DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mhcl and Myo18a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_732109.2 Gene:Mhcl / 41955 FlyBaseID:FBgn0026059 Length:2194 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038942261.1 Gene:Myo18a / 360570 RGDID:1562698 Length:2491 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2340 Identity:829/2340 - (35%)
Similarity:1268/2340 - (54%) Gaps:375/2340 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MFNFMKKSAGDEDKERRKREKKLRKEAKGTSGGPGMGGVTGVTGSMSTDELLRLDE--VRR---S 60
            |||.|||   |:||:..::|||.:||.|               ..||..||..|:|  :||   :
  Rat     1 MFNLMKK---DKDKDGGRKEKKEKKEKK---------------ERMSAAELRSLEEMSMRRGFFN 47

  Fly    61 LKIRGRRKEKEKLPSGITADYSADFFAALNADANGGSNGGAVGAADPEQDRGNEEIVASVMTHIE 125
            |....:|:.|.:|                                                    
  Rat    48 LNRSSKRESKTRL---------------------------------------------------- 60

  Fly   126 SRASNGAGVSVNYSEVTHSLLSGGLKNRFLPPIPPKPPKRGILKGSRSNMTNVHEEISFAGSAGG 190
                          |:::             |||.|     :..||..::|::..:         
  Rat    61 --------------EISN-------------PIPIK-----VASGSDLHLTDIDSD--------- 84

  Fly   191 AGGTPEMLLRNTFQNESLYEGAARGAGSIGSNSSQHGTSFTSVESLRSDGEQTGGQQRAMTLPAN 255
                                   ...|||..:|. |.::.:|.:.|:  ||:  |..|...|...
  Rat    85 -----------------------SNRGSIILDSG-HLSTASSSDDLK--GEE--GSFRGSVLQRA 121

  Fly   256 ARYGALPQGNSQGSHLHVLTSPSPSADSLTDT-TNSSFATPPFSLSPVGESQGIDRWARVHAFED 319
            |::|:|.:.|||........|.....:|.::| |.|..:..|   ||..|.:.::.....|:...
  Rat   122 AKFGSLAKQNSQMIVKRFSFSQRSRDESASETSTPSEHSAAP---SPQVEVRTLEGQLMQHSGLG 183

  Fly   320 VELPLP------------PVQ-----LVKLPPPRQLVIRRQKSPRQDFGFSLRKAICLDRTESLT 367
            :..|.|            |..     ||..|||....:..|:.|..|||||||:...|||...  
  Rat   184 IPRPGPRSRVPELVTKRFPADLRLPALVPPPPPALRELELQRRPTGDFGFSLRRTTMLDRAPE-- 246

  Fly   368 SPIFRPVI-FAEPGAGGG--ATGLLPGDRLIKVNGTPVGELPREIIIEMIRNSGEAVTVEVQPVA 429
            ...:|.|: |||||||..  |.||:|||||:::||..|....|:.|:||||.||::|.::|||:.
  Rat   247 GQAYRRVVHFAEPGAGTKDLALGLVPGDRLVEINGQNVENKSRDEIVEMIRQSGDSVRLKVQPIP 311

  Fly   430 ELVELSKRCMAPSTATVEE---ID-------HSITNGNCNTLRRSASKRFKRQSRHENG-----N 479
            ||.|||:..:........|   :|       ||....:|.|...||..       .:|.     .
  Rat   312 ELSELSRSWLRTGEGHRREPTDLDPVAASPAHSQVGCSCPTQEPSAFS-------SDNPPPPPYT 369

  Fly   480 GGGEEGGAKGVGHDLEADVADAS---QPERVWLVHRGGFTAAIRLPTASSGRDEENKLSLRLLHN 541
            ..|....|.......|..:|...   :.|:||||||.||:.|.:|.:..... .|.|:.::|.|:
  Rat   370 WAGVCARASCWSAKTEEQIAAEEAWYETEKVWLVHRDGFSLASQLKSEELSL-PEGKVRVKLDHD 433

  Fly   542 GEQLTVDEDDVEKQNSPALDLVEDICELKYLNEASVLHCLRQRYASNLIHTKAGPTLLVVNPMAP 606
            |..|.||||||||.|:|:.|.:||:..|.||||:||||.|||||.::|:||.|||:|||::|...
  Rat   434 GAILDVDEDDVEKANAPSCDRLEDLASLVYLNESSVLHTLRQRYGASLLHTYAGPSLLVLSPRGA 498

  Fly   607 LSLYSEKVVSMFRGCKTEDMPPHVYSLAQTAYRSLVETRRDQSLIFMGRSGSGKSTSFKHALNYL 671
            .::|||||:.||:||:.|||.||:|::||||||:::.:|:|||::.:|.|||||:||.:|.:.||
  Rat   499 PAVYSEKVMHMFKGCRREDMAPHIYAVAQTAYRAMLMSRQDQSIVLLGSSGSGKTTSSQHLVQYL 563

  Fly   672 ALAAGAYNNFI-NAEKVNALCTILEAFGNTKTCLNSNATRMTQLLSLDFDQTGQIASASLQVLLP 735
            |..||...|.: :.||..||.|:||||||:.|.:|.:|||.:|:|||||||.||:||||:|.:|.
  Rat   564 ATIAGTSGNKVFSVEKWQALATLLEAFGNSPTIMNGSATRFSQILSLDFDQAGQVASASVQTMLL 628

  Fly   736 ERQRAGRRLGHEHSFHIMTRLLAGAAGLLQKELHLENITSEDSHPFISLSQKLEDRHRAANDFMR 800
            |:.|..||...|.:|::...|||.....|:.||||.::...:....:.|| |.|::.|||..|.:
  Rat   629 EKLRVARRPASEATFNVFYYLLACGDSTLRTELHLNHLAENNVFGIVPLS-KPEEKQRAAQQFSK 692

  Fly   801 TVQAFETLNIDAKAVRGIWSILAAIYHLGIAGVTK------LGTGSTARTQFANPTAARKASGLL 859
            ...|.:.|.|..:..:..|.|||:|||||.||.||      .......|.|||....|:||:.||
  Rat   693 LQTAMKVLAISPEEQKACWLILASIYHLGAAGATKEPLEEQAEAAEGGRKQFARHEWAQKAAYLL 757

  Fly   860 GVNLEDLSSAAF-----GLTQPNAPNGGLSPSKSPTSD-TGHEW-AWECLEALVIGLYSEALAAV 917
            |.:||:||||.|     |.|...:.:....|.:|...: ||.:. |.||||.:..|||||....:
  Rat   758 GCSLEELSSAIFKHQLKGGTLQRSTSFRQGPEESGLGEGTGTKLSALECLEGMASGLYSELFTLL 822

  Fly   918 VALINRQICTSSHTIASIMLIDTPGFQNPASCGQQVGATLADLRHNYLQERLQMLFHHTTLVAPR 982
            ::|:||.:.:|.|::.|:|::||||||||...|...||:..:|.|||.|:|||.|||..|.:...
  Rat   823 ISLVNRALKSSQHSLCSMMIVDTPGFQNPEWGGSARGASFEELCHNYAQDRLQKLFHERTFLQEL 887

  Fly   983 DRYAQELVEIEMDLASECHP--GPLISLIDKAPQNHVVRS-SQRDLREHDRRGMLWLLDEEAIYP 1044
            :||.::.:|:..|   :..|  ...::.:|:|....:||| :..|    :.||:||||:|||:.|
  Rat   888 ERYKEDNIELAFD---DLEPVTDDSVAAVDQASHQSLVRSLAHAD----EARGLLWLLEEEALVP 945

  Fly  1045 NSNDDTFLERLFSHY----GDREHHSLLRKCAGPRQFVLHHLQGTNPVLYAVDGWVRHSREHPGI 1105
            .:.:||.|:||||:|    ||::..|.|.:.:.||.|:|.|..|||.|.|.|.||:.:::::|..
  Rat   946 GATEDTLLDRLFSYYGPQEGDKKGQSPLLRSSKPRHFLLGHSHGTNWVEYNVTGWLNYTKQNPAT 1010

  Fly  1106 RNAVSLLQDSSREEINRLYIGSLTRGSGAMVFCGSFAGLEGTQ--SLRRVSSIRRSFTT--AGVK 1166
            :||..|||||.::.|:.|::|   |...|.|..||.|||||..  :|||.:|:|::|||  |.||
  Rat  1011 QNAPRLLQDSQKKIISNLFLG---RAGSATVLSGSIAGLEGGSQLALRRATSMRKTFTTGMAAVK 1072

  Fly  1167 RNSIMLQVKFTVDGIIDTLRRTGTHFVHCYLLQHNAGKHTKYTANGSP----SSAAGQVSSEEEM 1227
            :.|:.:|:|..||.:|||::|:..|||||:|          ..|.|.|    |:::.:|||..|:
  Rat  1073 KKSLCIQIKLQVDALIDTIKRSKMHFVHCFL----------PVAEGWPGEPRSASSRRVSSSSEL 1127

  Fly  1228 --------------VNVPLLRSQLRGSQVLEAARLHRLGFPESVPLLEFVRRFGLLAGDLAS--- 1275
                          ::|.|||:|||||::|:|.|::|.|:|:.:...||.|||.:||..|..   
  Rat  1128 DLPPGDPCEAGLLQLDVSLLRAQLRGSRLLDAIRMYRQGYPDHMVFSEFRRRFDVLAPHLTKKHG 1192

  Fly  1276 ------NKDVSVEQILAVNELDVASYRIGPSQILFRSGVLSELEAKRDVLLSDRIIQLQAFCRGY 1334
                  ::..:||::|...:|:.:|..:|.|::.||:|.|:.||.:||...|..:...||.||||
  Rat  1193 RNYIMVDEKRAVEELLESLDLEKSSCCMGLSRVFFRAGTLARLEEQRDEETSRHLTLFQAACRGY 1257

  Fly  1335 LARKKMSQRRVQELAVRCIQRNVKAFLAVRDWPWWRLLVRVTPLLNVHRTEEQLKTANEELLMLR 1399
            |||:...:|::|:||:||:|:|:|....|:|||||:|...|.||:.|..:|||::..:||:..||
  Rat  1258 LARQHFKKRKIQDLAIRCVQKNIKKNKGVKDWPWWKLFTTVRPLIQVQLSEEQIRNKDEEIQQLR 1322

  Fly  1400 AKLEKIECDRSEVKAENQKLEAKLSELTVDLAEERSTAHIATERLEAETAERLKLEKELGDQTNK 1464
            .||||:|.:|:|::..:.:||.::||||.:|.:||:|...|::.|:|||||||:.|||:.:...:
  Rat  1323 NKLEKVEKERNELRLNSDRLETRISELTSELTDERNTGESASQLLDAETAERLRTEKEMKELQTQ 1387

  Fly  1465 VKNLQETTEKLEMELICAK----SDLNGISEDEDAENEDGVGGGVYKLKYERVARELEFTKRRLH 1525
            ...|::..|.::||::.|:    :::||..:|:||       ||.::|||||..||::|||:||.
  Rat  1388 YDALKKQMEAMDMEVMEARLIRAAEINGEVDDDDA-------GGEWRLKYERAVREVDFTKKRLQ 1445

  Fly  1526 TQHEHDLEQLVALKKHLEMKLSDAYEEVVEQRQVVGQWKRKAQKMTNEMNDLRMLLEEQNARNNL 1590
            .:.|..:|.....::.||.:|.|...:..|.::.:.|.|:|.|::|.|:.|.::.||.|..||:.
  Rat  1446 QELEDKMEVEQQNRRQLERRLGDLQADSDESQRALQQLKKKCQRLTAELQDTKLHLEGQQVRNHE 1510

  Fly  1591 LEKKQRKFDAECQSLQDAVRQERQAKERYGREKDVLQAEKFTLEQTLADTRLDLEFKEEKLASLQ 1655
            ||||||:||:|.....:..::|:..:|:..||||:|.||.|:|:|.:.:..||:....:|:.||:
  Rat  1511 LEKKQRRFDSELSQAHEETQREKLQREKLQREKDMLLAEAFSLKQQMEEKDLDIAGFTQKVVSLE 1575

  Fly  1656 RELEEMTFGGGTEE-EFAQLRRSKNETERRAKEQEEELDEMAGQIQLLEQAKLRLEMTLETMRKE 1719
            .||::::.....:| ..|::::...:.|.:.|:|||||||.||.||:||||||||||.:|.||:.
  Rat  1576 AELQDISSQESKDEASLAKVKKQLRDLEAKVKDQEEELDEQAGSIQMLEQAKLRLEMEMERMRQT 1640

  Fly  1720 ARRESQQRDEELEEVRGNGYKKIKALECQLETEHEERTLLLREKHELERRLSSMEDRDRVDRDAE 1784
            ..:|.:.||||:||.|.:..||::.:|.|||.|:|::...||||.|||.:||::.|:.. .||.|
  Rat  1641 HSKEMESRDEEVEEARQSCQKKLRQMEVQLEEEYEDKQKALREKRELESKLSTLSDQVN-QRDFE 1704

  Fly  1785 EALNQKLRRDLRKYKALLKDAQTQLERLKADTPGKTLIRQLRNQLEDAESARSLAMKARQTAEAE 1849
            .  .::||:||::.||||.|||..|:.||.:.|.|..|.||:||||::|...:.|:|||:..|.|
  Rat  1705 S--EKRLRKDLKRTKALLADAQIMLDHLKNNAPSKREIAQLKNQLEESEFTCAAAVKARKAMEVE 1767

  Fly  1850 LTEVQAMFDESHRARNDAEERANAAHRDRAELQAQIEENEEELGELMKKYSATVKQLNTEQINVS 1914
            :.::....|:..:|:...||:.:...|::.|:|.::||::|::.|||||:.|.|.|.:.:...::
  Rat  1768 MEDLHLQIDDIAKAKTALEEQLSRLQREKNEIQNRLEEDQEDMNELMKKHKAAVAQASRDMAQMN 1832

  Fly  1915 EAEFKLNEMEAERNNLKEQVAELQHRLDNVE-NLGDPSMAMMSKRLELRTKELESRLELEQATRA 1978
            :.:.:|.|...|:..|:|::..||.:::.:| ::.|.|:.   .|.|.:.:|||:|||.|:....
  Rat  1833 DLQAQLEESNKEKQELQEKLQALQSQVEFLEQSMVDKSLV---SRQEAKIRELETRLEFEKTQVK 1894

  Fly  1979 RLEVQVNRHKEALEKLQNEVTQSKMREMQAQDVIKKSQKSLRDMREEFHAVSSREQESLTRRKDL 2043
            |||...:|.||.:|||..|..|....|.:.::..|:.|:.|||.:||...::.:|.|:..::.:|
  Rat  1895 RLESMASRLKENMEKLTEERDQRAAAENREKEQNKRLQRQLRDTKEEMSELARKEAEASRKKHEL 1959

  Fly  2044 EKKVEQMESEGAALKNDLRLALQRIADLQQAMEEEGEEELSESDESLSSVGSI------------ 2096
            |..:|.:|:...:|:.||:||.:||.|||.|:|:|     .||||:...:.|:            
  Rat  1960 EMDLESLEAANQSLQADLKLAFKRIGDLQAAIEDE-----MESDENEDLINSLQDMVTKYQKRKN 2019

  Fly  2097 ---------SDLEDRL------------------------------------------RPVHVKR 2110
                     |:||||:                                          ||..|..
  Rat  2020 KLEGDSDVDSELEDRVDGVKSWLSKNKGPSKAPSDDGSLKSSRTALNSLPKEGKGPEERPSSVLS 2084

  Fly  2111 S----SQQSLNGSIGGGGGSVVSSTRTVVFEKDDNSPRITVTSPSSPHIHKLALAAKAIPANKPD 2171
            |    .:.:|..||||.|..  .|..|.:.|:        .|||..|     ...|:..|..:||
  Rat  2085 SLSYRKRLTLKDSIGGTGDQ--DSLLTTLSER--------ATSPERP-----PRKARVGPREEPD 2134

  Fly  2172  2171
              Rat  2135  2134

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MhclNP_732109.2 PDZ_canonical 337..426 CDD:483948 41/91 (45%)
COG5022 541..2019 CDD:227355 626/1535 (41%)
MYSc_Myo18 575..1305 CDD:276837 323/781 (41%)
Myo18aXP_038942261.1 PDZ_MYO18-like 220..308 CDD:467229 41/89 (46%)
COG5022 429..1960 CDD:227355 635/1564 (41%)
MYSc_Myo18 467..1228 CDD:276837 323/781 (41%)
CwlO1 1835..>2089 CDD:443091 71/261 (27%)

Return to query results.
Submit another query.