|.|:
Mosquito     1 MEPPTAEAVLQGVFTLYNDPNNVEKEKASKWLEEFQKSIHSWKIADELLRQKHDLNSCTFAAQTM 65

  Fly    65 HSKLMKHWHEVPPENREELKQKILESIVRFAGGPK-IVLNRLCISLGAYIVHMLGEWPGAIEEVI 128
            .:|:...:||:|....|.|:|.:||.:.......| :::.:|.::| |.:..::..|...:..::
Mosquito    66 RNKIQNSFHELPESAHESLRQSLLEHLSHITIETKSVIVTQLSLAL-ADLALLMSSWQKPVATLL 129

  Fly   129 NTF-QNQRMPNVSADVQLWIMLEVLTAIPEEAQVIHTSVKRVVLRAEIAKRVQLVIH------TV 186
            ..| .|..|        ::.::|:||.||||....|       ||....:|.:::|.      .|
Mosquito   130 QRFSSNANM--------MYALIELLTLIPEEVNSRH-------LRLGANRRKEILIDLEADSTLV 179

  Fly   187 ERYLKLQMNRVWDAEAYSNMN-----RAVKCVGTWIKNIGYTIEGCVTITAVLLEVVHKCYWPCI 246
            ..||.:.:       ...|.|     :.:||..:|::           |.|..|.
Mosquito   180 SEYLTVCL-------VNGNENELLRSKILKCFTSWVQ-----------INAFKLP---------- 216

  Fly   247 HAGDGCMTADENELAES-----CLKTMVNIIIQPDCHNYPKTAFVLI---------------KMF 291
                        |:::|     |.:.:.:....||.|.....:...:               |:|
Mosquito   217 ------------EISDSMIIVYCFQLLSSGTTSPDLHEAATDSLCSLLHCMELNNSRGGLDEKLF 269

  Fly   292 --LDSLSEITKTEWKRENDNEDIIVHIYMLFVSSVERHSTLLLSGITSADPELSILVHRIVQEIL 354
              :..|.|.......:|  :.|..:::..||...||.:.|.:::......|..|:   :.:..:|
Mosquito   270 GGIMCLEEAYNMSVAQE--DLDKSMNLCRLFTVLVESNLTRMVALSDDETPHYSV---KSLDLVL 329

  Fly   355 HCTDKPGIYPVEESCSTMALAFWYMLQDEVFAMSNDEQKHKCWEYIKPLYAHLTRILVRKSE-QP 418
            :|.   |.|..|  .:.:....||.|.::::..:|    ::...:.||....|...|.:.|: .|
Mosquito   330 NCV---GHYDYE--VAEITFNMWYRLSEDLYQRNN----YQLTAHFKPYVERLIAALYKHSQLDP 385

  Fly   419 DEKSLAKWSSDDLECFRCYRQDISDTFMYCYDVLNDYILEILA-AMLDEAIADLQRHPTHWTKLE 482
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Mosquito   386 DHDGLVEEGGS----FKDFRSKVS-------EIIKDVIFIVSSISCFKQMFVVLQSPNVSWESSE 439

  Fly   483 ACIYSFQSVAEH-----------------FGG--EEKRQIPRLMRVLAEIPYEKLNVKLLGTALE 528
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Mosquito   440 AALFIMQNVARNILPEIMELGEREIPTSRFNQLCEESEVVPKVVEAILNLP-ENCHIAIRYTSIS 503

  Fly   529 TMGSYCNWLMENPAYIPPAINLLVRGL--NSSMSAQATLGLKELCRDCQLQLKPYADPLLNACHA 591
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Mosquito   504 ILGELCDWIDSNPETLQPVLNFLLFALQQKNGLASAAANSLQLICSTCKKHMVGHISGLMEIARC 568

  Fly   592 SLNTGRMKNSDSVRLMFSIGKLMSLLRPEEIPKYLDIIVSPCFEELQAICQADS---KTPAARIR 653
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Mosquito   569 -LDSFDIQSESAIGLLKGISIIIGRLPPAQLTPAMQELCSFQVEALSRLANGDDDGLDGKKSRSD 632

  Fly   654 TIFRLNMISTLFSSLNTDVDEQATDQPIVQPVLLVMQRTMPIFKRIAEMWVEEIDVLEAACSAMK 718
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Mosquito   633 PAFWLDRLASIYRHVSPTVRNNE-----VNPCAFVIVNNWNVLSRALERYKNDSKIMERIVRCIR 692

  Fly   719 HAITNLRSSFQPMLQDLCLFIVASFQTRCCAPTLEISKTAIVMFFKDEGCKPLMQQLLREFIQHS 783
            :||..:.....|:|:.|...|:..:.....:..|.:....:..|..:|||...:..:|:.||:.:
Mosquito   693 YAIRCIGKQAMPILEPLVKQIITIYSGHNHSCLLYLGSILVDEFAYEEGCTQGLLNMLQAFIEPT 757

  Fly   784 FKLFESTPEQNFSNISDTMETFFGCLTQIIKKIP-QVLEDKTLAYDRLVFYAQRGMTLPESGAIR 847
            |.:.:.  |....|..|.::.||...|:.|::.| |.|:...:.  .::.......||....|..
Mosquito   758 FGVLQM--ENGLKNHPDMVDDFFRLATRFIQRAPLQFLQSPLVT--PIIQCGLLACTLDHREANI 818

  Fly   848 NSIQFLTHFVMQSRNH---AHVTEVVLATGE----QTLYTAMMCV 885
            :.::|....:...|.:   ..|..::.:.||    ..||.::.|:
Mosquito   819 SVMRFFCSLLRHDRANDLEPMVQSILASHGEALIMNLLYASVFCL 863

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
cdm	NP_650682.1	IBN_N	29..93	CDD:197981	17/63 (27%)
		Xpo1	98..>220	CDD:462459	28/134 (21%)
		Importin_rep	418..454	CDD:436727	6/35 (17%)
		Importin_rep_3	838..912	CDD:465873	11/55 (20%)
Tnpo-SR	XP_061498765.1	None