DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ema and ema

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_650542.1 Gene:ema / 41992 FlyBaseID:FBgn0038427 Length:1067 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061508757.1 Gene:ema / 1273188 VectorBaseID:AGAMI1_000429 Length:1102 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1133 Identity:728/1133 - (64%)
Similarity:857/1133 - (75%) Gaps:97/1133 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MFRSRSWFGGPWGGRPKNRLSLEHLKYLYSILEKNTTVSESNRGLLVESLRCIAEILIWGDQHDS 65
            ||||||||||.| .||||||||:|||||||:||:|||||||||||||||||.||||||||||:||
Mosquito     1 MFRSRSWFGGGW-NRPKNRLSLDHLKYLYSVLERNTTVSESNRGLLVESLRSIAEILIWGDQNDS 64

  Fly    66 LVFDFFLEKNMLSYFLHIMRQKSGGSSFVCVQLLQTLNILFENIRNETSLYYLLSNNHVNSIMVH 130
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||:||
Mosquito    65 SVFDFFLEKNMLSYFLHIMRQKSGGSSFVCVQLLQTLNILFENIRNETSLYYLLSNNLVNSIIVH 129

  Fly   131 KFDFSDEDVMGYYILFLKTLSLKLNTHTIHFFYNEHTNDFPLYTEAIKFFNHPESMVRIAVRTIS 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
Mosquito   130 KFDFSDEDVMGYYILFLKTLSLKLNTHTIHFFYNEHTNDFPLYTEAIKFFNHPESMVRIAVRTIT 194

  Fly   196 LNVYKVQNPSMLRFIRDKTAAPYFSNLVWFIGKHILELDTCVRTDIDHQSNQKLSNLVAEHLDHL 260
            ||||:||||:||:||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||..:|:||||||||||
Mosquito   195 LNVYRVQNPNMLQFIRDKTAAPYFSNLVWFIGKHILELDNCVRNDIDHQSQHRLANLVAEHLDHL 259

  Fly   261 HYLSDILLLEIKDLNAVLTEHLLHKLFVPLYIFSLTPAPPPPSLAVVTQNLAAVLNRNVDIDIQE 325
            |||:|||.|:|.|||||||||||||||||||||||||: ||.|:|.||.|||||||:.|||||:|
Mosquito   260 HYLNDILCLDIADLNAVLTEHLLHKLFVPLYIFSLTPS-PPMSMAEVTCNLAAVLNKVVDIDIKE 323

  Fly   326 MHNPRVSSIVALFLLSLVFLVVSHAPLVHALAWVILNGDHSVFKEGAAEILNSYVEHREVVVPGF 390
            |:||||:|:||||||||||||::|.||::||.|||||.||:|||||||::||:|:::||||..||
Mosquito   324 MNNPRVASVVALFLLSLVFLVITHRPLINALTWVILNADHTVFKEGAAQVLNAYIDNREVVALGF 388

  Fly   391 GEPDESLEQAL------------------DTVTGQSSSSSYALSEDSGVESSSPATTELDSQADA 437
            .:|.||||:||                  |..:|.::.|..:.|..||...:|..:|..:::|..
Mosquito   389 VQPVESLEEALESTVASSAAYGVEQLHLADEPSGSNNKSPNSSSSSSGKSHASSTSTSTNNEAPI 453

  Fly   438 VE-------AEQIKLRNITDEEKQLLQKSSSSTKADFAEMAKPFLDTVLHALDCTENDYLALLSL 495
            ..       :|:|:..|||||||:.|..::..|    .|..:||||.||.:|||||||:||||:|
Mosquito   454 SNSPSPPTLSEEIEKVNITDEEKEKLLLNAYRT----PETNRPFLDMVLSSLDCTENDFLALLAL 514

  Fly   496 CLIYAMSHNRGIKNEWFEQVLAKST-RGAFSYKTALIEHLLNIITQSSQPSSRIRLITVEIALEL 559
            ||:||:::|:|:.:||.|.||.:|: .....|...|||.||.|:..|||||.||||:|.|:||:|
Mosquito   515 CLLYALANNKGVNSEWLEIVLNRSSPSNRTQYNVILIEKLLQIVNISSQPSCRIRLVTTELALKL 579

  Fly   560 LVTFTRPSSDDSRCITAAQQDLLFS---ARNQSMVVIRNFYKSEDIFLDLFEDEYNEMRKAQLNV 621
            |........:||.  .:..::.|.|   :|||:|.|::||||||||||||||||||||.||.|||
Mosquito   580 LGQIIGSGVEDSS--PSVPEEYLASLHQSRNQAMNVLKNFYKSEDIFLDLFEDEYNEMVKATLNV 642

  Fly   622 EFLCMDSTILLPPTGTPLTGINFTRRLPCGEVEKARRAIRVYFLLRRTCQKFLNEKESLLPLTNV 686
            ||||.||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:|||||.||....|||:||||||:
Mosquito   643 EFLCNDSTILLPPTGTPLTGISFTRRLPCGEVEKARRAIRVFFLLRRMCQSMSGEKETLLPLTNL 707

  Fly   687 VNLVQVENVLDLNNSDLIACTVVAKDSSKQRRFLVIDALQLILVEPDAKLLGWGVAKFVGFLQDV 751
            ...||::|.||||||||||||||.:|.:|.|||||:|.|||||||||:|.|||||||||||||||
Mosquito   708 SQCVQIDNALDLNNSDLIACTVVMRDGTKYRRFLVMDILQLILVEPDSKRLGWGVAKFVGFLQDV 772

  Fly   752 EVQGDKDDSRCLHITVHRGGVTHNRTPLLSAKFLFDDHIRCMAAKQRLTKGRSKARQKKMYQIAQ 816
            ||.|||:|||.||:|:||||.|:||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||:||||
Mosquito   773 EVNGDKEDSRSLHLTIHRGGATNNRTPILSAKFMFDDHIRCMAAKQRLTKGRSKARQKKMFQIAQ 837

  Fly   817 LIEIPGQMDSPVY-AVGGTMVASSSGGSGNSSGSSSRSS-HHRPMFSTANRVPGFAAVLRGSN-- 877
            |:|||||::.|.: .:.||..:|:||......|:|.|.. .|||:|||:|||||.||.||..:  
Mosquito   838 LLEIPGQLNDPSFPTLAGTGGSSASGTPSLRHGASGRQGREHRPLFSTSNRVPGVAAALRRDSMP 902

  Fly   878 SAGVSRTQMAPNRSIEGIRNESAGRSRRRSPSSTSGSNLRADHSDRERSPSVSMGSHSSSQSREN 942
            |..|||.||:.:||.||   |..|..|:          |.|..:.||.|..:.:|| ||.:||||
Mosquito   903 SGSVSRVQMSASRSTEG---EPTGTRRK----------LTAGATRRESSQPIGIGS-SSLKSREN 953

  Fly   943 SQPRSTGNRSRESSPRMPRPRSEEIPLEDFQHSRNNSPHSRGNPSPASRSHTPIRV----LHYDQ 1003
            |:.||...||||||||:|||||||||||||:.|:|:||.||.:.:..||||||.|:    |....
Mosquito   954 SRNRSGTPRSRESSPRIPRPRSEEIPLEDFRRSQNSSPVSRNSSNNPSRSHTPSRLTLEPLSVVN 1018

  Fly  1004 LSGHSGSPREASLGGTNALLS---------------QLN--------------GLNREVLPTQSS 1039
            :|.:.|.....:.||..::||               .:|              .:..|:.||  |
Mosquito  1019 ISSNMGGSGSGTTGGNGSVLSGSVKDPIIPNVLLAGTINPVPNVTPLPVGGPLAVPSELSPT--S 1081

  Fly  1040 EETSFIGSDGNEATGGSEGRRRGAIETV 1067
            ||||||.::..:       ::||.||||
Mosquito  1082 EETSFIANEERQ-------KKRGVIETV 1102

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
emaNP_650542.1 FPL 50..199 CDD:462884 142/148 (96%)
CLEC16A_C 248..870 CDD:466083 409/652 (63%)
emaXP_061508757.1 None

Return to query results.
Submit another query.