Protein Alignment CG6006 and svopa

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001097812.1
• Gene: CG6006 / 41962
• FlyBaseID: FBgn0063649
• Length: 603
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_005165254.1
• Gene: svopa / 559162
• ZFINID: ZDB-GENE-060526-336
• Length: 549
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 515
• Identity: 117/515 - (22%)
• Similarity: 200/515 - (38%)
• Gaps: 115/515 - (22%)

  Fly   133 QLQHMPVATWRNLSGSV---DNCRRWEGI----------------DWSQVSNETTLPSDWKTPAE 178
            ||:.:||..:|....|.   |.|...|.:                |.:.|..|...|:|.....|
Zfish     7 QLRQLPVVKFRRTGESTRSEDECCGREEVLQVEGGRTDMESVSLADGAPVPREFANPTDDTFMVE 71

  Fly   179 MDKKLVACEKWEYETNDNVGNTWTS-----------------QWDLVC-EKEHLKNVAEMFFLLG 225
            ...:.:....::::.:...|.:|.:                 :|.|.. |...|.:|.    .:|
Zfish    72 DAVEAIGFGTFQWKLSILTGLSWMADAMEMMILSILAPQLHCEWALPSWEVALLTSVV----FIG 132

  Fly   226 VATGGIISGYLSDKFGRKTMLFISAVLQTIFGLWLYICSSFELYLTLRALLGL----VSVSVTY- 285
            :.....:.|.:|||:||||.|.:|.:....:|:.......:...|.||||:|.    ...|||.
Zfish   133 MMISSSLWGNISDKYGRKTGLKMSVLWTLFYGILSAFAPIYGWILFLRALVGFGIGGAPQSVTLY 197

  Fly   286 ---------SGLILAIEYVDGKWRTIAGMYNLFPLPISYMIISGLAYLTQDYQRLQLCIG-IPGI 340
                     :..||.||..   |    .:..:|.:.::.:::..|.:      |..|.:. ||..
Zfish   198 AEFLPMRSRATCILLIEIF---W----ALGTVFEVLLAILVMPTLGW------RWLLALSTIPLF 249

  Fly   341 FLCFLWFVVPESPRWLLVKGRIDEVRRIIEAAAKFNGRQLPADYQLTPPTQE--SSTQDVTYLFR 403
            ...||.|.:|||.|:.::.|..::....::..|..|...:|.. :|....||  ...||   ||
Zfish   250 IFAFLCFWLPESARYDVLTGNQEKALNTLKRIAAENNVPMPLG-KLIVARQEDRGKIQD---LF- 309

  Fly   404 SSYLRRISICFFCIWFTMNLVYYGIILNMSSF-------GGN-------------VYLNS----- 443
            |.:.|..::..:.|||:....|||::|..:..       ||.             .||||
Zfish   310 SPHFRWTTVLLWFIWFSNAFSYYGVVLLTTELFQEGGVCGGAKGSKMEPGCSLECKYLNSDDYKD 374

  Fly   444 -ALAGLVEIPAIAVAMYIITKVGKK----WLFCATLICAGVACCCAAITEGHADLLWLKITFLMM 503
             ....|.|.|.:.|.::.|.::|::    ..|....:|......|.    |...|    ..|:.:
Zfish   375 LLWTTLSEFPGLLVTLWAIDRLGRRKTMALCFFVFSLCIVPLYSCV----GRTSL----TVFIFI 431

  Fly   504 GKFTISAGNTIMPVYTAELYPTPIRNVGVGACNVAAGLALILTPYLSLLNKIEGHLLMTL 563
            .:..|:.|.....|||.|:|||..|.:|:|..:..|.:..::||:::.: .:|..:.:||
Zfish   432 ARAFIAGGFQAAYVYTPEVYPTATRALGLGTSSGMARVGALITPFVAQV-MLESSVYLTL 490

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG6006	NP_001097812.1	MFS_SLC22	189..579	CDD:340875	102/440 (23%)
svopa	XP_005165254.1	MFS_SVOP	87..508	CDD:340999	102/435 (23%)