Protein Alignment Mhcl and nmy-3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_732109.2
• Gene: Mhcl / 41955
• FlyBaseID: FBgn0026059
• Length: 2194
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_501620.2
• Gene: nmy-3 / 177750
• WormBaseID: WBGene00012437
• Length: 1464
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1645
• Identity: 384/1645 - (23%)
• Similarity: 707/1645 - (42%)
• Gaps: 343/1645 - (20%)

  Fly   543 EQLTVDEDDVEKQNS--PAL-DLVEDICELKYLNEASVLHCLRQRYASNLIHTKAGPTLLVVNPM 604
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 Worm    62 EQGFFEKKRIEKTKCEVPSLNNYSEDLCTLTQPNAATVLNALKIRYTSNVIHTFCGLFCVVINPW 126

  Fly   605 APLSLYSEKVVSMFRGCKTEDMPPHVYSLAQTAYRSLVETRRDQSLIFMGRSGSGKSTSFKHALN 669
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 Worm   127 RNIPIYSDEVKQLYQ--LQNDLPPHVYSVAQNAFHGILKGGRNQSILITGESGAGKTENTKKIID 189

  Fly   670 YLALAAGAYNNFINAEKVNALCTILEAFGNTKTCLNSNATRMTQLLSLDFDQTGQIASASLQVLL 734
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 Worm   190 FI-LSSSVSNNTI-GDCVVTSGVLLEAMGNARTTHNSNSSRFGKFIRIEFDENSKLIGAKIECYL 252

  Fly   735 PERQRAGRRLGHEHSFHIMTRLLAGAAGLLQKELHLENITSEDSHPFISLSQKLEDRHRAAND-- 797
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 Worm   253 LEKSRVVFQSDGDRNFHIFYQMLS-------------NYFDNPHKSFLKLSKKVNEYKYLRNDDS 304

  Fly   798 -------FMRTVQAFETLNIDAKAVRGIWSILAAIYHLGIAGVTKLGTGSTARTQFA-NPTAARK 854
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 Worm   305 MIDDAETAKMTDEAFTRIGLSEEEKIWIFQILSAVLWI---GDIKFGERSGLDVSFVESMQEVDN 366

  Fly   855 ASGLLGVNLEDLSSAAFGLTQPN--------APNGGLSPSKSPTSDTGHEWAWECLEALVIGLYS 911
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 Worm   367 IAELLEMKSSKLVDA---LTQPTIKVHDKLIRKNQNLAKTLSSAS------------AMAKILYE 416

  Fly   912 EALAAVVALIN--------RQICTSSHTIASIMLIDTPGFQ----NPASCGQQVGATLADLRHNY 964
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 Worm   417 RLFGWIVKRCNDAFSVDDTESTCRLSRFIA---VLDIAGFEIIEKN----------SFEQFCINY 468

  Fly   965 LQERLQMLFHHTTLVAPRDRYAQELVE-IEMDLASECHPGPLISLIDKAPQNHVVRSSQRDLREH 1028
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 Worm   469 TNEKLQQFFNHFMFAKEQSDYLEEGIKWTQVNFAN--HLQPTIDLIEKP---------------- 515

  Fly  1029 DRRGMLWLLDEEAIYPNSNDDTFLERLFSHYGDR---EHHSLLRKCAGPRQFVLHHLQGTNPVLY 1090
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 Worm   516 --MGILSFLEEECVVPNGSEKSLLEKLCSNLSNDSSFKKSKQTQKCSTIRHFYVQHYAG--EVHY 576

  Fly  1091 AVDGWVRHSREHPGIRNAV-SLLQDSSREEINRLY----IGSL-TRGSGAMVFCGSFAGLEGTQS 1149
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 Worm   577 NIDGWLDKNRDN--VETSVLDILSQSTHPLLKLLFPPVPVNNLKTR--------------RGT-- 623

  Fly  1150 LRRVSSIRRSFTTAGVKRNSIMLQVKFTVDGIIDTLRRTGTHFVHCYLLQHNAGKHTKYTANGSP 1214
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 Worm   624 ---------------ITNSTVSFLYKNQLQCLLDTLNSSSAHFIRCV------------------ 655

  Fly  1215 SSAAGQVSSEEEM---VNVPLLRSQLRGSQVLEAARLHRLGFPESVPLLEFVRRFGLLAGDLASN 1276
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 Worm   656 ------VSNYEKLPGKIDAPLVLAQLKCNGVLEGIRICREGYPSRLSHSEFIERYSLLMKNKEQS 714

  Fly  1277 KDVSVEQ--ILAVNELDVAS--YRIGPSQILFRSGVLSELEAKRDVLLSDRIIQLQAFCRGYLAR 1337
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 Worm   715 KGASEKEKCTLICQDAQVRKERYAVGKTKLFCKVGVISELETKRNNYISSFIILIQANIRYLNIQ 779

  Fly  1338 KKMSQRRVQELAVRCIQRNVKAFLAVRDWPWWRLLVRVTPLLNVHRTEEQLKTANEELLMLRAKL 1402
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 Worm   780 KDLIERRKKLEAVVTIQDNVRQFAELSQWPWYRIYHLTRGLIPRNRDKERIEELENEKLKLEEEI 844

  Fly  1403 EKIECDRSEVKAENQKLEAKLSELTVDLAEERSTAHIATERLEAETAERLKLEKELGDQTNKVKN 1467
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 Worm   845 QEMEIKNEEALKEN----LKLSML-----------------LDREKSEKVKVQKEL--------- 879

  Fly  1468 LQETTEKLEMELICAKSDLNGISEDEDAENEDGVGGGVYKLKYERVARELEFTKRRLHTQHEHDL 1532
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 Worm   880 --EEVEKQGREKLLEK--------------------------------EREFRK----TMEE--M 904

  Fly  1533 EQLVALKKHLEMKLSDAYEEVVEQRQVVGQWKRKAQKMTNEMNDLRMLLEEQNARNNLLEKKQRK 1597
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 Worm   905 EQNEEIFNVLERKYNEQHKKVMKMNDVLREYERKIEQLNMEKTD----LENENQK---LRETQNR 962

  Fly  1598 FDAECQSLQDAVRQERQAKERYGREKDVLQAEKFTLEQTLADTRLDLEFKEEK---------LAS 1653
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 Worm   963 QDSHYSNLEKEVMEKSSLIDELQNQIQKLSDE--NNEQRLTIAKLETALEDEKARFARQNNTIGD 1025

  Fly  1654 LQRELEEMTFGGGTEEEFAQL----RRSKNETERRAKEQEEELDEMAGQIQLLEQAKLRLEMTLE 1714
            :|:.:.|:      .|:.|:.    ...:|.|.:..:|:|:..:|:....:::::...:::...|
 Worm  1026 MQKLISEL------NEKIARFDNIALNERNSTRKIEREKEKLNEELTTAKEIIQKQAKKIDELKE 1084

  Fly  1715 TMRKEARRESQQRDEELEEVRGNGYKKIKALEC--QLETEHEERTLLLREK-HELERRLSSMEDR 1776
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 Worm  1085 ECRKR-KNEASRLERKLED------KEAMMADCVKELKDSHKERLKEMEQKVEDVKRKNSKLENE 1142

  Fly  1777 DRVDRDAEEALNQKLRRDLRKYKALLKD-AQTQLERLKADTPGKTLIRQLR-NQLEDAESARSLA 1839
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 Worm  1143 NSTQKSQIETFQRESSVD--------SDYGRSSSGRL------STLGRQYSLTSIGSFSSIRTVG 1193

  Fly  1840 MKARQTAEAELTEVQAMFDESHRARNDAEERANAA-HRDRAELQAQIEENEEELGELMKKYSA-- 1901
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 Worm  1194 LGSRKDSISDMT--SSMY--SLRRRDSTYDMTSSTIGLQRSPSTSQVMEKERRILELEKEKAAIN 1254

  Fly  1902 TVKQLNTEQINVSEAEFKLNEMEAE---------RNNLKEQVAELQHRLDNVENLGDPSMAMMSK 1957
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 Worm  1255 TDLQLVKRELDVYKSQLSAVESEKESLQTANRKQSNQLQETTRQLNSAQKNADNL-----ALRLK 1314

  Fly  1958 RLELRTKELESRLELEQATRARLEVQVNRHK-----EALEKLQNEVTQSKM-----REMQAQDVI 2012
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 Worm  1315 KALADCDEWKKKHE-ESIVESKTEILMERKRAMDRAEACEK-ETELKQSRMATIESARMELGGEL 1377

  Fly  2013 KKSQKSLRDMREEFHAVSS--REQESL-----TRRKDLEKKVEQMESEGAALKNDLRLALQRIAD 2070
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 Worm  1378 ARTQSELDRCRQIIIQLEENLKSQESLGNSFGRHQTNLNFEIENLRDENCALKAKIRRQYKQIEL 1442

  Fly  2071 LQQAMEEEGEEELSESDESL 2090
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 Worm  1443 LTQ--QDETNDELNHFENKV 1460

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mhcl	NP_732109.2	PDZ_canonical	337..426	CDD:483948
		COG5022	541..2019	CDD:227355	365/1565 (23%)
		MYSc_Myo18	575..1305	CDD:276837	186/776 (24%)
nmy-3	NP_501620.2	MYSc_class_II	97..747	CDD:276951	186/776 (24%)
		SMC_prok_B	848..>1463	CDD:274008	153/732 (21%)