DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment msps and Ckap5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001247129.1 Gene:msps / 41952 FlyBaseID:FBgn0027948 Length:2082 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_017447664.2 Gene:Ckap5 / 311191 RGDID:1563596 Length:2040 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2169 Identity:855/2169 - (39%)
Similarity:1238/2169 - (57%) Gaps:258/2169 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MAEDTEYKKLPVEERCVHKLWKARVDGYEEAAKIFRELDDEKSPEWSKFAGLIKKMVVDSNALAQ 65
            |.:|:|:.||||:::|.|||||||:.|||||.|||:::.|||||||||:.|||||.|.||||:.|
  Rat     1 MGDDSEWLKLPVDQKCEHKLWKARLSGYEEALKIFQKIKDEKSPEWSKYLGLIKKFVTDSNAVVQ 65

  Fly    66 EKGLEAALIFVENSGLAGRTVGDVMTGIVQKCIAAPKTKTKELSVQVALMYVEIEKQEAVVEELV 130
            .|||||||::|||:.:||:|.|:|::|:|.|....||.|.|||.:::.||||||||.|:|.|||:
  Rat    66 LKGLEAALVYVENAHVAGKTTGEVVSGVVSKVFNQPKAKAKELGIEICLMYVEIEKGESVQEELL 130

  Fly   131 KGMEAKNPKIVSACVAATTLALREFGHKVIGVKPLIKKLAPLMSDRDKTVRDEGKQLAVEIYRWI 195
            ||::.|||||:.||:.....||.|||.|:|.:||:||.|..|...|||.||||.|..|:|||||.
  Rat   131 KGLDNKNPKIIVACIETLRKALSEFGSKIILLKPIIKVLPKLFESRDKAVRDEAKLFAIEIYRWN 195

  Fly   196 GAAMKAQISTLPQVTLKELEDEFDKLKGERVEPSRYLKSQQEKQAKI--ADAAATEDAYNEDDGE 258
            ..|:|..:..:..|.|||||:|:.||.....:|||:|:||||.:||:  ..:|..:.....|||:
  Rat   196 RDAVKHTLQNINSVQLKELEEEWVKLPTGAPKPSRFLRSQQELEAKLEQQQSAGGDAEGGGDDGD 260

  Fly   259 AGVEEIDPMDLLDPVDILSKMPKDFYDKLEEKKWTLRKESLEVLEKLLTDHPKLENGEYGALVSA 323
            . |.:||..:||:.|:||||:|||||||:|.|||..|||:||.:|.|:.. |:||.|:|..||.|
  Rat   261 E-VPQIDAYELLEAVEILSKLPKDFYDKIEAKKWQERKEALEAVEGLVRS-PRLEAGDYAELVKA 323

  Fly   324 LKKVITKDSNVVLVAMAGKCLALLAKGLAKRFSNYASACVPSLLEKFKEKKPNVVTALREAIDAI 388
            ||||:.||:||:|||:|.|||..||.||.|:|..||...||::|||||||||.||.||:||||||
  Rat   324 LKKVVGKDTNVMLVALAAKCLTGLAVGLRKKFGQYAGHVVPTILEKFKEKKPQVVQALQEAIDAI 388

  Fly   389 YASTSLEAQQESIVESLSNKNPSVKSETALFIARALTRTQPTALNKKLLKLLTTSLVKTLNEPDP 453
            :.:|:|:...|.::..:.||||::|.:|:|||||:......:.|.|.|||....:|:|.:|:..|
  Rat   389 FLTTTLQNISEDVLAVMDNKNPTIKQQTSLFIARSFRHCTSSTLPKSLLKPFCAALLKHINDSAP 453

  Fly   454 TVRDSSAEALGTLIKLMGDKAVTPLLADVDPLKMAKIKECQEKAEI----KIKVAGPKKETRPAS 514
            .|||::.|||||.:|::|:|.|.|.|||||.||:.|||||.||.|:    |..:|..|||::|..
  Rat   454 EVRDAAFEALGTALKVVGEKTVNPFLADVDKLKLDKIKECSEKVELVHGKKSGLAAEKKESKPLP 518

  Fly   515 APTAKAAAPAKTVAGSVDPKPVTRPATTGARKVLKKPATVSGG----GATSAPTAALKAG---GK 572
            ...|.:.|     ||..|.|.|:.| ..|..|  |.|||.:||    |.|:||..:..:|   .|
  Rat   519 GRAAASGA-----AGDKDTKDVSGP-KPGPLK--KAPATKAGGPPKKGKTTAPGGSASSGTKNKK 575

  Fly   573 PLAT----EREITPEELQEKSEEILPAEILNGLVDSNWKNRLAAVEQLLGEISGFDAKQAGISQI 633
            .|.|    |.|::.|..:||:..:||...:..|..||||.|||.:|:....:...:..:.. .|.
  Rat   576 GLETKEIAEPELSIEVCEEKASAVLPPTCIQLLDSSNWKERLACMEEFQKAVELMERSEMP-CQA 639

  Fly   634 LIRTISGRKPGLKEMNFQVLKFKLDIIRSVAENYPLTTTTVDLVINEIIEKLADAKNGAAAADVL 698
            |::.:: :|||.||.||||::.||.|:..:|:....:.|:..:|::.:::|:.|.|.|..|.:.|
  Rat   640 LVKMLA-KKPGWKETNFQVMQMKLHIVALIAQKGNFSKTSAQIVLDGLVDKIGDVKCGNNAKEAL 703

  Fly   699 SAFAEATKLEYVVGKVLSFAFEQKSPKVQSEAFNWVNRSIIEFGF-QLQPKTLIEDVRKGVQSTN 762
            :|.|||..|.:...:|:|.||.||:||.|||..||::.:|.|||| :|..|..|.:|:..:.:||
  Rat   704 TAIAEACMLPWTAEQVMSMAFSQKNPKNQSETLNWLSNAIKEFGFSELNVKAFISNVKTALAATN 768

  Fly   763 PTVRASAIQMVGTMSMYMGKALMMFFDSEKPALKSQIQVEFDKNVGEKPPKPVRGVQRSSGGTAG 827
            |.||.|||.::|.|.:|:|.:|.|.|:.|||||.|||..||.|..|:.||.|.||:.:.|  |:|
  Rat   769 PAVRTSAITLLGVMYLYVGPSLRMIFEDEKPALLSQIDAEFQKMQGQSPPAPTRGISKHS--TSG 831

  Fly   828 NSPDNEDDDGGAAGEEEPINMADLLPRVDIAPQITEALLKEMSDKDWKTRNEGLTKLQAIISEAR 892
            .   :|.|||...|:... ::.||||||:|:.:||..|:.::.||:||.|.|||.::..||:||:
  Rat   832 T---DEGDDGDEPGDGSN-DVVDLLPRVEISDKITSELVSKIGDKNWKIRKEGLDEVAGIINEAK 892

  Fly   893 LIKPSIGDLAPALAHRLVDSNAKIAQTTLAICEQLATAMGAGCRNHVRNLFPGFLHALGDNKSFV 957
            .|:|:||:|..||..||.|||..:.|.||.|.:|||.|||...:.||:||....|..|||:|:.|
  Rat   893 FIQPNIGELPTALKGRLNDSNKILVQQTLNILQQLAVAMGPNVKQHVKNLGIPILTVLGDSKNNV 957

  Fly   958 RAAALNCINSFGEKGGYKEFFESEMIADALKGGSPALKTELWAWLADKLPGLPPKSVSKEDIHSM 1022
            |||||..:|::.|:.|.||:.|.|.:::.||..:|.|:.||..|||:|||.|   ..:..|:...
  Rat   958 RAAALATVNAWAEQTGMKEWLEGEDLSEELKKENPFLRQELLGWLAEKLPML---RSTPTDLILC 1019

  Fly  1023 VPHLYAHICDRNADVRKNANEAVLGIMIHLGFDAMNRALDKQKPASKKDILAALEKARPNLPVKP 1087
            |||||:.:.|||.||||.|.:|:...|:|||::.|.:|..|.||.||..:||.||||:.|:|.||
  Rat  1020 VPHLYSCLEDRNGDVRKKAQDALPFFMMHLGYEKMAKATGKLKPTSKDQVLAMLEKAKANMPSKP 1084

  Fly  1088 L--------PKG-----KHQ---API-----------PEEPKLKTVRGGGAGGAPGIQKSATARV 1125
            .        |.|     |.|   ||:           |:..|.|         |||:...|.:  
  Rat  1085 AAPSKAVSKPMGGSAPAKTQPIPAPVEDSVSNTMEAKPDPKKAK---------APGVSSKAKS-- 1138

  Fly  1126 AGGQDKQVPAR---KKDEDIDTSPLLCANSAKNQRLLDEQKMKVLKWTFVTPREEFTELLRDQMM 1187
              .|.|:||::   |:|:|......:...:.|.||:.||:.:|||||.|.|||:|:.|.|:.||.
  Rat  1139 --AQGKKVPSKTTLKEDDDKSGPIFIVVPNGKEQRMRDEKGLKVLKWNFTTPRDEYIEQLKTQMS 1201

  Fly  1188 TANVNKALIANMFHDDFRYHLKVIEQLSEDLAGNSKALVCNLDLILKWLTLRFYDTNPSVLIKGL 1252
            :. |.|.|...|||.||::|.|.:..:.:.|......::..||||||||||||:|||.|||:|.|
  Rat  1202 SC-VAKWLQDEMFHADFQHHNKALAVMVDHLESEKDGVISCLDLILKWLTLRFFDTNTSVLMKAL 1265

  Fly  1253 EYLVQVFQVLIDEEYILAENEGSSFVPHLLLKIGDPKDAVRNGVRRVLRQVILVFPFVKVFGYVM 1317
            |||..:|.:|.||||.|.|||.|||:|:|:||:|:|||.:|..||.:|.::.||:|..|:|.::|
  Rat  1266 EYLKLLFTLLSDEEYHLTENEASSFIPYLILKVGEPKDVIRKDVRAILNRMCLVYPASKMFPFIM 1330

  Fly  1318 EGLKSKNARQRTECLDELTFLIESYGMNIC---PQSAVREIARQISDRDNSVRNAALNCIVQVFF 1379
            ||.||||::||.|||:||..||||||||:|   |..|::|||..|.||||:|||||||.||.|:.
  Rat  1331 EGTKSKNSKQRAECLEELGCLIESYGMNVCQPTPGKALKEIAIHIGDRDNAVRNAALNTIVTVYN 1395

  Fly  1380 LSGEKTYKMIGHLNEKDLSMLDERIKRAKKTKKPTPPPSVDVPAPQRHDSIEIEDAEVGNGCDEL 1444
            :.|::.:|:||:|:|||:|||:|||||:.|                |..::.::.||      |.
  Rat  1396 VHGDQVFKLIGNLSEKDMSMLEERIKRSAK----------------RPSAVPVKQAE------EK 1438

  Fly  1445 PPPDEDGLQRELNARGQNNMTDRSATNVVAYLSSLTRQATFDQAPSSQLLLLQQQLQQLQQQAQQ 1509
            |       ||..|.....||..:....                 ..|..|.:..:..::|.::..
  Rat  1439 P-------QRTQNINSNANMLRKGPAE-----------------DMSSKLKIMYRTYRIQARSMS 1479

  Fly  1510 QKPSG------PFGLDSQVISEIEKD--WVRVDQMEQKPLLNVDISSLDEPIKVRPTRAGIHYPQ 1566
            ..|..      .|.||   :.|||.|  .||.:..|   |:...:..:.||:.:         |:
  Rat  1480 GHPEAAQMVRREFQLD---LDEIENDNGTVRCEMPE---LVQHKLDDIFEPVLI---------PE 1529

  Fly  1567 EKFDRLISRQHYMQQTLTTSPSSTAGMTSGVSPYRSPMRLQHQQPQQQLENNIPNLADVLPKHDP 1631
            .|.                         ..|||:...|.              .|.|..:.    
  Rat  1530 PKI-------------------------RAVSPHFDDMH--------------SNTASTIN---- 1551

  Fly  1632 QLVKVIKGVSSTDTLKARAAINELAAIIEAPEKQAVLRDYEEIFIQNVLAQFKNLSQIPSA---- 1692
               .:|..|:|.|...:..|:.::..::...:|...:..:.:.|:   :|.|..|..|.|.    
  Rat  1552 ---FIISQVASGDISTSIQALTQIDEVLRQEDKAEAMSGHIDQFL---IATFMQLRLIYSTHMAD 1610

  Fly  1693 ------QSVVVYQPLLSILYTFFHANILGKTLSVACIKNLMSALLNLMADPKLA-VGDDSQYNKV 1750
                  :.:.:|..::..:.:.|....|.:..|...:|:||..|:.||.|.::. :.:..|..:.
  Rat  1611 EKLDKDEIIKLYSCIIGNMISLFQIESLAREASTGVLKDLMHGLITLMLDSRIEDLEEGQQVIRS 1675

  Fly  1751 INGICLKVLDKVDFTNLNCALIRLLRET-CPEAKLPKFTDLLMKCIWRNVKMLPERSNELNYDAV 1814
            :|.:.:|||:|.|.||:..||:.||::: ...|..|||::|:|||:||.|::||:..|.:|.|.:
  Rat  1676 VNLLVVKVLEKSDQTNILSALLVLLQDSLLATASSPKFSELVMKCLWRMVRLLPDTINSINLDRI 1740

  Fly  1815 ILEVHEFMLALPSTWWQNRPSDTPMRTIKTILHNMAKVKGNAILQHLNQI--PTHSELHTYLIRI 1877
            :|::|.||...|....:...|:.|:||:||:||.:.|:||..||.||..|  ...|||..:|.|:
  Rat  1741 LLDIHIFMKVFPKEKLKQCKSEFPIRTLKTLLHTLCKLKGPKILDHLTMIDNKNESELEAHLCRM 1805

  Fly  1878 LKNFQKDGSASGIGASPQRAKEIASKRISHQTHDTVSQIFKLISDRDTKQQGLQKLYDFKQQNPD 1942
            :|:......:.....:.:.|..|..|....:.:|.:::|||.|..::..::||.:||::|::..|
  Rat  1806 MKHSMDQTGSKSDKETEKGASRIDEKSSKAKVNDFLAEIFKKIGSKENTKEGLAELYEYKKKYSD 1870

  Fly  1943 IDLSTFLQGSSAPFHKYIEEGLAEIERNQ--------NAG-STQDNRT-----AATRSYLTDVNY 1993
            .|:..||:.||..|..|:|.||..||..:        :|| |.|...|     .:|.|.|.:.|.
  Rat  1871 TDIEPFLKNSSQFFQSYVERGLRVIEMERESKGRIPTSAGISPQMEVTCVPTPTSTVSSLGNTNG 1935

  Fly  1994 QNNGPDPDFWMDRLQYHMTGGAAKLASARSADDGSHMLDNKVVDENLCLNGMNAQKASLIKREKR 2058
            :..|  |..:::||         |:...|..      |||...|:...|..:.::.|........
  Rat  1936 EEVG--PSVYLERL---------KILRQRCG------LDNTKQDDRPPLTSLLSKPAIPPVASST 1983

  Fly  2059 DMSPNRLQHLQAKLAQIK--KENH 2080
            ||       |.:||:|::  :|.|
  Rat  1984 DM-------LHSKLSQLRESREQH 2000

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
mspsNP_001247129.1 HEAT repeat 319..350 CDD:293787 20/30 (67%)
HEAT repeat 361..387 CDD:293787 18/25 (72%)
HEAT repeat 398..466 CDD:293787 28/67 (42%)
HEAT repeat 860..891 CDD:293787 13/30 (43%)
HEAT repeat 900..929 CDD:293787 14/28 (50%)
HEAT repeat 939..968 CDD:293787 15/28 (54%)
Ckap5XP_017447664.2 CLASP_N <679..775 CDD:432496 39/95 (41%)

Return to query results.
Submit another query.