DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment cher and cher

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262659.2 Gene:cher / 42066 FlyBaseID:FBgn0014141 Length:2577 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061502782.1 Gene:cher / 1274482 VectorBaseID:AGAMI1_012082 Length:2523 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:2523 Identity:1817/2523 - (72%)
Similarity:2084/2523 - (82%) Gaps:89/2523 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   143 DVCHQQTNDYYQPARQEGQQADQYEENFDE--DMEAERDLAEDAQWKKIQQNTFTRWANEHLKTI 205
            |:..|....|||..:|:.|..|..:.:.||  :||||||||||||||:|||||||||||||||.|
Mosquito     2 DIQVQGAPQYYQELQQQQQPRDYDDPDADEEAEMEAERDLAEDAQWKRIQQNTFTRWANEHLKII 66

  Fly   206 DRSINNLETDLSDGLRLIALIEVLSQKRMPKYNKRPTFRSQKLENVSVALKFLQDEGIKIVNIDS 270
            :::|.|||:||||||||||||||||||||.|:|||||||||||||||||||||:.||||||||||
Mosquito    67 NQTIANLESDLSDGLRLIALIEVLSQKRMSKHNKRPTFRSQKLENVSVALKFLEVEGIKIVNIDS 131

  Fly   271 SDIVDCKLKLILGLIWTLILHYSISMPMWDGED--DKQLNGSGHTPKQRLLNWIHAKIPDLPINN 333
            |||||||||||:|||||||||||||:|||:|::  |...||:|.:|||||:||||..:|||||||
Mosquito   132 SDIVDCKLKLIMGLIWTLILHYSISLPMWEGDENGDNLANGNGASPKQRLMNWIHRLVPDLPINN 196

  Fly   334 FTNDWTTGKAVGALVDACAPGLCPDWELWDPKDAVQNASEAMGLADDWLNVRQLIKPEELVNPNV 398
            ||:|||.||||||||||.||||||||.:||||||||||:||||||||||||||||:|||:||||:
Mosquito   197 FTSDWTNGKAVGALVDAVAPGLCPDWPMWDPKDAVQNAAEAMGLADDWLNVRQLIRPEEMVNPNI 261

  Fly   399 DEQSMMTYLSQYPNSKLKTGAPLRPKTNPNSIPPPRVRAYGPGIEPIGPVVGAPANFTVETFSAG 463
            ||||||||||||||:|||.||||||:||.:|:||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Mosquito   262 DEQSMMTYLSQYPNAKLKPGAPLRPRTNHSSVPPPRVRAYGPGIEPTGPTVGAPANFTVETFSAG 326

  Fly   464 KGSVDVDIQGPNGEIEKADVRFNNDKNLTYTVSYIPKSEGSHKVAVKFSGRDIPKSPFPVKVEGH 528
            ||:|||.:..|||..||.|.||||||||||:||||||.||.|||.|||:||||||||:.|:||..
Mosquito   327 KGNVDVAVHNPNGNPEKVDCRFNNDKNLTYSVSYIPKLEGPHKVYVKFNGRDIPKSPYEVQVESQ 391

  Fly   529 AGDASKVKVTGPGIQPNGVTIKKPTFFDILAKDAGRGVPEVIIIDPANHKTSVAAKVRQLENDTW 593
            |||||||..||||:.|:||.:.|.|:|||..||||:|.|||||:||||||||||||:||:..|.|
Mosquito   392 AGDASKVTATGPGLLPDGVVVGKQTYFDITTKDAGKGTPEVIILDPANHKTSVAAKLRQVGTDQW 456

  Fly   594 RCEYVTALQGLHSVNVFYAGTPIPNSPFPVKVAPLSDARKVRASGRGLQATGVRVG-DDADFKIY 657
            ||||.....||||||||:.|..|..||:.|:|||:.|.|||||||||||..||||. ||..|:|:
Mosquito   457 RCEYTAKQVGLHSVNVFFCGQQIRGSPYGVRVAPVCDPRKVRASGRGLQPVGVRVNDDDVTFRIF 521

  Fly   658 TEGAGEGEPEVRVIGPGGMNQNVMQSKVDGNTYECHYYPTKEGRYVIMVTFAGQEVAKSPFEVKV 722
            |||||||.|||::.||||:.......|:|..|||..|.|.|||||.|:|.:..||:.||||||.|
Mosquito   522 TEGAGEGIPEVKIFGPGGVVPEHSIRKLDATTYEAQYIPLKEGRYKILVLYGSQEIPKSPFEVTV 586

  Fly   723 GPKKESSIVAYGPGLSSGVIGYPAAFVVETNGETGALGFTVAGPSQAEIECHDNGDGSALVKYHP 787
            ||:|.:|||||||||.||::|.||.||||||||||.|||::||||||||||||||||||||||||
Mosquito   587 GPQKHTSIVAYGPGLKSGMVGQPACFVVETNGETGNLGFSIAGPSQAEIECHDNGDGSALVKYHP 651

  Fly   788 TAVGEYAVHILCDNEDIPKSPFIAQILPRT-DFHPELVKASGPGLEKN-GVTINQPTSFTVDPSK 850
            ||.||||||||||||||||||.|||:||:. ||||||||.||||:||| ||.:.:||.||||.::
Mosquito   652 TAPGEYAVHILCDNEDIPKSPHIAQVLPKADDFHPELVKVSGPGVEKNGGVIVGKPTEFTVDATR 716

  Fly   851 AGNAPLDVVVQDVFGTKLPVELKNNPDGTKKVTYTPTSGVPHTVEVNYGGVSTPNSPHRVYVGVP 915
            ||:|||:|.:.|||...:..::.....|.||:|||..|..|.|||||||||:.|:||.||.|..|
Mosquito   717 AGSAPLEVKINDVFSNTIAHKIAQTESGMKKITYTAPSAEPVTVEVNYGGVAVPHSPFRVNVSTP 781

  Fly   916 VDAAKVQAFGPWLQPGVRPNAATHFNVDAREAGDAELKVKIIHEETKIEVPCRIIDNEDNTYSVE 980
            :||:|||.|||||:|||:||||||||||||.||:..|:|.::|||:|.:||.|||||.||||:||
Mosquito   782 LDASKVQFFGPWLEPGVKPNAATHFNVDARAAGNGLLEVNLVHEESKQKVPVRIIDNNDNTYAVE 846

  Fly   981 VIPPSKGAYTTTMTYGGQRVPLGEKVVVEQTVDVSKIKVDGLEPTAPLNSLQQFRIITHGLPKAD 1045
            ||||..|.|:|.:.|||.:||:..||.|...||||||||||||||||||||||||:||:|:.|||
Mosquito   847 VIPPLPGTYSTNLLYGGLKVPMSPKVTVAPPVDVSKIKVDGLEPTAPLNSLQQFRVITNGIGKAD 911

  Fly  1046 LAVTITSPSGNRIKAHIIPTAEGFLVNFTPTQLGEYLLSICFGGTPITPRPFRLQCLTGSDSNKV 1110
            ||||||||||||:|||:||||||||||||||||||||||:.||||||||:|||||||.||||.||
Mosquito   912 LAVTITSPSGNRVKAHVIPTAEGFLVNFTPTQLGEYLLSVSFGGTPITPQPFRLQCLVGSDSRKV 976

  Fly  1111 QAFGPGLERGIVGQPAEFMIDTRGAGQGGLGVTVEGPCEAAINCRDNGDGTCNVAYLPTEAGDYT 1175
            ||.||||.|||:.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Mosquito   977 QASGPGLVRGIINRPAEFMIDTRGAGQGGLGVTVEGPCEAAINCRDNGDGTCNVAYLPTEIGDYT 1041

  Fly  1176 VNITFNERHITGSPFQPLIVPVPNLKNTRVSGIGIQPHGVIMNAATDFMVDMSKVGSNIDSGKLS 1240
            :|||||:.||.|||:|.:|||.|||...||||:|||||||:|||.|||:|||||||:::|..|||
Mosquito  1042 INITFNDDHIAGSPYQAIIVPEPNLNKIRVSGMGIQPHGVVMNAPTDFLVDMSKVGNDVDRSKLS 1106

  Fly  1241 CAIFDPMGHVLPSKIVQGPT-DDIFRIMYTPFEAGRHTIELMYDNIPVPGSPFVVNVKSGCDPAR 1304
            |.||||.|:.:|||:|...: ||:|||||||||||||||:|:|||:|||||||||||||||||:|
Mosquito  1107 CNIFDPRGNEIPSKLVPSDSADDVFRIMYTPFEAGRHTIDLLYDNVPVPGSPFVVNVKSGCDPSR 1171

  Fly  1305 CKAYGPGLEKGLTNQKNKFTVETKGAGNGGLSLAIEGPSEAKMTCTDNRDGSCDVDYLATDPGEY 1369
            |:|||||||..:|::...|||||:|||.|||||||||||||||:|||||||||||:|:.|:||||
Mosquito  1172 CRAYGPGLESAMTDKMATFTVETRGAGAGGLSLAIEGPSEAKMSCTDNRDGSCDVEYMPTEPGEY 1236

  Fly  1370 DITIRFADKHIPGSPFRVLVEETVDPSKVKVYGPGIEHGQVRESVPTFFNVDVGEAGPGRIAVKL 1434
            |:|||:||||||||||||:|.|:..|.||||||||||||||.:.:|..|.:|...||||:|||||
Mosquito  1237 DVTIRYADKHIPGSPFRVVVNESTRPEKVKVYGPGIEHGQVYDGLPAQFFIDCSGAGPGKIAVKL 1301

  Fly  1435 TNSEGIPVDNLRVEDKGNCIYAVHYVPPKAGSVLTCQVKFSEVEVPCSPFVMTVFPKSEPTKVKV 1499
            ::|||.|:.. :|:|||:.:|.|.|||||.|||:|..|.|::.:|.||||||||.|......|||
Mosquito  1302 SSSEGKPIAT-QVQDKGDGVYGVTYVPPKEGSVITANVCFADQDVSCSPFVMTVAPAPNDVPVKV 1365

  Fly  1500 KG-VNEKKKTPASLPAEFEIDT-KQAGQADINVAIKNPKGKAMQPRLEEVSTGTYVVSFVPDECG 1562
            .| ...||..||||||:|:||. |...:.||||:||.|.||.:.|::|:.:.|||.|||||||||
Mosquito  1366 YGDATTKKALPASLPAKFQIDAPKTKAKEDINVSIKGPDGKPLVPKMEQEADGTYGVSFVPDECG 1430

  Fly  1563 TYQCSIKYGDKEIEGSPFKLEAFPTGEAKKCKLVEQAPKIQTSGSQSHLKVDAREAGDGAVTCKI 1627
            .|..|||.|.|::.||||.|:|.|||||.|||:|:..|..|..|.::|..|||||||.|||||||
Mosquito  1431 PYNVSIKCGGKDVLGSPFLLQAIPTGEADKCKMVQAVPVNQEYGKKNHFAVDAREAGTGAVTCKI 1495

  Fly  1628 TNKAGSEIVDIDVIEKDGFFDILYALNDPGDYDINVKFGGKDIPNGSFSIKAVESIEQ------- 1685
            .:.:.:..||||:|||||||||.|.|.||||||:::||||::||||:|:||||:::|:       
Mosquito  1496 VSHSEASDVDIDIIEKDGFFDIFYVLKDPGDYDLDIKFGGQNIPNGTFTIKAVDNVEEEQVTKSA 1560

  Fly  1686 ----------------YSHSE-YIEE-----HTTKVVQQTTQSE------LVNGK--SEITYRSV 1720
                            |.|.| |||:     .:.:.:|||...|      |||||  |..|..||
Mosquito  1561 TSSSKTTSSAISENHSYQHQESYIEQVSSVSKSKQYIQQTASEEFLVRERLVNGKHDSVSTLNSV 1625

  Fly  1721 -----------------------------------------AFEKLPLPTTGGNVTAEVRMPSGK 1744
                                                     ..::|..|.|||.|||||:||||:
Mosquito  1626 QQLSASTTTTSNSSATNGNGTTEHDNHLNGTTQSSSRFHVFKLDRLNTPQTGGTVTAEVKMPSGE 1690

  Fly  1745 VDKPVIQDNRDGTVSVKYDPREEGSHELVVKYNGEPVQGSPFKFHVDSITSGYVTAYGPGLTHGV 1809
            ||||||.||.|||||::|:|:|||.|||.||||||.|||||||||||||:|||||||||||.|||
Mosquito  1691 VDKPVIDDNHDGTVSIRYEPKEEGIHELAVKYNGEHVQGSPFKFHVDSISSGYVTAYGPGLVHGV 1755

  Fly  1810 TGEPANFTISTKGASAGGLTMAVEGPSKADINYHDNKDGTVSVQYLPTAPGEYQVSVRFGDKHIK 1874
            |||||.|.||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||::||||||||||
Mosquito  1756 TGEPAQFIISTKGAGAGGLQMAVEGPSKADITYHDNKDGTVSVSYLPTAPGEYKISVRFGDKHIK 1820

  Fly  1875 GSPYFAKITGEGRKRNQISVGSCSEVTMPGDITDDDLRALNASIQAPSGLEEPCFLKRMPTGNIG 1939
            |||||||||||||||||||||||||||:||.|:|:|||:||||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1821 GSPYFAKITGEGRKRNQISVGSCSEVTLPGVISDNDLRSLNASIQAPSGLEEPCFLKRMPTGNIG 1885

  Fly  1940 ISFTPREIGEHLVSVKRLGKHINNSPFKVTVCEREVGDAKKVKVSGTGLKEGQTHADNIFSVDTR 2004
            |||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||||.|:|..||||:||.||:||:|||
Mosquito  1886 ISFTPREIGEHTVSVKRLGKHIANSPFKVNVCEREVGDAKKVIVTGNALKEGKTHQDNVFSIDTR 1950

  Fly  2005 NAGFGGLSVSIEGPSKAEIQCTDKDDGTLNISYKPTEPGYYIVNLKFADHHVEGSPFTVKVAGEG 2069
            |||:||||:||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.||||||||:|||
Mosquito  1951 NAGYGGLSLSIEGPSKAEIQCTDKDDGTLNIAYKPTEPGYYIVNLKFADHHVTGSPFTVKVSGEG 2015

  Fly  2070 SNRKREKIQRERDAVPITEIGSQCKLTFKMPGITSFDLAACVTSPSNVTEDAEIQEVEDGLYAVH 2134
            :||:||||||:|:||||||:||||||||||||||||||:|.||||..|:|||||||:||||||||
Mosquito  2016 TNRQREKIQRQREAVPITEVGSQCKLTFKMPGITSFDLSATVTSPGGVSEDAEIQEIEDGLYAVH 2080

  Fly  2135 FVPKELGVHTVSVRYSEMHIPGSPFQFTVGPLRDSGSHLVKAGGSGLERGVVGEAAEFNVWTREA 2199
            |:|||||||||||:|.::||||||||||||||:|:|:|||||||.|||.|..|..||||||||||
Mosquito  2081 FIPKELGVHTVSVKYKQIHIPGSPFQFTVGPLKDTGAHLVKAGGPGLEHGEQGVPAEFNVWTREA 2145

  Fly  2200 GGGSLAISVEGPSKADIEFKDRKDGSCDVSYKVTEPGEYRVGLKFNDRHIPDSPFKVYVSPDAGD 2264
            |||:|||||||||||:|||||||||||||||.|:|||:||:|||||||||||||||||:||..|:
Mosquito  2146 GGGTLAISVEGPSKAEIEFKDRKDGSCDVSYVVSEPGDYRIGLKFNDRHIPDSPFKVYISPAMGE 2210

  Fly  2265 AHKLEVQQFPQGNIQADAPYQFMVRKNGAKGELDAKIVAPSGTDDDCFIQVIDGEMYSVRFYPRE 2329
            ||||||.|||.|.:|||.|.||||||||||||||||:||||..:||||||:||.:.|||||||||
Mosquito  2211 AHKLEVAQFPTGCVQADKPAQFMVRKNGAKGELDAKVVAPSNNEDDCFIQLIDQDQYSVRFYPRE 2275

  Fly  2330 NGIHAIHVKFNGVHIPDSPFRIKVGKDVADPAAVHASGNGLDEVKTGHKADFIINTCNAGVGTLA 2394
            ||||||||||||||||.||:|||||||..|||||||||.||.:||||.|.|.||:|||||.||||
Mosquito  2276 NGIHAIHVKFNGVHIPGSPYRIKVGKDDVDPAAVHASGKGLGDVKTGEKTDLIIDTCNAGAGTLA 2340

  Fly  2395 VSIDGPSKVAMDCTEVEEGYKVRYTPLLPGEHYITVKYNNMHIVGSPFKVNATGDKLADEGAQET 2459
            |::|||:|||||||||||||||||||||||.:|:|:|||.|||||||||:|.||:.||:.|.|||
Mosquito  2341 VTVDGPAKVAMDCTEVEEGYKVRYTPLLPGHYYMTIKYNQMHIVGSPFKINCTGESLAEAGGQET 2405

  Fly  2460 STVIVETVQKVAKGGKNTGVHLPTFKSDASKVVSKGMGLKKAYIGKQNQFSISATDAGNNILYVG 2524
            |:||||||.||:|||..|||.||.|||||||:.||||||||||:||||||:|:|.|||||||:||
Mosquito  2406 SSVIVETVAKVSKGGNRTGVILPIFKSDASKIQSKGMGLKKAYMGKQNQFTINAGDAGNNILFVG 2470

  Fly  2525 MYGPKGPCEEFHVKHAGHNNYNVQYLVRDRGQYVLLIKWGEEHIPGSPFQIDV 2577
            :|||||||:|..:||.|.|.|.|.||||:||.|:||:|||::|||||||:::|
Mosquito  2471 IYGPKGPCDEVFIKHTGRNQYTVNYLVRERGDYILLVKWGDDHIPGSPFKVEV 2523

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
cherNP_001262659.2 CH_dFLNA-like_rpt1 175..297 CDD:409160 109/121 (90%)
CH_dFLNA-like_rpt2 298..415 CDD:409164 93/118 (79%)
IG_FLMN 432..527 CDD:214720 75/94 (80%)
IG_FLMN 532..627 CDD:214720 60/94 (64%)
IG_FLMN 631..724 CDD:214720 56/93 (60%)
IG_FLMN 728..815 CDD:214720 74/86 (86%)
IG_FLMN 821..913 CDD:214720 51/92 (55%)
IG_FLMN 918..1001 CDD:214720 55/82 (67%)
Filamin 1012..1098 CDD:395505 76/85 (89%)
IG_FLMN 1109..1196 CDD:214720 73/86 (85%)
Filamin 1197..1293 CDD:395505 68/96 (71%)
IG_FLMN 1302..1392 CDD:214720 68/89 (76%)
IG_FLMN 1395..1490 CDD:214720 57/94 (61%)
IG_FLMN 1494..1587 CDD:214720 51/94 (54%)
IG_FLMN 1606..1682 CDD:214720 50/75 (67%)
IG_FLMN <1731..1791 CDD:214720 47/59 (80%)
IG_FLMN 1797..1884 CDD:214720 77/86 (90%)
IG_FLMN 1978..2067 CDD:214720 76/88 (86%)
Filamin <2111..2159 CDD:395505 38/47 (81%)
IG_FLMN 2172..2260 CDD:214720 74/87 (85%)
IG_FLMN 2265..2354 CDD:214720 72/88 (82%)
IG_FLMN 2360..2448 CDD:214720 69/87 (79%)
IG_FLMN 2488..2577 CDD:214720 63/88 (72%)
cherXP_061502782.1 None

Return to query results.
Submit another query.