DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment cher and flnb

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001262659.2 Gene:cher / 42066 FlyBaseID:FBgn0014141 Length:2577 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_004914227.1 Gene:flnb / 100485165 XenbaseID:XB-GENE-494642 Length:2633 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:2669 Identity:1204/2669 - (45%)
Similarity:1602/2669 - (60%) Gaps:309/2669 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   177 ERDLAEDAQWKKIQQNTFTRWANEHLKTIDRSINNLETDLSDGLRLIALIEVLSQKRM-PKYNKR 240
            |:|||:||.||||||||||||.|||||.:::.|.||:||||||||||||:|||||||| .||::|
 Frog     5 EKDLAQDAPWKKIQQNTFTRWCNEHLKCVNKRIGNLQTDLSDGLRLIALLEVLSQKRMYRKYHQR 69

  Fly   241 PTFRSQKLENVSVALKFLQDEGIKIVNIDSSDIVDCKLKLILGLIWTLILHYSISMPMWDGEDDK 305
            |||...:||||||||:||:.|.||:|:|||..|||..||||||||||||||||||||:|:.|.|:
 Frog    70 PTFSQMQLENVSVALEFLERENIKLVSIDSKAIVDGNLKLILGLIWTLILHYSISMPVWEDEGDE 134

  Fly   306 QLNGSGHTPKQRLLNWIHAKIPDLPINNFTNDWTTGKAVGALVDACAPGLCPDWELWDPKDAVQN 370
            :.  ...|||||||.||..|||.|||.||:.:|..|||:|||||:||||||||||.||||..|:|
 Frog   135 ET--KNQTPKQRLLGWIQNKIPQLPITNFSQNWQDGKALGALVDSCAPGLCPDWESWDPKKPVEN 197

  Fly   371 ASEAMGLADDWLNVRQLIKPEELVNPNVDEQSMMTYLSQYPNSKLKTGAPLRPKTNPNSIPPPRV 435
            |.|||..|||||.|.|:|.|||:::|||||.|:||||||:|.:|||.||||:||.||.     :.
 Frog   198 AREAMQQADDWLGVPQVIAPEEIIDPNVDEHSVMTYLSQFPKAKLKPGAPLKPKLNPK-----KA 257

  Fly   436 RAYGPGIEPIGPVVGAPANFTVETFSAGKGSVDVDIQGPNGEIEKADVRFNNDKNLTYTVSYIPK 500
            ||||.|:||.|.:|...|.|||||.|||.|.|.|.|:.|.|..|:|.|..|||||.|::|.|:||
 Frog   258 RAYGLGVEPTGNMVKRSAPFTVETISAGTGEVLVYIEDPEGNREEAKVTGNNDKNKTFSVEYVPK 322

  Fly   501 SEGSHKVAVKFSGRDIPKSPFPVKVEGHAGDASKVKVTGPGIQPNGVTIKKPTFFDILAKDAGRG 565
            ..|.|||.|.|:|:.|.||||.|.||...||||||...|||::|.|....|||:|||....||.|
 Frog   323 VTGMHKVTVLFAGQHIAKSPFEVNVEKAQGDASKVTAKGPGLEPIGNIANKPTYFDIYTAGAGVG 387

  Fly   566 VPEVIIIDPANHKTSVAAKVRQLENDTWRCEYVTALQGLHSVNVFYAGTPIPNSPFPVKVAPLSD 630
            ...:.:|||.....:|...:....|..:||.|.....|.|:|.:.:.|...|.||:.|.:....:
 Frog   388 DIGIEVIDPQGRNNTVELALEDKGNCVYRCTYKPIKAGPHNVAINFGGEATPKSPYLVSIGEACN 452

  Fly   631 ARKVRASGRGLQATGVRVGDDADFKIYTEGAGEGEPEVRVIGPGGMNQNVMQSK-VDG-NTYECH 693
            ....||:|||||..|||:.:.|||::.|:.||.|:..|.|.||.|:::.:.||: :|| :.:|  
 Frog   453 PNACRANGRGLQPKGVRIRETADFRVDTKAAGSGDLHVSVKGPKGLDEVLKQSESLDGLHLFE-- 515

  Fly   694 YYPTKEGRYVIMVTFAGQEVAKSPFEVKV----GPKKESSIVAYGPGLSSGVIGYPAAFVVETNG 754
            |||...|:||:.:|:.|..:.||||||:|    ||:|   :.|:||||.||:.|..|.||||:.|
 Frog   516 YYPLTPGKYVVAITWGGHHIPKSPFEVQVALEAGPQK---VRAWGPGLYSGMAGKAADFVVESVG 577

  Fly   755 -ETGALGFTVAGPSQAEIECHDNGDGSALVKYHPTAVGEYAVHILCDNEDIPKSPFIAQILPRT- 817
             |.|:|||.:.|||||:|||.|.||||..|:|.|...||||:||:||:|||..||::|.|.|.: 
 Frog   578 SEVGSLGFAIEGPSQAKIECEDQGDGSCDVRYWPKEPGEYAIHIMCDDEDIQNSPYMALIQPASG 642

  Fly   818 DFHPELVKASGPGLEKNGVTINQPTSFTVDPSKAGNAPLDVVVQDVFGTKLPVELKNNPDGTKKV 882
            |..|:.|||.||||||.|..::.|..|.|||:.||.|.|.:..|||.|..:.:..|..||||...
 Frog   643 DIDPDKVKAYGPGLEKTGCIVSTPAEFAVDPTDAGKAALKIYSQDVEGNPVDIMTKEKPDGTYAC 707

  Fly   883 TYTPTSGVPHTVEVNYGGVSTPNSPHRVYVGVPVDAAKVQAFGPWLQ-PGVRPNAATHFNVDARE 946
            :|||...:.|||.|.:||||.||||.||.:|.......|:.|||.:: .|::.|..|||.||..|
 Frog   708 SYTPAKPIKHTVAVTWGGVSVPNSPFRVNIGQGSHPHLVKVFGPGVEKTGLKANEPTHFTVDCTE 772

  Fly   947 AGDAELKV------KIIHEETKIEVPCRIIDNEDNTYSVEVIPPSKGAYTTTMTYGGQRVPLGE- 1004
            ||:.::.|      ::|.:|.: ::...||.|.::|::|:.:||:.|.||..:.:.|:.:|... 
 Frog   773 AGEGDVSVGIKCDARVISDEEE-DIDFDIIPNANDTFTVKYMPPAAGRYTIKVLFAGEEIPESPF 836

  Fly  1005 KVVVEQTVDVSKIKVD-------GLEPTAPLNSLQQFRIITHGLPKADLAVTITSPS-GNRIK-A 1060
            ::.|:.:.|.||::.:       |:|...|    ..|.:.|.|..||.:.|:.|.|: |:.:| .
 Frog   837 RIKVDPSHDASKVRAEGPGLSKSGVENGKP----SHFTVYTKGAGKAPVDVSFTGPAPGDAVKDF 897

  Fly  1061 HIIPTAE-GFLVNFTPTQLGEYLLSICFGGTPITPRPFRL------------------------- 1099
            .||...: ...|.:||.|.|:..:::.:||.||...||.:                         
 Frog   898 EIIDNYDYSHTVRYTPVQQGKMKVAVNYGGDPIPKSPFTVGVAAPLDLNKIRINGLESRVEVGKD 962

  Fly  1100 --------------------------------------QCLT----------------------- 1103
                                                  :|.|                       
 Frog   963 QQFIVDPNGAGGQGKLEVKISSPSRKSVPCLVEPVPGNECSTVKYIPKEEGLYNVDVSYDGNPVP 1027

  Fly  1104 GS----------DSNKVQAFGPGLERGIVGQPAEFMIDTRGAGQGGLGVTVEGPCEAAINCRDNG 1158
            ||          |.:||:|:|||||.|:||:||||.|||:|||.||||:||||||||.|.|.|||
 Frog  1028 GSPYVVEATLPPDPSKVKAYGPGLEGGLVGKPAEFTIDTKGAGTGGLGLTVEGPCEAKIECSDNG 1092

  Fly  1159 DGTCNVAYLPTEAGDYTVNITFNERHITGSPFQ-------------------------------- 1191
            ||||:|:||||..|:|.|||.|.|.||.|||||                                
 Frog  1093 DGTCSVSYLPTTPGEYFVNILFEETHIPGSPFQANVEMPFDPSKVIATGPGLEHGKVGEAGLIHV 1157

  Fly  1192 ---------------------------------------PL------------------------ 1193
                                                   ||                        
 Frog  1158 DCSQAGPGNLAVEAVSDSGSKAEVNVQDNKDGTYTVTYVPLFAGMYTLALKYGGEQVPKFPARVK 1222

  Fly  1194 IVPVPNLKNTRVSGIGIQPHGVIMNAATDFMVD---MSKVGSNIDSGKLSCAIFDPMGHVLPSKI 1255
            :.|..:....:|.|.||:..||...|.|||.||   ::|.|.|    .:...|.:|.| .....:
 Frog  1223 VDPAVDTSKIKVFGPGIEEKGVFREATTDFTVDAKSLTKTGGN----HVKTKITNPSG-ASTDYL 1282

  Fly  1256 VQGPTDDIFRIMYTPFEAGRHTIELMYDNIPVPGSPFVVNVKSGCDPARCKAYGPGLEKGLTNQK 1320
            ::...|..:.:.|||||.|.|.|::.||:.|||.|||.|.|..||.|.|.||.|.||.:.|||:.
 Frog  1283 LRDNGDGTYYVEYTPFEKGAHAIKVTYDDEPVPNSPFKVGVTEGCYPDRVKAQGAGLTEALTNKP 1347

  Fly  1321 NKFTVETKGAGNGGLSLAIEGPSEAKMTCTDNRDGSCDVDYLATDPGEYDITIRFADKHIPGSPF 1385
            |.|:|.|:|||.|||.:.:|||||:||:|.||:||||.|:|.....|:||:.|.:..:|||||||
 Frog  1348 NLFSVITRGAGIGGLGITVEGPSESKMSCKDNKDGSCSVEYTPYVTGDYDVNITYDGEHIPGSPF 1412

  Fly  1386 RVLVEETVDPSKVKVYGPGIEHGQVRESVPTFFNVDVGEAGPGRIAVKLT--------------- 1435
            ||.|::.|||||||:.|||:... ||..:|..|.||..:||...:||::|               
 Frog  1413 RVPVKDVVDPSKVKISGPGLGTA-VRAKIPQQFTVDTSKAGIAPLAVQVTGPRAEADLLTRRNPL 1476

  Fly  1436 ---------------NSEGI--PVDNLRVEDKGNCIYAVHYVPPKAGSVLTCQVKFSEVEVPCSP 1483
                           |..|.  |||   :.|.|:..:.|.|.|...|. .|..|::::.|:|.||
 Frog  1477 QALSDFFKGEFKRNANEPGTVEPVD---LVDNGDGTHTVSYTPTLEGP-YTVAVQYADEEIPRSP 1537

  Fly  1484 FVMTVFPKSEPTKVKVKGVNE-KKKTPASLPAEFEIDTKQAGQADINVAIKNPKGKAMQPRLEEV 1547
            |.:.|.|..:.:||...|... .:...||||..|.:|.|.||...::|.|.:.:||..:.::::.
 Frog  1538 FKVKVLPTYDASKVTASGPGLCAQGISASLPVNFAVDAKNAGLGPLSVQITDQEGKPKKAQIQDN 1602

  Fly  1548 STGTYVVSFVPDECGTYQCSIKYGDKEIEGSPFKLEAFPTGEAKKCKLVEQAPKIQT---SGSQS 1609
            :.|||.||::||..|.|..::|||..:|..||:::.|...|:|.||.:.  .|.||.   :|.:.
 Frog  1603 NDGTYSVSYIPDRTGRYHVAVKYGGDDIPYSPYRIRAMSIGDASKCTVA--GPGIQAAVKTGEEV 1665

  Fly  1610 HLKVDAREAGDGAVTCKITNKAGSEIVDIDVIEK-DGFFDILYALNDPGDYDINVKFGGKDIPNG 1673
            ...|||..||.|.|||.|....|.| .:.||||. ||.:||.|.....|.|.|:|:|||.||||.
 Frog  1666 GFVVDATTAGKGKVTCSILGPDGLE-NEADVIENVDGTYDIYYTTAKTGPYVIHVRFGGADIPNS 1729

  Fly  1674 SFSIKAVE----SIEQYSHSEYIEEHTTKVVQQTTQSEL--VNGKSEITYRSVAFEKLPLPTTGG 1732
            .|::.|.:    .::|.|.|.....: ..:|.:|..:::  :||.|...:..|    :|.....|
 Frog  1730 PFTVMATDEVPVQVQQQSLSACPPGY-QPLVSETDYAQVGSMNGLSFRPFDLV----IPFAIRTG 1789

  Fly  1733 NVTAEVRMPSGKVDKPVIQDNRDGTVSVKYDPREEGSHELVVKYNGEPVQGSPFKFHVDSITSGY 1797
            .:|.:|.|||||.....|.||:|||||::|.|.|.|.|||.:|.||..:..||.:|.|:...:|.
 Frog  1790 EITGDVHMPSGKTAPADIVDNKDGTVSIRYVPTETGLHELAIKCNGAHIPESPLQFFVNYPNTGS 1854

  Fly  1798 VTAYGPGLTHGVTGEPANFTISTKGASAGGLTMAVEGPSKADINYHDNKDGTVSVQYLPTAPGEY 1862
            |:||||||.:||..:||.|||.|:.|..|||.:|:||||||:|:..||||||.:|.||||.||:|
 Frog  1855 VSAYGPGLIYGVANKPATFTIITEDAGEGGLDLAIEGPSKAEISCIDNKDGTCTVTYLPTLPGDY 1919

  Fly  1863 QVSVRFGDKHIKGSPYFAKITGEGRKRNQISVGSCSEVTMPGDITDDDLRALNASIQAPSGLEEP 1927
            .:.|::.|.||.|||:.||||.:.|:|:|:.:||.::..:  |||:.||..|:|||:||||.:||
 Frog  1920 NILVKYNDTHIAGSPFIAKITDDSRRRSQVKLGSTADFLL--DITETDLSLLSASIKAPSGRDEP 1982

  Fly  1928 CFLKRMPTGNIGISFTPREIGEHLVSVKRLGKHINNSPFKVTVCEREVGDAKKVKVSGTGLKEGQ 1992
            |.|||:|..:|||||.|||:||||||:|:.|:||.|||..:.|.:.|:|||.|||..|.||.||:
 Frog  1983 CLLKRLPNNHIGISFIPREVGEHLVSIKKNGRHIPNSPISIMVYQSEIGDASKVKAFGPGLIEGR 2047

  Fly  1993 THADNIFSVDTRNAGFGGLSVSIEGPSKAEIQCTDKDDGTLNISYKPTEPGYYIVNLKFADHHVE 2057
            |:..:.|.||||.||:||||:::|||||.:||..|.:|||..:||.|||||.|||::||||.||.
 Frog  2048 TYEMSDFIVDTREAGYGGLSLAVEGPSKVDIQTEDLEDGTCQVSYCPTEPGVYIVSIKFADEHVP 2112

  Fly  2058 GSPFTVKVAGEGSNRKREKIQRERDAVPITEIGSQCKLTFKMPGITSFDLAACVTSPSNVTEDAE 2122
            |||||.||.|||  |.:|.|.|.|.|..:..:|..|:|..|:|.|...:|.|.|.|||...::||
 Frog  2113 GSPFTAKVMGEG--RVKESITRRRKAPSVASVGGLCELNLKIPEIDRNELTAEVVSPSGRKQEAE 2175

  Fly  2123 IQEVEDGLYAVHFVPKELGVHTVSVRYSEMHIPGSPFQFTVGPLRDSGSHLVKAGGSGLERGVVG 2187
            |.::......|.|||:|.|:|||||:|...|:||||||||||||.:.|:..|||||.|||||..|
 Frog  2176 IVDLGQNTSCVRFVPQETGIHTVSVKYRGEHVPGSPFQFTVGPLGEGGAEKVKAGGPGLERGEAG 2240

  Fly  2188 EAAEFNVWTREAGGGSLAISVEGPSKADIEFKDRKDGSCDVSYKVTEPGEYRVGLKFNDRHIPDS 2252
            ..|||::||||||.|.|:|:|||||||:|.|:||||||..|||.|.|||:|.|.:||||.|||.|
 Frog  2241 VPAEFSIWTREAGAGGLSIAVEGPSKAEISFEDRKDGSSGVSYVVQEPGDYDVIIKFNDEHIPQS 2305

  Fly  2253 PFKVYVSPDAGDAHKLEVQQFPQGNIQADAPYQFMVRKNGAKGELDAKIVAPSGTDDDCFIQVID 2317
            ||.|.:...:.||.:|.|....:..::.:.|..|.:|.|||:|::|||:.:|||..::||:..::
 Frog  2306 PFLVPIVATSDDARRLTVTSLQESGLKVNQPASFAIRLNGARGKIDAKVHSPSGAVEECFVTELE 2370

  Fly  2318 GEMYSVRFYPRENGIHAIHVKFNGVHIPDSPFRIKVGK--DVADPAAVHASGNGLDEVKTGHKAD 2380
            .:.|:|||.|||||||.|.|||||.|:|.|||:::||:  ...||..|.|.|:||:...||.:::
 Frog  2371 PDKYAVRFMPRENGIHMIDVKFNGSHVPGSPFKVRVGEAGQEGDPGLVTAYGDGLETGTTGKQSE 2435

  Fly  2381 FIINTCNAGVGTLAVSIDGPSKVAMDCTEVEEGYKVRYTPLLPGEHYITVKYNN-MHIVGSPFKV 2444
            |||||..||.|.|:|:|:|||||.|:|.|..|||:|.|||:.||.:.|.|||.. .||||||||.
 Frog  2436 FIINTSKAGPGALSVTIEGPSKVTMECKECPEGYRVLYTPMAPGIYMIGVKYGGPNHIVGSPFKA 2500

  Fly  2445 NATGDKLAD-EGAQETSTVIVETVQKVAKGGKNTGVHLPTFKSDASKVVSKGMGLKKAYIGKQNQ 2508
            ..||.:|.. .|..|||::||::|.:.:.  :.|...||.|.|||:||.|||.||.||::|:::.
 Frog  2501 KVTGQRLVGIGGTSETSSIIVQSVTRAST--ETTYSALPRFASDATKVTSKGAGLSKAFLGQKST 2563

  Fly  2509 FSISATDAGNNILYVGMYGPKGPCEEFHVKHAGHNNYNVQYLVRDRGQYVLLIKWGEEHIPGSPF 2573
            |::..:.||:|||.||::||..||||..:||.|:.:|.|.|.|::||.|:|::||||||||||||
 Frog  2564 FTVDCSKAGSNILLVGVHGPTLPCEEVSIKHLGNKHYTVHYHVKERGDYMLVVKWGEEHIPGSPF 2628

  Fly  2574 QIDV 2577
            .|.|
 Frog  2629 HITV 2632

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
cherNP_001262659.2 CH_dFLNA-like_rpt1 175..297 CDD:409160 90/120 (75%)
CH_dFLNA-like_rpt2 298..415 CDD:409164 73/116 (63%)
IG_FLMN 432..527 CDD:214720 51/94 (54%)
IG_FLMN 532..627 CDD:214720 34/94 (36%)
IG_FLMN 631..724 CDD:214720 42/98 (43%)
IG_FLMN 728..815 CDD:214720 50/87 (57%)
IG_FLMN 821..913 CDD:214720 46/91 (51%)
IG_FLMN 918..1001 CDD:214720 28/89 (31%)
Filamin 1012..1098 CDD:395505 28/95 (29%)
IG_FLMN 1109..1196 CDD:214720 63/181 (35%)
Filamin 1197..1293 CDD:395505 34/98 (35%)
IG_FLMN 1302..1392 CDD:214720 50/89 (56%)
IG_FLMN 1395..1490 CDD:214720 38/126 (30%)
IG_FLMN 1494..1587 CDD:214720 32/93 (34%)
IG_FLMN 1606..1682 CDD:214720 35/80 (44%)
IG_FLMN <1731..1791 CDD:214720 29/59 (49%)
IG_FLMN 1797..1884 CDD:214720 51/86 (59%)
IG_FLMN 1978..2067 CDD:214720 55/88 (63%)
Filamin <2111..2159 CDD:395505 23/47 (49%)
IG_FLMN 2172..2260 CDD:214720 58/87 (67%)
IG_FLMN 2265..2354 CDD:214720 40/88 (45%)
IG_FLMN 2360..2448 CDD:214720 48/88 (55%)
IG_FLMN 2488..2577 CDD:214720 49/88 (56%)
flnbXP_004914227.1 CH_FLNB_rpt1 1..131 CDD:409158 93/125 (74%)
CH_SF 130..244 CDD:469584 74/115 (64%)
IG_FLMN 254..350 CDD:214720 53/100 (53%)
IG_FLMN 354..450 CDD:214720 34/95 (36%)
IG_FLMN 453..545 CDD:214720 41/93 (44%)
IG_FLMN 550..633 CDD:214720 49/85 (58%)
IG_FLMN 646..740 CDD:214720 47/93 (51%)
IG_FLMN 743..843 CDD:214720 30/100 (30%)
IG_FLMN 846..942 CDD:214720 28/99 (28%)
IG_FLMN 952..1038 CDD:214720 4/85 (5%)
IG_FLMN 1041..1131 CDD:214720 61/89 (69%)
IG_FLMN 1134..1226 CDD:214720 2/91 (2%)
IG_FLMN 1230..1326 CDD:214720 37/100 (37%)
IG_FLMN 1329..1418 CDD:214720 50/88 (57%)
IG_FLMN 1422..1545 CDD:214720 38/127 (30%)
IG_FLMN 1548..1639 CDD:214720 31/90 (34%)
IG_FLMN 1645..1737 CDD:214720 41/94 (44%)
IG_FLMN <1784..1847 CDD:214720 29/62 (47%)
IG_FLMN 1855..1941 CDD:214720 51/85 (60%)
IG_FLMN 2033..2120 CDD:214720 53/86 (62%)
IG_FLMN <2158..2218 CDD:214720 31/59 (53%)
IG_FLMN 2224..2314 CDD:214720 58/89 (65%)
IG_FLMN 2318..2409 CDD:214720 42/90 (47%)
IG_FLMN 2415..2504 CDD:214720 48/88 (55%)
IG_FLMN 2543..2632 CDD:214720 49/88 (56%)

Return to query results.
Submit another query.