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Protein Alignment Sur-8 and SHOC2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262665.1 Gene:Sur-8 / 42093 FlyBaseID:FBgn0038504 Length:694 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_031399.2 Gene:SHOC2 / 8036 HGNCID:15454 Length:582 Species:Homo sapiens


Alignment Length:558 Identity:327/558 - (58%)
Similarity:420/558 - (75%) Gaps:7/558 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    85 AGGATGSTGSGQQP-TGSNGHSHLHNENNANMPPETRPKMVTVKHPESNKPKPTTKKSKPIQADQ 148
            |.|..|.....::| |..........:::|..|........|:|.|   .|.|.|:|.   .::.
Human    30 ASGGFGKESKEKEPKTKGKDAKDGKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRP---NPAPGTRKK---SSNA 88

  Fly   149 DVIKALQRCRDEGIKRLDLSKSSITVIPSTVKECVHLTELYLYSNKIGQLPPEIGCLVSLRNLAL 213
            :|||.|.:||:|...||||||.||.::||::||...||||||||||:..||.|:||||:|..|||
Human    89 EVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLAL 153

  Fly   214 NENSLTSLPESLQNCSQLKVLDLRHNKLAEIPPVIYRLRSLTTLYLRFNRITAVADDLRQLVNLT 278
            :||||||||:||.|..:|::||||||||.|||.|:|||.|||||||||||||.|..|::.|..|:
Human   154 SENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKLS 218

  Fly   279 MLSLRENKIRELGSAIGALVNLTTLDVSHNHLEHLPEDIGNCVNLSALDLQHNELLDIPDSIGNL 343
            |||:|||||::|.:.||.|.||.||||:||.|||||::||||..::.||||||||||:||:||||
Human   219 MLSIRENKIKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNL 283

  Fly   344 KSLVRLGMRYNRLSSVPATLKNCKSMDEFNVEGNGITQLPDGMLASLSGLTTITLSRNQFASYPT 408
            .||.|||:||||||::|.:|..|.:::|.|:|.|.|:.||:.:|:||..|.::||:||.|..||.
Human   284 SSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPV 348

  Fly   409 GGPAQFTNVYSINLEHNRIDKIPYGIFSRAKGLTKLNMKENMLTALPLDIGTWVNMVELNLATNA 473
            |||:||:.:||:|:|||||:|||:|||||||.|:|||||:|.||:||||.|||.:|||||||||.
Human   349 GGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQ 413

  Fly   474 LQKLPDDIMNLQNLEILILSNNMLKKIPNTIGNLRKLRILDLEENRIEVLPHEIGLLHELQRLIL 538
            |.|:|:|:..|.:||:||||||:|||:|:.:|||||||.||||||::|.||:||..|.:||:|:|
Human   414 LTKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVL 478

  Fly   539 QTNQITMLPRSIGHLGNLTHLSVSENNLQFLPEEIGSLESLENLYINQNPGLEKLPFELALCQNL 603
            ..||:|.|||.||||.|||||.:.||.|..||||||:||:||.||:|.||.|..||||||||..|
Human   479 TNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKL 543

  Fly   604 KYLNIDKCPLSTIPPEIQAGGPSLVLQWLKMHSPYRQM 641
            ..::|:.||||.:||:|.|||||.::|:|||..|||.|
Human   544 SIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAM 581

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Sur-8NP_001262665.1 leucine-rich repeat 163..184 CDD:275380 12/20 (60%)
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PPP1R42 472..617 CDD:455733 89/144 (62%)
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SHOC2NP_031399.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..88 14/63 (22%)
RVxF motif, important for interaction with PP1c. /evidence=ECO:0000269|PubMed:35768504, ECO:0000269|PubMed:35830882, ECO:0000269|PubMed:35831509, ECO:0000269|PubMed:36175670 63..66 0/2 (0%)
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leucine-rich repeat 543..563 CDD:275380 9/19 (47%)

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