DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment cher and Flna

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001262659.2 Gene:cher / 42066 FlyBaseID:FBgn0014141 Length:2577 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006229631.1 Gene:Flna / 293860 RGDID:1560614 Length:2647 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2656 Identity:1224/2656 - (46%)
Similarity:1621/2656 - (61%) Gaps:283/2656 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   171 DEDMEA-ERDLAEDAQWKKIQQNTFTRWANEHLKTIDRSINNLETDLSDGLRLIALIEVLSQKRM 234
            |.:|.| |:||||||.||||||||||||.|||||.:.:.|.||:||||||||||||:||||||:|
  Rat    25 DAEMPATEKDLAEDAPWKKIQQNTFTRWCNEHLKCVSKRIANLQTDLSDGLRLIALLEVLSQKKM 89

  Fly   235 -PKYNKRPTFRSQKLENVSVALKFLQDEGIKIVNIDSSDIVDCKLKLILGLIWTLILHYSISMPM 298
             .|:|:|||||..:||||||||:||..|.||:|:|||..|||..|||||||||||||||||||||
  Rat    90 HRKHNQRPTFRQMQLENVSVALEFLDRESIKLVSIDSKAIVDGNLKLILGLIWTLILHYSISMPM 154

  Fly   299 WDGEDDKQLNGSGHTPKQRLLNWIHAKIPDLPINNFTNDWTTGKAVGALVDACAPGLCPDWELWD 363
            ||.|:|::  ....|||||||.||..|:|.|||.||:.||.:|:|:|||||:|||||||||:.||
  Rat   155 WDEEEDEE--AKKQTPKQRLLGWIQNKLPQLPITNFSRDWQSGRALGALVDSCAPGLCPDWDSWD 217

  Fly   364 PKDAVQNASEAMGLADDWLNVRQLIKPEELVNPNVDEQSMMTYLSQYPNSKLKTGAPLRPKTNPN 428
            ....|.||.|||..|||||.:.|:|.|||:|:|||||.|:||||||:|.:|||.|||||||.||.
  Rat   218 ASKPVNNAREAMQQADDWLGIPQVITPEEIVDPNVDEHSVMTYLSQFPKAKLKPGAPLRPKLNPK 282

  Fly   429 SIPPPRVRAYGPGIEPIGPVVGAPANFTVETFSAGKGSVDVDIQGPNGEIEKADVRFNNDKNLTY 493
                 :.|||||||||.|.:|...|.|||||.|||:|.|.|.::.|.|..|:|.|..|||||.|:
  Rat   283 -----KARAYGPGIEPTGNMVKKRAEFTVETRSAGQGEVLVYVEDPAGHQEEAKVTANNDKNRTF 342

  Fly   494 TVSYIPKSEGSHKVAVKFSGRDIPKSPFPVKVEGHAGDASKVKVTGPGIQPNGVTIKKPTFFDIL 558
            :|.|:|:..|:|||.|.|:|:.|.||||.|.|:...||||||...|||::|:|....|.|:|:|.
  Rat   343 SVWYVPEVTGTHKVTVLFAGQHIAKSPFEVYVDKSQGDASKVTAQGPGLEPSGNIANKTTYFEIF 407

  Fly   559 AKDAGRGVPEVIIIDPANHKTSVAAKVRQLENDTWRCEYVTALQGLHSVNVFYAGTPIPNSPFPV 623
            ...||.|..||:|.||...|.:|..::....:.|:||.|...::|:|:|:|.:||.|||.||:.|
  Rat   408 TAGAGIGEVEVVIQDPTGQKGTVEPQLEARGDSTYRCSYQPTMEGVHTVHVTFAGVPIPRSPYTV 472

  Fly   624 KVAPLSDARKVRASGRGLQATGVRVGDDADFKIYTEGAGEGEPEVRVIGPGGMNQNVMQSKVDGN 688
            .|....:....||.|||||..||||.:.||||:||:|||.||.:|.|.||.| .:.|.|..:...
  Rat   473 TVGQACNPTACRAVGRGLQPKGVRVKETADFKVYTKGAGSGELKVTVKGPKG-EERVKQKDLGDG 536

  Fly   689 TYECHYYPTKEGRYVIMVTFAGQEVAKSPFEVKVGPK-KESSIVAYGPGLSSGVIGYPAAFVVET 752
            .|...||||..|.|.:.:|:.||.:.:||||||||.: ....:.|:||||..|::|..|.||||.
  Rat   537 VYGFEYYPTIPGTYTVTITWGGQNIGRSPFEVKVGTECGNQKVRAWGPGLEGGIVGKSADFVVEA 601

  Fly   753 NG-ETGALGFTVAGPSQAEIECHDNGDGSALVKYHPTAVGEYAVHILCDNEDIPKSPFIAQI--L 814
            .| :.|.|||:|.|||||:|||.|.||||..|:|.|...||||||:||::|||..|||:|.|  .
  Rat   602 IGDDVGTLGFSVEGPSQAKIECDDKGDGSCDVRYWPQEAGEYAVHVLCNSEDIRLSPFMADIREA 666

  Fly   815 PRTDFHPELVKASGPGLEKNGVTINQPTSFTVDPSKAGNAPLDVVVQDVFGTKLPVELKNNPDGT 879
            |: ||||:.|||.||||||.||.||:|..||||...||.|||.|.|||..|..:...:|:|.:||
  Rat   667 PQ-DFHPDRVKARGPGLEKTGVAINKPAEFTVDAKHAGKAPLRVQVQDNEGHSVETTVKDNGNGT 730

  Fly   880 KKVTYTPTSGVPHTVEVNYGGVSTPNSPHRVYVGVPVDAAKVQAFGPWL-QPGVRPNAATHFNVD 943
            ...:|.|...|.||..|::||||.||||.||.||......||:.:||.: :.|::.:..|:|.||
  Rat   731 YSCSYVPRKPVKHTAMVSWGGVSIPNSPFRVNVGAGSHPNKVKVYGPGVAKTGLKAHEPTYFTVD 795

  Fly   944 AREAGDAE--------------------------------------------------------- 951
            ..|||..:                                                         
  Rat   796 CTEAGQGDVSIGIKCAPGVVGPTEADIDFDIIRNDNDTFTVKYTPCGAGSYTIMVLFADQATPTS 860

  Fly   952 ---LKVKIIHEETKIEV--------------PCR------------------------------I 969
               :||:..|:.:|::.              |..                              |
  Rat   861 PIRVKVEPSHDASKVKAEGPGLNRTGVELGKPTHFTVNAKTAGKGKLDVQFSGLAKGDAVRDVDI 925

  Fly   970 IDNEDNTYSVEVIPPSKGAYTTTMTYGGQRVPLGE-KVVVEQTVDVSKIKVDGLEPTAPLNSLQQ 1033
            ||:.||||:|:..|..:|....::||||..:|... .|.|..::|:|||||.||.....:...|:
  Rat   926 IDHHDNTYTVKYTPVQQGPVGVSVTYGGDHIPKSPFSVGVSPSLDLSKIKVSGLVDKVDVGKDQE 990

  Fly  1034 FRIITHGL-PKADLAVTITSPSGNRIKAHIIP--TAEGFLVNFTPTQLGEYLLSICFGGTPITPR 1095
            |.:.:.|. .:..:|..|.||||..:...:.|  .|:..:|.|.|.:.|.|.:.:.:.|.|:...
  Rat   991 FTVKSKGAGGQGKVASKIVSPSGAAVPCKVEPGLGADNSVVRFVPREEGPYEVEVTYDGVPVPGS 1055

  Fly  1096 PFRLQCLTGSDSNKVQAFGPGLERGIVGQPAEFMIDTRGAGQGGLGVTVEGPCEAAINCRDNGDG 1160
            ||.::.:..:..:||:||||||:.|..|.||.|.|||:|||.||||:||||||||.:.|.|||||
  Rat  1056 PFPVEAVAPTKPSKVKAFGPGLQGGNAGSPARFTIDTKGAGTGGLGLTVEGPCEAQLECLDNGDG 1120

  Fly  1161 TCNVAYLPTEAGDYTVNITFNERHITGSPFQPLIV------------------------------ 1195
            ||:|:|:|||.|||.:||.|.:.||.||||:..:|                              
  Rat  1121 TCSVSYVPTEPGDYNINILFADTHIPGSPFKAHVVPCFDASKVKCSGPGLERATAGEVGQFQVDC 1185

  Fly  1196 -----------------------------------------------------PVPNLKN----- 1202
                                                                 ||||..:     
  Rat  1186 SSAGSAELTIEICSEAGLPAEVYIQDHGDGTHTITYIPLCPGAYTVTIKYGGQPVPNFPSKLQVE 1250

  Fly  1203 --TRVSGI-----GIQPHGVIMNAATDFMVDMSKVGSNIDSGKLSCAIFDPMGHVLPSKIVQGPT 1260
              ...||:     ||:..||...|.|:|.|| ::..:......:...:.:|.|: |....||...
  Rat  1251 PAVDTSGVQCYGPGIEGQGVFREATTEFSVD-ARALTQTGGPHVKARVANPSGN-LTDTYVQDCG 1313

  Fly  1261 DDIFRIMYTPFEAGRHTIELMYDNIPVPGSPFVVNVKSGCDPARCKAYGPGLEKGLTNQKNKFTV 1325
            |..:::.|||:|.|.|::::.||..|||.|||.|.|..||||:|.:.:|||::.|.||:.|||||
  Rat  1314 DGTYKVEYTPYEEGVHSVDVTYDGSPVPSSPFQVPVTEGCDPSRVRVHGPGIQSGTTNKPNKFTV 1378

  Fly  1326 ETKGAGNGGLSLAIEGPSEAKMTCTDNRDGSCDVDYLATDPGEYDITIRFADKHIPGSPFRVLVE 1390
            ||:|||.|||.||:||||||||:|.||:||||.|:|:..:.|.|.:.:.:....:|||||:|.|.
  Rat  1379 ETRGAGTGGLGLAVEGPSEAKMSCMDNKDGSCSVEYIPYEAGTYSLNVTYGGHQVPGSPFKVPVH 1443

  Fly  1391 ETVDPSKVKVYGPGIEHGQVRESVPTFFNVDVGEAGPGRIAVKLTNSEGI--PVDNLRVEDKGNC 1453
            :..|.||||..|||:..|.||.::|..|.||..:||...:.||:...:|:  |||   |.|..:.
  Rat  1444 DVTDASKVKCSGPGLSPGMVRANLPQSFQVDTSKAGVAPLQVKVQGPKGLVEPVD---VVDNADG 1505

  Fly  1454 IYAVHYVPPKAGSVLTCQVKFSEVEVPCSPFVMTVFPKSEPTKVKVKGVN-EKKKTPASLPAEFE 1517
            ...|:|||.:.|| .:..|.:.|.|||.|||.:.|.|..:.:|||..|.. .....|||||.||.
  Rat  1506 TQTVNYVPSREGS-YSISVLYGEEEVPRSPFKVKVLPTHDASKVKASGPGLNTTGVPASLPVEFT 1569

  Fly  1518 IDTKQAGQADINVAIKNPKGKAMQPRLEEVSTGTYVVSFVPDECGTYQCSIKYGDKEIEGSPFKL 1582
            ||.|.||:..:.|.|.:|:||..:..:::...|||.|::|||..|.|...||||..||..||:::
  Rat  1570 IDAKDAGEGLLAVQITDPEGKPKKTHIQDNHDGTYTVAYVPDVTGRYTILIKYGGDEIPFSPYRV 1634

  Fly  1583 EAFPTGEAKKCKLVEQ----------APKIQTSGSQSHLKVDAREAGDGAVTCKITNKAGSEIVD 1637
            .|.|||:|.||.:...          .|.||. |.::.:.||.:.||.|.|||.:....||| ||
  Rat  1635 RAVPTGDASKCTVTVSIGGHGLGAGIGPTIQI-GEETVITVDTKAAGKGKVTCTVCTPDGSE-VD 1697

  Fly  1638 IDVIE-KDGFFDILYALNDPGDYDINVKFGGKDIPNGSFSIKAVESIE---------QYSHSEYI 1692
            :||:| :||.|||.|....||.|.|.|:|||:.:||..|.:.|:...:         |...|:|.
  Rat  1698 VDVVENEDGTFDIFYTAPQPGKYVICVRFGGEHVPNSPFQVTALAGDQPTVQTPLRPQQLPSQYT 1762

  Fly  1693 EEHTTKVVQQTTQSEL----VNGKSEITYRSVAFE-KLPLPTTGGNVTAEVRMPSGKVDKPVIQD 1752
            ....:   |||...|.    |||....:.|  .|: .:|.....|.:|.|||||||||.:|.|.|
  Rat  1763 YPQGS---QQTWIPERPMVGVNGLDVTSLR--PFDLVIPFTIKKGEITGEVRMPSGKVAQPSITD 1822

  Fly  1753 NRDGTVSVKYDPREEGSHELVVKYNGEPVQGSPFKFHVDSITSGYVTAYGPGLTHGVTGEPANFT 1817
            |:||||:|:|.|.|.|.||:.::|:...:.|||.:|:||.:..|::|||||||||||..:||.||
  Rat  1823 NKDGTVTVRYSPSEAGLHEMDIRYDNMHIPGSPLQFYVDYVNCGHITAYGPGLTHGVVNKPATFT 1887

  Fly  1818 ISTKGASAGGLTMAVEGPSKADINYHDNKDGTVSVQYLPTAPGEYQVSVRFGDKHIKGSPYFAKI 1882
            ::||.|..|||::|:||||||:|:..||:|||.||.|||..||:|.:.|::.|:||.|||:.|::
  Rat  1888 VNTKDAGEGGLSLAIEGPSKAEISCTDNQDGTCSVSYLPVLPGDYSILVKYNDQHIPGSPFTARV 1952

  Fly  1883 TGEGRKR-NQISVGSCSEVTMPGDITDDDLRALNASIQAPSGLEEPCFLKRMPTGNIGISFTPRE 1946
            ||:...| :.:.|||.:::  |.:|::.||..|.|::..|||.||||.|||:..|::||||.|:|
  Rat  1953 TGDDSMRMSHLKVGSAADI--PINISETDLSLLTATVVPPSGREEPCLLKRLRNGHVGISFVPKE 2015

  Fly  1947 IGEHLVSVKRLGKHINNSPFKVTVCEREVGDAKKVKVSGTGLKEGQTHADNIFSVDTRNAGFGGL 2011
            .|||||.||:.|:|:.:||..|.:.:.|:|||.:|:|||.||.||.|.....|.:|||:||:|||
  Rat  2016 TGEHLVHVKKNGQHVASSPIPVVISQSEIGDASRVRVSGQGLHEGHTFEPAEFIIDTRDAGYGGL 2080

  Fly  2012 SVSIEGPSKAEIQCTDKDDGTLNISYKPTEPGYYIVNLKFADHHVEGSPFTVKVAGEGSNRKREK 2076
            |:|||||||.:|...|.:|||..::|.|||||.||:|:||||.||.||||:|||.|||  |.:|.
  Rat  2081 SLSIEGPSKVDINTEDLEDGTCRVTYCPTEPGNYIINIKFADQHVPGSPFSVKVTGEG--RVKES 2143

  Fly  2077 IQRERDAVPITEIGSQCKLTFKMPGITSFDLAACVTSPSNVTEDAEIQEVEDGLYAVHFVPKELG 2141
            |.|.|.|..:..:||.|.|:.|:|.|:..|:.|.|||||..|.:|||.|.|:..|.:.|||.|:|
  Rat  2144 ITRRRRAPSVANVGSHCDLSLKIPEISIQDMTAQVTSPSGKTHEAEIVEGENHTYCIRFVPAEMG 2208

  Fly  2142 VHTVSVRYSEMHIPGSPFQFTVGPLRDSGSHLVKAGGSGLERGVVGEAAEFNVWTREAGGGSLAI 2206
            :|||||:|...|:||||||||||||.:.|:|.|:|||.||||...|..|||.:||||||.|.|||
  Rat  2209 MHTVSVKYKGQHVPGSPFQFTVGPLGEGGAHKVRAGGPGLERAEAGVPAEFGIWTREAGAGGLAI 2273

  Fly  2207 SVEGPSKADIEFKDRKDGSCDVSYKVTEPGEYRVGLKFNDRHIPDSPFKVYVSPDAGDAHKLEVQ 2271
            :|||||||:|.|:|||||||.|:|.|.|||:|.|.:|||:.|||||||.|.|:..:|||.:|.|.
  Rat  2274 AVEGPSKAEISFEDRKDGSCGVAYVVQEPGDYEVSVKFNEEHIPDSPFVVPVASPSGDARRLTVS 2338

  Fly  2272 QFPQGNIQADAPYQFMVRKNGAKGELDAKIVAPSGTDDDCFIQVIDGEMYSVRFYPRENGIHAIH 2336
            ...:..::.:.|..|.|..|||||.:|||:.:|||..::|::..||.:.|:|||.|||||::.|.
  Rat  2339 SLQESGLKVNQPASFAVSLNGAKGAIDAKVHSPSGALEECYVTEIDQDKYAVRFIPRENGVYLID 2403

  Fly  2337 VKFNGVHIPDSPFRIKVGK--DVADPAAVHASGNGLDEVKTGHKADFIINTCNAGVGTLAVSIDG 2399
            |||||.|||.|||:|:||:  ...||..|.|.|.||:...||..|:||:||.|||.|.|:|:|||
  Rat  2404 VKFNGTHIPGSPFKIRVGEPGHGGDPGLVSAYGAGLEGGVTGSPAEFIVNTSNAGAGALSVTIDG 2468

  Fly  2400 PSKVAMDCTEVEEGYKVRYTPLLPGEHYITVKYNN-MHIVGSPFKVNATGDKL-ADEGAQETSTV 2462
            ||||.|||.|..|||:|.|||:.||.:.|::||.. .||.|||||...||.:| ::....|||:|
  Rat  2469 PSKVKMDCQECPEGYRVTYTPMAPGSYLISIKYGGPYHIGGSPFKAKVTGPRLVSNHSLHETSSV 2533

  Fly  2463 IVETVQKVAKGGKNTGVHLPTF------KSDASKVVSKGMGLKKAYIGKQNQFSISATDAGNNIL 2521
            .|:::.|||.        :|..      .:|.||||:||:||.|||:|:::.|::..:.||||:|
  Rat  2534 FVDSLTKVAT--------VPQHATSGPGPADVSKVVAKGLGLSKAYVGQKSNFTVDCSKAGNNML 2590

  Fly  2522 YVGMYGPKGPCEEFHVKHAGHNNYNVQYLVRDRGQYVLLIKWGEEHIPGSPFQIDV 2577
            .||::||:.||||..|||.|...|:|.||::|:|:|.|::|||:|||||||::|.|
  Rat  2591 LVGVHGPRTPCEEILVKHMGSRLYSVSYLLKDKGEYTLVVKWGDEHIPGSPYRIMV 2646

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
cherNP_001262659.2 CH_dFLNA-like_rpt1 175..297 CDD:409160 92/123 (75%)
CH_dFLNA-like_rpt2 298..415 CDD:409164 71/116 (61%)
IG_FLMN 432..527 CDD:214720 51/94 (54%)
IG_FLMN 532..627 CDD:214720 40/94 (43%)
IG_FLMN 631..724 CDD:214720 46/92 (50%)
IG_FLMN 728..815 CDD:214720 50/89 (56%)
IG_FLMN 821..913 CDD:214720 49/91 (54%)
IG_FLMN 918..1001 CDD:214720 31/187 (17%)
Filamin 1012..1098 CDD:395505 27/88 (31%)
IG_FLMN 1109..1196 CDD:214720 57/169 (34%)
Filamin 1197..1293 CDD:395505 33/107 (31%)
IG_FLMN 1302..1392 CDD:214720 49/89 (55%)
IG_FLMN 1395..1490 CDD:214720 39/96 (41%)
IG_FLMN 1494..1587 CDD:214720 39/93 (42%)
IG_FLMN 1606..1682 CDD:214720 35/76 (46%)
IG_FLMN <1731..1791 CDD:214720 31/59 (53%)
IG_FLMN 1797..1884 CDD:214720 50/86 (58%)
IG_FLMN 1978..2067 CDD:214720 54/88 (61%)
Filamin <2111..2159 CDD:395505 27/47 (57%)
IG_FLMN 2172..2260 CDD:214720 59/87 (68%)
IG_FLMN 2265..2354 CDD:214720 42/88 (48%)
IG_FLMN 2360..2448 CDD:214720 49/88 (56%)
IG_FLMN 2488..2577 CDD:214720 49/88 (56%)
FlnaXP_006229631.1 CH_FLNA_rpt1 25..153 CDD:409157 94/127 (74%)
CH_FLNA_rpt2 156..269 CDD:409161 69/114 (61%)
IG_FLMN 281..375 CDD:214720 51/98 (52%)
IG_FLMN 381..477 CDD:214720 40/95 (42%)
IG_FLMN 480..571 CDD:214720 45/91 (49%)
IG_FLMN 577..659 CDD:214720 46/81 (57%)
IG_FLMN 672..766 CDD:214720 51/93 (55%)
IG_FLMN 769..869 CDD:214720 14/99 (14%)
IG_FLMN 872..968 CDD:214720 19/95 (20%)
IG_FLMN 972..1064 CDD:214720 27/91 (30%)
IG_FLMN 1067..1156 CDD:214720 56/88 (64%)
IG_FLMN 1160..1252 CDD:214720 4/91 (4%)
IG_FLMN 1256..1352 CDD:214720 33/97 (34%)
IG_FLMN 1355..1442 CDD:214720 48/86 (56%)
IG_FLMN 1448..1542 CDD:214720 39/97 (40%)
IG_FLMN 1545..1639 CDD:214720 39/93 (42%)
IG_FLMN 1665..1743 CDD:214720 36/79 (46%)
IG_FLMN <1797..1861 CDD:214720 31/63 (49%)
IG_FLMN 1868..1954 CDD:214720 50/85 (59%)
IG_FLMN 2047..2136 CDD:214720 54/88 (61%)
IG_FLMN 2238..2328 CDD:214720 59/89 (66%)
IG_FLMN 2332..2423 CDD:214720 44/90 (49%)
IG_FLMN 2429..2519 CDD:214720 50/89 (56%)
IG_FLMN 2558..2646 CDD:214720 49/87 (56%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 156 1.000 Domainoid score I4086
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H1119
Inparanoid 1 1.050 1581 1.000 Inparanoid score I79
OMA 1 1.010 - - QHG48636
OrthoDB 1 1.010 - - D24684at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001288
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45545
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100805
Panther 1 1.100 - - O PTHR38537
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X791
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1312.980

Return to query results.
Submit another query.